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文檔簡介
關于生物化學物質代謝及其調節第1頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五第一節細胞代謝的調節網絡一、代謝途徑交叉形成網絡二、分解代謝和合成代謝的單向性三、ATP是通用的能量載體四、NADPH以還原力形式攜帶能量五、代謝的基本要略第2頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五一、代謝途徑交叉形成網絡1、糖代謝與脂類代謝的相互關系2、糖代謝與蛋白質代謝的相互聯系3、脂類代謝與蛋白質代謝的相互聯系4、核酸與糖、脂類、蛋白質代謝的聯系第3頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五糖類脂類氨基酸和核苷酸之間的代謝聯系PEP丙酮酸生酮氨基酸-酮戊二酸核糖-5-磷酸
甘氨酸天冬氨酸谷氨酰氨丙氨酸甘氨酸絲氨酰蘇氨酸半胱氨酸
氨基酸6-磷酸葡萄糖磷酸二羥丙酮乙酰CoA甘油脂肪酸膽固醇亮氨酸賴氨酸酪酰氨色氨酸笨丙氨酸異亮氨酸亮氨酸色氨酸乙酰乙酰CoA脂肪核苷酸天冬氨酸天冬酰氨天冬氨酸苯丙酰氨酪氨酸異亮氨酸甲硫酰氨蘇氨酸纈氨酸琥珀酰CoA蘋果酸草酰乙酸檸檬酸異檸檬酸乙醛酸蛋白質淀粉、糖原核酸生糖氨基酸谷氨酰氨組氨酸脯氨酸精氨酸谷氨酸延胡索酸琥珀酸丙二單酰CoA1-磷酸葡萄糖第4頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五糖代謝與脂類代謝的相互聯系
糖乙酰CoA,NADPH脂肪酸磷酸二羥丙酮α-磷酸甘油脂肪有氧氧化酵解從頭合成脂肪甘油磷酸二羥丙酮糖代謝脂肪酸乙酰CoA琥珀酸糖
(植物)乙醛酸循環-氧化糖異生TCA第5頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五糖代謝與蛋白質代謝的相互聯系糖→→α-酮酸氨基酸蛋白質
NH3蛋白質氨基酸α-酮酸糖(生糖氨基酸)第6頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五脂類代謝與蛋白質代謝的相互聯系
脂肪甘油磷酸二羥丙酮脂肪酸乙酰CoA氨基酸碳架氨基酸蛋白質蛋白質氨基酸酮酸或乙酰CoA脂肪酸脂肪(生酮氨基酸)第7頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五核酸與糖、脂類、蛋白質代謝的聯系
核苷酸的一些衍生物具重要生理功能(如CoA、NAD+,NADP+,cAMP,cGMP)。
核酸是細胞內重要的遺傳物質,控制著蛋白質的合成,影響細胞的成分和代謝類型
核酸生物合成需要糖和蛋白質的代謝中間產物參加,而且需要酶和多種蛋白質因子。
各類物質代謝都離不開具備高能磷酸鍵的各種核苷酸,如ATP是能量的“通貨”,此外UTP參與多糖的合成,CTP參與磷脂合成,GTP參與蛋白質合成與糖異生作用。第8頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五脂肪代謝和糖代謝的關系延胡索酸琥珀酸蘋果酸草酰乙酸3-磷酸甘油三羧酸循環乙醛酸循環甘油乙酰CoA三酰甘油脂肪酸氧化
糖原(或淀粉)1,6-二磷酸果糖磷酸二羥丙酮磷酸烯醇丙酮酸丙酮酸合成植物或微生物第9頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五糖分解和糖異生途徑中相對獨立的單向反應
糖原(或淀粉)1-磷酸葡萄糖6-磷酸果糖1,6-二磷酸果糖3-磷酸甘油醛磷酸二羥丙酮2磷酸烯醇丙酮酸2丙酮酸葡萄糖己糖激酶果糖激酶二磷酸果糖磷酸酯酶丙酮酸激酶丙酮酸羧化酶6-磷酸葡萄糖磷酸酯酶6-磷酸葡萄糖2草酰乙酸PEP羧激酶第10頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五ATP攜帶能量由能源傳遞給細胞的需能過程ATPADP+Pi太陽能化學能生物合成細胞運動膜運輸第11頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五通過NADPH循環將還原力由分解代謝轉移給生物合成反應NADPH+H+NADP+分解代謝還原性有機物還原性生物合成反應氧化物還原性生物合成產物氧化前體第12頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五
代謝的基本要略
代謝的基本要略在于形成ATP、還原力和構造單元以用于生物合成。由ATP、還原力和構造單元可合成各類生物分子,并進而裝配成生物不同層次的結構。生物合成和生物形態建成是一個耗能和增加有序結構的過程,需要由物質流、能量流和信息流來支持。第13頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五脂肪葡萄糖、其它單糖三羧酸循環電子傳遞(氧化)蛋白質脂肪酸、甘油多糖氨基酸乙酰CoAe-磷酸化+Pi
小分子化合物分解成共同的中間產物(如丙酮酸、乙酰CoA等)
共同中間物進入三羧酸循環,氧化脫下的氫由電子傳遞鏈傳遞生成H2O,釋放出大量能量,其中一部分通過磷酸化儲存在ATP中。大分子降解成基本結構單位
生物氧化的三個階段NADPH第14頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五生物系統中的能流第15頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五(胞液)(線粒體)(PEP)丙氨酸天冬氨酸谷氨酸(轉氨基作用)糖的分解代謝和糖異生的關系第16頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五一、代謝調節的概念二、酶水平的調節三、細胞結構對代謝途徑的分隔控制調節四、激素調節和跨膜信號轉導第二節代謝調節第17頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五代謝調節
生命是靠代謝的正常運轉維持的。生命有限的空間內同時有那麼多復雜的代謝途徑在運轉,必須有靈巧而嚴密的調節機制,才能使代謝適應外界環境的變化與生物自身生長發育的需要。調節失靈便會導致代謝障礙,出現病態甚至危及生命。在漫長的生物進化歷程中,機體的結構、代謝和生理功能越來越復雜,代謝調節機制也隨之更為復雜。代謝調節的四級水平:酶水平調節細胞水平調節激素水平調節神經水平調節多細胞整體水平調節第18頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五1、酶的別構效應
酶活性的前饋和反饋調節2、產能反應與需能反應的調節3、酶的共價修飾與級聯放大機制二、酶水平的調節第19頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五酶活性的前饋和反饋調節
前饋(feedforward)和反饋(feedback)是來自電子工程學的術語,前者的意思是“輸入對輸出的影響”,后者的意思是“輸出對輸入的影響”,這里分別借用來說明底物和代謝產物對代謝過程的調節作用。這種調節可能是正調控,也可能是負調控,其調節機理是通過酶的變構效應來實現的。S0SnS2S1E0E1En-1或+—或+—反饋前饋第20頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五反饋調節中酶活性調節的機制代謝物別構中心活性中心第21頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五6-磷酸葡萄糖對糖原合成的前饋激活作用GUDPG6-P-G+1-P-G糖原糖原合成酶ATPADP
UTPUDPG
第22頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五葡萄糖丙酮酸羧化酶乙酰CoA磷酸烯醇式丙酮酸1,6-二磷酸果糖草酰乙酸-酮戊二酸擰檬酸天冬氨酸氨基酸蛋白質嘧啶核苷酸核酸
氨甲酰天冬氨酸——+++磷酸烯醇式丙酮酸羧化反應的調節控制第23頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五氨基酸合成的反饋調控反硝化作用氧化亞氮氨甲酰磷酸分支酸脫氧庚酮糖酸-7-磷酸天冬氨酸天冬氨酰磷酸赤蘚糖-4-磷酸脫氫奎尼酸莽草酸谷氨酸磷酸烯醇式丙酮酸+預苯酸TryPheTrpIleTrpHisCTPAMPGlnLysMetThr酮丁酸GlyAla谷氨酰胺合酶天冬氨酰半醛高絲氨酸氨基苯甲酸第24頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五細胞能量狀態指標
能荷=—————————
[ATP]+0.5[ADP][ATP]+[ADP]+[AMP][ATP][ATP][ADP]ATP系統質量作用比=第25頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五糖酵解與三羧酸循環途徑的調節丙酮酸
G細胞液檸檬酸乙酰CoA檸檬酸草酰乙酸-酮戊二酸乙酰CoA丙酮酸線粒體
G-6-P
F-6-PF-1.6-2P
磷酸果糖激酶
PEPADP+PiATPADP+PiATP
NADH
O2ATP
ADP+PiAMP+ATP2ADP
PiPi
PEP羧激酶+++---++----
己糖激酶
丙酮酸脫氫酶
檸檬酸合成酶-酮戊二酸
脫氫酶第26頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五
酶分子中的某些基團,在其它酶的催化下,可以共價結合或脫去,引起酶分子構象的改變,使其活性得到調節,這種方式稱為酶的共價修飾(Covalentmoldification
)。目前已知有六種修飾方式:磷酸化/去磷酸化,乙酰化/去乙酰化,腺苷酰化/去腺苷酰化,尿苷酰化/去尿苷酰化,甲基化/去甲基化,氧化(S-S)/還原(2SH)。激酶ATPADP磷酸化酶b(無活性)磷酸化酶aP(有活性)磷酸酯酶-OHH2OP例:糖原磷酸化酶的共價修飾共價修飾
第27頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五酶級聯系統調控示意圖意義:由于酶的共價修飾反應是酶促反應,只要有少量信號分子(如激素)存在,即可通過加速這種酶促反應,而使大量的另一種酶發生化學修飾,從而獲得放大效應。這種調節方式快速、效率極高。腎上腺素或胰高血糖素1、腺苷酸環化酶(無活性)腺苷酸環化酶(活性)2、ATPcAMPR、cAMP3、蛋白激酶(無活性)蛋白激酶(活性)4、磷酸化酶激酶(無活性)磷酸化酶激酶(活性)5、磷酸化酶b(無活性)磷酸化酶a(活性)6、糖原6-磷酸葡萄糖1-磷酸葡萄糖葡萄糖血液腎上腺素或胰高血糖素132102104106108葡萄糖ATPADPATPADP456第28頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五cAMP激活蛋白激酶的作用機理
第29頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五糖原合成酶和糖原磷酸化酶的調控
糖原的分解和合成都是根據肌體的需要由一系列的調控機制進行調控,其限速酶分別為糖原磷酸化酶和糖原合成酶。它們的活性是受磷酸化或去磷酸化的共價修飾的調節及變構效應的調節。二種酶磷酸化及去磷酸化的方式相似,但其效果相反。糖原合成酶a(有活性)糖原磷酸化酶b(無活性)OHOHATPADPH2OPi糖原合成酶b(無活性)糖原磷酸化酶a(有活性)PP第30頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五酶定位的區域化線粒體:丙酮酸氧化;三羧酸循環;-氧化;呼吸鏈電子傳遞;氧化磷酸化細胞質:酵解;磷戊糖途徑;糖原合成;脂肪酸合成;細胞核:核酸合成內質網:蛋白質合成;磷脂合成第31頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五動物細胞結構和代謝途徑第32頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五細胞膜結構對代謝的調節和控制作用
控制跨膜離子濃度梯度和電位梯度控制細胞和細胞器的物質運輸內膜系統對代謝途徑的分隔作用膜與酶的可逆結合第33頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五激素調節的機制1、含氮激素作用模式2、甾醇類激素作用模式第34頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五甾醇類激素作用原理示意圖第35頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五肽類激素通過cAMP-蛋白激酶調節代謝示意圖
ATP
cATP+PPi內在蛋白質的磷酸化作用改變細胞的生理過程細胞膜細胞膜cR蛋白激酶(無活性)c+RcATP蛋白激酶(有活性)受體環化酶激素G蛋白第36頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五一、原核和真核基因組二、原核生物酶合成調節的遺傳機制三、真核生物基因表達的調控第三節基因表達的調控第37頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五
基因(gene)是指DNA分子中的最小功能單位。包括RNA(tRNAr、rRNA)和蛋白質編碼的結構基因及無轉錄產物的調節基因。基因組(genome)是指某一特定生物單倍體所含的全體基因。原核細胞的“染色體”DNA分子就包含了一個基因組;而在真核細胞中則是指一套單倍染色體的的全部基因。原核和真核基因組第38頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五基因(gene)概念的發展1866年Mender建立遺傳兩大定律,提出遺傳因子的概念1903年Sutton&Boveri提出遺傳因子位于染色體上1909年Johansen提出基因概念,取代遺傳因子1910年Morgen建立基因假說,確認基因是確定性狀的功能單位1941年Beadle提出一個基因一個酶學說1944年Avery首次用實驗證實DNA是遺傳信息的載體1953年Watson&Crick確定DNA雙螺旋結構,進一步確定了基因的本質1957年Benzer提出順反子(cistron)學說,認為基因是分子的一段序列,負責遺傳信息的傳遞70年代發現基因包括有遺傳效應的外顯子(intron)和無效應的內含子(extron)第39頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五原核生物基因組的特點1、基因組小,單復制子,DNA分子上大部分是編碼蛋白質的基因,因此多數為單拷貝或僅有少量重復;2、功能相同的基因常串聯在一起,轉錄在同一個mRNA中(多順反子);3、有基因重疊,以此增加信息容量。真核生物基因組的特點1、基因組大,有多個復制子;mRNA為單順反子;2、有大量重復序列,根據重復次數可分為:
單拷貝序列,主要編碼蛋白質,數量多,但含量少
中度重復序列,可重復幾十到幾千次,編碼tRNA、rRNA和表達量大的蛋白質高度重復序列,可重復幾百萬次,不編碼,有高度變異性,可作指紋圖譜分析3、有斷裂基因,即基因中有外顯子區和內含子區,轉錄后經剪切去掉內含子后才成為可翻譯的mRNA模板或功能rRNA。4、DNA上有多數不編碼序列,在基因表達調控中起重要作用。第40頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五操縱子——原核基因表達的協同單位操縱子結構基因(編碼蛋白質,S)控制部位操縱基因(operator,O)啟動子(premotor,P)酶誘導和阻遏的操縱子模型合成途徑操縱子的衰減作用原核生物酶合成調節的遺傳機制
操縱子學說
第41頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五酶的誘導和阻遏操縱子模型B.有活性阻遏蛋白加誘導劑A.有活性阻遏蛋白C.無活性阻遏蛋白D.無活性阻遏蛋白加輔阻遏劑操縱基因啟動基因調節基因結構基因
阻遏蛋白(有活性)阻遏蛋白阻擋操縱基因結構基因不表達誘導物誘導物與阻遏蛋白結合,使阻遏蛋白不能起到阻擋操縱基因的作用,結構基因可以表達酶蛋白mRNA阻遏蛋白不能跟操縱基因結合,結構基因可以表達阻遏蛋白(無活性)酶蛋白mRNA代謝產物與阻遏蛋白結合,從而使阻遏蛋白能夠阻擋操縱基因,結構基因不表達代謝產物第42頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五大腸桿菌乳
糖
操
縱
子
模型調節基因操縱基因乳糖結構基因PLacZLacYLacamRNA
阻遏蛋白(有活性)基因關閉啟動子ORPLacZLacYLaca調節基因操縱基因乳糖結構基因啟動子ORmRNAZmRNAYmRNAa
阻遏蛋白(無活性)基因表達mRNAA、乳糖操縱子的結構
B、乳糖酶的誘導
乳糖
阻遏蛋白(有活性)第43頁,共48頁,2022年,5月20日,11點4分,星期五乳糖操縱子的降解物阻遏RLacZLacYLacamRNAmRNAZmRNAYmRNAa基因表達CAP基因結構基因TCGP(CAP)OCAP結合部位RNA聚合酶TcAMP-CAPP葡萄糖分解代謝產物腺苷酸環化酶磷酸二酯酶ATPcAMP5'-AMP抑制激活葡萄糖降解物與cAMP的關系cAMPCGP:降解物基因活化蛋白(catabolicgeneactivationprotein)
CAP:環腺苷酸受體蛋白(cycilicAMPrece
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