生物系統(tǒng)模擬分子模型化技術(shù)生物分子模擬電子細(xì)胞系統(tǒng)生物學(xué)分析方法生物系統(tǒng)宏觀方面.微觀方面:分子生物學(xué).細(xì)胞生物學(xué).分子遺傳學(xué).分子模型化技術(shù)分子模型化技術(shù)就是利用計算機模擬分子結(jié)構(gòu),研究分子之間相互作用的一種技術(shù).以三維圖形方式顯示分子的三維結(jié)構(gòu),顯示分子的理化或電子學(xué)特性.主要有線狀模型,球棒模型,空間填充模型等.分子模型化軟件:/空間填充模型空間填充模型也稱為calotte模型或CPK模型，CPK三個字母是來自Corey、Pauling（萊納斯·鮑林）與Koltun。是一種與球棒模型類似，用來表現(xiàn)分子三維空間分布的分子模型。是球棒模型的進一步發(fā)展，可顯示更為真實的分子外型。

生物分子模擬傳統(tǒng)的生物分子研究主要是實驗,通過生物學(xué)實驗分析和表征生物分子,如利用分子遺傳學(xué)方法確定基因的多態(tài)性,通過X-射線晶體衍射確定蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu),通過生化實驗研究生物大分子之間的相互作用,藥物分子與靶分子的結(jié)合.我們可以利用計算機進行模擬實驗,通過對生物大分子的結(jié)構(gòu)和動力學(xué)行為的模擬,為闡明其結(jié)構(gòu),生物功能提供了豐富的信息.表征字典(《現(xiàn)代漢語詞典》第五版)意:顯示出來的現(xiàn)象;表現(xiàn)出來的特征.例:心理疾病的外在表征.常用的模擬技術(shù)分子動力學(xué)模擬技術(shù).蒙特卡羅模擬技術(shù).分子動力學(xué)模擬技術(shù)分子動力學(xué)模擬是用計算機模擬的一種,是調(diào)查物質(zhì)諸性質(zhì)時候使用的手法之一。根據(jù)在計算機中每時每刻的追蹤全部的粒子的運動的規(guī)律,導(dǎo)出物質(zhì)全體的性質(zhì)這就是分子動力學(xué)法。蒙特卡羅模擬技術(shù)當(dāng)科學(xué)家們使用計算機試圖來預(yù)測復(fù)雜的趨勢和事件時，他們通常應(yīng)用一類需要長串的隨機數(shù)的復(fù)雜計算。設(shè)計這種用來預(yù)測復(fù)雜趨勢和事件的數(shù)學(xué)模型越來越依賴于一種稱為蒙特卡羅模擬的統(tǒng)計手段，而這種模擬進一步又要取決于可靠的無窮盡的隨機數(shù)目來源。

蒙特卡羅模擬因摩洛哥著名的賭場而得名。它能夠幫助人們從數(shù)學(xué)上表述物理、化學(xué)、工程、經(jīng)濟學(xué)以及環(huán)境動力學(xué)中一些非常復(fù)雜的相互作用。數(shù)學(xué)家們稱這種表述為“模式”，而當(dāng)一種模式足夠精確時，它能產(chǎn)生與實際操作中對同一條件相同的反應(yīng)。但蒙特卡羅模擬有一個危險的缺陷：如果必須輸入一個模式中的隨機數(shù)并不像設(shè)想的那樣是隨機數(shù)，而卻構(gòu)成一些微妙的非隨機模式，那么整個模擬（以及預(yù)測結(jié)果）都可能是錯的。

電子細(xì)胞電子細(xì)胞亦稱虛擬細(xì)胞或人工細(xì)胞.它是在計算機上模擬真實細(xì)胞的結(jié)構(gòu)和細(xì)胞的活動,闡明生命現(xiàn)象.電子細(xì)胞的關(guān)鍵是建模,涉及到細(xì)胞內(nèi)環(huán)境和細(xì)胞相關(guān)物質(zhì)對細(xì)胞的生命活動的作用.系統(tǒng)生物學(xué)分析方法關(guān)鍵字:計算機仿真.整合.數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)—圖.干涉系統(tǒng)生物學(xué)分析新的一頁

--生物信息學(xué)在生物醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用生物信息學(xué)在生物醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用生命組信息學(xué)計算機診斷學(xué)技術(shù)計算機輔助藥物分子設(shè)計生命組信息學(xué)基因組信息學(xué)--解讀天書.轉(zhuǎn)錄組信息學(xué)--探索基因表達調(diào)控規(guī)律.蛋白質(zhì)組信息學(xué)--鑒別生命機器.代謝組信息學(xué)--分析生物分子模塊和系統(tǒng).計算診斷學(xué)技術(shù)核心:基因芯片.作用:檢測疾病相關(guān)基因組,分析疾病產(chǎn)生根源,對疾病進行科學(xué)診斷和分類.數(shù)據(jù)分析三過程(主要針對腫瘤細(xì)胞):選擇腫瘤分型特異基因.構(gòu)建分類器.檢測分類預(yù)測結(jié)果的有效性.

主要的分類器模型和方法貝葉斯分類法K-近鄰法人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)貝葉斯分類器貝葉斯分類器的分類原理是通過某對象的先驗概率，利用貝葉斯公式計算出其后驗概率，即該對象屬于某一類的概率，選擇具有最大后驗概率的類作為該對象所屬的類。K-近鄰法思想簡介K-近鄰法的基本思想是在測試樣本x的k個近鄰中，按出現(xiàn)的樣本類別來作為x的類別，即先對x的k個近鄰一一找出它們的類別，然后對x類別進行判別，即在N個訓(xùn)練樣本中，找出x的k個近鄰。人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（ArtificialNeuralNetworks,ANN），一種模仿動物神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)行為特征，進行分布式并行信息處理的算法數(shù)學(xué)模型。這種網(wǎng)絡(luò)依靠系統(tǒng)的復(fù)雜程度，通過調(diào)整內(nèi)部大量節(jié)點之間相互連接的關(guān)系，從而達到處理信息的目的。人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)具有自學(xué)習(xí)和自適應(yīng)的能力，可以通過預(yù)先提供的一批相互對應(yīng)的輸入－輸出數(shù)據(jù)，分析掌握兩者之間潛在的規(guī)律，最終根據(jù)這些規(guī)律，用新的輸入數(shù)據(jù)來推算輸出結(jié)果，這種學(xué)習(xí)分析的過程被稱為“訓(xùn)練”。（引自《環(huán)球科學(xué)》2007年第一期《神經(jīng)語言：老鼠胡須下的秘密》）

計算機輔助藥物設(shè)計(1)概念:計算機輔助藥物設(shè)計根據(jù)已知藥物靶分子(蛋白質(zhì)或受體)的結(jié)構(gòu),針對性設(shè)計與靶分子結(jié)合的藥物分子.原理:首先通過X射線晶體衍射技術(shù)等技術(shù)支持獲得藥物分子的結(jié)構(gòu),采用分子模擬軟件分析結(jié)合部位的結(jié)構(gòu)性質(zhì);然后在化合物數(shù)據(jù)庫中搜索分子形狀的結(jié)構(gòu)特征設(shè)計全新的藥物分子.計算機輔助藥物設(shè)計(2)方法:數(shù)據(jù)庫搜索法和基于藥物靶結(jié)構(gòu)的全新分子藥物的設(shè)計方法.通過數(shù)據(jù)庫搜索發(fā)現(xiàn)與藥靶有較好親和力的小分子,從而發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)化合物.藥物