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文檔簡介

《微陣列設計與分析》

第一章緒論黃仲曦基礎醫學院腫瘤研究所微陣列技術起源腫瘤基因組解剖計劃檢測正常、癌前和癌細胞的基因組改變，提高病人的檢測、診斷和治療。1996年啟動TheCANCERGENOMEANATOMYPROJECT(CGAP)OnceaMolecularBlackBox細胞的奧秘CytoplasmNucleusGrowthfactorsHormones疾病的進程NormalcellMolecularchangesYear10Year6Year3Year0Cancercell細胞組成HumancellChromosomesCytoplasmNucleusDNADNAmolecule(chromosome)ChemicalbasesATCGGenesFunctionalRegionsWithinDNAMoleculesGene3Gene2NoncodingregionGene1NoncodingregionGenes“SwitchOn”GCCUGCCTCGGASectionofswitched-ongenemRNAGenetomRNAtoProteinCellnucleusGrowingproteinchainUniqueproteinRibosomemRNACancer–GenesWithDesignProblemsmRNAToomuchproteinNormalamountofproteinNoproteinCellnucleusAlterationShortenedproteinProteinwithaspellingmistakeExpressionProfilesProstateTissue,NormalBreastTissue,NormalExpressionProfilesinCancerProstateTissue,CancerProstateTissue,NormalHereisonesimplifiedexampleinprostatetissueof

howanormalcellmightdifferfromacancerousone.MeasuringExpressionProfilesStep1.IsolatingthemRNATesttubeStationarysupportpolyTpolyAmRNAMeasuringExpressionProfilesStep2.ConvertingmRNAintocDNAmRNATesttubeMeasuringExpressionProfilesStep3.ConvertingthecDNAintoacDNALibraryE.colibacteriumcDNAlibrarycDNAinsertedintoplasmidMeasuringExpressionProfilesStep4.IsolatingEachBacteriumcDNAlibraryMeasuringExpressionProfilesStep5.IdentifyingtheClonesESTSequencesDatabaseEST:ExpressionSequenceTagActiveGenetoESTESTSequencesDatabasemRNApolyAStationarysupportpolyTCGAPHelpsCancerResearchintheLabGeneAnalysisandGeneDiscoveryESTDatabaseNowThenNewgeneCGAPHelpsCancerResearchintheLabUnderstandingMoreAboutCancerBiologyICGAPHelpsCancerResearchintheLabUnderstandingMoreAboutCancerBiologyIICGAPHelpsCancerResearchintheLabUnderstandingMoreAboutCancerBiologyIIICGAPHelpsCancerResearchintheLabUnderstandingMoreAboutCancerBiologyIVCGAPHelpsCancerResearchintheClinicUnderstandingMoreAboutCancerBiologyGlassslidecDNAsmRNAsGenesProstate-SpecificMicroarrayProstateTissue,NormalProstateTissue,CancerCGAPHelpsCancerResearchintheClinicStep1.MicroarraysinDiagnosismRNAsFluorescentdyemRNAsPatient2Prostate-SpecificMicroarraysPatient1CGAPHelpsCancerResearchintheClinicStep2.MicroarraysinDiagnosisPatient2Patient1CGAPHelpsCancerResearchintheClinicStep3.MicroarraysinDiagnosisPatient2CancerPatient1Patient2ProstateExpressionProfilesPatient1NocancerCGAPHelpsCancerResearchintheClinicDifferentiatingBe

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