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文檔簡介
1、西 南 農 業 大 學200 200 學年第 學期期末(中)基因組學課程試題( 1 )卷答 案考試時間考試方式學生類別人數適用專業或科類年級題號一二三四五六七八九十總 分得分簽名一、名詞解釋(每題3分,共24分)1、基因組:是指細胞中所有的DNA,包括所有的基因和基因間區域。2、擬基因:是某一基因的非功能性拷貝,通常是因為發生了突變,其生物信息變得不可解讀。3、轉化:是指受體細胞從環境中攝取供體細胞釋放的DNA片段的過程。4、核酸雜交:是指兩個互補或部分互補的核酸分子形成穩定的堿基配對雜交體的過程。5、密碼偏倚:指特定生物的基因中并非平均地使用每個堿基密碼子。6、開放閱讀框:編碼蛋白的基因中翻
2、譯成蛋白質的那部分序列。7、同源性檢索:將一段DNA或氨基酸序列提交到數據庫進行序列比對查詢,以判斷所查序列是否與已知基因的序列相同或相似。8、直向同源:指同源基因來源于不同種屬生物之間,它們的共同祖先早于種屬分化。二、選擇題(請將正確答案的代碼填入括號內,每題2分,共10分)1、C 2、A 3、D 4、B 5、A 三、判斷正誤,并改正(每題3分,共18分)1、錯誤。線粒體基因組一般為環狀DNA分子。2、錯誤。轉導是指通過細菌噬菌體將小片段DNA從供體菌轉移到受體菌的過程。3、錯誤。物理作圖方法主要包括限制酶作圖、熒光原位雜交和序列標記位點作圖。4、錯誤。表達序列標簽(EST)是通過測定cDN
3、A序列得到。5、正確。某一新基因的功能還必須以實驗證據來證明。6、正確。四、簡答題(每題6分,共36分)1、答:它們的主要區別包括:(1)原核生物基因組比真核生物基因組要小得多。(2)原核生物的基因數通常比真核生物的少。(3)原核生物基因組大部分無斷裂基因,而真核生物基因基因一般都含有內含子。(4)原核生物基因組一般無重復序列,真核生物基因組則含了大量的重復序列。2、答:傳統基因組作圖方法的包括:(1)遺傳作圖:即應用遺傳學技術構建能顯示基因以及其他序列特征在基因組上位置的圖。(2)物理作圖:既應用分子生物學技術來直接分析DNA分子,從而構建能顯示包括基因在內的、序列特征的位置圖。3、答:遺傳
4、作圖的DNA標記有:(1)限制性酶切片段長度多態性(RFLP),它是利用限制性內切酶消化不同基因組DNA,再電泳轉膜,并與標記好的目的探針雜交所形成的差異。(2)簡單序列長度多態性(SSLP):是一系列不同長度的重復序列在不同基因組間的差異,包括小衛星和微衛星。(3)單核苷酸多態性(SNP):是指基因組中存在的單個的堿基突變(點突變)。4、答:鳥槍法測序主要是指首先進行單個測序反應,再將反應中得到的短序列通過檢測重疊區從而推倒出完整的序列的方法。其優點在于能相對較快地測定小基因組的序列,并且不需要遺傳或物理圖譜;其主要缺點是從起始序列尋找重疊區域及構建序列重疊群的復雜性和數據分析的限制。5、答
5、:Northern雜交是將某一物種某一組織的RNA印跡到尼龍膜上,再與標記的目標探針雜交的方法,其主要用來檢驗某一目標序列中是否含有表達序列或分析目標基因表達的物種、時間、空間和表達量的差異。6、答:確定基因功能的實驗方法主要包括:(1)基因失活,該方法是功能分析的關鍵,一般是用一段無關的DNA將目標基因破壞,可以通過將基因的染色體拷貝與一段與靶基因有相同序列的DNA進行同源重組來達到。(2)基因過剩表達,即將目標基因克隆入一種特殊的載體,該載體能目標基因合成盡可能多的蛋白質。通過以上兩種方法處理后,再觀測生物個體的遺傳表型,從而推測目標基因的功能。五、論述題(每題12分,共12分)答:(1)
6、家蠶基因組計劃的順利完成。2003-2004年,西南農業大學和中國科學院基因組研究所,克服種種困難,以家蠶品種“大造”為材料,構建了30個家蠶基因組文庫,完成了近600萬測序反應;綜合運用數學、計算機科學、物理學和信息學,完成了家蠶全基因組數據組裝以及家蠶全基因組數據的生物信息學分析和基因鑒定工作,完成了家蠶全基因組框架圖的繪制;結合家蠶功能基因組的研究,對家蠶重要功能基因進行了具體的功能分析。研究成果發表于國際頂級科學雜志Science。(2)家蠶基因組計劃的完成是基礎科學的一大貢獻。家蠶全基因組框架圖,是全世界第一張家蠶基因組框架圖,也是第一張鱗翅目昆蟲基因組框架圖,是迄今為止我國科學家獨
7、立完成的用霰彈法測序的最大基因組。所鑒定的18510個基因以及全基因組數據庫是目前世界上最完善、功能最強大和收集信息最多的數據庫,也是鱗翅目昆蟲中影響最大的一個基因組數據庫。家蠶基因組框架圖不但是生物基因組學的一個杰出成就,也是昆蟲學的一個里程碑。(3)家蠶基因組計劃的完成是振興傳統蠶絲產業的重要基礎。家蠶全基因組測序完成之后,我們詳細研究了參與家蠶重要生物學性狀決定的功能基因,發現了家蠶絲腺特異基因、激素調節相關基因、發育調控基因、性別調節基因和體液免疫因子等。上述幾類重要功能基因的發現,將為我們闡明家蠶繭絲蛋白質合成、生長、發育調節、免疫和抗性、性別決定等重要生物性狀的分子機理奠定重要的基礎。這些研究的進一步深入,將催生一批高水平的理論研究成果和重要的高新產業技術,推動家蠶重要經濟性狀遺傳機理和改良的研究,進而解決產業重大問題和推動蠶絲產業進步,實現蠶絲產量的提高、性別的人為調節、生絲品質的改善以及蠶抗病性的提高。 (4)家蠶基因組計劃的完成將促進新興絹絲產業的建立。家蠶蛋白質合成的高效性、高等生物蛋白質的后修飾加工能力、生產的大規模低成本優勢以及對人畜安全性等,滿足了新一代生物反應器的基本要求,有巨大的開發應用潛力。家蠶基因組的完成,將促進家蠶生物反應器的研究與應用,并在生物制藥、食品開發等新型生物產業領域有所作為。(5)家蠶基因組計劃的完成是家蠶模式生物
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