蛋白質結構域數據庫1、紀律是管理關系的形式。——阿法納西耶夫2、改革如果不講紀律，就難以成功。3、道德行為訓練，不是通過語言影響，而是讓兒童練習良好道德行為，克服懶惰、輕率、不守紀律、頹廢等不良行為。4、學校沒有紀律便如磨房里沒有水。——夸美紐斯5、教導兒童服從真理、服從集體，養成兒童自覺的紀律性，這是兒童道德教育最重要的部分。——陳鶴琴蛋白質結構域數據庫蛋白質結構域數據庫1、紀律是管理關系的形式。——阿法納西耶夫2、改革如果不講紀律，就難以成功。3、道德行為訓練，不是通過語言影響，而是讓兒童練習良好道德行為，克服懶惰、輕率、不守紀律、頹廢等不良行為。4、學校沒有紀律便如磨房里沒有水。——夸美紐斯5、教導兒童服從真理、服從集體，養成兒童自覺的紀律性，這是兒童道德教育最重要的部分。——陳鶴琴蛋白質結構與功能預測DNAsequencegenomeProteinsequenceProteinstructureperformmanycellularfunctionsProteinfunction一、積累知識巧婦難為無米之炊，創新必須以知識的積累為基礎。一個人的知識經驗越豐富，創新意識產生的機會就越多。直覺與一個人的知識經驗有密切的關系。通常，我們把活躍于顯意識的知識經驗稱為"知識塊"，而把沉積于潛意識的知識經驗稱為"潛知"。"知識塊"積累越多，形成各種聯想的可能性就越大。這樣，當面臨某一情境時，就能在極短的時間里，憑直覺識別。教學中，教師應注意學生創新意識的積累。創新意識主要表現在能夠同中求異，異中見同，平中見奇，具有質疑品質和問題意識。如《草船借箭》，別人想到的都是"造"箭，獨諸葛亮想到用"借"的方式智取10萬枝箭，成為千古絕唱。教授這篇課文時，不僅要啟發學生學習他奇妙的創新之舉，而且也要體會諸葛亮創新意識的直覺基礎--知人心，曉天文，懂地理。這正是創新意識品質，同樣是創新意識方法戰勝了常態意識方法。教學時教師要引導學生理解創新意識并不是天上掉下來的餡餅，而是有其深厚的知識積累。在日常教學中幫助學生積累知識經驗，為創新直覺的培養提供物質前提。語文課本中這樣的例子舉不勝舉：《鹿柴》中的"空山不見人，但聞人語響。"用"聲"反襯"靜"，"返景入深林，復照青臺上。"用"光"反襯"暗"。這首詩中創新意識的運用使其寥寥數筆便刻畫了一個栩栩如生的境界。別人寫小動物總愛寫其可愛的一面，老舍卻從"性格古怪"入物，同中求異。《司馬光》中別人想的都是"讓人離開水"，而司馬光想的卻是"讓水離開人"。再如作文教學，如果我們再自欺欺人地布置《一件小事》、《一件難忘的事》、《一件有意義的事》......那么我們只能生產出一批應試作文的機器。這樣的教學，不可能教出具有創新意識的人。教師應善于把握教材中的這些點滴契機，除了課本，教師應從不同的渠道為學生提供創新意識的空間。二、激發靈感創新源于靈感，沒有靈感就沒有創造。從心理學角度看，靈感是創造活動達到高潮時出現的一種心理狀態，在這種狀態下，人的注意力高度集中在思考的問題上，意識處于十分清晰、敏銳的狀態下，意識活動極為活躍，因此，新思路、新形象、新觀念往往一下子就從頭腦中冒了出來。靈感是直覺被激活的火花，是創造意識中出現的復雜的心理現象。"厚積而薄發"：厚積是直覺積累，薄發是靈感閃現。在教學《林海》一課時，為了讓學生體會文章的語言文字美，我采用了"比較"的方法，出示了兩個句子：1.綠顏色真多呀，數不勝數。2.多少種綠顏色呀，深的，淺的，明的，暗的，綠得難以形容。恐怕只有畫家才能描出這么多的綠顏色來呢！（課文原句）同學們都知道2句好，問得深入一些："為什么2句好？"在固定思路和習慣的引導下，學生大多千篇一律地回答："生動。"我啟發學生："用上修辭方法說一說好在哪里？"一個學生靈機一動："1句像一杯白開水，喝了就忘，2句像可樂，喝了還想喝。"教師要把握教育時機，善于點撥，激發學生的靈感，在課堂教學中培養學生的創新意識，讓學生享受到意識創造的快樂。靈感被激活，意識的閘門一旦打開，便一瀉千里，暢快淋漓。在這樣的訓練中，語言和意識同時得到訓練。又例如給水果拼盤起名字，開始學生起的名字都很普通："百花齊放"、"一枝獨秀"等，我啟發他們進行求異意識，換個角度看。例如站在"水果的一生"的角度看，可以起名："最后的時刻"。受到啟發，一個學生站在小螞蟻的角度給果盤起了個名字："迷宮"，還有個學生沒帶水果，他用別人不用的水果皮做了個拼盤，起名"果盤吃完以后"。對于靈感，要善于捕捉，要引導學生通過求異意識擺脫意識定勢，打破按固定思路、習慣考慮問題的枷鎖，使學生敢于大膽地想，大膽地說，聽、說、讀、寫更富有創造力，從而激發創新靈感。三、培養想象力想象比知識更重要。人類歷史上，許多偉大的科學發現和科學發明都來自科學家的"突發奇想"和"異想天開"。事物的表象會引發人的一連串聯想，聯想的深度和廣度直接影響著人的創造力。訓練學生的想象能力是創新意識訓練的有利措施，特別是兒童的"奇思妙想"和"異想天開"，是最有創造潛力的。一次，我在課堂上提了這么一個問題："核桃，人人都愛吃，可是要敲碎核桃殼取出完整的核桃仁卻十分麻煩。你有什么好辦法？"同學們提出了許多奇思妙想，有的說："讓農民伯伯改良核桃的品種，使核桃成熟時自動裂開。"有的說："發明一種機器，專門去核桃殼。"還有的說："老師，足球的氣打得太足就會炸，如果往核桃里打氣，讓核桃也炸開行嗎？"我和同學們聽著，都不由得為這些富有創造性的想法而激動起來，集體的智慧調動了個人的智慧，大家暢所欲言，開闊了意識。有個小女孩突發奇想：如果蘋果是方的，就不會到處亂滾了。他爸爸受女兒的啟發，將各種形狀的玻璃容器套在剛長出的西瓜上，培育出了便于運輸的方西瓜。可見，培養孩子的創新意識有多重要。事實上，正是喜歡"異想天開"的孩子，才是最有創造潛力、最具發展前途的人。因此，教師和家長應大膽面對孩子的想象，不要把孩子的"異想天開"視作"怪癖"，挫傷他們，應加倍關注愛幻想、愛標新立異、有獨特見解的孩子，充分挖掘其"異想天開"中的合理因素，使他們敢想敢說，勇于創新。美國和日本早在70年前就十分重視創新意識和能力的訓練。陶行知先生說："處處是創造之地，天天是創造之時，人人是創造之人......"每個人的身上都蘊藏著豐富的創造潛能，然而這種創造潛能猶如干柴，只有教師用不懈追求的熱情才能點燃。在語文教學中培養學生的創新意識和能力是每一位教師肩負的神圣而艱巨的任務。創造性閱讀教學是指教師和學生將已掌握的語言、思想、知識與方法進行重組，從而獲得新的語言、思想、知識與方法的互動交流的過程。這種教學關注的中心是創造性，即主動地發現探索和多角度的思考。它體現的特點是語言性和基礎性，在語言文字的學習中培養學生基本的創造意識和創造能力。創造從何而來？――從思維推理而來！“邏輯規則，或者更準確地說，推理規則，是程序的規則。”（卡爾?波普《猜想與反駁》）課的結構是作為有益的組織知識，作為一種指示和標準理論而被人們理解和運用的。然而由于人們過多地強調“教無定法”而忽視了教學應當有“法”的一面，忽視了對這種“組織知識”的研究。教學模式就是對“組織知識”的研究與運用。教學模式是指在一定的教育思想指導下，在豐富的教學實踐經驗基礎上，為完成特定的教學目標和教學內容而建立起來的、較為穩定的教學結構框架和可以操作的教學活動程序。所有的教學都需要一種程序，激發智慧的創造性教學更是如此。我們在實踐中構建并運用了“引―探―啟―練―悟”五環節創造性閱讀教學模式，使教學顯示出了科學的思維規則，收到了較為理想的效果。一、模式的操作程序與理論依據引：教師引出創造性閱讀的話題，或提供創造性閱讀的素材，引領學生進入創造性閱讀的課堂情境，引發學生的創造意識。第斯多惠認為：“教學的藝術不在于傳授的本領，而在于激勵、喚醒、鼓舞。”《語文課程標準》指出：“利用閱讀期待、閱讀反思和批判等環節，拓展思維空間，提高閱讀質量。”探：讓學生在自主閱讀的過程中，有意識地發現問題，并通過提問將自己朦朧的問題清晰化，然后調動自己的知識儲備和學習經驗分析問題，并嘗試解決問題。蘇霍姆林斯基認為：“讓學生體驗到一種自己在親自參與掌握知識的情感，乃是喚起學生特有對知識興趣的重要條件。”《語文課程標準》指出：“積極倡導自主、合作、探究的學習方式。”啟：對于學生無法獨立解決的疑難問題，教師從思維方法、知識要點等方面“點”一下，讓學生再度涵泳體味，再次動腦深入地分析問題，順暢地解決問題，從而得到更深的印象，獲得更大的益處。孔子曰：“不憤不啟，不悱不發，舉一隅不以三隅也，則不復也。”《語文課程標準》指出：“提倡啟發式、討論式教學。”練：設計典型的練習題，讓學生在鞏固知識、應用方法的過程中強化創造思維，歷練學生的創造技能。呂叔湘先生說：“語文的使用是一種技能，一種習慣，只有通過正確的模仿和反復的實踐才能養成。”《語文課程標準》指出：“語文教學要注重語文的積累、感悟和運用，注重基本技能的訓練，給學生打下扎實的語文基礎。”悟：讓學生或從文章整體切入，或從某個要點切入，用靜思、對比、聯想等形式品味語言，揣摩方法，把“只可意會，不可言傳”的東西心領神會，從而茅塞頓開，提升能力。這是語文教學的特別之法――悟。嚴羽在《滄浪詩話》中說：“大抵禪道惟在妙悟，詩道亦在妙悟。”《語文課程標準》指出：“讓學生在積極主動的思維和情感活動中，加深理解和體驗，有所感悟和思考，受到情感熏陶，獲得思想啟迪，享受審美樂趣。要珍視學生獨特的感受、體驗和理解。”二、五環模式的特點《語文課程標準》指出：“學生是語文學習的主人”，“教師是學習活動的組織者和引導者”。本模式充分體現出了學生在學習中的主體性――主人角色，充分體現出了教師在教學中的主導性――組織和引導的作用，充分體現出了師生雙方在教學中“平等對話”的關系及師生雙方在教學中的主動性和創造性。“引”以教師為主，“探”完全是學生的自主行為，“啟”和“練”雖然是師生互動的活動，但明顯以學生為主，“悟”純屬學生的內心體驗。創造性閱讀教學需要創造性的教學模式支撐，在“教無定法”中顯得有法，從而使教師和學生的創造活動在井然的秩序中開展。沈海燕，教師，現居甘肅會寧。蛋白質結構與功能預測DNAsequencegenomeProteinsequenceProteinstructureperformmanycellularfunctionsProteinfunction蛋白質序列分析主要內容蛋白質基本理化性質分析蛋白質一級序列蛋白質親疏水性分析跨膜區結構預測翻譯后修飾位點預測蛋白質序列分析蛋白質二級結構預測蛋白質二級結構蛋白質序列信號位點分析蛋白質超二級結構蛋白質結構域分析蛋白質三級結構蛋白質三維結構模擬蛋白質結構預測過程蛋白質序列實驗數據數據庫搜素已知結構的同源蛋白疊模型三維結構模型從頭EXPASy(ExpertProteinAnalysisSystemTools/tools/)ExPASywebsitevAExPASyProteomicsServerDataaseToolsScesMirrorsAboutconactcreMEtKExPASyCH,Tickentificationandchaprofilesearches][PostterizationwithpeptidemassfingerprintingdatatetengdeteandmassdifferencesareusedtobLycopOd幽-Predteinsfrotheirexpelerminemasse5anbeusedforreeorde課程安排蛋白質理化性質分析口使用工具:Protparam■二、跨膜區分析口使用工具:TMpred級結構分析口使用工具:PredictProtein■四、結構域分析口使用工具:InterProScan五、蛋白質三級結構分析口使用工具:SWISS-MODEL/SW|sS-Pdbviewer數據:C:zCN|shXi4Aprotein.txt、蛋白質基本理化性質分析↓蛋白質理化性質是蛋白質研究的基礎4蛋白質的基本性質:相對分子質量氨基酸組成等電點(pl)消光系數半衰期不穩定系數總平均親水性實驗方法相對分子質量的測定、等電點實驗、沉降實驗缺點:費時、耗資4基于實驗經驗值的計算機分析方法蛋白質理化性質分析工具工具站備注AacoMpldE/tools/aacomp/利用未知蛋白質的氨基酸組成確認具有相同組成的已知蛋白Computepl/Mwhty.org/tools/pitool.htm算蛋白質序列的等電點和子量ProtparARh/tools/protparam.html對氨基酸序列多個物理和化學參數(分子量、等電點、吸光系數等)進行計算Peptidemasshttp:/expasy:org/tools/peptide-mass.htm計算相應肽段的pl和分子量SAPhttp:/isrec.isb利用蛋白質序列統計分析方sib.ch/software/SAPSform.html法給出待測蛋白的物理化學ProtParan工具4基于蛋白質序列的組分分析↓氨基酸親疏水性等分析為高級結構預測提供參考■Expasy開發的針對蛋白質基本理化性質的分析:口Protparam工具otparam.htmlProt.Paramtool計算以下物理化學性質相對分子質量氨基酸組成等電點(PI)PleasenptethefollowingHieldsatatioe.消光系數Cc)E