藥物分子設(shè)計第三講46、寓形宇內(nèi)復(fù)幾時，曷不委心任去留。47、采菊東籬下，悠然見南山。48、嘯傲東軒下，聊復(fù)得此生。49、勤學如春起之苗，不見其增，日有所長。50、環(huán)堵蕭然，不蔽風日；短褐穿結(jié)，簞瓢屢空，晏如也。藥物分子設(shè)計第三講藥物分子設(shè)計第三講46、寓形宇內(nèi)復(fù)幾時，曷不委心任去留。47、采菊東籬下，悠然見南山。48、嘯傲東軒下，聊復(fù)得此生。49、勤學如春起之苗，不見其增，日有所長。50、環(huán)堵蕭然，不蔽風日；短褐穿結(jié)，簞瓢屢空，晏如也。分子力學MolecularMechanics計算化學的兩類方法分子力學分子力學,又叫力場方法(forcefieldmethod),目前廣泛地用于計算分子的構(gòu)象和能量分子力學從本質(zhì)上說上是能量最小值方法,即在原子間相互作用勢的作用下,通過改變粒子分布的幾何位型,以能量最小為判據(jù),從而獲得體系的最佳結(jié)構(gòu)。采用經(jīng)典的物理學定律,只考慮分子的核,而忽略外圍的電子。>量子力學利用薛定諤方程考慮外圍電子的影響古人云“讀書百遍，其義自見”，在語文教學中，學生閱讀能力的高低是體現(xiàn)學生語文水平的一個非常重要的方面。近些年來在中考中，一套試題有三分之一的題目均是閱讀分析題，分值占百分之四十到五十。由此可見，加強語文閱讀教學，是提高學生創(chuàng)新能力和提高語文教學質(zhì)量的一個核心問題。那么，怎樣才能加強閱讀教學，提高學生的創(chuàng)新能力和提高語文教學質(zhì)量呢？一、對初中生閱讀能力的培養(yǎng)，必須有計劃有系統(tǒng)地進行教師應(yīng)有效地把課文作為重點訓(xùn)練材料，根據(jù)不同年級材料的特點，有目的、有針對性地對學生加強閱讀的具體訓(xùn)練。要求學生在閱讀中，能準確地理解文章的重點字、詞、句在具體語境中的含義和表達作用，弄清不同體裁的文章的閱讀要求。閱讀記敘文，要弄清層次，正確理解文章的思想內(nèi)容，領(lǐng)會和分析文章的語言特點和表現(xiàn)方法；閱讀說明文，要理請層次，領(lǐng)悟內(nèi)容的科學性和語言的準確性，理解文章使用的主要說明方法，區(qū)分不同類型的說明文的特點及側(cè)重點；閱讀議論文，要理清層次，把握中心論點，分清理論論據(jù)和事實論據(jù)，分析議論的方法；閱讀小說，要理清情節(jié)線索，分析人物形象的性格特點和典型意義，理解環(huán)境描寫的襯托作用，把握作品的主題思想，領(lǐng)會文學語言的優(yōu)美生動，初步鍛煉閱讀欣賞的能力。二、培養(yǎng)學生的閱讀能力要訓(xùn)練閱讀速度和語音的抑揚頓挫，培養(yǎng)學生快讀、慢讀、朗讀、默讀、重讀、輕讀等多種閱讀能力。三、推進素質(zhì)教育，實行教育改革改革傳統(tǒng)的課堂結(jié)構(gòu)，使學生被動聽轉(zhuǎn)為主動閱讀。加強學生自我閱讀的實踐，要求學生對每一篇文章通過認真閱讀能有自己的獨立見解。每一節(jié)語文課都讓出三分之一或二分之一的時間給學生閱讀，讓學會體會課文的意義。如，教學都德的《最后一課》時，在作了集中、精粹的講解后，把時間留給學生閱讀課文，讓學生思考下列問題，本文的主題思想是什么？主人公是誰？“監(jiān)獄大門”“鑰匙”各比喻什么？等等。學生讀得認真，討論熱烈，多數(shù)學生回答得很好。四、抓閱讀中想象力的訓(xùn)練，培養(yǎng)學生的創(chuàng)新思維《爸爸的花兒落了》這篇課文中，題目就引發(fā)學生的思考，“爸爸的花兒落了”一語雙關(guān)。學生可以想象一下，該如何理解。從文章的線索上看：1.畢業(yè)典禮；2.花（夾竹桃），等等。學生的想象豐富多彩，合情合理。這種閱讀想象力的訓(xùn)練，既激發(fā)了學生的興趣，又拓寬了學生創(chuàng)新思維的空間。在教學《濟南的冬天》一文時，培養(yǎng)學生對部分句子中的語氣詞的運用能力。像這樣一些句子：“你們放心吧，這兒準保暖和。”“他們由天上看到山上，使不知不覺地想到：明天也許就是春天了吧，這樣的溫暖今天夜里山草也許就綠起來了吧？”“最妙的是下點小雪呀。”以上三句，如果去掉“吧”“呀”字與原句比較，就會發(fā)現(xiàn)表達效果的差異。一句是由“吧”字組成的祈使句，把讀者的感情一下子拉入文中，多么親切的話語，小山母親般的慈愛與溫情，全由“吧”字傳出，冬日的濟南在小山媽媽的懷抱中的幸福、溫暖、安詳?shù)膵蓱B(tài)也從側(cè)面得以表現(xiàn)。第二句中的“吧”字，分別組成了功能相同的兩個疑問句，將濟南冬日里的春日氣象進一步表現(xiàn)出來，同時將濟南人渴望春天、熱愛家鄉(xiāng)的美好情感表現(xiàn)得淋漓盡致，去掉“吧”字就成了表揣測語氣的陳述句，大大改變了原句的口吻。第三句是以“呀”字收尾的陳述句，在表陳述的同時，平添了幾許作者既贊嘆又頗感自豪的神情。試看，如果不帶語氣詞“呀”字，句子就只剩下陳述事實的交待，原句洋溢著的感情就消失了。六、拓寬閱讀范圍不局限于課本，開辟第二課堂，把閱讀擴展到課外去，利用一切時間和機會去閱讀。要求學生積極到學校圖書室借書讀，多到學校閱覽室讀一些有益的文章。每天讀一至二篇課外的文章，并寫出讀書心得，在學習小組中或班上交流。使學生在閱讀交流中，不斷提高閱讀興趣和能力。閱讀對學生的重要性是無與倫比的，閱讀使學生積累了豐富的寫作知識，學生讀得多了，接受的信息也多了，想象力也豐富了，思維更活躍了。通過閱讀，學生的說話能力和寫作能力提高了，同時，也促進了學生其他學科成績的提高。所以說，培養(yǎng)學生的閱讀能力，在初中語文教學中的作用是非常重要的。為此，愿堅守在中學語文教學戰(zhàn)線上的同仁，揚起閱讀教學的風帆，走進新課程改革，讓閱讀欣賞之花，開得更加鮮艷。眾所周知，體育教學既是素質(zhì)教育的重要內(nèi)容，是實施素質(zhì)教育的重要手段，具有其它學科不可代替的作用。體育對學生的發(fā)展有著不可忽視的重要作用。它能促進學生智力的發(fā)展，增強學生的體質(zhì)，培養(yǎng)學生的競爭意識和進取精神，鍛煉學生頑強的意志品質(zhì)，陶冶學生高尚的情操以及培養(yǎng)學生健康的審美觀念與審美能力。那么，如何在體育教學中落實素質(zhì)教育就成為體育老師關(guān)注的問題。本文就如何在中學體育教學中實施素質(zhì)教育，促進學生的全面發(fā)展作以下幾個方面的探討。一、思想品德教育貫穿在整個體育教學之中在初中體育教學的過程當中，既要強調(diào)學生體育技能方面的培養(yǎng)，更要注意學生思想品德方面的教育。在實際教學過程中，需要結(jié)合教材中的具體內(nèi)容，有針對性地對學生加強思想教育。比如在平時隊列隊形的訓(xùn)練之時，要培養(yǎng)學生熱愛祖國與人民，聽從指揮，服從安排的優(yōu)良品質(zhì)。還可以在學校組織的田徑運動會中，進一步培養(yǎng)學生熱愛班集體、團結(jié)協(xié)作、敢于爭第一的進取精神。二、強調(diào)學生的主體地位在初中體育教學的過程中，要注意擺正師生之間的正確位置，重點突出學生的主體地位。傳統(tǒng)教學方式是教師處在教學中的主體地位，教師與學生之間沒有充分的交流機會，這很容易導(dǎo)致學生對體育課產(chǎn)生厭倦情緒，不利于學生的個性發(fā)展。素質(zhì)教育強調(diào)的是學生是學習的主體，要善于激發(fā)學生的積極性與主動性，讓學生能夠主動參與體育教學，讓學生轉(zhuǎn)變?yōu)椤拔乙獙W”，成為體育學習的主體，教師在整個教學過程中起到主導(dǎo)性的作用。例如，在上籃球課時，教師可以在課堂上使用少量時間讓學生掌握好基本的籃球技術(shù)，騰出足夠的時間讓學生之間進行自由組合展開訓(xùn)練，根據(jù)學生掌握籃球技術(shù)的實際情況，可以采取比賽的形式，將一個班的學生分成不同的籃球小組，通過比賽讓學生找出自己在技術(shù)方面的不足，能激發(fā)學生求知的欲望，主動去學習籃球技術(shù)，逐漸確立學生的主體地位。在進行技術(shù)傳授的過程中，要將每一步的動作要領(lǐng)講解到位，包括學生大的運動量之后，如何能夠較快地消除疲勞等，這些都是采用了啟發(fā)式的方式，讓學生自己去思考與探索。三、在教學中激發(fā)學生對體育學習的興趣面向全體學生，教師要認真了解和研究全體學生，使每個學生都能夠在時間和空間上得到平等的教育，根據(jù)學生的身體素質(zhì)、接受能力、個性差異、隱性適度地分層教學，滿足不同層次學生的心理、生理的需求，激發(fā)學生體育學習的興趣。教師要根據(jù)教材情況，結(jié)合學生的身心特點，選擇“發(fā)現(xiàn)式”、“問題式”等新穎多變的教學方法和形式，讓學生動起腦筋，邊想邊練。教材有相對枯燥和相對趣味之分，相對枯燥教材教學時，教師運用教法要力求新穎，使學生的情緒不斷變化。在學習中保持強烈的好奇心和旺盛的求知欲，使學生對枯燥的教材教學不是苦學，而是“樂”學。如耐久跑是體育課中比較難教的內(nèi)容。學生感到枯燥、艱苦、不愿學。在教?W時，前幾次課采用與球類活動相結(jié)合的教法，讓學生在跑動中左右手運籃球，或跑動中運帶足球8分鐘和12分鐘跑，最后采用目標教學法讓學生自己制訂努力目標，教師根據(jù)學生的目標，分成幾個組進行相互競爭，相互鼓勵。這樣的學習興趣高，學習效果好。四、改革課外體育活動發(fā)展學生的特長素質(zhì)教育具有鮮明的個性化特征，是有效引導(dǎo)學生發(fā)展自己的興趣、愛好特長、自主性、獨立性、創(chuàng)造性的過程。體育教學的完整過程，應(yīng)包括體育課和課外體育活動。課外體育活動的教學不是傳授體育知識和技術(shù)，而是引導(dǎo)學生根據(jù)計劃、要求、自身興趣、愛好進行各種體育活動項目的練習。教師在必要時進行示范、指示、輔導(dǎo)、總結(jié)。課外活動的組織形式，應(yīng)采用選擇性自由組合的形式。根據(jù)學校現(xiàn)有的條件、學生的需要和興趣打破原來的班級分組，實施年級分組開放和實施一些普及性和興趣性較強的體育活動項目，采用興趣小組的形式。各興趣小組由有體育特長的學生負責，為學生提供選擇的自己練習手段、練習難度、練習伙伴，創(chuàng)設(shè)自主練習的氛圍。聘請有體育特長的文化課教師進行輔導(dǎo)，幫助學生解決在體育活動中遇到的問題和困難。培養(yǎng)學生自發(fā)自主進行體育活動的能力和習慣，使學生充分理解參加體育活動的必要性，結(jié)合參加體育活動的樂趣，建立良好的體育生活態(tài)度，并獲得人際關(guān)系需要的滿足，促進學生身體素質(zhì)的全面提高。五、做好心理素質(zhì)方面的培養(yǎng)教師要注重加強學生心理咨詢與心理素質(zhì)方面的培養(yǎng)。在初中體育教學過程中，教師要通過體育基本動作的示范，激發(fā)學生的學習興趣，教師通過親自示范每一個動作的要點，正確示范，讓學生在正式訓(xùn)練之前，能夠直觀地獲取一個完整動作形象，從而充滿自信地投入訓(xùn)練。體育教師要多和學生展開交流，讓學生能夠?qū)w育教師產(chǎn)生信任感與親切感。教師要因材施教，采用降低難度與提高保護意識等方法，培養(yǎng)學生對完成整個動作的信心，盡量消除學生心理方面的障礙，讓學生敢于去挑戰(zhàn)體育項目。在學生進行訓(xùn)練的過程中，體育教師要多給予學生鼓勵與肯定，讓學生能夠從體育動作圓滿完成之中，去感受成功的喜悅，進而提升學習能力。在初中體育教學的過程中，教師要多采用目標控制來進行體育訓(xùn)練。體育教師要根據(jù)學生性別、年齡與運動技能的大小等，給不同程度的學生規(guī)定不同的考核標準，讓學生能夠通過不斷努力來獲得成功的喜悅，加強學生的進取心，樹立好自信心，提升自身的能力。分子力學MolecularMechanics計算化學的兩類方法分子力學分子力學,又叫力場方法(forcefieldmethod),目前廣泛地用于計算分子的構(gòu)象和能量分子力學從本質(zhì)上說上是能量最小值方法,即在原子間相互作用勢的作用下,通過改變粒子分布的幾何位型,以能量最小為判據(jù),從而獲得體系的最佳結(jié)構(gòu)。采用經(jīng)典的物理學定律,只考慮分子的核,而忽略外圍的電子。>量子力學利用薛定諤方程考慮外圍電子的影響分子模型的表示MolecularModelRepresentation分子模型用球表示原子,彈簧表示化學健,彈簧的變形表示化學鍵的伸縮、彎折和扭轉(zhuǎn)。非鍵結(jié)合的原子通過范德華力、空間排斥、靜電吸引和排斥相互作用TorsiongBendingNon-BondedInteractions坐標系統(tǒng)CoordinateSystem0卡爾坐標CartesianCoordinatesCartesian之以A(Angstrom)為單位內(nèi)坐標Internalcoordinates用原子之間的距離、角度和二面角表征分子構(gòu)型通常用乙矩陣(Z-matrix)表示第一個原子是起點=y,·第二個原子由到第一個原子的距離(d21)表示第三個原子由到第二一個原子的距離(d32/31)和角度(a321/a312)表示Fx中zmm間alvaluesadded:.第四個原子在前兩項的基礎(chǔ)上引進二面角(4321)At31.50127.70凡t41,49分子力場的勢函數(shù)形式分子力場的相互作用化學鍵相互作用鍵伸縮能bondstretching/compression鍵角彎折能anglebending二面角扭轉(zhuǎn)能torsionrotation交叉作用crossingterms非化學鍵相互作用·范德華相互作用能vanderWaalsinteractio靜電相互作用能electrostaticcontributions分子力場一般把體系勢能表達為內(nèi)坐標的函數(shù)Energy=StretchingEnergyBendingEnergyTorsionEnergyNon-BondedInteractionEnergy分子力場的勢函數(shù)形式鍵伸縮能BondStretching-諧振子函數(shù)E平衡鍵長鍵長鍵伸縮力常數(shù)莫斯函數(shù)(MorseFunction)E=Dlexp(-A(l-lo))-1]Rauy·TRIPOS,Cherm-X,CHARMm和AMBER采用諧振子函數(shù)形式vFF,DRIEDING和UFF既支持莫斯函數(shù)也支持諧振子模型Optimum·MM2和MMX用二階泰勒展開的莫斯函數(shù)MM3,CFF和MMFF94用三階泰勒展開的莫斯函數(shù)分子力場的勢函數(shù)形式∝鍵角彎折能AngleBending諧振子模型Ek,(6-6)平衡鍵角鍵角鍵角彎折力常數(shù)諸諧振子模型在偏離平衡位置不大的情況下(10°以內(nèi))可以取得很好的結(jié)果采用諧振子的力場包括:TRIPOSCHEM,CHARMm,AMBER