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文檔簡介

PAGEPAGE259第十六章生物化學、分子與細胞生物學和生物物理學信息資源的情況比較突出,故本節(jié)將其資源融合在一起加以推介。第一節(jié)主要信息資源目錄一、HarvardDeptofMCB-BiologyLinks/BioLinks.biochem.html二、KarolinskaInstitutethttp://www.mic.ki.se/Chemistry.html。第二節(jié)雜志一、生物化學與生物物理學報/gyjs.asp?ID=1855982《生物化學與生物物理學報(Acta Biochimica et BiophysicaSinica)原名《生化學報》,1958年創(chuàng)刊,1961年改為現(xiàn)名。2004年改成英文版。原雙月刊,2003年起改為月刊。中國科學院主管,中科院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所主辦刊登生物化學生物物理學和分子生物學的研究論文,并酌登研究簡報和綜述性文章。被化學文摘、ISI的科學引文索引擴展版、生物學文摘、美國醫(yī)學索引、俄羅斯文摘雜志等國際檢索工具收錄是從事生物化學生物物理學和分子生物學研究的科技人員教學人員和管理人員的重要參考資料,也是學習與生物學相關(guān)學科的大學生和研究生的參考資料之一。2005年IF值0.505.二、生物化學與生物物理進展/ProgressinBiochemistryand。由中國科學院生物19742004JCRIF0.222,2005IF0.215。三、生物化學雜志(JournalofBiologicalChemistry,JBC)該刊由美國生物化學與分子生物學會(AmericanSocietyforBiochemistryandMolecularBiology,ASBMB,/ASBMB/site.nsf)19055500015%,后者5%。快速發(fā)表的研究成果要求特別具有新穎性、創(chuàng)造性、重要24“JBCPapersinPress”在網(wǎng)上公布。相應(yīng)地,如果論文中涉及到新認定的生物大分子結(jié)構(gòu),那ProteinDataBank。JBC、蛋白突變分析、轉(zhuǎn)基因與RNAiJBI2004年JCRIF6.355388432005IF5.854文獻出版后一年全文免費。(TheBiochemicalJournal)/1906(TheBiochemicalSociety,/)24酶、碳水化合物、類脂、基因結(jié)構(gòu)與表達、大分子的合成與降解、中間代謝與代謝控制、膜與受體、細胞結(jié)構(gòu)與功能等方面。2004JCRIF4.278,388812005IF4.2246五、生物化學-美國(Biochemistry-US)/journals/bichaw/美國化學會(AmericanChemicalSociety)主辦。196231膜結(jié)構(gòu)與功能之間關(guān)系,生物能學和免疫化學方面的研究成果。2004JCR示IF4.008388922005IF3.8481962-1995PDF(付費(免費1996(免費HTML/PDF格式文獻全文(付費。六、分析生物化學(AnalyticalBiochemistry)/wps/find/journaldescription.cws_home/622781/description#description,/science?_ob=JournalURL&_cdi=6692&_auth=y&_acct=C000054345&_version=1&_urlVersion=0&_userid=2787555&md5=e8fb131173fbb26050bf050436d50d89196024理與毒理學研究技術(shù)。2004IF2.37,2005IF2.670。網(wǎng)上/content/ap/ab19872003年的文獻目次。七、酶學方法(MethodsinEnzymology)/science?_ob=BookURL&_cdi=18066&_auth=y&_acct=C000054345&_version=1&_userid=2787555&md5=ea5f237b08069307f34e4c231454411e,/science/bookseries/007668791955122005IF1.695。網(wǎng)上可免費獲得1955(/science?_ob=BookURL&_cdi=18066&_auth=y&_acct=C000056124&_version=1&_userid=2088839&md5=43df8fd1178e122b14cf1905b97b72319952002/content/ap/ab。八、歐洲生物化學會聯(lián)合會快報(FEBSLetters)/wps/find/journaldescription.cws_home/506085/description#description,/science/journal/00145793,/science?_ob=JournalURL&_cdi=4938&_auth=y&_acct=C000054345&_version=1&_urlVersion=0&_userid=2787555&md5=a421092184927137886562c03e256822該刊為歐洲生物化學會聯(lián)合會(FederationofEuropeanBiochemicalSocietieFEBS362004JCRIF388982005IF3.4151968-1996、摘要加參加文獻(付費)PDF(付費19972004HTML(免費、PDF(免費,2005-2006年及預(yù)印本免費摘要、付費全文。九、生物化學年評(AnnualReviewofBiochemistry)/loi/biochem“Annual2004JCRIF22005IF33.4561932-1996(費PDF(付費1997(免費(HTML/PDF,付費。(TheEMBOJournal)/(需注冊/publications/journal.html1982(EuropeanMolecularBiologyOrganization,/)的機關(guān)刊。網(wǎng)上可得1984(3)24RNA、蛋白質(zhì)、細胞代謝、信號傳導(dǎo)、細胞周期、分化與死亡、膜與轉(zhuǎn)運、細胞與組織2004JCRIF10.492388222005IF10.053/publications/journal.html可依據(jù)主題內(nèi)容瀏12十一、分子生物學雜志(JournalofMolecularBiology)/wps/find/journaldescription.cws_home/622890/description#description,/science/journal/00222836。196450處理;細胞與發(fā)育生物學;病毒和抗菌素的遺傳學、結(jié)構(gòu)和生長周期。20045.542,388552005IF5.229。通過網(wǎng)站/science/journal/002228361966年至當前文獻摘要。十二、*細胞的分子生物學(MolecularBiologyoftheCell,MBC)/由美國細胞生物學會(TheAmericanSocietyforCellBiology,ASCB,應(yīng)用的重大進展。2004IF7.517。2005IF6.520。網(wǎng)上可免費獲得199219971997十三、自然綜述-分子細胞生物學(NatureReviewsMolecularCellBiology)/nrm/index.html“Nature”122004JCRIF33.170,38812005IF29.8522000文摘要。#(JournalofCell/contents-by-date.0.shtml195526面面,不管研究采用什么實驗方法,這些方面的論文可由該刊予以發(fā)表。2004JCRIF11.602,388182005IF10.951。文6十五、細胞科學雜志(JournalofCellScience)/,/contents-by-date.0.shtml生物學家公司(TheCompanyofBiologists)主辦。19662004JCRIF6.910,388402005IF6.5436十六、自然-細胞生物學(NatureCellBiology)/ncb/index.html,/ncb/archive/index.html“Nature”199912膜轉(zhuǎn)運和蛋白質(zhì)特征;細胞粘連與移動;信號傳導(dǎo);蛋白質(zhì)水解;細胞凋亡;細2004JCRIF20.649,居38852005IF19.717。該刊與NPG十七、細胞與發(fā)育生物學年評(AnnualReviewofCellandDevelopmentalBiology)/loi/cellbio“AnnualReview2004JCRIF17.80438862005IF23.6901985-1995(免費PDF(付費1996-2005(免費)和全文付費。十八、生物化學與生物物理學報(BBA-BiochimicaetBiophysicaActa)/homepage/sah/bba/fp.sht1947Bioenergetics》(2004JCRIF3.503,2005年JCFIF4.302Biomembrane(2004JCRIF3.441,2005JCRIF4.224)GeneralSubjects》(2004JCRIFJCRIF2.418)GeneStructureandExpression(2004年JCRIF2.045,2005JCRIF2.506)MolecularandCellBiologyof》(2004JCRIF5.004,2005JCRIFMolecularCell》(2004JCRIF3.482,2005IF4.844ProteinandProteomics》(2004JCRIF3.079,2005JCRIF2.980)MolecularBasisofDisease(2004年JCRIF3.046,2005JCRIF2.382)ReviewsonCancer(2004JCRIF16.120,2005JCRIF12.143)。論文(Regularpapers(RapidReports(ShortSequencepaper、促進者論文(Promoterpapers、綜述(Reviews)和小綜述Mini-ReviewsBBAPDFHTML(BiophysicalJournal)/1976(TheBiophysicalSociety)主辦。月刊。刊載生物物理學原始論文、來信和綜述。內(nèi)容側(cè)重分子與細胞生物學方面。2004IF4.5852005IF4.50712CellNatureMedicineFASEBJournal等。這三種雜志請參閱本篇第三章第二節(jié)。第三節(jié)圖書、講義一、《醫(yī)學生物化學》19981023補充讀物,在本科生化教材基礎(chǔ)上擴充內(nèi)容,又盡可能不與生化課本重復(fù)。第1-1213-2130二、與臨床相關(guān)的生物化學教科書(TextbookofBiochemistrywithClinicalCorrelations)ThomasM.Devlin主編。第5版,2002年。Wiley-Liss公司出版。在/gp/product/0471411361/104-6407456-5312731?v=glance&n=283155和/WileyCDA/WileyTitle/productCd-0471411361.html有售。容包括:大分子-DNA、RNA號傳導(dǎo)、神經(jīng)組織生物化學、肌肉運作、血凝與消化、以及營養(yǎng)學原理。三、哈帕氏生物化學(Harper’sBiochemistry)RobertK.Murray等主編。第26版,2000年。McGraw-Hill(Lange)公司出年出第1年出第2年出第3版,以后每兩年出一版,更新知識速度快是該書的一大特點,與生物化學學第25版中譯本(宋惠萍等譯)由科學出版社于2003年1月出版。目前一家日本網(wǎng)站(http://koonja.co.kr/shop/shop_goodsview.asp?top=1&isbn=0071389016&category=)售第25版。四、*生物化學(Biochemistry)JeremyM.BergJohnL.TymoczkoLubertStryerH.andCo.出版,2002NCBI“Books”(/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=stryer.TOC&depth=2)可用內(nèi)容詞在線檢索該書中的內(nèi)容,附“GlossaryoftoAbbreviationsin可在線免費閱讀。五、*細胞的分子生物學(MolecularBiologyoftheCell)BruceAlberts等主編,GarlandPublishing出版,2002年第4版。自網(wǎng)頁/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=cell.TOC&depth=2可查閱該書目次。六、*分子細胞生物學(MolecularCellBiology)HarveyLodish等主編。W.H.Freeman&Co.出版。1999年第4版。自網(wǎng)頁/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=mcb.TOC&depth=10可查閱該書目次。*MIT生物學超文本教科書7.01版BiologyofHypertextbook/esgbio/www/該書提供《MIT生物學導(dǎo)論(MITIntroductoryBiology》的補充材料輔助DNA免疫學、孟德爾遺傳學、照片合成等。可在線免費閱讀。八、*醫(yī)學生物化學(MedicalBiochemistry)/research/medicine/biochemistry/bioc800/start.html員會提供。教程設(shè)有索引、大綱、相關(guān)鏈接和測試題。九、細胞—分子方法(TheCell-AMolecularApproach)/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=cooper.TOC&depth=2GeoffreyM.Cooper(MA):SinauerAssociates,Inc.,2000年版。全書共分四大部分:導(dǎo)論、遺傳學信息流、細胞結(jié)構(gòu)與功能、NCBI第四節(jié)指南一、NationalAcademyofClinicalLaboratoryMedicinePracticeGuidelines(LMPG)/lmpg/main.stm(NACB(LMPG1994NACBLMPG(StandardsofLaboratoryPractice,SOLPs)(1999、(2002(2003(2000(2002年。供公開評議的草稿有:腫瘤標記物POCT(2004急性冠脈綜合征和心衰的生物標記、母體與胎兒健康危險性評估第二版(2003。2006二、TheAmericanSocietyforCellBiology(ASCB)-PublicPolicy/publicpolicy/涉及了當今全球生命科學研究的熱點倫理學問題,如“特別創(chuàng)造學說與智能設(shè)1997ASCB時事通訊中的公共政策簡報。WHO(WHO/biologicals/en/)等。第五節(jié)數(shù)據(jù)庫和軟件工具國際互聯(lián)網(wǎng)上分子生物學和遺傳學數(shù)據(jù)庫非常豐富,如上所述,這些數(shù)據(jù)庫多由國際權(quán)威研究機構(gòu)創(chuàng)建維護,數(shù)據(jù)信息穩(wěn)定可靠,而且?guī)炫c庫間交換數(shù)據(jù),(見本章第一節(jié)提供了一些著名的生物一、ProteinDataBank,PDB/pdb/PDB是世界上唯一一個國際性的處理實驗測定的高分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的倉庫。主要由Rutgers(新澤西州立大學)和圣地亞哥超型計算機中心(加利福尼亞大學EuropeanBioinformaticsInstituteMacromolecularStructureDatabasegroup)和日本大阪大學的蛋白質(zhì)研究所。二、ExPASyProteomicsServer/ExPASy(ExpertProteinAnalysisSystem)是瑞士生物信息研究所(SwissInstituteofBioinformatics,創(chuàng)建的蛋白質(zhì)組2(2-DPAGEPAGEUniProt(UniversalProteinResource)/sprot/UniProtSIBEBI(EuropeanBioinformaticsInstitute歐洲生物信息學研http://www.ebi.ac.uk/Swiss-Prot蛋白質(zhì)知識庫Swiss-ProtSwiss-ProtSwiss-ProEMBL核苷酸序列款目的翻譯。四、DatabaseofMacromolecularMovementswithAssociatedToolsFlexibilityandGeometricAnalysis/molmovdb/分析軟件工具的鏈接。數(shù)據(jù)庫主頁如下圖:16-1DatabaseofMacromolecularMovementswithAssociatedToolsFlexibilityandGeometricAnalysis第六節(jié)圖譜、影像一、NDBAtlasofNucleicAcidContainingStructures/atlas/index.html核酸數(shù)據(jù)庫(NucleicAcidDatabase,/)GalleryIndex”和“IndexListing(textonly)X線圖像長廊,可見下圖頁面:圖16-2NDBAtlasofNucleicAcidContainingStructuresX線圖像長廊頁面再以A-DNA為例,點擊查看,可見結(jié)構(gòu)圖像:圖16-3NDBAtlasofNucleicAcidContainingStructuresX線圖像長廊中A-DNA結(jié)構(gòu)圖像頁面NMRDNADoubleStrandedQuadruplexes16-4NDBAtlasofNucleicAcidContainingStructuresXDNADoubleStrandedQuadruplexes”頁面映核酸的各種結(jié)構(gòu)。同時提供實驗室數(shù)據(jù)等相關(guān)文檔的鏈接。二、MolecularExpressionsTM

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