藥物設計與開發第一頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三半個世紀之前，人們對在細胞水平和分子水平上的生命現象了解甚少，尋找新藥的方法多是基于經驗和嘗試，主要是通過大量化合物的篩選與偶然發現。靠這種方法發現了大批治療藥物。但它的不可預見性和盲目性，人力和物力的巨大消耗，發現新藥的成功率越來越低，促使人們發展具有較高預測性的更合理的研究方法。第二頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三發現新藥的途徑…第三頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三隨著生命科學的相關學科在上世紀后半期的迅速發展，定量構效關系、合理藥物設計、計算機輔助藥物設計、組合化學、高通量篩選等新技術、新方法不斷涌現，基因技術被應用到新藥的研究之中，新藥設計學也應運而生。近十年來，新藥設計與開發有了突飛猛進的發展，優良的新藥不斷問世，為世界制藥工業帶來了勃勃生機。第四頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三新藥設計新技術…第五頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三

藥物作用的生物學基礎第六頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三根據藥物在分子水平上的作用方式，可把藥物分成兩種類型，即非特異性結構藥物（StructurallyNonspecificDrug）和特異性結構藥物（StructurallySpecificDrug）。非特異性結構藥物的藥理作用與化學結構類型的關系較少，主要受藥物的理化性質的影響。如全身麻醉藥（氣體、低分子量的鹵烴、醇、醚、烯烴等），其作用主要受藥物的脂水（氣）分配系數的影響。特異性結構藥物發揮藥效的本質是藥物小分子與受體生物大分子的有效結合，這包括二者在立體空間上互補；在電荷分布上相匹配，通過各種鍵力的作用使二者相互結合，進而引起受體生物大分子構象的改變，觸發機體微環境產生與藥效有關的一系列生物化學反應。

第七頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三一、藥物作用的生物靶點能夠與藥物分子結合并產生藥理效應的生物大分子現通稱為藥物作用的生物靶點。這些靶點的種類主要有受體、酶、離子通道和核酸，存在于機體靶器官細胞膜上或細胞漿內。就目前上市的藥物來說，以受體為作用靶點的藥物約占52%；以酶為作用靶點的藥物約占22%；以離子通道為作用靶點的藥物約占6%；以核酸為作用靶點的藥物約占3％；其余17％藥物的作用靶點尚不清楚。

第八頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三1.以受體為靶點藥物與受體結合才能產生藥效。理想的藥物必須具有高度的選擇性和特異性。選擇性要求藥物對某種病理狀態產生穩定的功效。特異性是指藥物對疾病的某一生理、生化過程有特定的作用，此即要求藥物僅與疾病治療相關聯的受體或受體亞型產生結合。第九頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三現已有幾百種作用于受體的新藥問世，其中絕大多數是GPCR的激動劑或拮抗劑。例如，治療高血壓的血管緊張素II受體拮抗劑洛沙坦、依普沙坦，中樞鎮痛的阿片受體激動劑丁丙諾啡、布托啡諾，a-受體激動劑阿芬他尼等。

第十頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三G-蛋白偶聯受體（G-proteincross-linkedreceptor）第十一頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三G蛋白偶聯型受體－G蛋白－腺苷酸環化酶信號轉導途徑示意圖第十二頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三G蛋白偶聯型受體－G蛋白－腺苷酸環化酶信號轉導途徑示意圖第十三頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三近年來，受體的亞型及新受體不斷被發現和克隆表達，有關它們的生化、生理、藥理性質也相繼被闡明，為新藥的設計和研究提供了更準確的靶點和理論基礎和降低藥物毒副作用作出了很大的貢獻。現已知道，腎上腺能受體有a1、a2、bl、b2、b3亞型，多巴胺受體有Dl、D2、D3、D4、D5亞型，阿片受體有m、k、s、d、e亞型等。孤兒受體(orphanreceptor)是近年來提出的一種新概念，是指其編碼基因與某一類受體家族成員的編碼有同源性，但目前在體內還沒有發現其相應的配基。第十四頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三2.以酶為靶點：

由于酶催化生成或滅活一些生理反應的介質和調控劑，因此，酶構成了一類重要的藥物作用靶點。酶抑制劑通過抑制某些代謝過程，降低酶促反應產物的濃度而發揮其藥理作用。理想的酶抑制劑藥物，應該對靶酶有高度親和力和特異性。近年來，基于細胞代謝理論的指導，合理設計的酶抑制劑類藥物發展較快，目前世界上銷售量最大的20個藥物中有近一半為酶抑制劑類藥物。

第十五頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三近年來，酶抑制劑研究比較活躍的領域有：降壓藥的血管緊張素轉化酶（ACE）抑制劑，腎素抑制劑，調血脂藥HMG-CoA還原酶抑制劑非甾體抗炎藥物中的環氧化酶-2（COX-2）抑制劑，抗腫瘤藥物中的芳構化酶抑制劑抗前列腺增生治療藥中的5a-還原酶抑制劑等一氧化氮(NO)作為生物體內的重要信使分子和效應分子，在心血管、神經和免疫系統方面具有重要的生理功能。但過量產生或釋放時能介導多種疾病的發生和發展。一氧化氮合成酶(NOS)抑制劑可阻止NO過量生成。NO以及有關的NOS抑制劑的研究已成為近年來生物醫學和藥學研究的前沿領域之一。第十六頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三3.以離子通道為靶點：

帶電荷的離子由離子通道出入細胞，不斷運動、傳輸信息，構成了生命過程的重要組成部分，保持著生物體中細胞與細胞間的有效聯系。離子通道的阻滯劑和激活劑調節離子進出細胞的量，進而調節相應的生理功能，可用于疾病的治療。K+,Cl-

ChannelcurrentsPumpExchangerK+Ca2+Na+Na+Ca2+OutsideNa+insideMembrance第十七頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三這方面的研究近年來進展較快。如：

作用于Na+通道的藥物有奎尼丁、美西律、普羅帕酮等。作用于Ca2+通道的藥物有二氫吡啶類、苯烴胺類和硫氮雜卓類等，如硝苯地平、尼卡地平、尼莫地平

作用于K+通道的藥物主要為K+-ATP酶的激活劑和拮抗劑，如治療II型糖尿病的甲苯磺丁脲、格列本脲為K+通道的拮抗劑；而尼可地爾和吡那地爾為K+通道的激活劑，主要用于高血壓、心絞痛的治療。

III類抗心律失常藥物多為K+通道拮抗劑，主要藥物有胺碘酮、索他洛爾等。

第十八頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三4.以核酸為靶點：

人們普遍認為腫瘤的癌變是由于基因突變導致基因表達失調和細胞無限增殖所引起的。因此，可將癌基因作為藥物設計的靶，利用反義技術(antisensetechnology)抑制癌細胞增殖。以已知的抗腫瘤藥物為先導，以DNA為靶點設計新的抗癌藥物也正在開展。

第十九頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三二、藥物作用的體內過程藥物在體內發揮治療作用的關鍵與其在作用部位的濃度和與生物靶點相互作用（阻斷或刺激）的能力有關。藥物的作用必須考慮影響藥物療效的兩個基本因素，一個是藥物到達作用部位的濃度，以藥物作用的動力學時相（pharmacokineticphase）來描述。另一個重要因素是藥物與生物靶點的特異性結合，以藥物作用的藥效學時相（pharmcodynamicphase）來闡述。第二十頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三1.動力學時相：

對于一個藥物來說，除了必須考慮它與生物靶點的相互作用之外，還要考慮它在體內的吸收、分布、代謝和消除(ADME)。藥物的結構決定其物理化學性質，理化性質又決定其在體內的藥物動力學過程。一個藥物結構改變而引起療效的差異，很可能與影響其體內動力學過程有關。

吸收(absorption）分布(distribution)代謝(metabolism)排泄(excretion)

第二十一頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三2．藥效學時相：

結構特異性藥物發揮藥效的本質是藥物有機小分子經吸收、分布到達其作用的生物靶點后，與受體生物大分子相互作用的結果。藥物與受體分子結合形成復合物，進而引起受體構象的改變，觸發機體微環境產生與藥效有關的一系列生理效應。

第二十二頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三三、藥物一受體相互作用的化學本質藥物分子和受體的結合，除靜電相互作用外，主要是通過各種化學鍵連接，形成藥物-受體復合物，其中共價鍵的鍵能很大，結合是不可逆的。下面討論藥物與受體間可能產生的幾種化學鍵的情況。生長因子和受體…第二十三頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三1．共價鍵結合：

這是藥物和受體間可以產生的最強的結合鍵，它難以形成，但一旦形成也不易斷裂。某些有機磷殺蟲藥、膽堿酯酶抑制劑和烷化劑類抗腫瘤藥都是通過與其作用的生物受體間形成共價鍵結合而發揮作用的。第二十四頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三具有高張力的四元環內酯或內酰胺類藥物如β-內酰胺類抗生素也是同樣的情況。青霉素的抗菌作用就是由于它能和細菌細胞壁生物合成中的轉肽酶生成共價鍵，從而使轉肽酶失活。第二十五頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三2．非共價鍵的相互作用：

化療藥物和受體之間生成鍵能較大的不可逆的共價鍵，保持藥物與生物靶點的持久性結合，對于殺滅病原微生物和腫瘤細胞往往是理想的。而對于中樞神經系統藥物來說，藥物和受體間持久作用是非常有害的，人們希望其藥理作用只在較短時間內持續。藥物和相應受體間的結合通常建立在離子鍵或更弱的結合力上，這些力對于形成的藥物和受體復合物來說已足夠牢固和穩定，使其不太易于從作用部位除去。

第二十六頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三帶有電荷的蛋白多肽鏈

…第二十七頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三藥物-受體之間形成的這種離子鍵的結合，是非共價鍵中最強的一種，是藥物受體復合物形成過程中的第一個結合點。其他尚有多種非共價鍵形式，在藥物-受體相互作用過程中起著重要的作用。第二十八頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三受體大多是蛋白質。若一個藥物分子結構中的電荷分布正好與其特定受體區域相適應，那么藥物的正電荷（或部分正電荷）與受體的負電荷（或部分負電荷）產生靜電引力。藥物的負電荷（或部分負電荷）與受體的正電荷（或部分正電荷）產生靜電引力。當接近到一定程度時，分子的其余部分還能與受體通過分子間普遍存在的范德華引力相互吸引，這樣藥物與受體就結合形成復合物。

第二十九頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三局部麻醉藥分子與受體相互作用模型…

第三十頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三四、藥物與受體相互作用的立體效應由蛋白質組成的受體，有一定的三維空間結構。在藥物與受體的各原子或基團間相互作用時，作用的原子或基團間的距離對于相互的引力有重要的影響。藥物中官能團間的距離，手征性中心及取代基空間排列的改變，均能強烈地影響藥物受體復合物的互補性，從而影響藥物和受體的結合。第三十一頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三由于受體和藥物都是三維實體，也導致了藥物的立體異構，即幾何異構和光學異構對藥物活性有較大的影響。幾何異構是由雙鍵或環等剛性或半剛性系統導致分子內旋轉受到限制而產生的。幾何異構體的理化性質和生理活性都有較大的差異，如順、反式已烯雌酚的例子。第三十二頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三光學異構分子中存在手性中心，兩個對映體除了將偏振光向不同的方向旋轉外，有著相同的物理性質和化學性質。但其生理活性則有不同的情況。有些藥物光學異構體的藥理作用相同，例如左旋和右旋氯喹具有相同的抗瘧活性。但在很多藥物中，左旋體和右旋體的生物活性并不相同，例如D-（-）-異丙基腎上腺素作為支氣管舒張劑，比L-（+）-異丙基腎上腺素強800倍。第三十三頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三藥物中光學異構體生理活性的差異反映了藥物與受體結合時的較高的立體要求。一般認為，這類藥物需要通過三點與受體結合，如圖12-8中D-（-）腎上腺素通過下列三個基團與受體在三點結合：1）氨基；2）苯環及其二個酚羥基；3）側鏈上的醇羥基。而L-異構體只能有兩點結合。第三十四頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三有一些藥物，左旋體和右旋體的生物活性類型都不一樣，如扎考必利（Zacopride）是通過拮抗5-HT3受體而起作用，為一類新型的抗精神病藥。深入地研究證明，（R）-異構體為5-HT3受體的拮抗劑，而（S）-異構體則為5-HT3受體的激動劑。

第三十五頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三除了藥物受體對藥物的光學活性有選擇性外，由于生物膜、血漿和組織上的受體蛋白和酶，對藥物進入機體后的吸收、分布和排泄過程，均有立體選擇性地優先通過與結合的情況，可導致藥效上的差別。胃腸道對D-葡萄糖，L-氨基酸，L-甲氨蝶呤和L（+）抗壞血酸等有立體選擇性，可優先吸收，主動轉運。在藥物代謝過程中代謝酶對藥物的立體選擇性也可導致代謝差異，代謝酶多為光學活性的大分子。可導致代謝速率和藥效、毒性的差異。第三十六頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三

藥物開發的基本途徑與方法第三十七頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三有目的的研究一個新藥，首先要確定其治療用途，藥物在體內可能作用的靶點和判定藥物活性的藥理模型，在這些基礎上進行藥物化學的研究工作。新藥的藥物化學研究通常分為兩個階段，一是發現先導化合物，二是對先導化合物進行結構優化。第三十八頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三一、先導化合物的發現先導化合物是現代新藥研究的出發點。先導化合物是指有獨特結構且具有一定生物活性的化合物。它可能因為活性太小，選擇性不高，或藥代動力學性質不好，不能作為新藥開發；但可以在該化合物結構的基礎上，進行一系列的結構改造或修飾，得到符合治療要求的新藥。先導化合物大體是通過四個途徑發現的，即：從天然產物中得到；以現有的藥物作為新藥研究的基礎；用藥理模型篩選新藥；根據生理病理機制設計藥物。第三十九頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三1、從天然資源得到先導化合物從中藥青蒿中分離出的抗瘧有效成分青蒿素，對耐氯喹的瘧原蟲有極高的殺滅作用。后采用結構修飾的方法合成了抗瘧效果更好的蒿甲醚和青蒿素琥珀酸酯，療效比青蒿素高5倍，且毒性比青蒿素低。從微生物資源的開發中，能獲得新藥和供研究用的先導化合物，近代應用超敏菌株與特異靶方法發現了許多新的抗生素。第四十頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三例如用對β-內酰胺類抗生素特別敏感的菌株，并用不同β-內酰胺酶作區別實驗，發現了克拉維酸和硫霉素等強力抑制β-內酰胺酶活性的藥物。第四十一頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三2、以現有的藥物作為先導物已有的藥物中有些可被選作先導物，進一步優化得到新藥。這可有以下的幾種類型。(1)由藥物副作用發現先導化合物：在某些情況下，一藥物的毒副作用可能對另一種疾病有治療作用。例如吩噻嗪類抗精神失常藥氯丙嗪及其類似物，是由結構類似的抗組胺藥異丙嗪的鎮靜副作用發展而來的。第四十二頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三(2)通過藥物代謝研究得到先導物：藥物通過體內代謝過程，可能被活化，也可能被失活，甚至轉化成有毒的化合物。采用這類先導物，得到優秀的藥物的可能性較大，甚至直接得到比原來藥物更好的藥物。例如，抗抑郁藥丙咪嗪和阿米替林的代謝物去甲丙咪嗪和去甲阿米替林，抗抑郁作用比原藥強，且有副作用小、生效快的優點。第四十三頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三(3)以現有突破性藥物作先導：近年來隨著生理生化機制的了解，得到了一些疾病治療的突破性的藥物，稱原型藥物（PrototypeDrug）。隨之出現了大量的“Me-too”藥物。“Me-too”藥物特指具有自己知識產權的藥物，其藥效和同類的突破性的藥物相當。這種旨在避開“專利”藥物的產權保護的新藥研究，大都以現有的藥物為先導物進行研究。例如蘭索拉唑及其它的拉唑的研究是以奧美拉唑為先導物的，其活性比奧美拉唑活性更強。第四十四頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三3、用活性內源性物質作先導化合物現代生理學認為，人體被化學信使（生理介質或神經遞質）所控制。體內存在一個非常復雜的信息交換系統，每一個信使都各具特殊的功能，并在其作用的特定部位被識別。患病時機體失去了平衡，而藥物治療，就是用外源性的化學物質（信使），來幫助機體恢復平衡。根據對生理病理的了解來研究新藥，被稱作合理藥物設計（RationalDrugDesign）。通常是針對與該生理活動有關的酶或受體來設計藥物。

第四十五頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三于是內源性的神經遞質，內源性的受體激動劑就順理成章的成了藥物研究的先導化合物。例如氟脲嘧啶的研究以核酸合成的核苷酸尿嘧啶作為先導化合物，將5位的氫換成氟，使之成為生物體的正常代謝物的代謝拮抗劑，用做抗腫瘤藥。第四十六頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三4、利用組合化學和高通量篩選得到先導化合物在上世紀八十年代初，科學家提出一種新藥研究的新思路，即對含有數十萬乃至數百萬個化合物的化學品庫進行同步的合成和篩選，這一方法現叫做組合化學(CombinationalChemistry)。組合化學化合物庫的構建是將一些基本小分子如氨基酸、核苷酸、單糖等通過化學或生物合成的手段裝配成不同的組合，由此得到大量具有結構多樣性的化合物分子。傳統化學合成…組合化學合成…第四十七頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三組合化學也被稱為非合理藥物設計(IrrationalDrugDesign)，其研究策略是采用構建大量不同結構的化合物庫，并不進行混合物的分離，通過高通量篩選(High-ThroughputScreening)，發現其組分具有生物活性后再進行分離并確定其結構。對沒有活性的大量化合物就不做結構確證和分離的工作。所得到的活性化合物可成為進一步研究的先導化合物。高通量篩選是組合化學能否實施的一個關鍵。以影響生命過程的一些環節的酶、受體、離子通道作為藥物作用的靶標進行分離，純化和鑒定，由此建立起分子、細胞水平的高特異性的體外篩選模型。在此基礎上加上自動化操作系統，即可以實現高通量、快速、微劑量的篩選。第四十八頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三二、先導化合物的優化方法在新藥研究過程中，確定了先導化合物后，進一步的工作就是對先導化合物進行優化，以得到與先導化合物類似結構的較好的藥物。使其活性更強、選擇性更好、毒副作用更小以及具有符合使用的藥代動力學性質。通常用于先導化合物優化的方法有：采用生物電子等排體進行替換、前藥設計、軟藥設計、定量構效關系研究等等。第四十九頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三1、采用生物電子等排體進行替換元素周期表中同族元素最外層的電子數目相等，它們的理化性質亦相似。這一關系被擴大到外層電子數相等的原子、離子或基團，被稱作電子等排體。外層電子數4567N+PSClP+AsSeBrS+SbTeI第五十頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三在半合成抗生素中，環內等價電子等排體（噻吩環、噻唑環、四氮唑環）的并相互替代應用的較多。利用生物電子電子等排體對先導化合物中的某一個基團逐個進行替換得到一系列的新化合物，是藥物化學家設計研究藥物的經典方法。對得到的化合物進行藥理篩選，可能得到比先導化合物更優的化合物或藥物。第五十一頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三2、前藥設計

藥物經過化學結構修飾后得到的化合物，在體外沒有或很少有活性，但在生物體或人體內通過酶的作用又轉化為原來的藥物而發揮藥效時，則稱原來的藥物為母體藥物(ParentDrug)，修飾后得到的化合物為前體藥物，簡稱前藥(Prodrug)。概括起來前藥設計的目的主要有以下四個方面。⑴增加藥物的代謝穩定性。⑵干擾轉運特點，使藥物定向靶細胞，提高作用選擇性。⑶消除藥物的副作用或毒性以及不適氣味。⑷改變溶解度以適應劑型的需要。第五十二頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三如羧芐青霉素口服時對胃酸不穩定，易被分解失效。將其側鏈上的羧基酯化為茚滿酯則對酸穩定，可供口服，吸收得以改善。雌二醇等天然雌激素在體內迅速代謝，作用時間短暫。與長鏈脂肪酸形成的酯類，因不溶于水而貯存于體內脂肪組織中成為延效制劑。

第五十三頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三利用作用部位的某些特異的物理及化學或生物學特性，應用前藥原理設計前體藥物，可使藥物在某些特定靶組織中定位。如果化合物具有較高毒性，但對病理組織細胞有良好治療作用，則可以在藥物分子上引入一個載體，使藥物能轉運到靶組織細胞部位，而后，通過酶的作用或化學環境的差異使前藥在該組織部位分解，釋放出母體藥物來。許多有效的抗癌藥物就是根據這種設想而設計的，例如從氮芥到環磷酰胺。

第五十四頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三許多藥物由于味覺不良而限制其應用。例如抗瘧藥奎寧具有強烈的苦味，利用奎寧分子中的羥基使其成為碳酸乙酯，由于水溶性下降而成為無味奎寧，適合于小兒應用。許多抗生素都有強烈的苦味，例如氯霉素、紅霉素等，就是利用結構中的羥基酰化作用來遮蔽苦味的，常用的前體藥物有氯霉素棕櫚酸酯和琥珀酸酯，紅霉素碳酸乙酯和硬脂酸酯等。第五十五頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三3、軟藥設計

設計出容易代謝失活的藥物，在完成治療后，按預先規定的代謝途徑和可以控制的速率分解、失活并迅速排出體外，從而避免藥物的蓄積毒性。這類藥物被稱為“軟藥”(softdrug)。阿曲庫銨在生理pH和體溫下，進行消除，生成N-甲基四氫罌粟堿和其它代謝物，鏈上的雙酯也可被血漿中的酯酶水解，這種性質避免了氯筒箭毒堿類肌肉松弛藥的蓄積中毒副作用。第五十六頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三4、定量構效關系研究

一般的構效關系的研究是根據同類藥物的結構變化，討論其活性變化的有無或趨勢，而定量構效關系是用數學函數式來表示同類藥物結構變化后活性的改變。同類藥物是指具有相同基本結構并有同一藥理作用類型的藥物。用于先導物的優化則是指同一個先導物用不同的電子等排體進行替換得的一系列同類物。利用所得的數學函數式可以預測未合成的化合物的活性和估計同類藥物中活性最優的化合物。定量構效關系經常使用的物理化學參數如下表所示：第五十七頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三第五十八頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三在使用的參數中，有的需用化合物測定，有些可根據已有數據進行計算。現在已積累了很多用于定量構效關系研究的數據，可在文獻中查到。利用這些數據可以推算未合成的化合物的數據，使之可進行活性預測。第五十九頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三利用定量構效關系方法進行先導物優化的一般過程如圖所示：第六十頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三計算機輔助藥物設計簡介

第六十一頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三隨著計算機圖形學的發展，在20世紀80年代初期出現了計算機輔助分子造型術（Computer-AidedMolecularModeling），該技術一問世，立刻受到了藥物化學家的關注。藥物化學家把該技術與新藥設計的一個分支——合理藥物設計（RationalDrugDesign）相結合，迅速發展成現在總稱為計算機輔助藥物設計（Computer-AidedDrugDesign，CADD）的一大類方法，成為新藥設計的一個有力的研究工具。依據合理藥物設計的基本假定，藥物的活性是因一個藥物的小分子（配體，Ligand）和另一個較大的分子受體（Receptor）或酶（Enzyme），通常是蛋白質分子相結合而產生的。第六十二頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三研究小分子和大分子的立體空間和化學鍵力的相互作用，是合理藥物設計的重要內容。為了直觀地表示小分子和大分子之間存在立體空間和化學結合作用，早期的研究者用示意圖和各種分子模型來進行研究。

二氫葉酸還原酶的分子模型…

第六十三頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三計算機輔助分子造型術對比歷年使用的各種示意圖和分子模型都有無比的優越性。它既可以在顯示器屏幕上建立三維化學分子結構模型，而且可利用多年來計算機化學（ComputerChemistry）的成果，在這些模型基礎上來計算各種分子的特性和分子間的相互作用。利用這種圖示化的技術，化學家可在顯示器屏幕上隨意剪裁、連接、建造和組合分子，使之適應所作用的大分子。第六十四頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三小分子和大分子結合的示意圖…

第六十五頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三計算機輔助藥物設計現包括一系列用于藥物研究的計算機圖示和計算方法，主要有：分子造形術(MolecularModel)，分子作用力學方法(MolecularMechanics)，分子動力學方法(MolecularDynamics)，靜電學方法(Electrostatics)，量子力學方法(QuantumMechanics)，計算化學方法(ComputationalAlchemy)，對接術(Docking)，從頭設計法(DeNovoDesign)，構象分子場分析方法(ConformationalMolecularFieldAnalysis，Comfa)，3-D定量構效關系(3-DQuantitativeStructure-ActivityRelationships，3-DQSAR)，藥效團建模法(PharmacophoreModeling)等。第六十六頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三廣義的計算機輔助藥物設計也包括利用計算機搜尋，檢索資料，處理信息。如現在建立的受體和酶的X-衍射數據庫，蛋白質的立體結構數據庫。組合化學（CombinationChemistry）和高通量篩選（HighThroughputScreen）也都必須使用計算機處理。第六十七頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三在用計算機輔助藥物設計時，可根據受體的化學和幾何結構是否已知，把研究的問題分成兩大類：對接問題和確定藥效團問題。如果受體的結構已知，目標為設計可置于受體的連接腔里，形成低內能的受體-藥物復合物的小分子藥物。該問題簡稱為對接問題。實際上迄今為止，采用X-射線衍射結晶法或核磁共振技術法詳盡研究過的受體的數量較少，大部分受體的三維結構都不清楚。一般是通過實驗發現受體的配體，利用這些配體的幾何結構和化學特征，通過計算機的幫助得到受體的信息，特別是得到該類藥物的藥效團(Pharmacophore)。該類問題簡稱為確定藥效團問題。

第六十八頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三現已有一些成功的實例的報道。例如美國加州大學的研究人員以HIV蛋白酶為靶進行酶抑制劑設計的研究。先利用HIV蛋白酶的晶體結構數據推算出該酶結構的互補結構。再以化合物結構數據庫中分子形狀進行對比，疊合，打分。然后對分數高的進行合成和活性篩選。第六十九頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三依照他們與蛋白質表面形成氫鍵能力的大小；分子側鏈被酶的底物包容的情況及合成的難易程度，篩選出一個化合物，溴哌醇。其羥基恰好可以與酶活性部位的天冬氨酸作用。對進一步修飾改造的氟哌啶醇及還原的羥基哌啶醇所進行的活性測定表明其對HIV蛋白酶有抑制活性，并具有很高的選擇性。這說明用計算機數據庫方法尋找先導化合物是可以成功的。計算機輔助藥物設計方法現已在制藥工業中得到廣泛的應用。很多用于計算機輔助藥物設計的軟件已經商業化，也有很多數據庫被商品化或可免費使用。據報道：現在每項有一定規模的新藥研究工作中，計算機輔助藥物設計的研究都是一部分基本的研究內容；現在世界上每一個大的制藥公司都在使用計算機技術以加速新藥的研發速度。第七十頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三臨床候選藥物的研究與開發第七十一頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三新藥從發現到上市的過程及所需要的大致時間…第七十二頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三一、臨床前體內外藥效學評價有效性是新藥治病救人的首要條件，也是評價新藥的基礎。一個化合物首先必需有效才有可能成為藥物。所以，藥效評價是新藥評價中重要而且必須及早完成的工作。藥效的評價應該在從生物實驗到臨床試驗的所有階段進行。藥物是否有效最終是由臨床試驗決定的，但未經臨床前藥理學評價的物質不能直接用于臨床，這不但存在著該物質是否有效的問題，還涉及安全性、倫理道德與人權的問題。藥效學實驗也是新藥的藥理研究的一部分。藥理學通過定向篩選、普遍篩選、高通量篩選等藥理篩選試驗可以篩選出有效而毒性小的藥物，供藥效學比較研究；也可能意外的發現創新型藥物、新的藥物結構類型或新的作用機制。因此新藥藥效學評價一方面評選新藥，另一方面是發現新藥。第七十三頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三1．藥效學研究的內容：

新藥的藥效學研究是研究藥物的生化、生理效應及機制以及劑量和效應之間的關系，主要評價擬用于臨床預防、診斷、治療作用有關的新藥的藥理作用的觀測和作用機理的探討。第七十四頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三2．藥效學研究的目的

藥效學研究的目的：①確定新藥預期用于臨床防、診、治目的藥效②確定新藥的作用強度③闡明新藥的作用部位和機制④發現預期用于臨床以外的廣泛藥理作用。從而為新藥臨床試用時選擇合適的適應癥和治療人群以及有效安全劑量和給藥途徑，為新藥申報提供可靠的試驗依據及促進新藥的開發。第七十五頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三3．藥效學評價實驗設計藥效研究的基本要求如下：方法應有兩種以上，其中必須有整體實驗或動物模型實驗，所用方法和模型要能反應藥理作用的本質指標應能反映主要藥效作用的藥理本質，應明確、客觀、可定量劑量設計能反應量效關系，盡量求出ED50或有效劑量范圍實驗應用不同形式的對照（如溶劑對照、陽性藥對照）給藥途徑應與臨床用藥途徑一致。第七十六頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三實驗設計要求如下：實驗設計原則：重復、隨機、對照試驗方法和實驗動物選擇體外試驗：方法簡便，敏感性高，比體內法用藥量少，結果判斷更直接，尤其適用于大樣本篩選，可初步確定被研究對象能否產生某方面的藥理作用；但缺乏對機體整體性的調節，也往往不能反映藥物代謝物可能產生的作用。體內試驗：反映的藥效結果可靠性大，與臨床實際治療應用比較相近。藥物體內試驗結果往往是其藥效評價的主要指標。在動物體內試驗中，動物選擇是否得當，直接關系著實驗的成功和質量高低。

第七十七頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三4．藥效學評價分析藥效學評價分析是通過藥效試驗，應用有關指標對藥物的科學評價。通過評價證明某一藥物具有何種藥效作用，作用強度如何，是否比標準藥物作用強，強多少倍；作用是否持續，強度變化是否隨時間變化，劑量變化是否有明顯的規律；有什么特點；受什么因素的影響。藥效評價的定量分析方法：量-效關系分析時-效關系分析構-效關系分析時-量關系分析藥-靶關系分析第七十八頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三5．新藥作用機制的研究藥物作用機制的研究不但有助于闡明藥物治療作用和不良反應的本質，同時對于提高療效，設計新藥，了解生命現象具有重要意義。雖然各國新藥審批的規定對藥理作用機制的研究都提得比較籠統，但是如果作用機制不清楚，僅僅一個新藥療效好，毒性小就可以臨床應用，對新藥研發可能是一大不足。當發現新藥作用于新作用機制時一方面，盡快開展全面的藥效學，安全性和臨床評價以期早日成功另一方面，發現此新作用機制的苗頭時，應該盡早收集類似化合物進行綜合評選，以獲得更優的候選化合物。甚至可能從以淘汰的候選藥物中發現其新的療效。第七十九頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三二、臨床前安全性評價安全性研究始終貫穿于新藥開發的全過程，而一般把臨床安全性研究納入新藥臨床研究及藥物不良反應監測的范疇，就非臨床研究項目時間花費而言，急性毒性、長期毒性、生殖毒性、致突變試驗、致癌試驗等安全性評價研究約占整個臨床前研究時間的90%。臨床前安全性評價的質量主要就是看是否認真實施非臨床實驗研究規范(GoodlaboratoryPracticeforNon-clinicalLaboratoryStudies，簡稱GLP)為從源頭上提高藥物研究水平，保證藥物研究質量，我國國家食品藥品監督管理局規定，自2007年１月１日起，新藥臨床前安全性評價研究必須在經過《藥物非臨床研究質量管理規范（GLP）》認證的實驗室進行。否則，其藥品注冊申請將不予受理。第八十頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三（一）新藥臨床前安全性評價的目的預測臨床用藥的安全性，為臨床研究提供可靠的參考。確定新藥毒性的強弱，找出毒性反應及毒性反應的劑量，為臨床安全監測、可能發生的毒副反應及預防和解救措施提供依據確定新藥安全劑量的范圍，闡明在多大劑量范圍有效且不產生毒副作用尋找毒性的靶器官，損傷的性質、程度及可逆性第八十一頁，共九十一頁，編輯于2023年，星期三（二）新藥臨床前安全性評價的內容1．一般毒理學試驗全身性用藥毒性試驗單次給藥毒性試驗多次給藥毒性試驗(亦稱長期毒性