1、o微生物約有10萬種，有人估計目前知的種只占地球上實踐存在的微生物總數的20%，微生物很能夠是地球上物種最多的一類。微生物資源是極其豐富的，但在人類消費和生活中僅開發利用了已發現微生物種數的1%. o1 1、土壤、土壤o2 2、水中、水中o3 3、空氣、空氣o4 4、人體、人體o5 5、消費環境、消費環境鼻咽腔鼻咽腔鼻咽腔鼻咽腔葡萄球菌、甲，丙型鏈球菌葡萄球菌、甲，丙型鏈球菌肺炎球菌、奈氏菌、類桿菌等肺炎球菌、奈氏菌、類桿菌等外耳道外耳道外耳道外耳道葡萄球菌、類白喉桿菌葡萄球菌、類白喉桿菌綠膿桿菌、非致病性分枝桿菌綠膿桿菌、非致病性分枝桿菌表皮葡萄球菌表皮葡萄球菌口腔口腔口腔口腔甲，丙型鏈球菌

2、甲，丙型鏈球菌類白喉桿菌、肺炎球菌類白喉桿菌、肺炎球菌奈氏菌、乳桿菌、梭桿菌奈氏菌、乳桿菌、梭桿菌螺旋體、放線菌、白念珠菌螺旋體、放線菌、白念珠菌腸道腸道腸道腸道大腸桿菌、產氣桿菌、變形桿菌大腸桿菌、產氣桿菌、變形桿菌綠膿桿菌、葡萄球菌、厭氧性細菌綠膿桿菌、葡萄球菌、厭氧性細菌真菌、乳桿菌，雙歧桿菌等真菌、乳桿菌，雙歧桿菌等陰道陰道陰道陰道大腸桿菌、乳桿菌大腸桿菌、乳桿菌白念珠菌、類白喉桿菌白念珠菌、類白喉桿菌非致病性分枝等非致病性分枝等皮膚皮膚皮膚皮膚葡萄球菌、綠膿桿菌、白念珠菌葡萄球菌、綠膿桿菌、白念珠菌丙酸桿菌、類白喉桿菌、丙酸桿菌、類白喉桿菌、非致病性分枝桿菌非致病性分枝桿菌人體內正常

3、菌群的分布眼結膜眼結膜眼結膜眼結膜白色葡萄球菌、干燥桿菌白色葡萄球菌、干燥桿菌尿道尿道尿道尿道白色葡萄球菌、類白喉桿菌、白色葡萄球菌、類白喉桿菌、非致病性分枝桿菌非致病性分枝桿菌人體正常菌群及其意義人體正常菌群及其意義一一 正常菌群正常菌群normal floranormal flora 正常人體的體表及與外界相通正常人體的體表及與外界相通的腔道的黏膜上存在者不同種類和的腔道的黏膜上存在者不同種類和一定數量的細菌，這些細菌通常對一定數量的細菌，這些細菌通常對人體是無害的，稱為正常菌群。人體是無害的，稱為正常菌群。o二二 正常菌群的生理作用正常菌群的生理作用o 1 1、拮抗作用：生物屏障、拮抗作

4、用：生物屏障o 改動改動pHpH：抑制外來菌：抑制外來菌 o 占位性維護作用：生物膜占位性維護作用：生物膜 o 爭奪營養爭奪營養 o 抗生素與細菌素的作用抗生素與細菌素的作用o2 2、營養作用、營養作用o 代謝：蛋白質、糖、脂肪、代謝：蛋白質、糖、脂肪、o 膽汁、膽固醇膽汁、膽固醇 o 合成：維生素合成：維生素o 乳酸桿菌乳酸桿菌o 3 3、免疫作用、免疫作用 Ag AbAg Abo o 4 4、抗癌作用、抗癌作用 激活巨噬細胞激活巨噬細胞四菌群失調及菌群失調癥四菌群失調及菌群失調癥 由于某種緣由使正常菌群的種類、數量由于某種緣由使正常菌群的種類、數量和比例發生較大幅度的改動，導致微生和比例發

5、生較大幅度的改動，導致微生態失去平衡稱為菌群失調。態失去平衡稱為菌群失調。 由于菌群失調而使宿主發生一系列臨床由于菌群失調而使宿主發生一系列臨床病癥，那么稱為菌群失調癥。病癥，那么稱為菌群失調癥。 措施：停用原來的抗生素措施：停用原來的抗生素 微生態制劑酪酸菌、雙歧桿微生態制劑酪酸菌、雙歧桿菌、乳酸菌素等菌、乳酸菌素等 微生物的分類單元和命名微生物的分類單元和命名 o分類單元分類單元o微生物的主要分類單位，依次為界微生物的主要分類單位，依次為界 (kingdom) 、門、門( phylum 或或 division)、綱、綱 (class) 、目、目 (order) 、科、科 (fami1y)

6、、屬、屬 (genus) 、種、種 (species) 。o具有完全或極多一樣特點的有機體構成同種。性質類似、具有完全或極多一樣特點的有機體構成同種。性質類似、相互有關的各種組成屬。相近似的屆合并為科。近似的科相互有關的各種組成屬。相近似的屆合并為科。近似的科合并為目。近似的目歸納為綱。綜合各綱成為門。由此構合并為目。近似的目歸納為綱。綜合各綱成為門。由此構成一個完好的分類系統。成一個完好的分類系統。o此外，每個分類單位都有亞級，即在兩個主要分類單位之此外，每個分類單位都有亞級，即在兩個主要分類單位之間，可添加間，可添加“亞門、亞門、“亞綱、亞綱、“亞目、亞目、“亞科等次要亞科等次要分類單位。

7、在種以下還可以分為亞種、變種、型、菌株等。分類單位。在種以下還可以分為亞種、變種、型、菌株等。o1.“種種(species)的概念的概念o關于微生物關于微生物“種的概念，目前看法不一。種的概念，目前看法不一。o微生物的種可以看做是：具有高度特征類似性的菌株群，微生物的種可以看做是：具有高度特征類似性的菌株群，該菌株群與其他類群的菌株有很明顯的區別。該菌株群與其他類群的菌株有很明顯的區別。 o在微生物中，一個種只能用該種內的一個典型菌株作為其在微生物中，一個種只能用該種內的一個典型菌株作為其詳細代表，此典型菌株就是該種的方式菌株詳細代表，此典型菌株就是該種的方式菌株(type strain)。o

8、2.亞種亞種 (subspecies) 的概念的概念o當某一種內的不同菌株，存在少數明顯而穩定的變異特征當某一種內的不同菌株，存在少數明顯而穩定的變異特征或遺傳性狀而又缺乏又區分成新種時，可將這些菌株細分或遺傳性狀而又缺乏又區分成新種時，可將這些菌株細分成兩個或更多的小的分類單元，即亞種。成兩個或更多的小的分類單元，即亞種。o亞種是細菌分類中具有正式分類位置的最低等級。亞種是細菌分類中具有正式分類位置的最低等級。o3.亞種以下的分類等級亞種以下的分類等級o通常表示能用某些特殊的特征加以區別的菌株類群。如型、菌株通常表示能用某些特殊的特征加以區別的菌株類群。如型、菌株等。它們的提出和運用均不受等

9、。它們的提出和運用均不受“國際命名法規的限制，同時也國際命名法規的限制，同時也不具有正式的分類位置。不具有正式的分類位置。o 型型(form)作為假設干變異型的后綴。作為假設干變異型的后綴。o如以生物變型如以生物變型 (biovar) 表示特殊的生化或生理特征；血清變型表示特殊的生化或生理特征；血清變型 (serovar 構造的不同；致病變型構造的不同；致病變型 (pathovar) 表示某些寄主的專表示某些寄主的專注致病性；噬菌變型注致病性；噬菌變型 (phagovar) 表示對噬菌體的特異性反響；表示對噬菌體的特異性反響；形狀變型形狀變型 (morphovar) 表示特殊的形狀特征等。表示

10、特殊的形狀特征等。o 菌株菌株(strain)o菌株菌株, 品系品系 (病毒中那么稱毒株或株病毒中那么稱毒株或株)，主要指同種微生物不同來，主要指同種微生物不同來源的純培育物。即同種微生物不同來源的純培育物源的純培育物。即同種微生物不同來源的純培育物(pure culture)。o純培育物純培育物 (pure culture): 由單一微生物細胞繁由單一微生物細胞繁衍產生的培育物。衍產生的培育物。o從自然界分別純化所得到的純培育的后代，經過從自然界分別純化所得到的純培育的后代，經過鑒定屬于某個種，但由于來自不同的地域、土壤鑒定屬于某個種，但由于來自不同的地域、土壤和其他生活環境，它們總會出現一

11、些細微的差別。和其他生活環境，它們總會出現一些細微的差別。這些單個分別物的純培育的后代稱為菌株。菌株這些單個分別物的純培育的后代稱為菌株。菌株常以數目、字母、人名或地名表示。得到分別純常以數目、字母、人名或地名表示。得到分別純化而未經鑒定的純培育物的后代那么稱為分別物化而未經鑒定的純培育物的后代那么稱為分別物(isolates)。微生物的命名微生物的命名o微生物的命名和其他生物一樣，都按國際命名法命名，即采用林微生物的命名和其他生物一樣，都按國際命名法命名，即采用林奈氏奈氏 (Linnaeus) 所創建的所創建的“雙名法。雙名法。o每一種微生物的學名每一種微生物的學名(scientific n

12、ame)都由前面一個屬名都由前面一個屬名(generic name)與一個種名加詞與一個種名加詞(specific epithet)兩部分組兩部分組成，書寫時排成斜體或正體加下劃線。成，書寫時排成斜體或正體加下劃線。o屬名在前，用以描畫某微生物主要特征的名詞或用作名詞的描畫屬名在前，用以描畫某微生物主要特征的名詞或用作名詞的描畫詞。字首字母要大寫，由微生物的構造、外形，或科學家名字而詞。字首字母要大寫，由微生物的構造、外形，或科學家名字而來。其詞源可來自拉丁詞、希臘詞或其他拉丁化的外來詞，或以來。其詞源可來自拉丁詞、希臘詞或其他拉丁化的外來詞，或以組合方式拼成。組合方式拼成。o種加詞在后，用以

13、描畫微生物的次要特征。均小寫，來自微生物種加詞在后，用以描畫微生物的次要特征。均小寫，來自微生物的色素、外形、來源、病名或科學家姓名等，與屬名一樣，也由的色素、外形、來源、病名或科學家姓名等，與屬名一樣，也由拉丁詞、希臘詞或拉丁化的外來詞組成。拉丁詞、希臘詞或拉丁化的外來詞組成。原核微生物伯杰氏分類系統原核微生物伯杰氏分類系統o細菌、放線菌等原核微生物的分類系統很多，目前較有代表性和細菌、放線菌等原核微生物的分類系統很多，目前較有代表性和最有影響的分類系統是美國的最有影響的分類系統是美國的 (Bergey s Manual of Determinative Bacteriology ，簡稱，簡

14、稱“手冊手冊 ) 。“手冊自手冊自 1923 年第一版以來，相繼于年第一版以來，相繼于 1925 ， 1930 ， 1934 ， 1939 ， 1948 ， 1957， 1974和和1994 年出版了第二版至第九版。年出版了第二版至第九版。o1984-1989年，出版了年，出版了 (Bergeys Manual of Systematic Bacteriology ，簡稱，簡稱“系統分類學手冊系統分類學手冊 ) 。該手冊與。該手冊與有很大不同，各級分類有很大不同，各級分類單元中廣泛采用細胞化學分析、數值分類方法和核酸技術，尤其單元中廣泛采用細胞化學分析、數值分類方法和核酸技術，尤其是是16S

15、rRNA寡核苷酸序列分析技術，以闡明細菌的親緣關系。寡核苷酸序列分析技術，以闡明細菌的親緣關系。o2000年，年，Bergeys Manual of Systematic Bacteriology 第二第二版開場分版開場分5卷陸續出版。卷陸續出版。o微生物分類鑒定的根據微生物分類鑒定的根據o根據微生物分類學中運用的技術和方法，可把它們分成四根據微生物分類學中運用的技術和方法，可把它們分成四個不同的程度：個不同的程度：o細胞形狀和行為程度；細胞組分程度；蛋白質程度；細胞形狀和行為程度；細胞組分程度；蛋白質程度；基因組程度基因組程度o在微生物分類學開展的早期，主要的分類鑒定目的是以在在微生物分類學

16、開展的早期，主要的分類鑒定目的是以在細胞形狀和習性為主，可稱為經典的分類鑒定法。細胞形狀和習性為主，可稱為經典的分類鑒定法。o經典分類鑒定方法的目的根據，參經典分類鑒定方法的目的根據，參p409表表14-3。o其他三種實驗技術主要是其他三種實驗技術主要是60年代以后采用的，稱為化學分年代以后采用的，稱為化學分類法和遺傳學分類法，這些方法再加上數值分類鑒定法，類法和遺傳學分類法，這些方法再加上數值分類鑒定法，可稱為現代的分類鑒定方法可稱為現代的分類鑒定方法o思索題：思索題：o1.名詞解釋：微生物的種、亞種、方式菌名詞解釋：微生物的種、亞種、方式菌株、菌株、純培育物。株、菌株、純培育物。o2.微生

17、物經典鑒定目的中的形狀、生理和微生物經典鑒定目的中的形狀、生理和生化反響、生態習性分別主要包括哪些內生化反響、生態習性分別主要包括哪些內容？容？o3.為何通常選用為何通常選用16S或或18S rRNA作為生作為生物系統進化和分類鑒定的目的？物系統進化和分類鑒定的目的？微生物之間的關系o四大類，即互生、共生、拮抗和寄生。 o1.互生是指兩種可以單獨生活的生物生活在一同時有利于對方。這是一種可分可合，合比分好的相互關系。例如在土壤中，當分解纖維素的細菌與好氧的自生固氮菌生活在一同時，后者可將固定的有機氮化合物供應前者需求，而纖維素分解菌也可將產生的有機酸作為后者的碳源和能源物質，從而促進各自的增殖

18、和擴展。在植物根部生長的根際微生物與高等植物之間也存在著互生關系。在人體腸道中，正常菌群可以完成多種代謝反響，對人體生長發育有重要意義，而人體的腸道那么為微生物提供了良好的生態環境。 o2.共生是指兩種生物共居在一同相互分工協作，彼此分別就不能很好地生活。地衣就是微生物間共生的典型例子，它是真菌和藍細菌或藻類的共生體。在地衣中，藻類和藍細菌進展光協作用合成有機物，作為真菌生長繁衍所需的碳源，而真菌那么起維護光合微生物的作用，在某些情況下，真菌還能向光合微生物提供生長因子和運輸無機營養。 o根瘤菌與豆科植物共生構成根瘤共生體，是微生物與植物共生的又一典型。由于彼此雙贏，所以稱為互惠共生。菌固定大

19、氣中的氮氣，為植物提供氮素養料，而豆科植物根的分泌物能刺激根瘤菌的生長，同時，還為根瘤菌提供維護和穩定的生長條件。許多真菌能在一些植物根上發育，菌絲體包圍在根面或侵入根內，構成了兩者的共生體，稱為菌根。一些植物，例如蘭科植物的種子假設無菌根菌的共生就無法發育，杜鵑科植物的幼苗假設無菌根菌的共生就不能存活。微生物與動物互惠共生的例子也很多，例如，牛、羊、鹿、駱駝等反芻動物，吃的草料為它們胃中的微生物提供了豐富的營養物質，但這些動物本身卻不能分解纖維素，食草動物瘤胃中的纖維素分解菌可以將其分解成糖，并被其它菌轉化成有機酸，最后經氧化，成為動物的主要能量來源醫學教育網搜集整理。 o3.拮抗拮抗 生物之間并非都是友好相處，也生物之間并非都是友好相處，也有矛盾和爭斗，甚至生死相拼。拮抗關系是指一有矛盾和爭斗，甚至生死相拼。拮抗關系是指一種微生物在其生命活動中，產生某種代謝產物或種微生物在其生命活動中，產生某種代謝產物或改動環境條件，從而抑制其它微生物的生長繁衍，改動環境條件，從而抑制其它微生物的生長繁衍，甚至殺死其它微生物的景象。在制造泡菜、青儲甚至殺死其它微生物