核酸提取方法的技術(shù)要點(diǎn)和注意事項(xiàng)_第1頁(yè)
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核酸提取方法的技術(shù)要點(diǎn)和注意事項(xiàng)一、 核酸的基本概念核酸是脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)的總稱,是由許多核苷酸單體聚合成的生物大分子化合物,為生命的最基本物質(zhì)之一。一個(gè)核苷酸分子是由一分子含氮的堿基、一分子五碳糖和一分子磷酸組成的。根據(jù)五碳糖的不同可以將核酸分為脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)兩大類。核酸都是極性化合物,都溶于水,不溶于乙醇,氯仿等有機(jī)溶劑。在酸性溶液中易水解,在中性及弱堿性溶液中穩(wěn)定性稍高。二、 核酸提取前樣本采集、預(yù)處理和保存全血:抗凝劑EDTA或枸櫞酸鈉,不宜使用肝素(抑制Taq活性);血清和血漿:主要用于檢測(cè)病毒、細(xì)菌和腫瘤細(xì)胞等釋放入血的游離核酸;分泌物:痰液是檢測(cè)呼吸道病原體核酸的主要樣本,深部咳痰,患者采集早晨起床后的第一口痰,采集前應(yīng)先漱口,以避免混入大量口腔脫落的上皮細(xì)胞和唾液影響檢測(cè)結(jié)果。三、 核酸提取的基本步驟及使用試劑核酸的釋放;2.核酸的分離與純化;3.核酸的濃縮、沉淀與洗滌。核酸提取的常用組分成分名稱 原理及作用酚 蛋白質(zhì)的變性劑,可抑制DNase的降解作用

SDS(十二烷基磺親水基表面活性劑,可破壞細(xì)胞膜、核膜、并使組織蛋白酸鈉)與DNA分離溶解脂類蛋白TritonX-100非離子表面活性劑,有助于蛋白質(zhì)與DNA分離異硫氤酸胍 變性裂解細(xì)胞,強(qiáng)有力的蛋白質(zhì)變性劑,能迅速溶解蛋白質(zhì),導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)4-羥乙基哌嗪一種重要的氫離子緩沖劑,能較長(zhǎng)時(shí)間控制恒定磺酸(HEPES)異丙醇氯化鈉磺酸(HEPES)異丙醇氯化鈉DNA在冷乙醇或異丙醇中沉淀,因?yàn)镈NA在醇中不可溶而黏在一起,這一步也能除掉鹽分氯化鈉溶液中DNA的溶解度最低,而蛋白質(zhì)高,可以去除蛋白;抑制核酸酶在裂解過程中對(duì)核酸的破壞,維持核酸的穩(wěn)定等礦物油去除非核酸有機(jī)雜質(zhì)礦物油去除非核酸有機(jī)雜質(zhì)磁珠吸附核酸磁珠四、實(shí)驗(yàn)室常用核酸提取技術(shù)酚/氯仿抽提法/醇沉淀法;2.層析柱法;3.煮沸裂解法;4.一步法;5.納米磁珠法。酚/氯仿抽提法/醇沉淀法:酚是蛋白質(zhì)的變性劑,同時(shí)抑制了DNase的降解作用,SDS(十二烷基磺酸鈉)將細(xì)胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白質(zhì),核蛋白變性降解,使核酸釋放。核酸易溶于水,不溶于有機(jī)溶劑,蛋白質(zhì)本身帶有親水基團(tuán),但當(dāng)有機(jī)溶劑存在時(shí),蛋白質(zhì)變性沉淀。利用離心后有機(jī)溶劑位于底層(脂質(zhì))核酸存在水相層,蛋白質(zhì)則沉淀于兩相之間的原理分離核酸。層析柱法:提DNA時(shí):通過特殊硅基質(zhì)吸附材料,能夠特定吸附DNA,而RNA和蛋白質(zhì)順利通過,然后利用高鹽低PH結(jié)合核酸,低鹽高PH值洗脫,來分離純化DNA。提RNA時(shí):提取使用到的離心管壁多是聚丙烯的材料,管壁上有靜電,會(huì)吸附核酸。carrierRNA減少了目標(biāo)核酸物質(zhì)的管壁吸附損失,進(jìn)而提高微量的核酸純化柱上的結(jié)合和洗脫效率,同時(shí)降低了提取環(huán)境中的RNase降解微量RNA的概率。注意:可以進(jìn)行核酸的純化核濃縮,不適用大批量樣本,對(duì)人員操作要求高。煮沸裂解法:加入Tris等使細(xì)胞膜破裂,在用高溫使細(xì)胞完全裂解,并使宿主細(xì)胞的蛋白質(zhì)與DNA變性,再使用有機(jī)溶劑抽提使核酸分離并進(jìn)行沉淀。通過離心去除變性的蛋白質(zhì)和染色體DNA,回收上清液中的目的DNA。注意:需要金屬浴,有爆蓋風(fēng)險(xiǎn),不能用于RNA。一步法:首先核酸釋放劑快速裂解、釋放病毒核酸,然后加入待測(cè)樣本,與釋放劑充分混勻,靜置一段時(shí)間后,加入擴(kuò)增試劑上機(jī)擴(kuò)增。注意:要求試劑盒的抗干擾能力高。納米磁珠法:磁珠表面連接了可特異地與核酸發(fā)生作用的功能基團(tuán),具有可逆吸附核酸的特性,通常采用帶有氨基、巰基、環(huán)氧基等基團(tuán)的活化試劑對(duì)磁珠表面包覆的高分子進(jìn)行化學(xué)修飾。也可用納米技術(shù)對(duì)超順磁性納米顆粒的表面進(jìn)行改良和表面修飾后,制備成超順磁性氧化硅納米磁珠。磁珠能與核酸分子特異性地識(shí)別和高效結(jié)合。在外加磁場(chǎng)的作用下,把血液、動(dòng)物組織、食品、病原微生物等樣本中的核酸分離出來。注意:可以進(jìn)行核酸的純化核濃縮,可以適用大批量樣本,可以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化。五、 提取核酸的質(zhì)量評(píng)價(jià)產(chǎn)率:⑴紫外分光光度計(jì)測(cè)量A260OD值;⑵提取核酸后進(jìn)行定量PCR,比較Ct值;⑶通過內(nèi)標(biāo)(InternalControl/Calibrator)評(píng)價(jià)。純度:檢測(cè)230nm、260nm、280nmOD值,常以260/280比值評(píng)價(jià)。完整性:核酸分子在pH8.0的電泳環(huán)境中,帶負(fù)電荷,在一定強(qiáng)度電場(chǎng)力的作用下,從負(fù)極向正極遷移。分子量大的核酸電泳過程中受到的阻力較大,泳動(dòng)速率較慢;反之,分子量較小的核酸片段跑在前面。以電泳結(jié)果評(píng)價(jià)提取核酸的完整性。抑制物:常以擴(kuò)增的目的曲線和內(nèi)標(biāo)曲線進(jìn)行評(píng)價(jià)。六、 提取核酸時(shí)的注意事項(xiàng)1.一定注意不同方法對(duì)核

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