國自然-面上項目標書范例國自然-面上項目標書范例國自然-面上項目標書范例xxx公司國自然-面上項目標書范例文件編號：文件日期：修訂次數：第1.0次更改批準審核制定方案設計，管理制度申請代碼H1606受理部門收件日期受理編號國家自然科學基金申請書(2010版)1)如果您是Word2000,wordXP,word2003或以上版本用戶，請把Word宏的安全性設為:"中"方法:Word菜單->工具->宏->安全性->安全級,設置為"中"(如果您是Word97用戶，繼續執行以下步驟)(如果您是Office2007用戶，點擊word左上角"安全警告"處"選項"中的"啟用此內容")2)關閉本文檔，重新打開本文檔1)如果您是Word2000,wordXP,word2003或以上版本用戶，請把Word宏的安全性設為:"中"方法:Word菜單->工具->宏->安全性->安全級,設置為"中"(如果您是Word97用戶，繼續執行以下步驟)(如果您是Office2007用戶，點擊word左上角"安全警告"處"選項"中的"啟用此內容")2)關閉本文檔，重新打開本文檔3)點擊"啟用宏"按鈕，即可開始填寫本文檔或打印了亞類說明：附注說明：項目名稱：Pyk2促進肝癌細胞遷移的一個新的分子機制研究：結合并磷酸化E-cadherin申請人：電話：依托單位：通訊地址：郵政編碼：266021單位電話：電子郵箱：申報日期：201FORMTEXT0年FORMTEXT2月FORMTEXT26日國家自然科學基金委員會

基本信息yoKWT/OQ申請人信息姓名性別男出生年月1973年4月民族漢族學位博士職稱副主任醫師每年工作時間（月）8電話電子郵箱傳真國別或地區中國個人通訊地址工作單位主要研究領域腫瘤分子生物學依托單位信息名稱聯系人電子郵箱電話網站地址合作研究單位信息單位名稱項目基本信息項目名稱資助類別面上項目亞類說明附注說明申請代碼H1606:腫瘤復發與轉移H1617:消化系統腫瘤基地類別研究年限2011年1月—2013年12月研究屬性基礎研究申請經費萬元摘要(限400字)：FORMTEXTE-cadherin的喪失與肝癌轉移密切相關。其喪失的主要原因是由于其酪氨酸殘基被磷酸化后蛋白被降解。我們通過酵母雙雜交發現一個新的能與E-cadherin相互作用的非受體型酪氨酸激酶Pyk2。Pyk2活性增強可促進肝癌細胞遷移。本課題假設Pyk2結合并磷酸化E-cadherin，導致E-cadherin蛋白降解，細胞遷移性增加。本課題設計首先通過GSTpulldown、免疫共沉淀證明二者相互作用可靠；其次通過磷酸化實驗確證Pyk2可以磷酸化E-cadherin；然后應用細胞遷移實驗和裸鼠成瘤實驗確定：Pyk2通過磷酸化E-cadherin而影響肝癌細胞遷移和腫瘤轉移；最后分析在人肝癌標本中二者表達的相關性以及與轉移的關系。本課題新發現Pyk2可以直接磷酸化E-cadherin，促進肝癌細胞遷移和腫瘤轉移，具有國際先進性。這對于肝癌侵襲轉移的復雜機制有新的理解，對于藥物研發提供新的思路。關鍵詞(用分號分開，最多5個)FORMTEXT肝癌；E-cadherin；Pyk2；腫瘤轉移經費申請表（金額單位：萬元）科目申請經費備注（計算依據與說明）一.研究經費FORMTEXT=sum(tbl_budgetb3:b3)+sum(tbl_budgetb9:b9)+sum(tbl_budgetb12:b12)+sum(tbl_budgetb15:b16)FORMTEXT1.科研業務費FORMTEXT=sum(tbl_budgetb4:b8)FORMTEXT（1）測試/計算/分析費FORMTEXTFORMTEXTDNA測序，生物信息分析，統計分析（2）能源/動力費FORMTEXTFORMTEXT1FORMTEXT（3）會議費/差旅費FORMTEXTFORMTEXT參加學術會議3-4人次（4）出版物/文獻/信息傳播費FORMTEXTFORMTEXT文獻檢索，發表論文，專利申請（5）其他FORMTEXTFORMTEXT成果鑒定2.實驗材料費FORMTEXT=sum(tbl_budgetb10:b11)FORMTEXT（1）原材料/試劑/藥品購置費FORMTEXTFORMTEXT各種試劑盒，脂質體，抗體，細胞培養，實驗耗材（2）其他FORMTEXTFORMTEXT動物飼養，臨床調研3.儀器設備費FORMTEXT=sum(tbl_budgetb13:b14)FORMTEXT（1）購置FORMTEXTFORMTEXT（2）試制FORMTEXTFORMTEXT4.實驗室改裝費FORMTEXTFORMTEXT5.協作費FORMTEXTFORMTEXT二.國際合作與交流費FORMTEXT=sum(tbl_budgetb18:b19)FORMTEXT1.項目組成員出國合作交流FORMTEXTFORMTEXT2.境外專家來華合作交流FORMTEXTFORMTEXT邀請美國康奈爾大學關軍林教授合作交流三.勞務費FORMTEXTFORMTEXT研究生加班補貼四.管理費FORMTEXTFORMTEXT5%管理費合計FORMTEXT=sum(tbl_budgetb2:b2)+sum(tbl_budgetb17:b17)+sum(tbl_budgetb20:b21)FORMTEXT與本項目相關的

其他經費來源國家其他計劃資助經費FORMTEXT其他經費資助（含部門匹配）FORMTEXT其他經費來源合計FORMTEXT=sum(tbl_budgetc23:c24) 報告正文一、立項依據與研究內容：（一）項目的立項依據原發性肝癌是最常見的惡性腫瘤之一，我國的肝癌發病數占全球所有肝癌病例的一半左右，因此我國對于肝癌的研究顯得非常迫切[1]。肝癌非常容易轉移，其復發轉移是治療失敗的主要原因。了解肝癌侵襲轉移的相關機制，對于設計合理的治療藥物，進一步提高我國肝癌的治療水平具有重要意義[2]。E-cadherin在肝癌細胞的侵襲、轉移中起到了不可忽視的作用。E-cadherin屬于鈣粘附蛋白家族(Cadherin家族)，在調節細胞與細胞之間、細胞與基質之間的粘附反應，介導細胞間的接觸抑制和凋亡等方面發揮重要作用。E-cadherin與β-catenin、p120等形成復合體發揮上述功能[3]。E-cadherin與多種腫瘤的浸潤轉移密切相關[4-5]。有人認為提高E-cadherin的表達可以成為腫瘤治療的一個方向[6]。與其他腫瘤類似，研究表明E-cadherin在肝細胞癌的陽性率顯著低于癌旁組織及正常肝組織，表達越低則腫瘤病理分級越差，也越容易出現轉移[7-9]。有人報道缺乏E-cadherin表達的人肝癌細胞株非常容易發生轉移，但是轉染E-cadherin后這種特性發生逆轉，說明E-cadherin在肝癌細胞轉移過程中發揮著重要的作用[10]。E-cadherin喪失或低表達的機制至今仍然不是完全清楚。目前認為可能是由于基因突變導致功能喪失、啟動子甲基化后轉錄沉默[11]以及E-cadherin蛋白被磷酸化后水解等。但是在亞洲人群中基因突變和啟動子甲基化都不常見[12-13]。因此最大的可能性是E-cadherin蛋白被磷酸化后水解。有文獻證明，酪氨酸殘基磷酸化的E-cadherin能夠與Hakai（一種E3泛素連接酶）結合，使其泛素化而降解[14]。那么有多少酪氨酸激酶參與這個機制呢有報道EGFR，IGF-1R能夠磷酸化E-cadherin。對于E-cadherin磷酸化的調節機制目前仍然不是非常明確。為了解E-cadherin在肝癌細胞的分子信號通路，我們以E-cadherin（胞內段）為誘餌應用酵母雙雜交（CytoTRAP系統）在肝臟的cDNA文庫中篩選到一個新的能與E-cadherin相互作用的非受體型酪氨酸激酶-Pyk2。那么，Pyk2是否能磷酸化E-cadherin并調節細胞遷移呢Pyk2(prolinerichtyrosinekinase2)是一種富含脯氨酸的非受體型酪氨酸蛋白激酶，與FAK同源度較高，屬于FAK家族。Pyk2是酪氨酸激酶家族中的后起之秀，在調節細胞存活、增殖和遷移[16]方面受到越來越多的關注。Pyk2信號通路的活化能夠增強細胞運動和遷移，研究發現Pyk2在多種腫瘤的侵襲和轉移中起作用[17-18]。其中Sun等研究表明，Pyk2在59%的肝癌組織中表達上調，Pyk2高表達與肝癌組織體積、Edmonson分級呈正相關，Pyk2表達越高病人預后越差。動物實驗顯示在侵襲邊緣的肝癌細胞和轉移到肺結節中的肝癌細胞均發現Pyk2高表達。肝癌細胞株轉染Pyk2后，其遷移功能增強；而用裸鼠做實驗發現抑制Pyk2的活性后肝癌腫瘤的大小和肺轉移率都較對照明顯減少[19-20]。Pyk2調節腫瘤轉移的具體機制是什么呢有研究表明，在肝癌細胞中，Pyk2提高c-Src的磷酸化水平和活性，與c-Src形成復合體激活ERK通路，從而增強肝癌細胞的侵襲性[19-20]；也有報道Pyk2與PECAM-1（血小板/內皮細胞粘附分子，與E-cadherin一樣都屬于鈣粘附蛋白家族）結合并且都影響腫瘤細胞的侵襲性[21]；還有報道RhoC通過激活Pyk2促進前列腺癌轉移[18]以及與SOCS3、Cyr61有關等[22-23]。總而言之，目前Pyk2調節腫瘤細胞轉移的具體機制仍不十分清楚。Pyk2與E-cadherin能否結合并調節肝癌細胞的侵襲轉移呢這是我們想要研究的問題。我們繼續應用酵母雙雜交反復驗證、GST-Pulldown實驗、免疫共沉淀證明二者相互作用是可靠的（具體結果見研究基礎）。那么，現在的問題是二者在體內狀態下是否結合結合后的調節機制是什么二者的結合位點在什么地方結合后如何調節細胞遷移以及影響腫瘤轉移考慮到Pyk2是一個激酶蛋白，我們的前期工作發現E-cadherin與Pyk2的激酶部分結合，因此有兩種可能性。一種是Pyk2磷酸化E-cadherin，另外一種就是E-cadherin抑制Pyk2的磷酸激酶活性。我們認為第一種可能性較大。有文獻報道，Pyk2能磷酸化VE-cadherin（E-cadherin同源家族成員）并且抑制其與Catenin，P120等形成復合體[24-25]。E-cadherin與VE-cadherin同源性很高，理化性質相似，Pyk2能夠磷酸化VE-cadherin應該也有可能磷酸化E-cadherin。因此我們有理由推測，由于腫瘤始動因素的作用，Pyk2表達增多，活性增強，從而磷酸化E-cadherin，導致E-cadherin降解，最終使細胞遷移性增強。但是也不能排除第二種可能性，E-cadherin抑制Pyk2的磷酸激酶活性，從而導致腫瘤細胞侵襲性下降。申請人以前的工作就發現鈣粘附蛋白家族的另外一個成員γ-Protocadherins能夠抑制Pyk2的活性[26]，申請人做這方面工作時曾取E-cadherin做對比參照，結果發現抑制Pyk2激酶活性不是很明顯（本數據未發表），因此不支持第二種可能性。二者具體如何調節還需要進一步實驗來證實。本課題的設計主要是為了解答上述問題。首先在前期工作基礎上繼續明確Pyk2與E-cadherin能相互作用以及調節機制；其次應用細胞遷移實驗確定二者的調節對腫瘤細胞遷移、侵襲性的影響；然后應用裸鼠成瘤轉移實驗明確二者的調節在對肝癌遠處轉移的影響；最后分析在肝癌病人組織標本中二者表達的相關性以及與轉移的相關性。本課題在國際上最新發現Pyk2與E-cadherin直接相互作用，并且確定其結合機制，明確這種調節與肝癌細胞遷移力和腫瘤轉移的關系。這對于肝癌侵襲轉移的復雜機制有新的理解。許多新型抗癌藥物如赫賽汀、格列衛、吉非替尼、厄洛替尼都是以酪氨酸激酶為治療靶點，取得非常好的療效。本研究對于確定E-cadherin和酪氨酸激酶Pyk2做為分子治療靶點、設計合理的治療藥物可以提供更有利的素材。參考文獻：[1]HeJ,GuD,WuX,etal.MajorcausesofdeathamongmenandwomeninChina.NEnglJMed2005;353:1124–34.[2]吳孟超，廖美琳，陸嘉德常見惡性腫瘤治療進展上海科技教育出版社2007[3]BryantDM,StowJL.TheinsandoutsofE-cadherintrafficking.TrendsCellBiol.2004Aug;14(8):427-34[4]WellsA,YatesC,ShepardCR.E-cadherinasanindicatorofmesenchymaltoepithelialrevertingtransitionsduringthemetastaticseedingofdisseminatedcarcinomas.ClinExpMetastasis.2008;25(6):621-8.Epub2008Jul4[5]SalonC,LantuejoulS,EyminB,etal.TheE-cadherin-beta-catenincomplexanditsimplicationinlungcancerprogressionandprognosis.FutureOncol.2005Oct;1(5):649-60[6]HowardEW,CammKD,WongYC,etal.E-cadherinupregulationasatherapeuticgoalincancertreatment.MiniRevMedChem.2008May;8(5):496-518.[7]GuoC,LiuQG,YangW,etal.Relationamongp130Cas,E-cadherinandbeta-cateninexpression,clinicopathologicsignificanceandprognosisinhumanhepatocellularcarcinoma.HepatobiliaryPancreatDisInt.2008Oct;7(5):490-6.[8]ZhaiB,YanHX,LiuSQ,etal.ReducedexpressionofE-cadherin/catenincomplexinhepatocellularcarcinomas.WorldJGastroenterol.2008Oct7;14(37):5665-73.[9]FransveaE,AngelottiU,AntonaciS,etal.Blockingtransforminggrowthfactor-betaup-regulatesE-cadherinandreducesmigrationandinvasionofhepatocellularcarcinomacells.Hepatology.2008May;47(5):1557-66.[10]OsadaT\"[Author]&itool="OsadaT,SakamotoM\"[Author]&itool="SakamotoM,InoY\"[Author]&itool="InoY,etal.E-cadherinisinvolvedintheintrahepaticmetastasisofhepatocellularcarcinoma.Hepatology.1996Dec;24(6):1460-7[11]AuerkariEI.Methylationoftumorsuppressorgenesp16(INK4a),p27(Kip1)andE-cadherinincarcinogenesis.OralOncol.2006Jan;42(1):5-13.[12]WeiY\"[Author]&itool="WeiY,VanNhieuJT\"[Author]&itool="VanNhieuJT,PrigentS\"[Author]&itool="PrigentS,etal.AlteredexpressionofE-cadherininhepatocellularcarcinoma:Correlationswithgeneticalterations,β-cateninexpression,andclinicalfeaturesHepatology

2002Sep;36(3):692-701[13]YuJ,NiM,XuJ,etal.Methylationprofilingoftwentypromoter-CpGislandsofgeneswhichmaycontributetohepatocellularcarcinogenesis.BMCCancer2002,2:29[14]FujitaY,KrauseG,ScheffnerM,Hakai,etal.Hakai,ac-Cbl-likeprotein,ubiquitinatesandinducesendocytosisoftheE-cadherincomplex.NatCellBiol.2002Mar;4(3):222-31.[15]McLachlanRW,YapAS.Notsosimple:thecomplexityofphosphotyrosinesignalingatcadherinadhesivecontacts.JMolMed200785:545-554.[16]AvrahamH,ParkSY,SchinkmannK,etal.RAFTK/Pyk2-mediatedcellularsignalling.CellSignal.2000Mar;12(3):123-33.[17]BehmoaramE,BijianK,JieS,etal.Focaladhesionkinase-relatedproline-richtyrosinekinase2andfocaladhesionkinaseareco-overexpressedinearly-stageandinvasiveErbB-2-positivebreastcancerandcooperateforbreastcancercelltumorigenesisandinvasiveness.AmJPathol.2008Nov;173(5):1540-50.[18]IiizumiM,BandyopadhyayS,PaiSK,etal.RhoCpromotesmetastasisviaactivationofthePyk2pathwayinprostatecancer.CancerRes.2008Sep15;68(18):7613-20.[19]SunCK,ManK,NgKT,etal.Proline-richtyrosinekinase2(Pyk2)promotesproliferationandinvasivenessofhepatocellularcarcinomacellsthroughc-Src/ERKactivation.Carcinogenesis.2008Nov;29(11):2096-105.[20]SunCK\"[Author]&itool="SunCK,NgKT\"[Author]&itool="NgKT,SunBS\"[Author]&itool="SunBS,etal.Thesignificanceofproline-richtyrosinekinase2(Pyk2)onhepatocellularcarcinomaprogressionandrecurrence.BrJCancer.2007Jul2;97(1):50-7.[21]ZhangX,XuLH,YuQ.CellaggregationinducesphosphorylationofPECAM-1andPyk2andpromotestumorcellanchorage-independentgrowth.MolCancer.2010Jan14;9:7[22]ZhangS,GuoD,JiangL,etal.SOCS3inhibitingmigrationofA549cellscorrelateswithPYK2signalinginvitro.BMCCancer.2008;8:150.[23]VitaleG,GentiliniD,AbbruzzeseA,etal.Pyk2andCyr61atthecross-roadofcAMP-dependentsignallingininvasivenessandneuroendocrinedifferentiationofprostatecancer.CancerBiolTher.2009;8[24]TurowskiP,MartinelliR,CrawfordR,etal.Phosphorylationofvascularendothelialcadherincontrolslymphocyteemigration.JCellSci.2008Jan1;121(Pt1):29-37.[25]PotterMD,BarberoS,ChereshDA.TyrosinephosphorylationofVE-cadherinpreventsbindingofp120-andbeta-cateninandmaintainsthecellularmesenchymalstate.JBiolChem.2005Sep9;280(36):31906-12.[26]JianChen,LuY\"[Author]&itool="LuY,MengS\"[Author]&itool="MengS,etal.alpha-andgamma-ProtocadherinsNegativelyRegulatePYK2.JBiolChem.2009Jan30;284(5):2880-90

（二）項目的研究內容、研究目標,以及擬解決的關鍵科學問題。１.主要研究內容1）確定E-cadherin與Pyk2體外、體內相互作用、作用位點以及調節關系。A．取E-cadherin與Pyk2不同結構域和不同突變體，應用酵母雙雜交、GST-PullDown以及免疫共沉淀的方法確定二者相互作用的結構域，以及作用位點。B.選取二者表達量都適中的肝癌組織，行內源性免疫共沉淀，證明在體內二者也相互作用。C.應用免疫熒光技術和蔗糖密度梯度超速離心方法分析細胞組分的方法確定E-cadherin與Pyk2在細胞中共定位。D.應用磷酸化實驗，確定E-cadherin是否是Pyk2的底物，應用定點突變的方法，確定酪氨酸的磷酸化位點。（同時再次確證E-cadherin能否影響Pyk2激酶活性。）2）從細胞水平確定Pyk2對E-cadherin的調節影響細胞遷移。A.篩選Pyk2穩定表達細胞株，然后應用Transwell細胞遷移實驗觀察過表達Pyk2的細胞其遷移性、侵襲性的變化，檢測過表達Pyk2時E-cadherin的磷酸化狀態和蛋白水平的變化，確定Pyk2對E-cadherin磷酸化狀態的調節影響細胞遷移。B.取高轉移肝癌細胞株MHCC97-H、HCCLM3(購自上海中山醫院肝癌研究所)，應用RNAi技術沉默Pyk2的表達，觀察細胞遷移性、侵襲性的變化，檢測相應狀態下E-cadherin的磷酸化狀態和表達水平的變化。從相反方向確定Pyk2的表達抑制后對E-cadherin磷酸化狀態的調節，以及這種調節對細胞遷移的影響。3）從動物模型水平確定Pyk2對E-cadherin的調節影響腫瘤轉移。應用Pyk2穩定表達細胞株接種裸鼠，觀察裸鼠腫瘤肺轉移肝轉移情況，分析Pyk2的過表達對E-cadherin磷酸化狀態的調節關系，以及與腫瘤轉移的相關性。4）從肝癌病人標本中尋找Pyk2與E-cadherin磷酸化狀態的相關性，以及與腫瘤轉移的的相關性。收集肝癌標本，應用免疫組化和Western等方法確定Pyk2的表達水平的變化與E-cadherin磷酸化狀態和蛋白水平的相關性，以及二者與腫瘤轉移的相關性。２.研究目標1）確定Pyk2結合E-cadherin相互作用的結構域及磷酸化位點，并闡明其調節機制。2）確定Pyk2與E-cadherin的調節可影響肝癌細胞遷移和腫瘤轉移。３.擬解決的關鍵科學問題E-cadherin酪氨酸殘基的磷酸化導致其被降解，增加細胞侵襲性。本課題能夠確定酪氨酸激酶Pyk2能否磷酸化E-cadherin，Pyk2與E-cadherin的調節是否是調節腫瘤細胞轉移的新的分子機制。（三）擬采取的研究方案及可行性分析。１.研究方法GST-pulldown，熒光共定位，內源、外源免疫共沉淀，蔗糖密度梯度超速離心，磷酸化實驗，定點突變，穩定表達細胞株的篩選，RNAi抑制Pyk2表達，細胞遷移、侵襲實驗，裸鼠成瘤腫瘤轉移實驗，免疫組化，定量PCR，Western檢測等。２.關鍵技術說明：1）磷酸化實驗首先應用酪氨酸激酶的通用底物E4Y1作為陽性參照，以純化的GST-E-cadherin蛋白為底物，以GST蛋白作為陰性對照，觀察Pyk2是否可以磷酸化E-cadherin。如果能磷酸化E-cadherin則應用生物信息分析，定點突變，尋找磷酸化位點；如果不能磷酸化E-cadherin，則以通用底物E4Y1作為底物，加入不同量的E-cadherin觀察是否可以影響Pyk2的激酶活性。2）細胞遷移實驗首先分別用空載體，，轉染肝癌細胞株（PRNK為Pyk2的C段，為Pyk2的失活突變體），用G418篩選出穩定表達細胞株。并檢測穩定表達細胞株Pyk2蛋白表達量的不同。然后應用穩定表達細胞株做Transwell細胞遷移和侵襲實驗，比較細胞遷移率的變化；檢測細胞遷移率的變化與Pyk2蛋白表達量的關系。同時取相應細胞做定量PCR，Western蛋白定量，磷酸化抗體檢測磷酸化狀態來比較E-cadherin在轉錄水平、蛋白水平、磷酸化水平的變化以及這些變化與腫瘤遷移的關系，與Pyk2蛋白表達量的關系。3）裸鼠成瘤腫瘤轉移實驗取上述三組穩定表達細胞株分別接種裸鼠，待腫瘤直徑約時取出腫瘤重新接種于另外一批裸鼠的肝左葉。接種5星期左右處死裸鼠，收集肝臟和肺臟，觀察肝內轉移情況和肺轉移情況。檢測三組腫瘤Pyk2蛋白表達量的不同以及與腫瘤轉移的關系。同時取相應腫瘤做定量PCR，Western蛋白定量，磷酸化抗體檢測磷酸化狀態來比較E-cadherin在轉錄水平、蛋白水平、磷酸化水平的變化，確定這些變化與腫瘤轉移的關系，與Pyk2蛋白表達量的關系。4）蔗糖密度梯度超速離心定位和內源免疫共沉淀取肝癌腫瘤的癌旁組織，裂解離心，取裂解液上清，蔗糖密度梯度超速離心。取離心后的不同組分樣品做Western，分別用E-cadherin抗體和Pyk2抗體作為一抗檢測。如果二者表達最多的峰值是在同一個組分中，則提示我們二者在細胞內是共定位的。取上述二者的表達較多的組分，用Pyk2單抗免疫沉淀Pyk2（免疫球蛋白作對照），然后用E-cadherin單抗雜交檢測E-cadherin是否能與Pyk2共沉淀下來。相反方向則是：用E-cadherin單抗免疫沉淀E-cadherin（免疫球蛋白作對照），然后用Pyk2單抗雜交檢測Pyk2是否能與E-cadherin共沉淀下來。３.技術路線（見下圖）定點突變，定點突變，GST-pulldown，免疫共沉淀等方法驗證確定相互作用的結構域以及位點熒光共定位，免疫組化，蔗糖密度梯度超速離心等方法驗證在細胞以及腫瘤組織中共定位收集肝癌病人標本和臨床資料免疫組化、Western等方法檢測E-cadherin蛋白水平、磷酸化狀態和Pyk2表達量的相關性，以及與肝癌轉移的相關性。磷酸化實驗確定E-cadherin是否是Pyk2的磷酸化底物，以及磷酸化位點細胞遷移實驗:測Pyk2蛋白過表達和RNAi抑制時與E-cadherin磷酸化水平、細胞遷移的關系。篩選穩定表達Pyk2肝癌細胞株，檢測Pyk2蛋白表達量與E-cadherin磷酸化水平的關系。裸鼠成瘤轉移實驗:Pyk2蛋白表達量、E-cadherin磷酸化水平與腫瘤轉移的關系。匯總分析數據：揭示Pyk2磷酸化E-cadherin機制；揭示Pyk2通過磷酸化E-cadherin影響肝癌細胞遷移和腫瘤轉移的機制。左側部分：取E-cadherin與Pyk2不同結構域和不同突變體，應用酵母雙雜交、GST-PullDown以及免疫共沉淀的方法確定二者相互作用的結構域，以及作用位點。熒光共定位，免疫組化，蔗糖密度梯度超速離心等方法驗證二者在細胞以及腫瘤組織中共定位；磷酸化實驗確定E-cadherin是Pyk2的磷酸化底物，以及磷酸化位點。這部分內容從生化的角度確定Pyk2磷酸化E-cadherin的分子機制。中間部分：通過細胞遷移實驗、裸鼠成瘤轉移實驗從細胞水平、動物模型確定：Pyk2通過磷酸化E-cadherin影響肝癌細胞遷移和腫瘤轉移的機制。右側部分：收集肝癌病人標本和臨床資料，通過免疫組化、Western等方法檢測E-cadherin/Pyk2蛋白水平、磷酸化狀態，分析二者表達量的相關性，以及與肝癌轉移的相關性。最下面部分為匯總數據，總結分析。4.可行性分析前期實驗已經從酵母雙雜交、GST-PullDown、免疫共沉淀等證實了E-cadherin與Pyk2相互作用(見研究基礎部分)，而且二者功能上密切相關。E-cadherin作為一種細胞黏附分子在細胞黏附、細胞遷移和接觸抑制方面具有作用。而Pyk2能通過各種信號途徑參與調節細胞黏附、擴散和遷移等過程。因此，二者在功能上是有互相作用基礎的。考慮到Pyk2是一個激酶蛋白，且前期實驗結果提示Pyk2激酶區域結合E-cadherin，因此有兩種可能，一種是Pyk2磷酸化E-cadherin，另外一種是E-cadherin抑制Pyk2激酶活性。我們認為第一種可能性較大。根據文獻報道，Pyk2能磷酸化E-cadherin的同源蛋白VE-cadherin并且抑制其與Catenin、P120等形成復合體，從而影響細胞遷移。E-cadherin與VE-cadherin同源性很高，理化性質相似，Pyk2能夠磷酸化VE-cadherin應該就有可能磷酸化E-cadherin。因此我們有理由推測，由于腫瘤始動因素的作用，Pyk2表達增多，活性增強，從而磷酸化E-cadherin，導致E-cadherin降解，最終使細胞遷移性增強。我們上述實驗設計基本基于這個邏輯。磷酸化實驗證實Pyk2磷酸化E-cadherin，導致E-cadherin蛋白減少。細胞遷移實驗和動物實驗設計邏輯是通過Pyk2過表達，檢測E-cadherin磷酸化增強，蛋白量減少，導致細胞遷移增強或者腫瘤轉移增加；RNAi抑制Pyk2的表達，則出現相反的結果，E-cadherin磷酸化減弱，蛋白量增加，導致細胞侵襲性減弱和腫瘤肺轉移減少。事實是否如此，需要實驗來證明。申請人以前的工作曾發現鈣粘附蛋白家族的另外一個成員γ-Protocadherins能夠抑制Pyk2的活性，因此從邏輯上講也不能完全排除第二種可能性，即E-cadherin抑制Pyk2的磷酸激酶活性。如果是這樣的話，則可能的假設是：在正常細胞中，E-cadherin抑制Pyk2的活性，在腫瘤條件下，由于其他原因E-cadherin減少或消失，而不能抑制Pyk2活性，導致Pyk2活性增強，因而腫瘤細胞遷移性增強。如果基于這個邏輯的話，實驗設計就要改變為：磷酸化實驗時應用酪氨酸激酶的通用底物E4Y1作為底物，觀察E-cadherin對Pyk2激酶活性是否有抑制作用。然后篩選E-cadherin過表達、功能失活突變體和空載體的穩定表達肝癌細胞株，然后行細胞遷移實驗和裸鼠成瘤實驗，觀察E-cadherin蛋白過表達或功能失活突變后與細胞遷移或者腫瘤轉移的關系，同時檢測其與Pyk2蛋白表達量及磷酸化水平相關性。但是申請人在完成γ-Protocadherins抑制Pyk2的活性的工作中曾取E-cadherin做對比參照，結果發現E-cadherin抑制Pyk2激酶活性不是很明顯，因此這種可能性不大。從上面的分析來看，本課題在理論和邏輯上是可行的。2）本課題是本人前期工作的延續，本人對E-cadherin/Pyk2的研究非常熟悉，前期工作構建的質粒表達載體等為本課題的下一步研究提供了很多有利的條件。本課題組的成員對所需要的技術方法都很熟練，且都有相應的工作基礎，可以在各個方面進行協作。3）本課題所涉及的技術均為較成熟的技術，所需的設備和條件本校都具備。（四）本課題的特色與創新之處1.本課題通過酵母雙雜交新發現一個與E-cadherin相互作用的蛋白--非受體型酪氨酸激酶Pyk2，并證明兩者的相互作用可靠，國內外研究至今未曾見過報道，具有國際先進性和獨創性。（有報道二者的表達量與腫瘤轉移的關系，但是二者直接相互作用未見報道。）2.本課題新發現Pyk2磷酸化E-cadherin影響肝癌細胞轉移的機制，對于E-cadherin在肝癌轉移過程中的分子機制有新的理解，因此具有獨創性和先進性。（五）年度研究計劃及預期研究結果1.年度研究計劃磷酸化實驗確定二者的調節關系，肝癌組織內源免疫共沉淀確定相互作用可靠，同時確定二者結合的結構域，磷酸化位點。蔗糖密度梯度超速離心，熒光共定位等相關的實驗進一步確證二者共定位。同時收集病例標本，收集臨床資料。純化蛋白制備抗體。細胞遷移實驗，裸鼠成瘤腫瘤轉移實驗檢測Pyk2的表達與E-cadherin的磷酸化狀態，以及細胞遷移的關系，確定其調節機制。同時完成E-cadherin/Pyk2的表達以及磷酸化狀態與肝癌的分期、轉移、預后、復發等臨床指標的相關性分析。補充實驗遺漏，整理實驗資料，統計處理實驗數據，撰寫論文。2.預期研究結果1)確定Pyk2能夠磷酸化E-cadherin，以及二者相互作用的結構域以及磷酸化位點。2)確定Pyk2通過磷酸化E-cadherin，從而影響肝癌細胞遷移和腫瘤轉移。3)確定在肝癌組織中E-cadherin蛋白水平、磷酸化狀態和Pyk2表達量的相關性，以及二者的表達與肝癌轉移的相關性。4)在國外學術期刊上發表SCI論文2-4篇，其中影響因子大于5的有一篇以上。在國內核心期刊發表論文2-4篇，并在國內外學術會議交流。5)培養研究生2-3名。二、研究基礎與工作條件（一）研究基礎第一步：為了研究肝癌轉移的機制，首先選取E-cadherin（胞內段，以下實驗同）為誘餌在肝臟的cDNA文庫中做酵母雙雜交，尋找與E-cadherin相互作用的蛋白。我們先選取的是LACZ系統藍白斑篩選，但是因為背景高而放棄。后來選取CytoTRAP系統，背景明顯減低，測序后有意義的基因有31個。其中有4個為Pyk2片段。通過克隆Pyk2基因全長驗證，確定二者在酵母中的相互作用是強陽性的（圖1）。（同時驗證Pyk2的同源蛋白FAK與E-cadherin相互作用為可疑弱陽性）。圖1酵母雙雜交（CytoTRAP系統）驗證Pyk2與E-cadherin相互作用pMyr-Lamin為陰性對照，pMyr-SB為陽性對照，E-Cad為E-Cadherin縮寫，以下圖示與此相同。Psos-E-Cad為誘餌蛋白。CytoTRAP系統酵母雙雜交特點為兩個蛋白如果不相互作用在25℃時可以生長，而在37第二步：原核表達E-cadherin和His-Pyk2進行GST-Pulldown。為了驗證二者是直接結合，我們分別細菌中表達純化GST-E-cadherin和His-Pyk2，可惜His-Pyk2全長非常難純化，得不到純化的蛋白。我們表達純化了His-Pyk2的激酶部分。GST-Pulldown實驗結果證實Pyk2的激酶部分能夠與E-cadherin直接結合（圖2）。泳道123圖2原核表達E-cadherin和His-Pyk2激酶部分進行GST-Pulldown。分別原核表達GST、GST-E-cadherin和His-Pyk2激酶部分，取等量GST、GST-E-cadherin分別與相同量的His-Pyk2激酶部分混合，加入谷胱甘肽瓊脂