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文檔簡介

1、專業資料推薦SPSS 詳細操作:廣義估計方程SPSS 詳細操作:廣義估計方程2017-03-18 17:40 一、問題與數據 在臨床研究中,經常會比較兩種治療方式對患者結局的影響, 并且多次測量結局。例如,為了研究兩種降壓藥物對血壓的 控制效果是否存在差異,研究者會對兩個人群服藥后在不同 時間點記錄血壓值,然后評價降壓效果。或者對兩組動物分 別施加兩種干預,連續記錄多個時間點的結局,然后比較兩 種干預的效果。這種設計可以用如下示意圖表示:另外,有時研究只需要收集一個時間點的數據,但是一個研 究對象會提供多個部位的數據點。例如,研究者想評價冠心 病患者在冠脈搭橋術后應用阿司匹林是否可以有效降低患

2、 者血管的再堵塞,評價的方法是術后 1 年做冠脈造影觀察血 管是否堵塞,但是每個患者可能會在同一次手術中對多條冠 狀動脈血管進行搭橋,因此有的患者可能會貢獻多組數據。 這種設計可以用如下示意圖表示:以上兩種設計,不管是臨床試驗還是動物試驗都非常常見, 它的特點在于數據間非獨立,同一個體間數據具有相關性。 對于這樣的設計類型,該如何分析呢? 今天我們來介紹另外一種非常好的方法廣義估計方程(GEE )。GEE既可以處理連續型結局變量也可以處理分類 型結局變量,它實際上代表了一種模型類別,即在傳統模型 的基礎上對相關性數據進行了校正, 可以擬合 Logistic 回歸、 泊松回歸、 Probit 回

3、歸、一般線性回歸等廣義線性模型。 本文將以阿司匹林預防冠脈搭橋后血管再堵塞為例介紹運 用 SPSS 進行 GEE 的操作方法。以下為數據格式: 表 1. 數據格式每名患者貢獻數據量不等。如編號為 1 的患者只對一根血管 進行了搭橋手術,編號為 2 的患者則有兩根血管進行搭橋手 術。表 2. 變量賦值(注:本例中數據純屬虛構,分析結果不能產生任何結論。 性別為待調整變量。 )二、SPSS 分析方法1. 數據錄入 SPSS首先在 SPSS 變量視圖 ( Variable View )中新建上述表 2 中 變量,然后在數據視圖( Data View )中錄入數據。2. 選擇 Analyze Gene

4、ralized Linear ModelsGeneralized Estimating Equations3. 選項設置 在 Repeated 模塊中,將患者 ID 選入 Subject variables 框,搭橋血管 Num 選入 Within-subject variables 框。在Working Correlation Matrix 的 Structure 下拉列表中選擇同 一患者貢獻數據的相關性結構。其有 5 個選項,分別為:Independent :各數據間獨立,即同一患者貢獻的數據可以 視為來源于不同個體。AR(1) :自相關,用于不同時間點的數據,相鄰時間點相關 性最大,時間

5、間距越大相關性越小。Exchangeable :等相關,各數據點的相關性均相等。M-dependent :相鄰相關,僅臨近的 M+1 個數據相關。 Unstructured :不限定相關結構,由數據本身決定。本例中,同一患者搭橋的血管互相之間應等同看待,兩兩間 相關性應相等,因此選擇等相關更合適。其他維持默認。 在 Type of Model 模塊中設置模型類型在此界面有 6 種模型類型可選:Scale Response :結局變量為連續型變量Ordinal Response :結局變量為有序分類變量Counts :結局變量為計數Binary Response or Events/Trials

6、 Data :結局變量為二分類 變量Mixture :結局變量為 Tweedie 分布變量Custom :自定義以上 6 大類類型下還需選擇連接函數。本例中結局變量為二 分類變量, Logistic 回歸應用更加普遍,因此我們選擇 Binary logistic 來擬合校正數據相關性的 Logistic 回歸模型。 在 Response 模塊指定結局變量將 Outcome 變量選入 Dependent Variable ,在 Reference Category 中選擇最小值作為參考值 (本例中 0 為最小值,代 表未發生結局) 。 在 Predictors 模塊中將要納入模型的 Treatm

7、ent 和 Sex 變量選入 Covariates 中。 Covariates 應放入連續型變量,Factors 中放入分類變量,但是本例中兩自變量均為二分類 變量,放入 Covariates 處也可。 在 Model 模塊中將 Treatment 和 Sex 選入 Model 框內, 還可納入交互項,本例中不納入。 在 Statistics 模塊中除默認外,另外勾選 Include exponential parameter estimates 以獲得 OR 值,然后點擊 OK。三、結果解讀 結果中首先給出的是一些模型基本信息,在此略過。這里僅 介紹模型參數估計值結果:從結果可以看到,Tre

8、atment變量的系數值(B)為-1.077 ,Exp(B)為0.341,即OR值,P=0.046,說明術后使用阿司匹林的患者 1 年后發生血管再堵塞的風險是使用安慰劑組的0.341 倍且有統計學意義,即阿司匹林具有保護作用。另外 我們納入校正的性別變量 Sex OR 值為 0.692 ,但 P=0.531 未達顯著水平。如果我們不考慮數據間的相關性,直接采用傳統的 Logistic 回歸模型,那么將得到以下結果:從結果中可以看到,盡管 Treatment 的 OR 值與 GEE 模型 中相差不大,但其 P 值卻不再顯著。從本例中可以看到,如 果在數據分析中方法選用錯誤將可能得不到正確結論。四

9、、結果匯總 冠脈搭橋術后患者應用阿司匹林可以有效降低發生血管堵 塞的風險。服用阿司匹林組患者發生血管堵塞風險是服用安 慰劑組患者的 0.341 倍( P=0.046 )。五、總結與拓展 對于文首提及的兩個例子,常見的分析方法有重復測量方差 分析和多水平模型,但是重復測量方差分析要求結局變量為 連續變量,不適用于分類變量。多水平模型處理相關性數據 時非常靈活,結局可以為連續變量,也可以為分類變量,應 用非常廣泛。GEE 的應用似乎沒有前兩種廣泛,但其具有非常好的特性。GEE 既可以處理連續型結局變量也可以處理分類型結局變 量,其優勢在于, 即使設定的數據間相關結構與實際有偏差, 在樣本量較大時其

10、模型估計參數仍然具有無偏性。 GEE 模型 中自變量系數估計值準確性的論證相較于多水平模型更加 充分,因此部分研究者更加推薦使用 GEE 。雖然 GEE 模型中數據間相關結構指定錯誤時模型系數也具 有無偏性,但前提是樣本量要足夠大。在同樣的樣本量下,正確的相關結構更可能得到準確的參數估計和置信區間,因 此應仔細分析數據類型,選擇最可能正確的相關結構。 關于 GEE 的內容較為復雜, 在此無法詳述, 對 GEE 有興趣 的讀者或需要使用 GEE 模型的讀者,推薦閱讀專業書籍和 文獻。 SPSS 詳細操作:廣義估計方程2017-03-18 17:40 一、問題與數據 在臨床研究中,經常會比較兩種治

11、療方式對患者結局的影響, 并且多次測量結局。例如,為了研究兩種降壓藥物對血壓的 控制效果是否存在差異,研究者會對兩個人群服藥后在不同 時間點記錄血壓值,然后評價降壓效果。或者對兩組動物分 別施加兩種干預,連續記錄多個時間點的結局,然后比較兩 種干預的效果。這種設計可以用如下示意圖表示:另外,有時研究只需要收集一個時間點的數據,但是一個研 究對象會提供多個部位的數據點。例如,研究者想評價冠心 病患者在冠脈搭橋術后應用阿司匹林是否可以有效降低患 者血管的再堵塞,評價的方法是術后 1 年做冠脈造影觀察血 管是否堵塞,但是每個患者可能會在同一次手術中對多條冠 狀動脈血管進行搭橋,因此有的患者可能會貢獻

12、多組數據。這種設計可以用如下示意圖表示:以上兩種設計,不管是臨床試驗還是動物試驗都非常常見, 它的特點在于數據間非獨立,同一個體間數據具有相關性。 對于這樣的設計類型,該如何分析呢? 今天我們來介紹另外一種非常好的方法廣義估計方程(GEE )。GEE既可以處理連續型結局變量也可以處理分類 型結局變量,它實際上代表了一種模型類別,即在傳統模型 的基礎上對相關性數據進行了校正, 可以擬合 Logistic 回歸、 泊松回歸、 Probit 回歸、一般線性回歸等廣義線性模型。 本文將以阿司匹林預防冠脈搭橋后血管再堵塞為例介紹運 用 SPSS 進行 GEE 的操作方法。以下為數據格式: 表 1. 數據

13、格式每名患者貢獻數據量不等。如編號為 1 的患者只對一根血管 進行了搭橋手術,編號為 2 的患者則有兩根血管進行搭橋手 術。表 2. 變量賦值(注:本例中數據純屬虛構,分析結果不能產生任何結論。 性別為待調整變量。 )二、SPSS 分析方法1. 數據錄入 SPSS首先在SPSS變量視圖(Variable View )中新建上述表 2中 變量,然后在數據視圖( Data View )中錄入數據。2. 選擇 Analyze Generalized Linear ModelsGeneralized Estimating Equations3. 選項設置 在 Repeated 模塊中,將患者 ID 選

14、入 Subject variables 框,搭橋血管 Num 選入 Within-subject variables 框。在Working Correlation Matrix 的 Structure 下拉列表中選擇同 一患者貢獻數據的相關性結構。其有 5 個選項,分別為:Independent :各數據間獨立,即同一患者貢獻的數據可以 視為來源于不同個體。AR(1) :自相關,用于不同時間點的數據,相鄰時間點相關 性最大,時間間距越大相關性越小。Exchangeable :等相關,各數據點的相關性均相等。 M-dependent :相鄰相關,僅臨近的 M+1 個數據相關。Unstructur

15、ed :不限定相關結構,由數據本身決定。本例中,同一患者搭橋的血管互相之間應等同看待,兩兩間相關性應相等,因此選擇等相關更合適。其他維持默認。 在 Type of Model 模塊中設置模型類型在此界面有 6 種模型類型可選:Scale Response :結局變量為連續型變量Ordinal Response :結局變量為有序分類變量Counts :結局變量為計數Binary Response or Events/Trials Data :結局變量為二分類 變量Mixture :結局變量為 Tweedie 分布變量Custom :自定義以上 6 大類類型下還需選擇連接函數。本例中結局變量為二

16、分類變量, Logistic 回歸應用更加普遍,因此我們選擇 Binary logistic 來擬合校正數據相關性的 Logistic 回歸模型。 在 Response 模塊指定結局變量將 Outcome 變量選入 Dependent Variable ,在 Reference Category 中選擇最小值作為參考值 (本例中 0 為最小值,代 表未發生結局) 。 在 Predictors 模塊中將要納入模型的 Treatment 和 Sex 變量選入 Covariates 中。 Covariates 應放入連續型變量, Factors 中放入分類變量,但是本例中兩自變量均為二分類 變量,放

17、入 Covariates 處也可。 在 Model 模塊中將 Treatment 和 Sex 選入 Model 框內, 還可納入交互項,本例中不納入。 在 Statistics 模塊中除默認外,另外勾選 Include exponential parameter estimates 以獲得 OR 值,然后點擊 OK。三、結果解讀 結果中首先給出的是一些模型基本信息,在此略過。這里僅 介紹模型參數估計值結果:從結果可以看到,Treatment變量的系數值(B)為-1.077 ,Exp(B)為0.341,即OR值,P=0.046,說明術后使用阿司匹林的患者 1 年后發生血管再堵塞的風險是使用安慰劑

18、組的0.341 倍且有統計學意義,即阿司匹林具有保護作用。另外 我們納入校正的性別變量 Sex OR 值為 0.692,但 P=0.531 未達顯著水平。Logistic如果我們不考慮數據間的相關性,直接采用傳統的 回歸模型,那么將得到以下結果: 從結果中可以看到,盡管 Treatment 的 OR 值與 GEE 模型 中相差不大,但其 P 值卻不再顯著。從本例中可以看到,如 果在數據分析中方法選用錯誤將可能得不到正確結論。四、結果匯總 冠脈搭橋術后患者應用阿司匹林可以有效降低發生血管堵 塞的風險。服用阿司匹林組患者發生血管堵塞風險是服用安 慰劑組患者的 0.341 倍( P=0.046 )。五、總結與拓展 對于文首提及的兩個例子,常見的分析方法有重復測量方差 分析和多水平模型,但是重復測量方差分析要求結局變量為 連續變量,不適用于分類變量。多水平模型處理相關性數據 時非常靈活,結局可以為連續變量,也可以為分類變量,應 用非常廣泛。GEE 的應用似乎沒有前兩種廣泛,但其具有非常好的特性。 GEE 既可以處理連續型結局變量也

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