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文檔簡介
1、1. DNA的堿基組成:的堿基組成: 具有生物具有生物種的特異性種的特異性: 不同物種不同物種DNA有其獨特的堿基組成;有其獨特的堿基組成; 同一物種不同組織同一物種不同組織/器官器官/DNA堿基組成一樣,堿基組成一樣, 不受生長發育、營養狀況及環境條件的影響。不受生長發育、營養狀況及環境條件的影響。 腺嘌呤腺嘌呤胸腺嘧啶胸腺嘧啶鳥嘌呤鳥嘌呤胞嘧啶胞嘧啶3.二級結構二級結構B型雙螺旋結構型雙螺旋結構1.1.反向,平行,右手螺旋, 大溝,小溝2.2.鏈間堿基配對相連3.3.每10個堿基對上升一周4.疏水堿基位于內部5.相鄰堿基平面互相平行, 垂直于螺旋軸DNADNA,雙螺旋,正反向,雙螺旋,正反
2、向,互補鏈。互補鏈。A A對對T T,GCGC連,配對時,連,配對時,靠氫鍵,靠氫鍵, AT2,GC3,十堿基,轉一圈,螺距十堿基,轉一圈,螺距3434點中間。點中間。堿基力和氫鍵,維持螺堿基力和氫鍵,維持螺旋結構堅。旋結構堅。(AT2AT2,GC3GC3是指之間二個氫鍵是指之間二個氫鍵GCGC間三個間三個. .螺距螺距3434點中間即點中間即3.43.4) 其他類型的DNA雙螺旋z Z 型 DNA左旋、細長 答案:答案:疏水作用力疏水作用力(堿基堆積力堿基堆積力) 氫鍵氫鍵 范德華力范德華力二級結構:含短的不完全螺旋區的多核苷酸鏈;G-U G-U 配對形成的氫鍵較弱配對形成的氫鍵較弱提問:提
3、問:DNA形成形成三級結構及染色三級結構及染色體的意義何在?體的意義何在?答案:答案:壓縮分子空間壓縮分子空間人體每個體細胞人體每個體細胞DNA長長2m,細胞直細胞直徑徑0.1mm,細胞核細胞核0.05mm葉綠體中含有環狀DNA線粒體中含有環狀DNA細菌等原核生物細菌等原核生物固定固定負超螺旋負超螺旋(右手拓撲結構)(右手拓撲結構)反之,則為正超螺旋自然界通常為負超螺旋。環狀DNADNA降解:核苷酸骨架上降解:核苷酸骨架上3,5 -磷酸二酯鍵的斷裂磷酸二酯鍵的斷裂(2)變性因素)變性因素 高溫(一般高溫(一般7575) 熱變性熱變性 強酸、堿強酸、堿 酸堿變性酸堿變性 強氧化劑強氧化劑 尿素尿
4、素(PAGE中中DNA )機理:雙鏈間氫鍵斷開,成為兩條單鏈機理:雙鏈間氫鍵斷開,成為兩條單鏈(3 3)增色效應)增色效應RNA變性:從螺旋到線團之間的轉變變性:從螺旋到線團之間的轉變RNA的變性引起的性質變化沒有的變性引起的性質變化沒有DNA明顯明顯 Tm值大小與下列因素有關:值大小與下列因素有關:(1 1)DNA的均一性:的均一性:越均一越均一Tm的的范圍愈小范圍愈小(2)GC含量含量:越多越多Tm越高越高 經驗公式:經驗公式: XG+C(Tm69.3)2.44(3)介質中的離子強度:介質中的離子強度:愈高愈高Tm愈高愈高 不易用稀電解質保存不易用稀電解質保存DNA 復性時紫外吸收減少復性
5、時紫外吸收減少1 1、堿水解、堿水解 0.3 M NaOH溶液中溶液中: RNA磷酸酯鍵磷酸酯鍵被水解生成被水解生成2/3 -核苷酸核苷酸DNA則不受影響則不受影響l無無2OH不形成堿水解中間產物不形成堿水解中間產物2 2、酸水解、酸水解糖苷鍵糖苷鍵比比磷酸酯鍵磷酸酯鍵更易被酸水解;更易被酸水解;嘌呤嘌呤堿比堿比嘧啶嘧啶堿的糖苷鍵對酸更不穩定;堿的糖苷鍵對酸更不穩定;對酸最不穩定的對酸最不穩定的:嘌呤嘌呤與脫氧核糖間糖苷鍵與脫氧核糖間糖苷鍵DNA在在pH2.8、100加熱加熱1h,可除去嘌呤堿,可除去嘌呤堿形成無嘌呤酸(形成無嘌呤酸(apurinic acid,APA)3、酶水解其它:對底物二
6、級結構的專一性其它:對底物二級結構的專一性 作用于雙鏈核酸:雙鏈酶作用于雙鏈核酸:雙鏈酶 作用于單鏈:單鏈酶作用于單鏈:單鏈酶+PyPyPyPyPyPyPuPuPPPPPPPPPP2H2OPPPPPPP2H2OPP+OHOHPPPPPGAGAAAGGCUUC 牛胰核糖核酸酶(牛胰核糖核酸酶(RNase )作用:嘧啶核苷作用:嘧啶核苷3磷酸與其它核苷酸連鍵磷酸與其它核苷酸連鍵 專一性極高的內切酶專一性極高的內切酶(1)RNase3嘧啶核苷酸嘧啶核苷酸/其結尾的寡核苷酸其結尾的寡核苷酸+PyPyPyPyPyPyPuPuPPPPPPPPPP2H2OPPPPPPP2H2OPP+OHOHPPPPPGAGAAAGGCUUC 核糖核酸酶核糖核酸酶T1 (RNase T1)作用:作用:3鳥苷酸與相鄰核苷酸鳥苷酸與相鄰核苷酸5OH連鍵連鍵產物:產物:3鳥苷酸或以其為末端的寡核苷酸鳥苷酸或以其為末端的寡核苷酸核糖核酸酶核糖核酸酶T2 (RNase T2 ) 作用位點為作用位點為腺苷酸腺苷酸殘基殘基 可將可將tRNA完全降解為完全降解為3腺苷酸結尾腺苷酸結尾的寡核苷酸的寡核苷酸 DNase :牛脾脫氧核糖核酸酶:牛脾脫氧核糖核酸酶 Mg2+抑制抑制 DNA降解為降解為3磷酸磷酸為末端的寡聚核苷酸為末端的寡聚核苷酸使甲基化使甲基
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