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文檔簡介
1、第八期生物數據分析技能實訓會隨著高通量組學技術的蓬勃發展,生物醫學正加速進入大數據時代。借助生物醫學多組學、多層次的海量數據,可以從前所未有的廣度和深度來研究生物體運行機制,但海量復雜數據帶來的挑戰同樣巨大。由于生物醫學數據多呈分散復雜特征,因此常需要深入分析已有數據。在此基礎上,以海量數據發掘與解析為主體內容的生物信息學技能就成為科研必要手段,如疾病的病因學、臨床診斷標志物、作用靶點識別,關鍵大分子的發現與功能預測,以及遺傳調控機制等方面。會議特邀倫永志教授擔任主講教師。本課程曾分別用名基因序列分析技術和功能基因組信息分析技術,后將上述兩門課程整合更名為生物數據分析技能。自第七期會議起,倫老
2、師對課程內容進行了較大幅度更新,以順應學科發展和學員需要。授課繼續沿用倫老師獨創的TPS(Teaching-Practicing-Showing)教學模式,著力于以實際問題為引線,將理論授課與上機實踐有機地融為一體,逐步介紹涉及的各項技能,并指導學員將其融會貫通以真正掌握相關的基本方法與常用工具。TPS教學模式多年來在本科、研究生教學及二十余期培訓會議中取得了極佳的教學效果,受到廣大學員的一致好評和推崇。主辦單位:北京華斯泰生物醫學科技有限公司時間地點:2018年7月12日(周四)報到,7月13日15日授課。南京錦江都城酒店,地址:南京市雨花臺區安德門大街50號。培訓日程(全部課程均含上機實踐
3、):日期時間授課題目授課內容7月12日16:00-21:00報到(外地學員)7月13日08:00-08:30報到(本地學員)08:30-09:00預裝軟件.調試網絡09:00-12:00核酸信息注釋l NCBI數據庫常用資源:Nucleotide、Gene、Unigene子數據庫的功能及信息注釋;常見序列格式的轉換。l EBI數據庫常用資源:HGNC、Expression Atlas子數據庫的功能及信息注釋。l 序列比對工具:局部比對工具BLAST;全局比對工具ClustalX;保守信息圖形化工具Weblogo。14:00-16:00核酸信息注釋l 基因結構注釋在線工具:內含子剪切位點、可變剪
4、接、啟動子序列、轉錄因子結合位點。16:00-18:00蛋白質信息注釋l 蛋白質序列數據庫:UniProt數據庫的功能及信息注釋。l 蛋白質相互作用數據庫:String數據庫的信息注釋。l 蛋白質結構數據庫:PDB數據庫的信息注釋。7月14日09:00-12:00非編碼RNA信息注釋及靶基因預測l miRNA信息注釋及靶基因預測:miRBase/TargetScan/miRTarBase等數據庫l LncRNA信息注釋及靶基因預測:NONCODE/LNCipedia/lncrnadb等數據庫14:00-18:00基因集功能富集分析l Gene Ontology、KEGG pathway數據庫的
5、信息注釋l 利用DAVID在線工具富集分析基因集功能l 利用Excel軟件/Venn在線工具繪制基因集功能富集圖及維恩圖(Venn分析)7月15日09:00-12:00基因表達數據處理與分析l 利用ArrayTools軟件處理從NCBI GEO子數據庫下載的表達數據l 利用Cluster/Treeview軟件進行聚類分析l 基因集共表達分析14:00-17:00交互作用網絡數據可視化分析l 利用Cytoscape軟件進行關聯基因注釋及其交互關系、分子間相互作用及基因表達的可視化分析。具體事宜:1、培訓期間提供午餐,晚餐自理。2、上機實踐需自帶筆記本電腦,會場將布置充足的電源插座。請確保電腦配置
6、無線網卡,操作系統為Win XP/ 7/ 8/ 10,而非Mac系統或上網本(個別軟件不能運行)。3、會場除正常無線wifi覆蓋外,將單獨鋪設網線以保證上網條件。盡管如此,為提高上網效率,建議學員自行攜帶4G無線上網卡。4、授課幻燈PDF版、軟件(附帶安裝指南)及上機實踐文檔已上傳至百度網盤,在報到通知中會告知登錄名及密碼。軟件請事先下載并安裝,如安裝有問題,請咨詢客服或提前到達會場咨詢。5、嚴格按照培訓日程授課,最后一天(7月15日)下午仍有重要課程,外地學員需合理安排返程時間。6、住宿統一安排在南京錦江都城酒店(南京南站店),主辦單位可為學員代訂房間,標準間單住380元/人、合住190元/
7、人(含早餐),費用自理;學員也可自行上網預訂。住宿費發票在退房時由酒店開具。對于需要合住的學員,會務組將按報到先后順序安排,最后出現單人無法安排的情況,需要自補房間差價。注冊費用:2800元/人,同一單位三人以上2600元/人。授課期間發放紙質邀請函(蓋章)和發票。按繳費先后順序確定座位號。繳費方式:賬戶名稱:北京華斯泰生物醫學科技有限公司 賬戶號:0200245009200091577開戶行:中國工商銀行北京豐益橋支行 匯款用途處寫明:生物數據分析+姓名或報到當天現金(或刷卡)支付。報名咨詢: 聯系人:章老師手機號-mail:Huasitai如您或您的學生計劃參加請填寫報名表并于報到前發送至聯系人E-mail。為確保您已報名成功,請之后來電或者發短信予以確認。如有疑問,歡迎垂詢!"-生物數據分析技能實訓會報名表地點:南京錦江都城酒店時間:2018年7月12日-15日請用“”代替“”單位名稱郵編單位地址姓名性別職稱/職務手機常用郵箱發票抬頭納稅人識別號發票內容會議費 會務費 其他(請注明):注冊費大寫: 萬 千 百 十元整小寫: (不含住宿費)是否代定住宿是否雙人間:培訓人員優惠價190元/天/人。單人間:培訓人員優惠價380元/天/
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