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文檔簡介

1、.生物化學名詞解釋大全氨基酸amino acids:是含有一個堿性氨基和一個酸性羧基的有機化合物,氨基一般連接在α-碳上。氨基酸是肽和蛋白質的構件分子。必需氨基酸essential amino acids:指人或其它脊椎動物自己不能合成,需要從飲食中獲得的氨基酸,例如賴氨酸、蘇氨酸等氨基酸非必需氨基酸nonessential amino acids:指人或其它脊椎動物自己能由簡單的前體合成的,不需要由飲食供給的氨基酸,例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。等電點pI,isoelectric point:使分子處于兼性分子狀態(tài),在電場中不遷移分子的凈電荷為零的pH值。茚三酮反響ninh

2、ydrin reaction:在加熱條件下,氨基酸或肽與茚三酮反響生成紫色與脯氨酸反響生成黃色化合物的反響。肽鍵peptide bond:一個氨基酸的羧基與另一個氨基酸的氨基縮合,除去一分子水形成的酰胺鍵。肽peptides:兩個或兩個以上氨基酸通過肽鍵共價連接形成的聚合物。蛋白質一級構造primary structure:指蛋白質中共價連接的氨基酸殘基的排列順序。層析chromatography:按照在挪動相可以是氣體或液體和固定相可以是液體或固體之間的分配比例將混合成分分開的技術。離子交換層析ion-exchange column chromatography:使用帶有固定的帶電基團的聚合

3、樹脂或凝膠層析柱別離離子化合物的層析方法。透析dialysis:通過小分子經半透膜擴散到水或緩沖液的原理將小分子與生物大分子分開的一種別離純化技術。凝膠過濾層析gel filtration chromatography:也叫做分子排阻層析molecular-exclusion chromatography。一種利用帶孔凝膠珠作基質,按照分子大小別離蛋白質或其它分子混合物的層析技術。親和層析affinity chromatography:利用共價連接有特異配體的層析介質別離蛋白質混合物中能特異結合配體的目的蛋白或其它分子的層析技術。高壓液相層析HPLC,high-pressure liquid

4、chromatography:使用顆粒極細的介質,在高壓下別離蛋白質或其它分子混合物的層析技術。凝膠電泳gel electrophoresis:以凝膠為介質,在電場作用下別離蛋白質或核酸等分子的別離純化技術。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳:SDS-PAGE,sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrohoresis在有去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰胺凝膠電泳。SDS-PAGE只是按照分子大小別離的,而不是根據分子所帶的電荷和大小別離的。等電聚焦電泳IFE,isoelectric focusing electrophoresis:利用特殊的

5、一種緩沖液兩性電解質在聚丙烯酰胺凝膠內制造一個pH梯度,電泳時每種蛋白質就將遷移到它的等電點pI處,即梯度中的某一pH時,就不再帶有凈的正或負電荷了。雙向電泳two-dimensional electrophoresis:是等電聚焦電泳和SDS-PAGE的組合,即先進展等電聚焦電泳按照pI別離,然后再進展SDS-PAGE按照分子大小,經染色得到的電泳圖是個二維分布的蛋白質圖。Edman降解Edman degradation:從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經層析鑒定,余下的多肽鏈少了一個殘基被回收再進展下一輪降

6、解循環(huán)。同源蛋白質homologous proteins:來自不同種類生物、而序列和功能類似的蛋白質。例如血紅蛋白。構型configuration:一個有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。這種排列不經過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。構型的改變往往使分子的光學活性發(fā)生變化。構象conformation:指一個分子中,不改變共價鍵構造,僅單鍵周圍的原子旋轉所產生的原子的空間排布。一種構象改變?yōu)榱硪环N構象時,不要求共價鍵的斷裂和重新形成。構象改變不會改變分子的光學活性。肽單位peptide unit:又稱之肽基peptide group,是肽鏈主鏈上的重復構造。是由參與肽鍵形成的氮原子和碳

7、原子和它們的4個取代成分:羰基氧原子、酰胺氫原子和兩個相鄰的α-碳原子組成的一個平面單位。蛋白質二級構造protein secondary structure:在蛋白質分子中的部分區(qū)域內氨基酸殘基的有規(guī)那么的排列,常見的二級構造有α-螺旋和β-折疊。二級構造是通過骨架上的羰基和酰胺基團之間形成的氫鍵維持的。蛋白質三級構造protein tertiary structure:蛋白質分子處于它的天然折疊狀態(tài)的三維構象。三級構造是在二級構造的根底上進一步盤繞、折疊形成的。三級構造主要是靠氨基酸側鏈之間的疏水互相作用、氫鍵范德華力和鹽鍵靜電作用

8、力維持的。蛋白質四級構造quaternary structure:多亞基蛋白質的三維構造。實際上是具有三級構造的多肽鏈亞基以適當方式聚合所呈現出的三維構造。α-螺旋α-helix:蛋白質中常見的一種二級構造,肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋構造,螺旋是靠鏈內氫鍵維持的。每個氨基酸殘基第n個的羰基氧與多肽鏈C端方向的第4個殘基第n+4個的酰胺氮形成氫鍵。在典型的右手α-螺旋構造中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升0.15nm。β-折疊β-

9、sheet:是蛋白質中的常見的二級構造,是由伸展的多肽鏈組成的。折疊片的構象是通過一個肽鍵的羰基氧和位于同一個肽鏈或相鄰肽鏈的另一個酰胺氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列走向都是由N到C方向;或者是反平行排列肽鏈反向排列。β-轉角β-turn:也是多肽鏈中常見的二級構造,連接蛋白質分子中的二級構造α-螺旋和β-折疊,使肽鏈走向改變的一種非重復多肽區(qū),一般含有216個氨基酸殘基。含有5個氨基酸殘基以上的轉角又常稱之環(huán)loops。常見的轉角含有4個氨基酸殘基,有兩種類型。轉角I的特點是:

10、第1個氨基酸殘基羰基氧與第4個殘基的酰胺氮之間形成氫鍵;轉角II的第3個殘基往往是甘氨酸。這兩種轉角中的第2個殘基大都是脯氨酸。超二級構造super-secondary structure:也稱之基元motif。在蛋白質中,特別是球蛋白中,經常可以看到由假設干相鄰的二級構造單元組合在一起,彼此互相作用,形成的有規(guī)那么、在空間上能識別的二級構造組合體。構造域domain:在蛋白質三級構造內的獨立折疊單元。構造域通常都是幾個超二級構造單元的組合。纖維蛋白fibrous proteins:一類主要的不溶于水的蛋白質,通常都含有呈現一樣二級構造的多肽鏈。許多纖維蛋白結合嚴密,并為單個細胞或整個生物體提

11、供機械強度,起著保護或構造上的作用。球蛋白globular proteins:一類蛋白質,許多都溶于水,球蛋白是緊湊的、近似球形的、含有折疊嚴密的多肽鏈。典型的球蛋白含有能特異識別和結合其它化合物的凹陷或裂隙部位。角蛋白keratins:由處于α-螺旋或β-折疊構象的平行的多肽鏈組成的不溶于水的起著保護或構造作用的蛋白質。膠原蛋白collagen:是動物結締組織中最豐富的一種構造蛋白,它是由原膠原蛋白分子組成,原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋構造的蛋白。每個原膠原分子都是由3條特殊的左手螺旋螺距0.95nm,每一圈含有3.3個殘基的多肽鏈右手旋轉形成的。疏水

12、互相作用hydrophobic interaction:非極性分子之間的一種弱的、非共價的互相作用。這些非極性分子如一些中性氨基酸殘基,也稱之疏水殘基在水相環(huán)境中具有避開水而互相聚集的傾向。伴娘蛋白chaperone:與一種新合成的多肽鏈形成復合物并協(xié)助它正確折疊成具有生物功能構象的蛋白質。伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有組裝的蛋白亞基的不正確的聚集,協(xié)助多肽鏈跨膜轉運以及大的多亞基蛋白質的組裝和解體。二硫鍵disulfide bond:通過兩個半胱氨酸巰基的氧化形成的共價鍵。二硫鍵在穩(wěn)定某些蛋白的三維構造上起著重要的作用。范德華力van der Waals force:中性原子之

13、間通過瞬間靜電互相作用產生的一種弱的分子之間的力。當兩個原子之間的間隔 為它們的范德華半徑之和時,范德華引力最強。強的范德華排斥作用可以防止原子互相靠近。蛋白質變性denaturation:生物大分子的天然構象遭到破壞導致其生物活性喪失的現象。蛋白質在受到光照、熱、有機溶劑以及一些變性劑的作用時,次級鍵受到破壞,導致天然構象的破壞,使蛋白質的生物活性喪失。復性renaturation:在一定的條件下,變性的生物大分子恢復成具有生物活性的天然構象的現象。肌紅蛋白myoglobin:是由一條肽鏈和一個血紅素輔基組成的結合蛋白,是肌肉內儲存氧的蛋白質,它的氧飽和曲線為雙曲線型。血紅蛋白hemoglo

14、bin:是由含有血紅素輔基的4個亞基組成的寡聚蛋白。血紅蛋白負責將氧由肺運輸到外周組織,它的氧飽和曲線為S型。波爾效應Bohr effect:CO2濃度的增加降低細胞內的pH,引起紅細胞內血紅蛋白的氧親和力下降的現象。別構效應allosteric effect:又稱之變構效應。是寡聚蛋白與配基結合改變蛋白質的構象,導致蛋白質生物活性改變的現象。鐮刀型細胞貧血病sickle-cell anemia:血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細胞呈鐮刀狀。其特點是病人的血紅蛋白β-亞基N端的第6個氨基酸殘基是纈氨酸,而不是正常的谷氨酸殘基。酶enzyme:生物催化劑,除少

15、數RNA外幾乎都是蛋白質。酶不改變反響的平衡,只是通過降低活化能加快反響的速度。全酶holoenzyme:具有催化活性的酶,包括所有的必需的亞基、輔基和其它的輔助因子。脫輔基酶蛋白apoenzyme:酶中除去催化活性可能需要的有機或無機輔助因子或輔基后的蛋白質部分。酶活力單位U,active unit:酶活力的度量單位。1961年國際酶學會議規(guī)定:1個酶活力單位是指在特定條件25,其它為最適條件下,在1分鐘內能轉化1微摩爾底物的酶量,或是轉化底物中1微摩爾的有關基團的酶量。比活specific activity:每分鐘每毫克酶蛋白在25下轉化的底物的微摩爾數μm。比活是酶純度的測

16、量。活化能activation energy:將一摩爾反響底物中的所有分子由基態(tài)轉化為過渡態(tài)所需要的能量。活性部位active site:酶中含有底物結合部位和參與催化底物轉化為產物的氨基酸殘基的部分。活性部位通常都位于蛋白質的構造域或亞基之間的裂隙或是蛋白質外表的凹陷部位,通常都是由在三維空間上靠得很近的一些氨基酸殘基組成的。酸-堿催化acid-base catalysis:質子轉移加速反響的催化作用。共價催化covalent catalysis:一個底物或底物的一部分與催化劑形成共價鍵,然后被轉移給第二個底物。許多酶催化的基團轉移反響都是通過共價催化方式進展的。靠近效應proximity

17、effect:非酶促反響或酶促反響速率的增加是由于活性部位處反響劑有效濃度增大底物靠近活性部位的結果,這將導致更頻繁地形成過渡態(tài)。初速度initial velocity:酶促反響最初階段底物轉化為產物的速度,這一階段產物的濃度非常低,其逆反響可以忽略不計。米氏方程Michaelis-Menten equation:表示一個酶促反響的起始速度v與底物濃度S關系的速度方程,v=VmaxS/Km+S。米氏常數Michaelis constant,Km:對于一個給定反響,導致酶促反響速度的起始速度v0到達最大反響速度Vmax一半時的底物濃度。催化常數catalytic numberKcat:也稱之轉換

18、數turnover number。一個動力學常數,是在底物濃度處于飽和狀態(tài)下,一個酶或一個酶活性部位催化一個反響有多快的測量。催化常數等于最大反響速度除以總的酶濃度Vmax/Etotal,或者是每摩爾酶活性部位每秒鐘轉化為產物的底物的摩爾數。雙倒數作圖double-reciprocal plot:也稱之Lineweaver-Burk作圖。一個酶促反響速度的倒數1/v對底物濃度的倒數1/s的作圖。X和y軸上的截距分別代表米氏常數Km和最大反響速度Vmax的倒數。競爭性抑制作用competitive inhibition:通過增加底物濃度可以逆轉的一種酶抑制類型。一個競爭性抑制劑通常與正常的底物或

19、配體競爭同一個蛋白質的結合部位。這種抑制使得Km增大,而Vmax不變。非競爭性抑制作用noncompetitive inhibition:抑制劑不僅與游離酶結合,也可以與酶-底物復合物結合的一種酶促反響抑制作用。這種抑制使得Vmax變小,但Km不變。反競爭性抑制作用uncompetitive inhibition:抑制劑只與酶-底物復合物結合,而不與游離酶結合的一種酶促反響抑制作用。這種抑制作用使得Vmax,Km都變小,但Vmax/Km比值不變。絲氨酸蛋白酶serine protease:活性部位含有在催化期間起著親核體作用的絲氨酸殘基的蛋白酶。酶原zymogen:通過有限蛋白水解可以由無活性

20、變成具有催化活性的酶前體。調節(jié)酶regulatory enzyme:位于一個或多個代謝途徑內的一個關鍵部位的酶,它的活性根據代謝的需要被增加或降低。別構酶allosteric enzyme:一種其活性受到結合在活性部位以外部位的其它分子調節(jié)的酶。別構調節(jié)劑allosteric modulator:結合在別構酶的調節(jié)部位調節(jié)該酶催化活性的生物分子,別構調節(jié)劑可以是激活劑,也可以是抑制劑。齊變形式concerted model:一樣配體與寡聚蛋白協(xié)同結合的一種形式。按照最簡單齊變形式,由于一個底物或別構調節(jié)劑的結合,蛋白質的構象在T對底物親和性低的構象和R對底物親和性高的構象之間變換。這一形式提出

21、所有蛋白質的亞基都具有同樣的構象,或是T,或是R構象。序變形式sequential model:一樣配體與寡聚蛋白協(xié)同結合的另外一種形式。按照最簡單的序變形式,一個配體的結合會誘導它結合的亞基的三級構造的變化,以及使相鄰亞基的構象發(fā)生很大的變化。按照序變形式,只有一個亞基對配體具有高的親和性。同功酶isoenzyme或isozyme:催化同一化學反響而化學組成不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列、底物的親和性等方面都存在著差異。別構調節(jié)物allosteric modulator:也稱之別構效應物allosteric effector。結合在別構酶的調節(jié)部位,調節(jié)酶催化活性的生物分子。別構調節(jié)物可

22、以是激活劑或抑制劑維生素vitamin:是一類動物本身不能合成但對動物生長和安康又是必需的有機化合物,所以必須從飲食中獲得。許多輔酶都是由維生素衍生的。水溶性維生素water-soluble vitamins:一類能溶于水的有機營養(yǎng)分子。其中包括在酶的催化中起著重要作用的B族維生素以及抗壞血酸維生素C等。脂溶性維生素lipid vitamins:由長的碳氫鏈或稠環(huán)組成的聚戊二烯化合物。脂溶性維生素包括維生素A、D、E和K,這類維生素能被動物貯存。輔酶coenzyme:某些酶在發(fā)揮催化作用時所需要的一類輔助因子,其成分中往往含有維生素。輔基prosthetic group:是與酶蛋白共價結合的金

23、屬離子或一類有機化合物,用透析法不能除去。輔基在整個酶促反響過程中始終與酶的特定部位結合。尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸NADP+,nicotinamide adenine dinucleotide phosphate:含有尼克酰胺的輔酶,在某些氧化復原反響中起著氫原子和電子載體的作用,常常作為脫氫酶的輔酶。黃素單核苷酸FMN, flavin mononucleotide:核黃素磷酸,是某些氧化復原酶的輔酶。黃素腺嘌呤二核苷酸FAD, flavin adenine dinucleotide:是某些氧化復原酶的輔酶,含有核黃素。硫胺素焦磷酸t(yī)hiamine pyrophosp

24、hate:是維生素B1的輔酶形式,參與轉醛基反響。磷酸吡哆醛pyidoxal phosphate:是維生素B6吡哆醇的衍生物,是轉氨酶、脫羧酶和消旋酶的輔酶。生物素biotin:參與脫羧反響的一種酶的輔助因子。輔酶Acoenzyme A:一種含有泛酸的輔酶,在某些酶促反響中作為酰基的載體。類胡蘿卜素carotenoids:由異戊二烯組成的脂溶性光合色素。轉氨酶transaminases:也稱之氨基轉移酶aminotransferases,在該酶的催化下一個α-氨基酸的氨基轉可移給另一個α-酮酸。醛糖aldoses:一類單糖,該單糖中氧化數最高的碳原子指定

25、為C-1是個醛基。酮糖ketoses:一類單糖,該單糖中氧化數最高的碳原子指定為C-2是個酮基。異頭物anomers:僅在氧化數最高的碳原子異頭碳具有不同構型的糖分子的兩種異構體。異頭碳anomeric carbon:一個環(huán)化單糖的氧化數最高的碳原子。異頭碳具有一個羰基的化學反響性。變旋mutarotation:一個吡喃糖、呋喃糖或糖苷伴隨著它們的α-和β-異構形式的平衡而發(fā)生的比旋度變化。單糖monosaccharide:由三個或更多碳原子組成的具有經歷公式CH2On的簡單糖。糖苷glycosides:單糖半縮醛羥基與另一個分子例如醇、糖、嘌呤或嘧啶的羥

26、基、胺基或巰基縮合形成的含糖衍生物。糖苷鍵glycosidic bond:一個糖半縮醛羥基與另一個分子例如醇、糖、嘌呤或嘧啶的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵,常見的糖苷鍵有O-糖苷鍵和N-糖苷鍵。寡糖oligoccharide:由2個20個單糖殘基通過糖苷鍵連接形成的聚合物。多糖polysaccharide:20個以上的單糖通過糖苷鍵連接形成的聚合物。多糖鏈可以是線性的或帶有分支的。復原糖reducing sugar:羰基碳異頭碳沒有參與形成糖苷鍵,因此可被氧化充當復原劑的糖。淀粉starch:一類可作為植物中貯存多糖的葡萄糖殘基的同聚物。由兩種形式的淀粉:一種是直鏈淀粉,是沒有分

27、支的只是通過α-1→4糖苷鍵連接的葡萄糖殘基聚合物。另一種是支鏈淀粉,是含有分支的α-1→4糖苷鍵連接的葡萄糖殘基聚合物,支鏈在分支點處通過α-1→6糖苷鍵與主鏈相連。糖原glycogen:是含有分支的α-1→4糖苷鍵連接在一起的葡萄糖的同聚物,支鏈在分支點處通過α-1→6糖苷鍵與主鏈相連。極限糊精limit dexitrin:是指支鏈淀粉中帶有支鏈的核心部分,該部分在支鏈淀粉經淀粉酶水解作用、糖原磷酸化酶

28、或淀粉磷酸化酶作用后仍然存在。糊精的進一步降解需要α1→6糖苷鍵的水解。肽聚糖peptidoglycan:N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰唾液酸交替連接的雜多糖與不同組成的肽穿插連接形成的大分子。肽聚糖是許多細菌細胞壁的主要成分。糖蛋白glycoprotein:含有共價連接的葡萄糖殘基的蛋白質。蛋白聚糖proteoglycans:由雜多糖與一個多肽鏈組成的雜化的大分子,多糖是分子的主要成分。脂肪酸fatty acid:是指一端含有一個羧基的長的脂肪族碳氫鏈。脂肪酸是最簡單的一種脂,它是許多更復雜的脂例如三脂酰甘油、甘油磷脂、鞘磷脂和蠟的成分。飽和脂肪酸satur

29、ated fatty acid:不含有-C=C-雙鍵的脂肪酸。不飽和脂肪酸unsaturated fatty acid:至少含有一個-C=C-雙鍵的脂肪酸。必需脂肪酸ossential fatty acids:維持哺乳動物正常生長所需的,而動物又不能合成的脂肪酸,例如亞油酸和亞麻酸。三脂酰甘油triacylglycerol:也稱之甘油三酯triglyceride。一種含有與甘油酯化的3個脂酰基的脂。脂肪和油是三脂酰甘油的混合物。磷脂phospholipid:含有磷酸成分的脂。例如卵磷脂、腦磷脂等。鞘脂sphingolipids:一類含有鞘氨醇骨架的兩性脂,一端連接著一個長鏈的脂肪酸,了一端為一

30、個極性的醇。鞘脂包括鞘磷脂、腦磷脂以及神經節(jié)苷脂,一般存在于植物和動物膜內,尤其是在中樞神經系統(tǒng)的組織內含量豐富。鞘磷脂sphingomyelin:一種由神經酰胺的C-1羥基上連接了磷酸膽堿或磷酸乙醇胺構成的鞘脂。鞘磷脂存在于大多數哺乳動物細胞的質膜內,是髓鞘的主要成分。卵磷脂lecithin:就是磷脂酰膽堿PC,phosphatidyl choline,是磷脂酸與膽堿形成的酯。腦磷脂cephalin:就是磷脂酰乙醇胺PE,phosphatidyl ethanolamine,是磷脂酸與乙醇胺形成的酯。脂質體liposome:是由包圍水相空間的磷脂雙層形成的囊泡小泡。生物膜bioligical

31、membrane:鑲嵌有蛋白質的脂雙層,起著劃分和分隔細胞和細胞器的作用。生物膜也是許多與能量轉化和細胞內通訊有關的重要部位。內在膜蛋白integral membrane proteins:插入脂雙層的疏水核和完全跨越脂雙層的膜蛋白。外周膜蛋白peripheral membrane proteins:通過與膜脂的極性頭部或內在膜蛋白的離子互相作用和形成氫鍵與膜的內、外外表弱結合的膜蛋白。膜蛋白一旦從膜上釋放出來,通常都是水溶性的。流體鑲嵌模型fluid mosaic model:針對生物膜的構造提出的一種模型。在這個模型中,生物膜被描繪成鑲嵌有蛋白質的流體脂雙層,脂雙層在構造和功能上都表現出不

32、對稱性。有的蛋白質"鑲"在脂雙層外表,有的那么部分或全部嵌入其內部,有的那么橫跨整個膜。另外脂和膜蛋白都可以進展橫向擴散。通透系數permeability coefficient:是離子或小分子擴散過脂雙層膜才能的一種量度。通道蛋白channel proteins:是一種帶有中央水相通道的內在膜蛋白,它可以使大小適宜的離子和分子從膜的任一方向穿過膜。膜孔蛋白pore proteins:其含義與通道蛋白類似,只是該術語常用于細菌。被動轉運passive transport:也稱之易化擴散facilitated diffusion。是一種轉運方式,通過該方式溶質特異結合于一個轉

33、運蛋白,然后被轉運過膜,但轉運是沿著濃度梯度下降方向進展,所以被動轉運不需要能量支持。主動轉運active transport:一種轉運方式,通過該方式溶質特異結合于一個轉運蛋白,然后被轉運過膜,但與被動轉運方式相反轉運是逆著濃度梯度方向進展的,所以主動轉運需要能量來驅動。在原發(fā)主動轉運過程中,能源可以是光、ATP或電子傳遞。而第二級主動轉運是在離子濃度梯度驅動下進展的。協(xié)同運送cotransport:兩種不同溶質跨膜的耦聯(lián)轉運。可以通過一個轉運蛋白進展同一方向同向轉運或反方向反向轉運轉運。胞吞作用endocytosis:物質被質膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形式物質在囊泡內并被帶入到細胞內的過程

34、。胞吐作用exocytosis:確定要分泌的物質被包裹在脂囊泡內,該囊泡與質膜交融,然后將物質釋放到細胞外空間的過程。核苷nucleoside:是由嘌呤或嘧啶堿基通過共價鍵與戊糖連接組成的化合物。核糖與堿基一般都是由糖的異頭碳與嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之間形成的β-N-糖苷鍵連接的。核苷酸nucleotide:核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。cAMPcyclic AMP:3,5-環(huán)腺苷酸,細胞內的第二信使,由于某些激素或其它分子信號刺激激活腺苷酸環(huán)化酶催化ATP環(huán)化形成的。磷酸二酯鍵phosphodiester linkage:一種化學基團,指一分子磷酸與兩個醇羥

35、基酯化形成的兩個酯鍵。該酯鍵成了兩個醇之間的橋梁。例如一個核苷的3羥基與另一個核苷的5羥基與同一分子磷酸酯化,就形成了一個磷酸二酯鍵。脫氧核糖核酸DNA , deoxyribonucleic acid:含有特殊脫氧核糖核苷酸序列的聚脫氧核苷酸,脫氧核苷酸之間是通過3,5-磷酸二酯鍵連接的。DNA是遺傳信息的載體。核糖核酸RNA , ribonucleic acid:通過3,5-磷酸二酯鍵連接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。核糖體核糖核酸rRNA, ribosomal robonucleic acid:作為核糖體組成成分的一類RNA,rRNA是細胞內最豐富的RNA。信使核糖核酸mRNA,

36、 messenger ribonucleic acid:一類用作蛋白質合成模板的RNA。轉移核糖核酸t(yī)RNA, transfer ribonucleic acid:一類攜帶激活氨基酸,將它帶到蛋白質合成部位并將氨基酸整合到生長著的肽鏈上的RNA。tRNA含有能識別模板mRNA上互補密碼的反密碼。轉化作用transformation:一個外源DNA通過某種途徑導入一個宿主菌,引起該細菌的遺傳特性改變的作用。轉導作用transduction:借助于病毒載體,遺傳信息從一個細胞轉移到另一個細胞。堿基對base pair:通過堿基之間氫鍵配對的核酸鏈中的兩個核苷酸,例如A與T或U,以及G與C配對。查格

37、夫法那么Chargaff's rules:所有DNA中腺嘌呤與胸腺嘧啶的摩爾含量相等,A=T,鳥嘌呤和胞嘧啶的摩爾含量相等G=C,即嘌呤的總含量與嘧啶的總含量相等A+G=T+C。DNA的堿基組成具有種的特異性,但沒有組織和器官的特異性。另外生長發(fā)育階段、營養(yǎng)狀態(tài)和環(huán)境的改變都不影響DNA的堿基組成。DNA雙螺旋DNA double helix:一種核酸的構象,在該構象中,兩條反向平行的多核苷酸鏈圍繞彼此纏繞形成一個右手的雙螺旋構造。堿基位于雙螺旋內側,磷酸與糖基在外側,通過磷酸二酯鍵相連,形成核酸的骨架。堿基平面與假想的中心軸垂直,糖環(huán)平面那么與軸平行。兩條鏈皆為右手螺旋。雙螺

38、旋的直徑為2nm,堿基堆積間隔 為0.34nm,兩核苷酸之間的夾角是36°,每對螺旋由10對堿基組成,堿基按A-T, G-C配對互補,彼此以氫鍵相連系。維持DNA雙螺旋構造穩(wěn)定的力主要是堿基堆積力。雙螺旋外表有兩條寬窄、深淺不一的一個大溝和一個小溝。大溝major groove和小溝minor groove:繞B-DNA雙螺旋外表上出現的螺旋槽溝,寬的溝稱之大溝,窄溝稱之小溝。大溝、小溝都是由于堿基對堆積和糖-磷酸骨架改變造成的。DNA超螺旋DNA supercoiling:DNA本身的卷曲,一般是DNA雙螺旋的彎曲、欠旋負超螺旋或過旋正超螺旋的結果。拓撲異構酶topoisom

39、erase:通過切斷DNA的一條或兩條鏈中的磷酸二酯鍵,然后重新纏繞和封口來改變DNA連環(huán)數的酶。拓撲異構酶I通過切斷DNA中的一條鏈減少負超螺旋,增加一個連環(huán)數;而拓撲異構酶II切斷DNA的兩條鏈增加負超螺旋,減少2 個連環(huán)數。某些拓撲異構酶II也稱之DNA促旋酶。核小體nucleosome:用于包裝染色質的構造單位,是由DNA鏈繞一個組蛋白核纏繞構成的。染色質chromatin:是存在于真核生物間期細胞核內,易被堿性染料著色的一種無定形物質。染色質中含有作為骨架的完好的雙鏈DNA,以及組蛋白、非組蛋白和少量的RNA。染色體chromosome:是染色質在細胞分裂過程中經過嚴密纏繞、折疊、凝

40、縮和精細包裝形成的具有固定形態(tài)的遺傳物質存在形式。簡言之,染色體是一個大的單一的雙鏈DNA分子與相關蛋白質組成的復合物,DNA中含有許多基因,貯存和傳遞遺傳信息。DNA變性DNA denaturation:DNA雙鏈解鏈別離成兩條單鏈的現象。退火annealing:即DNA由單鏈復性變成雙鏈構造的過程。來源一樣的DNA單鏈經退火后完全恢復雙鏈構造,同源DNA之間、DNA和RNA之間退火后形成雜交分子。融解溫度melting temperature, Tm:雙鏈DNA融解徹底變成單鏈DNA的溫度范圍的中點溫度。增色效應hyperchromic effect:當雙螺旋DNA融解解鏈時,260nm處

41、紫外吸收增加的現象。減色效應hypochromic effect:隨著核酸復性,紫外吸收降低的現象。核酸內切酶endonuclease:核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶中可以水解核酸分子內磷酸二酯鍵的酶。核酸外切酶exonuclease:從核酸鏈的一端逐個水解下核苷酸的酶。限制性內切酶restriction endonucleases:一種在特殊核苷酸序列處水解雙鏈DNA的內切酶。I型限制性內切酶既催化宿主DNA的甲基化,又催化非甲基化的DNA的水解;而II型限制性內切酶只催化非甲基化的DNA的水解。限制酶圖譜restriction map:同一DNA用不同的限制酶進展切割從而獲得各種限制酶的切割位

42、點,由此建立的位點圖譜有助于對DNA的構造進展分析。反向重復序列inverted repeat sequence:在同一多核苷酸鏈內的相反方向上存在的重復的核苷酸序列。在雙鏈DNA中反向重復可能引起十字形構造的形成。重組DNA技術recombination DNA technology:也稱之基因工程genomic engineering。利用限制性內切酶和載體,按照預先設計的要求,將一種生物的某種目的基因和載體DNA重組后轉人另一生物細胞中進展復制、轉錄和表達的技術。基因gene:也稱之順反子cistron。泛指被轉錄的一個DNA片段。在某些情況下,基因常用來指編碼一個功能蛋白或RNA分子的

43、DNA片段。分解代謝反響catabolic reaction:降解復雜分子為生物體提供小的構件分子和能量的代謝反響。合成代謝反響anabolic reaction:合成用于細胞維持和生長所需要的分子的代謝反響。反響抑制feedback inhibition:催化一個代謝途徑中前面反響的酶受到同一途徑的終產物抑制的現象。前饋激活feed-forward activation:代謝途徑中一個酶被該途徑中前面產生的代謝物激活的現象。標準自由能變化ΔG°standard free-energy change:在一系列標準條件溫度:298K;壓力:1個大氣壓;所有溶質

44、的濃度都是1M下發(fā)生的反響的自由能變化。ΔG°表示pH7.0條件下的標準自由能變化。標準復原電位E°standard reduction potential:25和pH7.0條件下一個復原劑和它的氧化形式在1M濃度下表現出的電動勢。酵解glycolysis:一個由10步酶促反響組成的糖分解代謝途徑,通過該途徑,一分子葡萄糖轉換為兩分子丙酮酸,同時凈生成兩分子ATP和兩分子NADH。發(fā)酵fermentation:營養(yǎng)分子例如葡萄糖產能的厭氧降解,在乙醇發(fā)酵中,丙酮酸轉化為乙醇和CO2。巴斯德效應Pasteur effect:氧存在下,酵解速度放

45、慢的現象。底物程度磷酸化substrate phosphorylation:ADP或某些其它的核苷-5-二磷酸的磷酸化是通過來自一個非核苷酸底物的磷酰基的轉移實現的。這種磷酸化與電子傳遞鏈無關。檸檬酸循環(huán)citric acid cycle:也稱之三羧酸循環(huán)tricarboxylic acid cycle,Krebs 循環(huán)Krebs cycle。是用于乙酰CoA中的乙酰基氧化生成CO2的酶促反響的循環(huán)系統(tǒng),該循環(huán)的第一步反響是由乙酰CoA和草酰乙酸縮合形成檸檬酸。回補反響anaplerotic reaction:酶催化的補充檸檬酸循環(huán)中間代謝物的供給的反響,例如由丙酮酸羧化生成草酰乙酸的反響。乙

46、醛酸循環(huán)glyoxylate cycle:是某些植物、細菌和酵母中檸檬酸循環(huán)的修改形式,通過該循環(huán)可以由乙酰CoA經草酰乙酸凈生成葡萄糖。乙醛酸循環(huán)繞過了檸檬酸循環(huán)中生成兩個CO2的步驟。戊糖磷酸途徑pentose phosphate pathway:也稱之磷酸己糖支路hexose monophosphate shunt。是一個葡萄糖-6-磷酸經代謝產生NADPH和核糖-5-磷酸的途徑。該途徑包括氧化和非氧化兩個階段,在氧化階段,葡萄糖-6-磷酸轉化為核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成兩分子的NADPH;在非氧化階段,核酮糖-5-磷酸異構化生成核糖-5-磷酸或轉化為酵解中的兩個中間代謝物果糖-6

47、-磷酸和甘油醛-3-磷酸。糖醛酸途徑glucuronate pathway:從葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1-磷酸開場,經UDP-葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗壞血酸的途徑。但只有在植物和那些可以合成抗壞血酸維生素C動物體內,通過該途徑可以合成維生素C。無效循環(huán)futile cycle:也稱之底物循環(huán)substrate cycle。一對催化兩個途徑的中間代謝物之間循環(huán)的方向相反、代謝上不可逆的反響。有時該循環(huán)通過ATP的水解導致熱能的釋放。例如,葡萄糖+ATP=葡萄糖-6-磷酸+ADP與葡萄糖-6-磷酸+H2O=葡萄糖+Pi反響組成的循環(huán)反響,其凈反響實際上是ATP+H2O=ADP+Pi。磷酸解作

48、用phosphorolysis:在分子內通過引入一個無機磷酸形成磷酸酯鍵而使原來鍵斷裂的方式。實際上引入了一個磷酰基。半乳糖血癥galactosemia:人類的一種基因型遺傳代謝缺陷,特點是由于缺乏1-磷酸半乳糖尿苷酰轉移酶導致嬰兒不能代謝奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。尾部生長tailward growth:一種聚合反響機理,經過活化的單體的頭部結到聚合物的尾部,連接到聚合物尾部的單體的尾部又成了接收下一個單體的受體。糖異生作用gluconeogenesis:由簡單的非糖前體轉變?yōu)樘堑倪^程。糖異生不是糖酵解的簡單逆轉。雖然由丙酮酸開場的糖異生利用了糖酵解中的7步近似平衡反響的逆反響,但還必須利用

49、另外4步酵解中不曾出現的酶促反響繞過酵解中的三個不可逆反響。呼吸電子傳遞鏈respiratory electron-transport chain:由一系列可作為電子載體的酶復合體和輔助因子構成,可將來自復原型輔酶或底物的電子傳遞給有氧代謝的最終電子受體分子氧O2。氧化磷酸化oxidative phosphorylation:電子從一個底物傳遞給分子氧的氧化與酶催化的由ADP和Pi生成ATP的磷酸化相偶聯(lián)的過程。化學浸透理論chemiosmotic theory:一種學說,主要論點是底物氧化期間建立的質子濃度梯度提供了驅動由ADP和Pi形成ATP的能量。解偶聯(lián)劑uncoupling agent

50、:一種使電子傳遞與ADP磷酸化之間的嚴密偶聯(lián)關系解除的化合物,例如2,4-二硝基苯酚。P/O比P/O ratio:在氧化磷酸化中,每1/2O2被復原時形成的ATP的摩爾數。電子從NADH傳遞給O2時,P/O比為3,而電子從FADH2傳遞給O2時,P/O比為2。高能化合物high energy compound:在標準條件下水解時自由能大幅度減少的化合物。一般是指水解釋放的能量能驅動ADP磷酸化合成ATP的化合物。葉綠體chloroplast:藻類和植物中含有葉綠素進展光合作用的器官。葉綠素chlorophyll:光合作用膜中的綠色色素,它是光合生物中主要的捕獲光的成分。輔助色素accessor

51、y pigments:在植物和光合細菌中象類胡蘿卜素、葉黃素和藻膽色素那樣吸收可見光的色素,這類色素是對葉綠素捕獲光能的補充。光合作用photosynthesis:綠色植物或光合細菌利用光能將CO2轉化成有機化合物的過程。光合磷酸化photophosphorylation:在葉綠體ATP合成酶催化下依賴于光的由ADP和Pi合成ATP的過程。光反響light reactions:光合色素將光能轉變成化學能并形成ATP和NADPH的過程。暗反響dark reactions:利用光反響生成的ATP和NADPH的化學能使CO2復原成糖或其它有機物的一系列酶促過程。Calvin 循環(huán)Cavin cycl

52、e:也稱之復原戊糖磷酸循環(huán)RPP cycle: reductive pentose phosphate cycle,C3途徑C3 pathway。在光合作用期間,將CO2復原轉化為糖的反響循環(huán)。是植物用于固定二氧化碳生成磷酸丙糖的循環(huán)途徑。C4途徑C4 pathway:一些植物中固定碳的途徑,其特點是通過使CO2濃縮減少光呼吸。在該途徑中,在葉肉細胞CO2被整合到C4酸中,然后C4酸在維管束鞘細胞被脫羧,釋放出的CO2被Calvin 循環(huán)利用。光呼吸photorespiration:植物依賴光攝取氧進展磷酸乙醇酸代謝的過程。光呼吸之所以發(fā)生是由于O2可以與CO2競爭核酮糖-1,5-二磷酸羧化氧

53、化酶的活性部位。β氧化途徑βoxidation pathway:是脂肪酸氧化分解的主要途徑,脂肪酸被連續(xù)地在β碳氧化降解生成乙酰CoA,同時生成NADH和FADH2,因此可產生大量的ATP。該途徑因脫氫和裂解均發(fā)生在β位碳原子而得名。每一輪脂肪酸β氧化都是由4步反響組成:氧化、水化、再氧化和硫解。肉毒堿穿梭系統(tǒng)carnitine shuttle system:脂酰CoA通過形成脂酰肉毒堿從細胞質轉運到線粒體的一個穿梭循環(huán)途徑。酮體acetone body:在肝臟中由乙酰CoA合成的燃料分子&bet

54、a;羥基丁酸、乙酰乙酸和丙酮。在饑餓期間酮體是包括腦在內的許多組織的燃料,酮體過多將導致中毒。檸檬酸轉運系統(tǒng)citrate transport system:將乙酰CoA從線粒體轉運到細胞質的穿梭循環(huán)途徑。在轉運乙酰CoA的同時,細胞質中的NADH氧化成NAD+、NADP+復原為NADPH。每循環(huán)一次消耗2分子ATP。酰基載體蛋白ACP, acyl carrier protein:通過硫酯鍵結合脂肪酸合成的中間代謝物的蛋白質原核生物或蛋白質的構造域真核生物。生物固氮作用Biological nitrogen fixation:大氣中的氮被復原為氨的過程。生物固氮只發(fā)生在少數的細菌和藻類中。尿素

55、循環(huán)urea cycle:是一個由4步酶促反響組成的可以將來自氨和天冬氨酸的氮轉化為尿素的代謝循環(huán)。該循環(huán)是發(fā)生在脊椎動物肝臟中的一個代謝循環(huán)。脫氨deamination:在酶的催化下從生物分子氨基酸或核苷酸分子中除去氨基的過程。氧化脫氨oxidative deamination:α-氨基酸在酶的催化下脫氨生成相應α-酮酸的過程。氧化脫氨過程實際上包括脫氫和水解兩個步驟。轉氨酶transaminases:也稱之氨基轉移酶aminotransferases。催化一個α-氨基酸的α-氨基向一個α-酮酸轉移的酶。轉氨transamination:一個α-氨基酸的α-氨基借助轉氨酶的催化作用轉移到一個α-酮酸的過程。乒乓反響ping-pong reaction:在該反響中,酶結合一個底物并釋放出一個產物,留下一個取代酶,然后該取代酶再結合第二個底物和釋放出第二個產物,最后酶恢復到它的起始狀態(tài)。生糖氨基酸glucogenic amino acids:那些降解能生成可作為糖異生前體分子,例如丙酮酸或檸檬酸循環(huán)中間代謝物的氨基酸。生酮氨基酸acetonegenic amino acid:那些降解可

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