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文檔簡(jiǎn)介
1、pcr技術(shù)詳細(xì)步驟-從rna抽提到電泳鑒定pcr技術(shù)詳細(xì)步驟一從rna抽提到電泳鑒定rna抽提一,準(zhǔn)備工作1, 實(shí)驗(yàn)器具與材料:(1)移液槍:1ml、200uk 10ul(2)吸頭:1ml、200ul 20ul(3)吸頭臺(tái):放置1ml吸頭的一個(gè),放置200ul和20ul的吸頭一個(gè)(4)ep 管 1.5ml、100ul(5)玻璃研磨器(6)容量瓶:1000ml(7)鹽水瓶:100ml(8)15ml塑料管一個(gè)(配75%乙醇用)2, 實(shí)驗(yàn)器具的處理與準(zhǔn)備(1)塑料制品:(包插吸頭、ep管等)將塑料制品逐個(gè)浸泡于1%cdepc水屮(必要時(shí)小槍頭需要川吸管打入depc水)37°c 過(guò)仗,然后送
2、至高壓3次,后在80°c烘烤箱中烘t (或置于37°c中8小時(shí)左右烘干),試驗(yàn)前 將槍頭放入吸頭臺(tái)。(2)玻璃制品:(主要是玻璃研磨器)先泡酸過(guò)夜,沖洗干凈后,在1%<depc水中泡8小時(shí)左右,37°c烘干,用蒙錫紙包裹 送至干烤3次。(3)金屬制品:(銀子等)先洗干凈,再送干烤3次。(不需要泡depc水)3, 試劑配制和準(zhǔn)備:(1)depc水:泡實(shí)驗(yàn)器具的depc水的配制:1000ml雙蒸水中加imidepc,放 在1000ml容量瓶中靜宣4小時(shí)后備用。配75%乙醇的depc水的配制:100ml鹽水瓶?jī)?nèi)裝 40ml雙蒸水,加40uldepc, 37
3、6;c過(guò)夜,送至髙壓。(2)75%乙醇(要在抽提時(shí)現(xiàn)配):用無(wú)水乙醇和depc水配制(depc水:無(wú)水乙 醇= 1:3),然后放于20°c備用。(3)異丙醇:放入棕色瓶(4)氯仿:放入棕色瓶(5)trizol: 100ml/瓶 存放于4°c二,抽提時(shí)注意事項(xiàng):全程佩戴一次性手套和口罩,手套要勤換,避免戴上的一次性的手套接觸可疑污染物。三,抽提步驟1. 勻漿化作用取約100mg鼠腦組織放于玻璃研磨器內(nèi),先加0.2ml的trizol溶液,研磨組織后,倒入 1.5mlep管中,再在研磨器內(nèi)加入0.8ml的trizol溶液洗,后全部再倒入ep管中。顛倒混 勻10下,室溫靜置5分鐘。
4、2. 分離階段每imitrizol中加0.2ml氯仿。蓋緊樣品管蓋,用手用力搖晃試管15秒,使其充分混勻, 室溫靜置5分鐘。后12000rmp離心15分鐘。3. rna的沉淀將上層水相轉(zhuǎn)入新的1.5mlepffh (約400-500ul),m 0.5ml異丙醇,混勻后放于20°c中1小時(shí),后12000rmp離心10分鐘。34. rna的洗脫小心倒掉上清,留取沉淀。力mml現(xiàn)配的75%的乙醇(預(yù)冷)振蕩洗滌rna沉淀一次, jn7500rmp離心5分鐘。5. rna的再溶解小心倒掉上清,取沉淀置超凈工作臺(tái)開(kāi)風(fēng)機(jī)吹干(約30分鐘,此時(shí)rna沉淀變透明)。 注意不能讓rna沉淀完全干燥(會(huì)
5、極大地降低它地町溶性)。再在管中加20ul的depc水 溶解,在5560°c下孵育10分鐘助溶。6. rna的保存提取的rna保存于70°c超低溫冰箱中,或立即用于逆轉(zhuǎn)錄。trizol法抽提總rna細(xì)胞1x107組織100mg力nlmltrizol細(xì)胞用1 ml加樣器吹至液體澄清且無(wú)細(xì)胞團(tuán)塊勻漿(要徹底,厲轉(zhuǎn)至ep管)(組織勻漿量100mg時(shí)分裝1ml/每ep管)顛倒混勻10下,室溫5分鐘加氯仿1/5體積(0.2ml)(必須按總體積的1/5)顛倒混勻15s,室溫5分鐘14°c,離心 12000rmp, 15分鐘轉(zhuǎn)上層水相(約400-5001)于另一噺1.5mlep
6、管中1加等體積異丙醇(約400 -5001),混勻后2(tc中1小時(shí)14°c,離心 12000rmp, 10分鐘棄上清加冰預(yù)冷的75%乙醇(用髙壓后的depc水配)1ml4°c離心7500rmp, 5分鐘棄上淸,超凈工作臺(tái)開(kāi)風(fēng)機(jī)干燥約30分鐘(不能完全干燥)溶于 depc 水中至20pl (101-201)(可在55-60°c水中,v10分鐘助溶)立即保存于70c超低溫冰箱中,或立即用于逆轉(zhuǎn)錄4逆轉(zhuǎn)錄(rt)一,準(zhǔn)備工作1, 實(shí)驗(yàn)器具與材料:(1) 移液槍:200uk 10ul(2) 吸頭:200uk 20ul(3) ep 管 1.5ml、100ul(4) 水浴箱
7、2, 實(shí)驗(yàn)器具的處理與準(zhǔn)備塑料制品:(包括吸頭、ep管等)將塑料制品逐個(gè)浸泡于1%°depc水屮(必要時(shí)小槍頭需要用吸管打入depc水)37°c 過(guò)夜,然后送至高壓3次,后在80°c烘烤箱中烘干(或置丁$7°c中8小時(shí)左右烘干),試驗(yàn)前 將槍頭放入吸頭臺(tái)。3, 試劑配制和準(zhǔn)備:(1) depc水:泡實(shí)驗(yàn)器具的depc水的配制:1000ml雙蒸水中加imidepc,放在 1000ml容量瓶中靜置4小時(shí)后備用。逆轉(zhuǎn)錄中所用的depc水的配制:100ml鹽水瓶?jī)?nèi)裝 40ml雙蒸水,加40uldepc, 37°c過(guò)夜,送至高壓,后分裝到幾個(gè)1.5mle
8、p管屮,2(tc中 保存?zhèn)溆谩?2) rt中所需耍的各種試劑(3)引物濃度計(jì)算方法:(新合成的引物的稀釋)假如終濃度為x um(pmol/ul)加depc 水體積(ul) = (odx33x1000000) / (分子量xx)%1, rt時(shí)注意事項(xiàng):為避免rna猶污染,在rt中仍要佩戴一次性手套和口罩。%1, rt步驟用ssiii逆轉(zhuǎn)錄酶進(jìn)行rt (20ul體積)1, 準(zhǔn)備0.65ml的ep管2, 冰上操作:在ep管中加入10uidepc水,1引物,1ul模板rna, luldntp, 短暫離心。3, 65°c水浴5分鐘后,立刻0°c冰水浴至少1分鐘。4, 短暫離心后,冰上
9、操作:加入4ul 5xfirst-strand buffer, 1ul 0.1mdtt, 1ul rnaseinhibitor, 1ul ssiii逆轉(zhuǎn)錄酶。5, 範(fàn)暫離心6, 50°c水浴60分鐘進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。7, 70 °c水浴15分鐘滅活逆轉(zhuǎn)錄酶8, 20°c保存,或立即進(jìn)行pcr。用amv逆轉(zhuǎn)錄酶進(jìn)行rt (10ul體積)1, 準(zhǔn)備0.65mlep 管2, 加入4.5ul depc 水,1ul 引物,1ul 模板 rna3, 稍離心,100°c沸水裕1min4, 加入0.5uldntp, 2ul 5xbuffer, 1ulamv 逆轉(zhuǎn)錄酶5, 稍離
10、心,封口膜封口,42°c水浴90°c作rt6, 100°c沸水裕3min滅活amv7, 立即pcr或20°c保存。5聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(pcr)二,準(zhǔn)備工作8, 實(shí)驗(yàn)器具與材料:(1) 移液槍:200ul、10ul(2) 吸頭:200uk 20ul(3) 吸頭臺(tái):放置200ul和20ul的吸頭一個(gè)(4) ep 管 1.5ml、100ul2, 實(shí)驗(yàn)器具的處理與準(zhǔn)備(1) 槊料制品:(包括吸頭、ep管等)送至高壓3次,試驗(yàn)前將槍頭放入吸頭臺(tái)。3, 試劑配制和準(zhǔn)備:(1) 雙蒸水:100ml鹽水瓶?jī)?nèi)裝40ml蒸懈水,送至高壓,后分裝到兒個(gè)1.5mlep管中, 20
11、c中保存?zhèn)溆谩?2) pcr中所需要的各種試劑三,pcr時(shí)注意事項(xiàng):佩戴一次性手套,同時(shí)避免戴上的一次性的手套接觸可疑污染物。四,pcr步驟1, 準(zhǔn)備100ul ep管2, 依次在管中加入:(50ul反應(yīng)體系)ddh20 37.5ul x?10mm dntp 1ul x?10xpcr buffer 5ul x?25mm mgcl2 (加z前要搖勻)3ul x?上游引物1ulx?下游引物1ulx?模板 cdnaiul3, 稍離心4, 100°c沸水浴1分鐘5, 趁熱加入tag酶0.5(冰上操作)6, 再加入50ul液體石蠟封閉7, wooormp離心1分鐘8, pcr條件94
12、6;c 1min58 °c 50sec72 °c 1min30sec進(jìn)行40個(gè)循環(huán),然后72°c 10min完后4°c保溫。9, 10ooormp 離心5min10, 將下層水相轉(zhuǎn)入新的0.65mlep管中,20°c保存。電泳鑒定一,準(zhǔn)備工作1, 實(shí)驗(yàn)器具與材料:(1)移液槍:10ul(2)吸頭:20ul(3)吸頭臺(tái):放置200ul和20ul的吸頭一個(gè)(4)三角燒瓶:50ml 個(gè)(5)瓊脂糖2, 實(shí)驗(yàn)器具的處理與準(zhǔn)備(1)塑料制品:(包括吸頭等)送至高壓3次,試驗(yàn)前將槍頭放入吸頭臺(tái)。(2)電泳板及電泳槽:用白來(lái)水沖洗t凈備用3, 試劑配制和準(zhǔn)備
13、:(1)電泳緩沖液(tae):先配制0.5mol/l,ph8.0的edta溶液:將37.2g edta-na加入160ml蒸錨水屮,在攪 拌器上劇烈攪拌。在用naoh調(diào)節(jié)溶液ph值至8.0(約需4gna0h)o用蒸館冰足容至200mlo 后送至髙壓滅菌。室溫保存。再配制50xtae溶液:在400ml蒸係水中溶解121 g tris堿 加入28.55ml冰乙酸和50ml0.5ml/l edta溶液,再加蒸飾水定容至500ml,室溫保存。(2)瓊脂糖溶液(1.0% :50xtae溶液取10ml,稀釋成500ml,取50ml溶解0.5g瓊脂糖,電爐i:煮至沸騰,溶 化的瓊脂物冷卻至60°c
14、左右時(shí)加入10mg/ml eb 5ul,充分混勻,將溫?zé)岬哪z倒入已置好 梳子的電泳板中,在室溫下放置45min左右后進(jìn)行電泳。(3) 漠化乙錠(eb) (10mg/ml):在20ml水中加入0.2g漠化乙錠,磁力攪拌數(shù)小時(shí)。然后用鋁箔包裹容器或?qū)⑷芤恨D(zhuǎn)移 至棕色瓶中,室溫保存。(4) 加樣緩沖液(loading buffer) 一般為6xloading buffer二,電泳鑒定時(shí)注意事項(xiàng):佩戴一次性手套,避免皮膚接觸eb。無(wú)路做膠還是電泳緩沖液盡量用新的,不要超過(guò) 兩周。五,電泳步驟i, 50xtae取10ml稀釋成500ml,取50ml溶解0.5g瓊脂糖。電爐匕煮沸后加入eb5ul 另外450ml
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