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文檔簡介
名詞解釋基因:DNA分子上含有特定遺傳信息的一段核苷酸序列,是DNA上的特定功能單位和遺傳單位。轉座:由可移動的DNA序列(插入序列和轉座子)介導的基因移位或重排轉座子:染色體DNA上能夠自主復制并移動位置的基本單位RNA選擇性剪接:指用不同的剪接方式從一個mRNA前體產生不同mRNA剪接異構體的過程。可分為平衡剪切、5’選擇性剪切、3’選擇性剪切、外顯子遺漏型剪切及相互排斥性剪切。基因打靶:利用DNA同源重組原理,在基因組中的某一特定部位進行定點的基因重組,是研究基因的功能的有效手段。包括基因敲除和基因敲入原位雜交:利用標記探針與細胞、組織或染色體水平上通過雜交對DNA或RNA進行定位和相對定量研究的一種手段。核小體:染色體的基本結構單位,由DNA和5種組蛋白共同構成,真核生物DNA在細胞內的初級組裝就是形成核小體,其長度被壓縮了7倍蛋白質組學:在蛋白質水平研究基因組的基因表達,分析基因組的蛋白質類型、空間結構變異以及相互作用的機制。RNAi(RNA干擾):外源RNA介導產生轉錄沉默復合物,引起特異RNA降解的基因轉錄后表達調控岡崎片段:在DNA復制過程中產生的中間產物,長度為1000-2000bp,能夠轉變為成熟的DNA鏈,在DNA隨后鏈合成中起作用轉基因動物:應用轉基因技術培育出的攜帶外源基因的動物,是通過gainoffunction途徑研究基因功能的重要手段核心啟動子:保證RNA聚合酶Ⅱ轉錄正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括轉錄起始位點及轉錄起始位點上游-30~-25bp處的TATA盒。上游啟動元件:真核基因的啟動子在-35~-25區含有TATA序列,將該區上游的保守序列稱為上游啟動元件增強子:能使與它連鎖的基因轉錄頻率明顯增加的DNA序列反義RNA:能與特異基因的mRNA互補結合的RNA,抑制蛋白質的合成信號肽:在起始密碼子之后的一段編碼疏水性氨基酸序列的RNA區域,負責把蛋白質引導到細胞內的不同膜結構的亞細胞器內熱休克蛋白:為一類應激反應性蛋白,包括HSP70,HSP40,GrpE三個家族,能夠幫助其他多肽進行正確的折疊、組裝、轉運、降解,為分子伴侶的一類C值:通常是指一種生物單倍體基因組DNA的總量操縱子:原核生物功能相關的基因串聯地排列在一起,在一個共同的調控區的調節下,一起轉錄生成一個多順反子,最終表達產物是一些功能相關的酶或蛋白質,它們-起參與某種底物的代謝或某種產物的合成。把這些基因及其調控序列構成的轉錄單位稱為操縱元反式作用因子:為DNA結合蛋白,核內蛋白,可使鄰近基因開放(正調控)或關閉(負調控)順式作用元件:影響表達活性的DNA序列,屬于非編碼序列,分啟動子、增強子、沉默子等
符號SNP單核苷酸多態性RACEcDNA末端快速擴增SAGE基因表達系列分析FISH熒光原位雜交HSP熱休克蛋白ORF可譯框架STS序列標記位點EMSA凝膠滯緩實驗SSB單鏈結合蛋白YAC酵母人工染色體載體HGP人類基因組計劃簡答1、真核生物基因組DNA特征(1)真核生物基因組DNA與蛋白質結合形成染色體,儲存于細胞核內,除配子細胞外,體細胞有兩份同源的基因組。(2)真核細胞基因轉錄產物為單順反子,即一個結構基因轉錄、翻譯成一個mRNA分子,合成一條多肽鏈。(3)存在大量重復序列,重復序列長度可長可短,短的僅含兩個核苷酸,長的多達數百、乃至上千。重復頻率也不盡相同(4)基因組中不編碼的區域多于編碼區域。(5)基因不連續,真核生物結構基因的內部存在許多不編碼蛋白質的間隔序列,稱為內含子,編碼區則稱為外顯子。(6)基因組遠大于原核生物的基因組,具有許多復制起點,而每個復制子的長度較小2、PCR技術原理與反應體系(1)定義:PCR是根據DNA復制的原理,在體外利用酶促反應獲得特異序列的基因組DNA或cDNA的專門技術(2)反應體系:模板DNA、特異性引物、DNA聚合酶、dNTP及含有Mg2+的緩沖液。(3)原理:①變性:將雙鏈DNA分子在臨近沸點的溫度下加熱分離成兩條單鏈DNA分子②退火:溫度降低,特異性引物與單鏈DNA分子結合③延伸:DNA聚合酶以單鏈DNA為模板并利用反應混合物種的四種dNTP合成新生的DNA互補鏈④變性、退火、延伸三步不斷重復,多次循環之后,反應混合物中所含的雙鏈DNA數理論最高值為2n3、色氨酸操縱子調控基因表達的機制(1)色氨酸操縱子的調節效應:當有足夠的色氨酸時,操縱子自動關閉。細菌直接利用外界的Trp。缺乏Trp時,色氨酸操縱子被打開,5個結構基因表達,產生3個酶催化分支酸合成為色氨酸。(2)色氨酸操縱子的結構:①合成色氨酸所需要酶類的5個基因E、D、C、B、A頭尾相接串連排列組成結構基因群;②結構基因受其上游的啟動子P和操縱子o的調控;③調控基因trpR的位置遠離P-o-結構基因群,低水平表達調控蛋白R。(3)色氨酸操縱子的調控包括阻遏蛋白的負調控和弱化調控①阻遏蛋白的負調控:當培養基中缺乏色氨酸時,調節基因表達產物——阻遏蛋白與操縱序列結合阻止RNA聚合酶對結構基因區轉錄②弱化調控:a.結構:前導序列包括起始密碼子和終止密碼子,其后半段含有A、B和C,在被轉錄生成mRNA時能形成發夾結構。當A形成發夾結構時,B就不能形成發夾結構,卻有利于C生成發夾5、類固醇激素調節基因轉錄,基因組DNA上由類固醇激素的效應元件6、熱休克蛋白使某些能自發折疊的蛋白質正確折疊形成天然空間構象7、DNA損傷:堿基脫落、堿基修飾、交聯、鏈的斷裂、充足;修復機制包括錯配修復、切除修復、重組修復、以及DNA直接修復和SOS修復8、核小體是染色體的基本構成單位,其核心顆粒由組蛋白八聚體和大約140bp的DNA組成9、人類基因組四張圖:物理圖、遺傳圖、轉錄圖、全序列圖10、DNA復制的引發體是RNA引物;PCR的引物是特異性單核苷酸11、轉錄過程中關鍵酶是RNA聚合酶12、RNA提取過程中的困難是RNA酶活性高且無處不在13、原核RNA聚合酶組成:RNA聚合酶Ⅰ存在于核仁中,轉錄rRNA順序;RNA聚合酶Ⅱ存在于核質中,轉錄大多數基因,需要“TATA”框;RNA聚合酶Ⅲ存在于核質中,轉錄很少14、可被磷酸化修飾的氨基酸殘基:絲氨酸/組氨酸型,酪氨酸型,組氨酸型15、σ因子作用:模板鏈選擇和轉錄起始;核心酶負責RNA鏈的延伸16、基因表達分成組成型表達和調節型表達17、轉座可分為復制型轉座和非復制型轉座,轉座子分為插入序列轉座和復合型轉座子18、基因敲除可分為完全型敲除和條件型敲除19、基因表達調控有正調控和負調控,原核生物采用負調控,真核生物多采用正調控20、mRNA具有5’端帽子結構和3’端尾巴結構,功能是為蛋白質提供模板21、質粒在細胞內的復制有緊密控制型和松弛控制型兩種22、基因表達特異性:時間特異性和空間特異性23、限制性內切酶水解DNA在3’,5’-磷酸二酯鍵,DNA連接酶作用形成3’,5’-磷酸二酯鍵24、原核生物轉錄終止機制:非ρ因子依賴的自動終止,依賴ρ因子的終止25、rRNA的化學修飾主要是甲基化,原核生物rRNA堿基甲基化,真核生物rRNA核糖甲基化26、反式作用因子分為通用轉錄因子和特異轉錄因子,三個功能結構域是:DNA識別結合域、轉錄活性域、結合其他蛋白的結合域;作用是能識別并結合順式作用元件,正調節或負調節27、密碼子特點:擺動性、簡并性、通用性、連續性;反密碼子與密碼子配對依據是擺動學說28、與O序列結合:
Lac阻遏蛋白;與P序列結合:RNA聚合酶;與CAP結合:環一磷酸腺苷;與CAP位點結合:CAP-cAMP29、rRNA:真核:5s、5.8、18、28;原核:5、16、2330、核糖體有3個tRNA結合位點,分別是A、P、E位點。A:新到來的氨酰-tRNA的結合位點;P:肽酰-tRNA的結合位點;E:延伸過程中的多肽鏈轉移到氨酰-tRNA上釋放tRNA的位點31、翻譯起始:帽子識別結構:甲酰蛋氨酸
【補充】1、原核DNA特征(1)只有一條染色體且大都帶有單拷貝基因,只有少數基因以多拷貝形式存在(2)整個染色體DNA幾乎全部由功能基因與調控序列組成(3)幾乎每個基因序列都與它所編碼的蛋白質序列呈線性相關2、真核DNA復制的特點(1)真核生物DNA復制的特點(2)有多處復制起始點;(3)在全部完成復制之前,各個起始點上DNA的復制不能再開始;(4)DNA復制只在S期進行。(5)復制子相對較小,為40-100千堿基對。3、原核生物和真核生物mRNA的比較原核生物真核生物無需轉錄后加工需要轉錄后加工,前體是hnRNA轉錄和翻譯在同一細胞空間且同時進行合成和表達在不同的時空范疇半衰期短半衰期較短以多順反子的形式存在以單順反子的形式存在5’端無帽子結構,3’端無尾巴結構5’端有帽子結構,3’端有尾巴結構填空1、DNA二級結構分為兩大類:右手螺旋A-DNA、B-DNA;左手螺旋Z-DNA2、SSB蛋白作用:保持單鏈存在,沒有解鏈作用3、原核生物一種RNA聚合酶負責所有mRNA、tRNA、rRNA的合成,真核生物有三類RNA聚合酶4、轉錄:模板識別、轉錄起始、延伸、終止5、真核生物結構基因的轉錄產物時單順反子6、在DNA重組技術中,最常用到的原核生物載體是質粒7、真核DNA復制的起始點被稱為ARS(自主復制序列),ORC(起點識別結合物)結合于ARS,由6中蛋白質組成8、C值隨生物進化而增加,但與種系進化復雜程度不一致9、由阻遏蛋白介導的調控方式為負性調控10、基因表
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