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文檔簡介
第八章、核酸化學(xué)核酸的組成成分DNA的結(jié)構(gòu)DNA和基因組RNA的結(jié)構(gòu)核酸生物合成核酸的生物學(xué)功能核酸的分子生物學(xué)2一、核酸的生物學(xué)功能(一)核酸與遺傳信息的傳遞DNA是基本遺傳物質(zhì)一定結(jié)構(gòu)的DNA產(chǎn)生一定結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),才有一定形態(tài)和生理特征,所以DNA的特定遺傳密碼產(chǎn)生的蛋白質(zhì)就代表特定生物的遺傳性。在遺傳過程中DNA的具體作用:(1)在細(xì)胞分裂時按照自己的結(jié)構(gòu)精確復(fù)制傳給后代;(2)作為模板將所貯遺傳信息傳給mRNA。3RNA在傳遞遺傳信息上的作用
1)mRNA是蛋白質(zhì)合成的模板;2)tRNA識別mRNA上的遺傳密碼,轉(zhuǎn)運特定氨基酸到核糖體上合成肽鏈;3)rRNA是核糖體的主要成分,是翻譯工作的場所。(二)核酸與蛋白質(zhì)的生物合成DNA轉(zhuǎn)錄為mRNA是有選擇的,tRNA和rRNA也是DNA的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。(三)核酸結(jié)構(gòu)改變與生物變異一切生物的變異和進化都可以說是由于DNA的結(jié)構(gòu)改變而引起蛋白質(zhì)改變的結(jié)果。4生物遺傳的變異起源于DNA堿基配對的改變。1)有的由于DNA堿基的顛倒(如TA被顛倒為AT)或被調(diào)換(如GC被換為TA);2)有的由于在DNA復(fù)制過程中被遺漏了一對或多了一對核苷酸,3)或者在轉(zhuǎn)譯時發(fā)生了差誤,如氨酰tRNA合成酶錯將一個結(jié)構(gòu)與正常氨基酸十分相似的物質(zhì)交給tRNA。4)還有一些生物的遺傳性狀發(fā)生了突變。5(四)DNA與細(xì)菌轉(zhuǎn)化一種細(xì)菌的遺傳性狀因吸收了另一種細(xì)菌的DNA而發(fā)生改變的現(xiàn)象,稱為細(xì)菌的轉(zhuǎn)化。(五)核酸與病變遺傳性疾病是由于遺傳缺陷而產(chǎn)生的,也就是DNA結(jié)構(gòu)改變的結(jié)果。鐮刀型紅細(xì)胞貧血和白化病(albinism)。病毒對活細(xì)胞的侵染是寄主發(fā)生疾病,主要是由于核酸的作用。如流感、肝炎、帶狀皰疹、脊髓灰質(zhì)炎、白血病、煙草斑紋病。6(六)遺傳工程遺傳工程是用人工方法改組DNA,從而培育新型生物品種的技術(shù)。實驗室中將細(xì)菌作材料研究遺傳工程過程可分為:(1)重組DNA分子(基因重組);(2)將重組DNA引入受體細(xì)胞(轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo))。有利:(1)改良微生物品種使產(chǎn)生人工難以制得的生物活性物質(zhì)如胰島素、干擾素等;(2)解決某些疾病病因和控制這些疾病。7不利:1)使某些細(xì)菌失去對抗菌素的敏感性,引起某些疾病的廣泛流行;2)使某些酶失去應(yīng)有的生物活性等。(七)克隆與克隆化由單一親代細(xì)胞用無性繁殖產(chǎn)生的子代細(xì)胞稱克隆,形成克隆的過程稱克隆化。二、核酸的組成成分核酸nucleicacid核苷酸nucleotide核苷nucleoside磷酸phosphate嘌呤堿purinebase
或嘧啶堿pyrimidinebase(堿基base)核糖ribose
或脫氧核糖deoxyribose
(戊糖amylsugar)(一)核糖和脫氧核糖OHOH2COHOHOH12OHOH2COHOH12β-D-2-核糖β-D-2-脫氧核糖O核糖+H+糠醛甲基間苯二酚FeCl3綠色產(chǎn)物Δ脫氧核糖+H+
Δω-羥基-γ-酮戊醛二苯胺藍色產(chǎn)物RNA和DNA定性、定量測定(二)嘌呤堿和嘧啶堿NNNNHHHHNNNNHHHH123456789嘌呤NH2腺嘌呤adenine(A)NNNNHHHHOH2N鳥嘌呤guanine(G)NNHHHH123645嘧啶NNHHHHNH2OH胞嘧啶Cytosine(C)NNHHHHOOHH尿嘧啶uracil(U)NNHHHHOOHHCH3胸腺嘧啶thymine(T)NNOOHHH酮式HNNOOHHH酮式HHH烯醇式(三)核苷OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖NNNNHHHH9腺嘌呤胸苷OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖OHOH2COHOH1′2′3′4′5′核糖NNOOHHH尿嘧啶H1尿苷NCOONHHH51OH假尿苷(ψ)(四)核苷酸OHOH2COHOHOH1′2′3′4′5′核糖NNNNHHHH9腺嘌呤胸苷PO--O—O‖胸苷-5′-磷酸AMPP
O--O—O‖~ADPATPP
O--O—O‖~各種核苷三磷酸和脫氧核苷三磷酸是體內(nèi)合成RNA和DNA合成的直接原料。在體內(nèi)能量代謝中的作用:ATP——能量“貨幣”UTP——參加糖的互相轉(zhuǎn)化與合成CTP——參加磷脂的合成GTP——參加蛋白質(zhì)和嘌呤的合成第二信使——cAMPOHO-O
O—CH2
TO=P—O-3′5′OHOHO-O
O—CH2
GO=P—O-3′5′OHO
O—CH2OHOH
AO=P—OO-3′5′3′5′1′PPPOHATGpGpTpAOHpG-T-ApGTA三、DNA的結(jié)構(gòu)(一)DNA的一級結(jié)構(gòu)
1)因為DNA的脫氧核苷酸只在它們所攜帶的堿基上有區(qū)別,所以脫氧核苷酸的序列常被認(rèn)為是堿基序列(basesequence)。2)通常堿基序列由DNA鏈的5′→3′方向?qū)憽?)DNA中有4種類型的核苷酸,有n個核苷酸組成的DNA鏈中可能有的不同序列總數(shù)為4n。1.雙螺旋結(jié)構(gòu)的主要依據(jù)(1)DNA中A=T、C=G。后發(fā)現(xiàn):A與T生成2個氫鍵、C與G生成3個氫鍵。(2)電位滴定證明,嘌呤與嘧啶的可解離基團由氫鍵連接。(二)DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)1953年,Watson
和Crick
提出。2021鳥嘌呤-胞嘧啶堿基對腺嘌呤-胸腺嘧啶堿基對22磷酸二酯鍵232.雙螺旋結(jié)構(gòu)模型要點(1)兩條多核苷酸鏈反向平行。(2)堿基內(nèi)側(cè),A與T、G與C配對,分別形成3和2個氫鍵。(3)雙螺旋每轉(zhuǎn)一周有10個bp,螺距3.4nm,直徑2nm。3.雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定因素(1)氫鍵(太弱);(2)堿基堆積力(basestackingforce,由芳香族堿基π電子間的相互作用引起的,能形成疏水核心,是穩(wěn)定DNA最重要的因素;(3)離子鍵(減少雙鏈間的靜電斥力)。242526(三)DNA的三級結(jié)構(gòu)線形分子、雙鏈環(huán)狀(dcDNA)→超螺旋染色體包裝染色體包裝的結(jié)構(gòu)模型多級螺旋模型壓縮倍數(shù)76405
DNA→核小體→螺線管→超螺線管→染色單體2nm10nm30(10)nm400nm2~10μm
一級包裝二級包裝三級包裝四級包裝四、DNA與基因組織DNATranscription
RNA(mRNA、tRNA、rRNA)TranslationProtein基因基因是DNA片段的核苷酸序列,DNA分子中最小的功能單位。結(jié)構(gòu)基因調(diào)節(jié)基因基因組30五、RNA結(jié)構(gòu)1、其基本結(jié)構(gòu)同DNA,主要區(qū)別:1)核糖為:RNA;2)含氮堿基中有U,沒有T。2、RNA主要有三種:1)結(jié)構(gòu)RNA(rRNA);2)信使RNA(mRNA);3)轉(zhuǎn)運RNA(tRNA).313233主要特征:1.四臂四環(huán);2.氨基酸臂3′端有CCAOH的共有結(jié)構(gòu);3.D環(huán)上有二氫尿嘧啶(D);4.反密碼環(huán)上的反密碼子與mRNA相互作用;5.可變環(huán)上的核苷酸數(shù)目可以變動;6.TψC環(huán)含有T和ψ;7.含有修飾堿基和不變核苷酸。3435六核酸的生物合成一)DNA的生物合成二)RNA的生物合成36一)DNA的生物合成(一)DNA的半保留復(fù)制371、原核微生物的單鏈環(huán)狀DNA主要采用滾環(huán)式復(fù)制5′3′5′3′5′一)DNA的生物合成-半保留DNA復(fù)制的起點和方向382、真核生物DNA的多起點復(fù)制S1S2S3Sn39(三)原核細(xì)胞的DNA復(fù)制1.DNA聚合酶Ⅰ(PolⅠ)(dNMP)n+dNTPMg2+(dNMP)n+1+PPi特點(1)不能催化從無到有的聚合反應(yīng)。(2)催化的反應(yīng)只能在引物的3′延伸。(3)3′接上的核苷酸決定于模板鏈。(4)具有5′→3′和3′→5′外切酶活性。402.PolⅡ和PolⅢPCR(多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))5′5′1熱變性2退火5′5′5′5′3DNA聚合酶5′5′5′5′重復(fù)1,2,3PCR反應(yīng)全過程413.雙鏈DNA復(fù)制的分子機制(1)岡崎片段和半不連續(xù)復(fù)制5′3′3′5′5′3′3′5′5′3′3′5′復(fù)制叉上DNA合成的三種可行性42(2)岡崎片段的RNA引物利福酶素對RNA聚合酶有抑制作用。氯霉素對蛋白質(zhì)合成有抑制作用。引物RNA在復(fù)制過程中暫時存在,最后通過PolⅠ的5′→3′外切酶活力水解。(3)DNA連接酶催化一條DNA鏈的3′末端與相鄰的另一條DNA鏈的5′末端之間的磷酸二酯鍵的合成。43
其它功能:(1)修補雙螺旋DNA中單股的缺口;(2)連接線狀雙螺旋DNA以產(chǎn)生環(huán)狀DNA;(3)重組過程中將幾段DNA鏈連接起來。(4)母本DNA雙鏈的分離DNA解螺旋酶(DNAhelicase)拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ(typeⅡtopoisomerase)44(5)DNA聚合酶的“校對”作用DNA聚合酶的3′→5′外切酶活力是校對新生DNA鏈和改正聚合酶活性所造成“錯配”的一種手段。4.真核細(xì)胞DNA的復(fù)制(1)真核細(xì)胞DNA復(fù)制有多個起始點。(2)至少有5種DNA聚合酶,即α、β、γ、δ、ε。(3)端粒由端粒酶催化復(fù)制。生物細(xì)胞DNA復(fù)制分子機制的基本特點455.反轉(zhuǎn)錄作用利用反轉(zhuǎn)錄酶可制造與任何RNA(mRNA、tRNA、rRNA)的互補DNA(cDNA)。6.DNA的損傷與修復(fù)(1)DNA損傷的各種結(jié)構(gòu)變化①堿基缺失或插入②堿基改變③形成TT二聚體46(2)修復(fù)機制①光復(fù)活;②切除修復(fù);③重組修復(fù);④SOS修復(fù)(3)修復(fù)缺陷和疾病癌癥;著色性干皮
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