生物信息學智慧樹知到期末考試答案+章節答案2024年華東理工大學LINUX不支持多個程序同時并獨立的運行。

答案:錯兩個蛋白質序列相似性超過30%就是同源蛋白。

答案:錯在代謝組學分析中，PLS-DA（偏最小二乘判別分析分析）是一種有監督方法，需要事先確定樣品所屬的類別。

答案:對同源性是指一種很直接的數量關系，需實驗驗證。

答案:錯流平衡分析生成的代謝矩陣S中，反應物的系數表示為正值，產物的系數表示為負值。

答案:錯代謝網絡模型分為（）模型、（）模型和（）模型等三個層次。

答案:動力學模型###計量模型###調控模型在全基因組代謝網絡構建時，一個代謝反應只能由一種酶催化。

答案:錯下面各種相互作用中，哪些屬于大分子間相互作用？

答案:蛋白-蛋白相互作用###基因-蛋白相互作用利用實驗手段獲得蛋白質等生物大分子三維結構的方法有哪些？

答案:X射線衍射###核磁共振###冷凍電鏡美國政府于1990年10月啟動被稱為生命科學“登月計劃”的人類基因組計劃,預期到2005年完成人類基因組大約（）億個堿基的全序列測定。

答案:30下面哪些代謝物組分析方法不需要有樣品的類別信息？

答案:主成分分析###層次聚類法13C代謝通量分析中，如果測量谷氨酸同位素豐度，最多能測量出幾種同位素異構體的信息？

答案:32人類基因組計劃中，中國參與了（）%的測序工作？

答案:1生物信息學產生的背景源于美國政府于1990年10月啟動的（）計劃。

答案:人類基因組計劃在蛋白質功能預測中，通過比對數據庫相似性序列確定功能的原則是：超過（）個氨基酸的區段至少有25%相同為顯著匹配。

答案:80除了人工審核注釋的蛋白質序列數據庫，以下哪個數據庫中收錄了由計算機翻譯或模擬獲得的蛋白質序列數據？

答案:TrEMBL分子動力學模擬通過求解（）來模擬分子體系的運動，獲得體系內原子的運動軌跡。

答案:牛頓力學方程綜合考慮準確性和計算速度，目前常用于對未知序列進行數據庫相似性搜索的算法屬于以下哪種？

答案:Fasta或Blast利用X射線衍射、核磁共振、冷凍電鏡等技術獲得的生物大分子結構，存儲于下列哪個生物大分子結構數據庫？

答案:PDBDavidBaker是研究蛋白質晶體結構解析的領軍人物。

答案:錯生物信息學就是“干”的實驗科學，所有的研究結論從計算和預測中來，于“濕”實驗中得到驗證。

答案:對在全基因組代謝網絡構建時，一種酶只能催化一個代謝反應。

答案:錯在代謝組學分析中，PCA（主成分分析）是一種有監督方法，需要事先明確樣品所屬類別。

答案:錯生物信息學研究任務之一包括SNP的發現和鑒定，對于疾病機理和藥物開發靶點發現具有重要意義。

答案:對同源序列（Homolog）根據在同種屬和不同種屬可再分為直向同源序列（Ortholog）和旁系同源序列（Paralog）。

答案:對局部比對用于比較相似性程度較高的兩個序列的比對，找出兩個序列全長的最優比對結果。

答案:錯利用分子對接方法可以預測獲得蛋白質和小分子的復合物結構。

答案:對代謝組學能夠更準確地反映生物體系的狀態，基因組學和蛋白質組學告訴你什么可能會發生，而代謝組學則告訴你什么確實發生了。

答案:對網絡可以分為有向網絡和無向網絡，生物網絡都是無向網絡。

答案:錯分子動力學模擬是解析蛋白質結構功能關系的重要手段之一，其主要理論基礎是求解牛頓力學方程。

答案:對國際核酸數據庫由EMBL，DDBJ和GenBank組成，它們在1988年形成國際核酸數據庫聯合中心，對數據進行

答案:數據同步更新###數據格式相同###三方共享下面哪類生物分子屬于小分子物質？

答案:氨基酸###抗生素全基因組代謝網絡模型可用于哪些方面研究？

答案:預測基因操作靶點###估算代謝通量分布###分析基因對生長的重要性分子動力學模擬通過求解牛頓力學方程模擬分子體系的運動，獲得體系內原子的運動軌跡。

答案:對代謝物組學數據具有什么特點？

答案:相互作用關系復雜###高噪聲###高變異性###高維、小樣本隨著生物信息學的誕生及應用，今后生物學研究項目的起點將是理論的，一位科學家將從理論推測開始，然后才轉向實驗去追蹤或檢驗該假設。

答案:對全基因組代謝網絡模型可整合基因組、蛋白組、代謝物組和代謝通量組等多組學數據，為全面了解細胞功能提供了便利條件。

答案:對分子對接的兩個理論基礎模型是（）模型和（）模型。

答案:誘導契合模型###鎖鑰模型分子鐘是用高度保守的核酸或蛋白質分子變異程度來度量時間的一個尺度。

答案:對IluminaSolexa測序技術的技術缺點是不能測定很長的序列，其根本原因在于

答案:難以做到所有反應隨著時間和測序長度的平齊性：###DNA聚合酶隨著反應時間效率的衰減對生物體系代謝產物的分析可分為哪幾個層次。

答案:代謝指紋分析###代謝靶標分析###代謝輪廓分析###代謝組分析序列比對根據比對的計算方法可以分為（）比對和（）比對。

答案:全局序列比對###局部序列比對生物學工作者向Genbank數據庫提交大量序列或較復雜序列的獨立程序是（）。

答案:Sequin在蛋白質功能預測中，通過比對數據庫相似性序列確定功能的原則是：超過80個氨基酸的區段至少有（）相同為顯著匹配。

答案:25%二代測序技術平臺因為采用大規模平行測序思路，可以用于統計學分析，因此有很多應用領域

答案:ChIP-seq###sRNA-seq###RNA-seq###Tnseq哪種組學數據不能通過儀器直接測量出來，只可通過計算得到？

答案:代謝通量組如果要構建進化樹，首先需要對序列進行。

答案:多序列比對IluminaSolexa測序技術的核心步驟是邊測序邊合成(SBS)，其中每一步加入一種熒光標記以及修飾過的堿基，其目的在于（）：

答案:阻斷擴增反應二代測序技術技術總體特征不包括的是：

答案:熒光拍照生物信息學的研究目標：以（）和（）等生物大分子數據為主要對象。

答案:核酸###蛋白（）是NCBI提供的集成檢索工具，通過一次檢索可查詢NCBI多個子數據庫中的相關信息。

答案:Entrez在核酸數據庫中比對核酸序列，需要選擇一下那種blast模式？

答案:blastn當目標蛋白質和模板蛋白的序列比對完成后，同源建模方法如何對目標蛋白的主鏈結構進行建模？

答案:根據結構保守區將模板結構的坐標直接拷貝到目標蛋白中生物信息學方法識別基因主要的兩個途徑：基因組外顯子識別和EST策略，其中人類基因組（）序列均可用前者預測，但基因的完整預測準確性僅20%。

答案:90%生物序列數據庫包括核酸序列數據庫和蛋白序列數據庫，以下哪個不屬于蛋白質序列數據庫？

答案:OMIM截止到2019年5月，我國運算速度最快的超算是以下哪個？

答案:神威太湖之光能統籌兼顧準確性和計算量的分子對接算法是一下哪種？

答案:半柔性對接一般情況下，序列一致性需高于多少，同源建模預測得到的三維結構被認為是可靠的？

答案:30%在各種代謝物組學分析方法中，哪種方法不需要識別出化合物？

答案:代謝指紋分析生物序列常使用的序列文件格式為（），是最簡單的格式，第一行以“>”表示一個序列的開始。

答案:FASTA合成生物學的研究內容包括：合成代謝網絡、遺傳/基因線路的設計與構建、細胞群體系統及多細胞系統研究、數學模擬和功能預測。

答案:對R語言中，需要安裝軟件包時需要調用的命令是（）？

答案:install.packages()在代謝網絡中，每一個節點代表一個（）？

答案:代謝物Linux是一款免費的操作系統，用戶可以通過網絡或其他途徑免費獲得，并可以任意修改其源代碼。

答案:對Linux系統非常獨立，不能在Windows下運行Linux環境。

答案:錯利用R可以繪制并分析基因芯片數據的火山圖來顯示差異基因及p-value。

答案:對R是生物信息分析中非常重要的工具，可以實現以下哪些功能？

答案:測序數據分析###生態學數據分析###進化樹分析###聚類分析在生物信息學研究中使用Linux系統的優勢在于？

答案:Linux系統支持集群計算機的使用###Linux系統支持多種平臺，并且不斷更新###Linux系統是科學研究的通用平臺###Linux系統是免費的以下哪些屬于生物網絡？

答案:蛋白質互作網絡###基因調控網絡###代謝網絡###信號轉導網絡系統生物學是在系統層面上研究生命現象的一門學科，最基本的模型是網絡模型。

答案:對全基因組代謝網絡模型是基于基因-蛋白-代謝反應三者之間的對應關系建立起來的？

答案:對代謝物組分析可在代謝靶標分析、代謝物譜分析和代謝指紋分析三個層次上開展。

答案:對在主成分分析中，兩個樣品在得分圖上的距離越近，它們屬于同一類別的可能性就越大。

答案:對流平衡分析不但考慮了代謝反應的化學計量信息，也包含了代謝反應的調控信息。

答案:錯下面哪些方法可用在代謝物組學分析中應用？

答案:質譜法###核磁共振法###光譜法下面哪些測量值可作為流平衡分析的約束條件？

答案:產物生成速率###同位素豐度代謝網絡研究所建立的模型可分為計量模型、調控模型和動力學模型三種。

答案:對常用的代謝物分離方法包括哪些？

答案:液相色譜法###氣相色譜法###毛細管電泳法代謝物組研究的對象是什么？

答案:內源性化合物13C代謝通量分析中，測量丙氨酸同位素豐度時，最多能測量出幾種同位素異構體的信息？

答案:8PDB數據庫中同時包含了利用實驗解析和計算模擬的生物大分子的三維結構信息。

答案:錯分子對接可以分為哪幾種類型？

答案:半柔性對接###剛性對接###柔性對接以下哪項參數無法通過一級序列的理化性質計算獲得？

答案:進化關系分子動力學模擬可以獲得蛋白質在溶液中一段時間內的運動情況，但是消耗計算資源。

答案:對以下分子力場中，不屬于非鍵作用的是（）？

答案:鍵的伸縮蛋白質三維結構預測的方法包括哪些？

答案:同源建模###折疊識別###從頭預測以下關于同源建模的說法中，表述錯誤的是（）？

答案:同源建模時只能選擇一個結構作為模板來建模疏水作用力是蛋白質折疊的主要驅動力，氨基酸親疏水性等分析為高級結構預測提供參。

答案:對UniProt數據庫整合了哪三大數據庫資源？

答案:PIR-PSD###Swiss-Prot###TrEMBL利用計算手段預測的蛋白質三維結構能達到很高的準確性，不需要再進行優化了。

答案:錯IluminaSolexa測序技術的技術缺點是不能測定很長的序列，其根本原因在于PCR擴增摻入堿基時，難以做到所有反應隨著時間和測序長度的平齊性。

答案:對二代測序技術技術總體思路是統計學（大量重復）、分子生物學（如PCR和連接反應）和微液滴/微流控化學反應

答案:對二代測序技術平臺包括

答案:IlluminaSolexa###454平臺IluminaSolexa對測序對象進行測序時需要采用P5和P7引物進行擴增，其目的是與芯片中植入的寡核苷酸進行配對，從而固定到芯片上，為后續邊測序邊合成打下良好基礎。

答案:對與IlluminaSolexa相比，454測序技術平臺的缺點是熒光試劑成本高，而且會產生相同堿基的連續摻入。

答案:對基因結構的預測是基因組測序后的最重要一個步驟，真核生物和原核生物因為密碼子表的不同，方法會有所不同。各種預測方法得到的結果也有所不同

答案:對隨著鏈特異性轉錄組測序技術等的大量應用，為基因的鑒定提供了一個更為直接的工具和數據庫

答案:對CodonW是密碼子偏好性分析軟件，以下哪些功能可以用該軟件分析

答案:密碼子適應指數###最優密碼子使用頻率###有效密碼子數###密碼子偏性指數基因的預測軟件主要有

答案:CpGPlot###GENOMESCAN###GENSCANCpG島指的是一段（）bp長度的DNA序列，G+C含量達到（）以上，與基因的存在相關性達到60-80%以上

答案:200，50全局序列比對用于整體相似性程度較低、在較小區域內有局部相似性的兩個序列比對。

答案:錯在蛋白質數據庫中比對蛋白質序列，需要選擇一下那種blast模式？

答案:blastp傳統的基于動態規劃的局部性比對性算法采用的是精確的序列比對，雖然有著較好的比較結果，但是算法的時間復雜度較高。

答案:對多序列比對就是兩條以上的序列進行比對，可以用于進化樹分析、尋找保守區域等。

答案:對以下哪些屬于蛋白質打分矩陣？

答案:遺傳密碼矩陣###PAM矩陣###BLOSUM矩陣###疏水矩陣BLAST是基于局部比對算法，采用漸進式比對方法，對數據分成字段等思路進行的成對比對方法

答案:對生物信息學的研究對象中包括各種數據庫，比如

答案:PDB###GenBank###Uniprot###KEGGGenBank對于核酸數據的顯示方式有以下幾種

答案:Graph###ASN.1###FASTA###GBKUniprotKB對于生物數據在不同數據