好文章 三要素 張輝中山大學(xué)人類病毒學(xué)研究所Email zhangh92 1 SCI Sciencecitationindex 由美國科學(xué)信息研究所 ISI 1961年創(chuàng)辦出版的引文數(shù)據(jù)庫SCI 科學(xué)引文索引 EI 工程索引 ISTP 科技會(huì)議錄索引 是世界著名的三大科技文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)SCI論文 在SCI所收錄的科學(xué)期刊上發(fā)表的論文 2 影響因子 impactfactor IF 指的是某一期刊的文章在特定年份或時(shí)期被引用的頻率 是衡量學(xué)術(shù)期刊影響力的一個(gè)重要指標(biāo) 計(jì)算方式 某雜志2008年的IF 2006 2007兩年論文在2008年被引總數(shù) 除以在2006 2007兩年所發(fā)論文總數(shù) 3 雜志的IF愈高 品牌效應(yīng)愈大 審稿更嚴(yán)格 投稿難度愈大但是 發(fā)表在IF高的雜志 不見得學(xué)術(shù)價(jià)值就大 單篇學(xué)術(shù)論文的引用頻率更重要 引用頻率愈高 其學(xué)術(shù)價(jià)值愈大 所發(fā)雜志的IF高 單篇的引用頻率也高 就是最有價(jià)值的論文 也不見然 4 IF 5 6Citations 40 5 6 一篇SCI學(xué)術(shù)論文的產(chǎn)生流程 提出假說實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) 預(yù)實(shí)驗(yàn)全面展開實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析論文寫作與修改送出發(fā)表補(bǔ)充實(shí)驗(yàn)和回答審稿人的問題 至少3月 一般半年 可達(dá)1 2年 Read Hardwork Pray 自己掌握時(shí)間 第一階段 第二階段 第三階段 7 好文章三要素1 好主意 Goodidea 2 有邏輯的結(jié)構(gòu) Logicstructure 3 精美的數(shù)據(jù) Beautifuldata 8 1 好主意 假說 眼光 Vision 知識面 Knowledge 靈感 Inspiration 機(jī)遇 Chance 計(jì)算 Calculation 勇氣 Courage 新穎性和意義 Noveltyandsignificance 9 1 眼光 Vision 洞察力手握水晶球預(yù)見未來的能力預(yù)知本學(xué)科發(fā)展的方向既考導(dǎo)師也考你 諾查丹瑪斯的預(yù)言李淳風(fēng)與袁天罡的推背圖劉伯溫的燒餅歌 10 2 靈感 Inspiration 鬼點(diǎn)子 腦筋急轉(zhuǎn)彎 多與導(dǎo)師 同學(xué)討論 互相啟發(fā) 真理面前 人人平等 11 3 知識面 Knowledge 本行 熟讀唐詩三百首 不會(huì)作詩也會(huì)吟 他行 他山之石 可以攻玉 不相關(guān) 功夫在詩外 尤其是要緊跟本行中的最新進(jìn)展 積極追蹤時(shí)尚元素 12 讀文獻(xiàn)十問 1此文解決了什么問題 2你能用一句話概括此文的中心思想嗎 3此文的logicflow清楚嗎 試簡述之4此文最重要 最創(chuàng)新的的圖表 數(shù)據(jù) 是哪一個(gè) 5此文最切合主題圖表 數(shù)據(jù) 是哪一個(gè) 此文最大的紕漏是什么 若你是此文的第一作者 你下一步干嘛 哪個(gè)圖表最值得你學(xué)習(xí)和效仿 9有值得你學(xué)習(xí)的實(shí)驗(yàn)方法嗎 10你最欣賞哪句英語 Journalclub上要回答的問題 13 4 機(jī)遇 Chance Chancefavorsthepreparedmind機(jī)遇偏愛有準(zhǔn)備的頭腦 巴斯德 14 什么是 有準(zhǔn)備的頭腦 1 有足夠的知識面2 有所需的技術(shù)3 正在從事類似的工作 位置站得不錯(cuò) 4 完成了前期工作 打伏擊戰(zhàn) 15 16 Nature July2002 Nature May2003 17 November2003 18 19 20 5 計(jì)算 Calculation 自己 對手 時(shí)間 資源 風(fēng)險(xiǎn) 知己知彼 百戰(zhàn)不殆 孫子夫未戰(zhàn)而廟算勝者 得算多也 未戰(zhàn)而廟算不勝者 得算少也 多算勝 少算不勝 而況于無算乎 孫子凡事預(yù)則立 不預(yù)則廢 禮記 中庸 21 6 勇氣 Courage 若你的發(fā)現(xiàn)是真的 而你所從事的工作又在熱點(diǎn)上 那你就有競爭者 idea愈好 競爭愈烈 本人因此 要有強(qiáng)烈的競爭意識和危機(jī)感 兩軍相逢勇者勝 劉伯承 古代劍客們 在與對手狹路相逢時(shí) 無論對手有多么強(qiáng)大 就算對方是天下第一劍客 明知不敵 也要亮出自己的寶劍 即使倒在對手的劍下 也雖敗猶榮 這就是亮劍精神 李云龍 若遇到可發(fā)CNS文章的課題 哪怕不吃不喝 睡在實(shí)驗(yàn)室 也要把工作盡早完成 AnunknownPhDstudent 22 2 結(jié)構(gòu) Logicstructure 23 編一個(gè)完整的故事 Makeaperfectstory 組織你的數(shù)據(jù) 從生化實(shí)驗(yàn) 動(dòng)物實(shí)驗(yàn) 到臨床實(shí)驗(yàn) 做實(shí)驗(yàn)的順序和論文的順序會(huì)大不相同 24 邏輯流 Logicflow 內(nèi)涵與外延 因果 判斷和推理等等 學(xué)一點(diǎn)形式邏輯 25 每張圖表 每個(gè)數(shù)據(jù)的重要性是不一樣的 骨骼與肌肉的關(guān)系 26 搶先回答別人可能的問題 27 3 精美的數(shù)據(jù) Beautifuldata 28 對照 Control Control Control 29 叫人印象深刻的發(fā)現(xiàn) Impressivefindings 30 多重驗(yàn)證 同一結(jié)果 兩種以上的方法證實(shí) 公認(rèn)的技術(shù)驗(yàn)證 31 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析樣本量統(tǒng)計(jì)方法說服你自己 32 問泉那得清如許為有源頭活水來 實(shí)驗(yàn)生物學(xué)家 Experimentalbiologist 是手巧的工匠 更是思想家 33 34 BiochemicalPurificationandIdentificationofAPOBEC3G AssociatedProteinsbyTandemPurificationAssay TAP 35 腦筋急轉(zhuǎn)彎 MicroRNA有可能抑制了HIV 1什么環(huán)節(jié) 而且有重大意義 在潛伏感染時(shí) HIV 1的蛋白表達(dá)明顯減少 是不是由于miRNA抑制所致 36 GenomicDNA PolII Drosha Exportin5 Dicer Pri miRNA Pre miRNA miRNA TargetmRNA protein miRISC P body GenerationandfunctionofmicroRNA 37 HIV 1的生活周期 結(jié)合受體 膜融合和進(jìn)入 反向轉(zhuǎn)錄 入核和整合 轉(zhuǎn)錄 出核 裝配 翻譯 出芽 成熟 RNA DNA 前病毒 RNA 病毒蛋白質(zhì) 病毒顆粒 38 HIV 1latencyPre integrationlatency APOBEC3Gcouldplayakeyrole Post integrationlatency ThemajorHIV 1reservoirinthepost HAARTera 39 RestingCD4T cells ActivatedorincompletedactivatedCD4T cells Activation Formationofpost integrationHIV 1latency Nostimulation 40 MechanismofHIV 1post integrationlatencyTranscriptionalinefficiencyNF kB NFAT CDK9 CyclinT1TatproteinPost transcriptionalsuppressionRev 41 AdaptedfromHanandSiliciano NatureMedicine2007 13 1138 40 42 Furtado M R etal NEJM 340 1614 22 1999 Chun T W etal PNAS 100 1908 13 2003 Lassen K G etal PLoSPathog2 e68 2006 Zhang L etal NEJM 340 1605 13 1999 Patterson B K etal AIDS 15 1635 41 2001 Latently infectedrestingCD4T cellsharborvariousviralRNAs Incompletedtranscript Multiple splicedRNA UnsplicedRNA IntegratedviralDNA 43 vpr RRE LTR vif pol env vpu nef gag 1 9 Kb 7261 9172nt A 7261 7960nt B 7961 8351nt C 8291 8691nt D 8631 8981nt F 9047 9172nt LTR E 8921 9046nt tat rev 1 2 Kb 7961 9172nt HIV 1RNAgenomeandits3 UTR 3 UTRsharedbymostHIV 1RNAs 44 pCMV pA eGFP FragmentsofHIV 13 UTR NucleofectionwithAMAXA RestingCD4T cells 45 RelativeGFPMFI 骨干數(shù)據(jù) 46 IsolationofrestingprimaryCD4T lymphocytes RestingCD4 Tcells ActivatedCD4 Tcells CD25 CD69 47 CD25 CD69 CFSE RestingCD4Tcells RestingCD4Tcells combinedanti mirs RestingCD4Tcells pNL4 3 RestingCD4Tcells pNL4 3 anti mirnegctl RestingCD4Tcells pNL4 3 combinedanti mirs ActivatedCD4Tcells pNL4 3 TheanalysisofcellproliferationstatusofrestingCD4T cellstransfectedwithpNL4 3andanti microRNAinhibitors 48 49 MiRNAarrayanalysistocomparecellularmiRNAsinrestingandactivatedCD4T cells 50 PutativebindingsitesforrestingCD4T cell enrichedcellularmiRNAs B5 D3 D9 F3 51 ConfirmtheenrichmentofseveralcellularmiRNAsinrestingCD4T lymphocytesby stem loop RT PCR 52 NL4 3 nt9097 5 AUCUG AGCCUGGGAGCUCUC 3 llllllllllllllmir 283 GAGUUAUCUGACACUCGAGGAA 5 NL4 3 nt8096 5 ACGAGGAUUGUGGAACUUCUGGGACGCAGGGG 3 lllllllllllllllmir 125b3 AGUGUUCAAU CCCAGAGUCCCU 5 NL4 3 nt8957 5 UCGAGCUUGCUACAAGGGACUUU 3 lllllllllllllllllllmir 3823 GCUUAGGUGGUGCUUGUUGAAG 5 NL4 3 nt8113 5 UCUGGGACGCAGGGGGUGGGAA 3 llllllllllllllllmir 1503 GUGACCA UGUUCCCAACCCUCU 5 NL4 3 nt8720 5 AGGGGUCA GAUAUCCACUGACC 3 lllllllllllllllmir 2233 CCCCAUAAACUGUU UGACUGU 5 InteractionofcellularmiRNAsandtheirtargetsinthe3 endofHIVRNA 53 mir 125b GFP GGTTAGACCAGATCTGAGCCTGGGAGCTCTC GFP GGTTAGACCAGATCTGAGCCTGGTCTATCTC mir 28 GFP ACGAGGATTGTGGAACTTCTGGGACGCAGGGG GFP ACGAGGATTGTGGAACTTCTGGGACGACTTTT GFP GTGGAACTTCTGGGACGCAGGGGGTGGGAA GFP GTGGAACTTCTGGGACGCAGGGGGTGTTCC mir 150 GFP CACCAGGGCCAGGGGTCAGATATCCACTGACC GFP CACCAGGGCCAGGGGTCAGATATCCAAGTCAA mir 223 GFP CTGCTGACATCGAGCTTGCTACAAGGGACTTT GFP CTGCTGACATCGAGCTTGCTACAAGGTCAGGG mir 382 F5mF5B13mB13B12mB12D10mD10D11mD11 Mutationsinthe seed sequences 54 Mutationsin seed sequenceeliminatethemiRNA mediatedinhibition 骨干數(shù)據(jù) 55 Ago Agocleavespassengerstrand TwostrandsaredissociatedbyanRNAhelicase Agoloading BindtotargetmRNA Removepassengerstrand miRNA Antisenseinhibitor 2 O methyl oligonuceotides Translationinhibition 56 EffectofantisenseinhibitorontheGFPexpressionofpGFP 1 2kb 57 HIV 1infectiousclone Nucleofection AsimpleHIV 1latencymodel TransduceHIV 1infectiouscloneintothenucleusofrestingCD4T cellswithAMAXA miRNA 58 CD25 CD69 CFSE RestingCD4Tcells RestingCD4Tcells combinedanti mirs RestingCD4Tcells pNL4 3 RestingCD4Tcells pNL4 3 anti mirnegctl RestingCD4Tcells pNL4 3 combinedanti mirs ActivatedCD4Tcells pNL4 3 TheanalysisofcellproliferationstatusofrestingCD4T cellstransfectedwithpNL4 3andanti microRNAinhibitors 59 HIV 1mRNAexpressionintheCD4T cellstransfectedwithpNL4 3 60 InductionofHIV 1productionfromtherestingCD4T cellstransfectedwithpNL4 3 61 EffectofmiRNAantisenseinhibitorsonHIV 1productionfromrestingCD4T cellstransfectedwithpNL4 3 骨干數(shù)據(jù) 62 63 HIV 1copynumbers 5 0005005050 No 1No 2