EppendorfMastercyclereprealplex熒光定量儀操作指引e要點_第1頁
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文檔簡介

1、 Mastercyclereprea/p/ex 操作手冊 eppendorF 證書經授權的熱量循環儀 該儀器為經授權的熱量循環儀,儀器序列號為: 購買者需預先支付由RocheMolecularSystems公司持有的美國專利號為4683195,4683202 及4965188的專利預付金以及由F.Hoffmann-LaRoche有限公司持有的美國國外的相關專利索賠金。該儀器用于進行聚合酶鏈反應(PCR)過程全程的本質特性的研究與開發。按產量 支付的專利費用可以支付給應用生物系統,或者也可以通過購買授權試劑的方式來抵付。該 儀器作為經授權的熱量循環儀,可以使用由應用生物系統提供的應用軟件。根據配

2、合使用的 授權試劑的標簽權,該儀器與授權試劑的配合使用可以向購買者提供有限的聚合酶鏈反應執照。如果僅僅購買儀器,客戶不能夠持有聚合酶鏈反應執照,也沒有權力執行聚合酶鏈反應 過程。有關購買執行聚合酶鏈反應的執照的更多信息,請通過聯系應用生物系統執照部門經 理獲得,地址為:美國加利福尼亞州福斯特城林肯驅動中心850號,94404。 所有權力均不通過暗示,訴訟等以立即執行的方式轉移給專利品,其中不僅僅限于5項核酸 酶檢測項目以及任何試劑與用具的專利索賠。 應用生物系統對該儀器的性能不作保證。 該產品說明書版權所有,如無經2005EppendorfAG,Hamburg授權不可復制Mastercycle

3、r為注冊商標,美國注冊號為2273536,加拿大注冊號為TMA510572 Mastercycle注冊商標受到美國專利號6210958的保護 EppendorfMastercyclereprealplex目錄: 1安全預防法 2安裝 2.1 交貨包裝 2.2 儀器的安裝 2.3 功能性單元 2.3.1 Mastercyclereprealplex 2.4 啟動 2.4.1 realplex模塊與熱模塊之間的連接 2.4.2 Mastercyclereprealplex與計算機之間的連接 2.4.3 與其它部件的連接 2.4.4 realplex軟件的安裝 2.4.4.1 安裝主程序 2.4.4

4、.2 數據恢復 2.4.4.3 開始realplex軟件的運行 3.操作 管理者登陸 登陸 用戶變更 系統配置 對使用者的管理 新用戶建立 編輯用戶 刪除用戶 用戶層 循環儀 realplex模塊 系統層 特性 登陸出錯信息 用戶登陸 軟件更新 檢測項目管理 建立檢測項目 打開檢測項目 保存檢測項目 保存模板文件 模板文件的使用 復制檢測項目 檢測項目的輸出 檢測項目的輸入 建立文件夾 刪除檢測項目和文件夾 探針管理 染料管理 校準 背景校準 顏色校準 使用商業的校準工具包進行的顏色校準 客戶特有的染料的校準 數據庫管理 當前數據庫的自動保存 當前數據庫的保存 輸入數據庫 數據庫的歸檔 4編程

5、(檢測項目的建立) 7.1 建立一個新的檢測項目 7.2 建立板布局 7 染料的確定 7 參考染料的選擇 7 樣本容積輸入 7 探針類型的確定 7 背景的確定 7 樣品類型的定義 7.2 標準 7.2 陽性對照 7.2 陰性對照 7.2 未知樣品 7 復制和標準系列的自動建立 7 定量的樣品類型 7 相對定量的樣品類型 7.2 多plex分析例子 7.2 單plex分析的例子 7 熔點分析中的樣品類型 7 終點測定中的樣品類型 7 +/-檢測項目中的樣品類型 7 基因辨識中的樣品類型 7 樣品的復制與剪切 7 刪除樣品 7 幾個樣品的歸組 7 子檢測項目的測定 7 板布局的刪除 7 完整檢測項

6、目的板布局編輯 7.3 pcr程序的建立 7 用模板程序建立一個pcr程序 7 不用模板程序建立pcr程序 7 程序步的插入和編輯 7.3 溫度 7.3 循環(15步循環) 7.3 保溫 7.3 暫停 7.3 聲音 7.3 熔解曲線 7.3 終點 7 程序的復制 7 程序的刪除 7 測量點的確定 7 熱蓋設置 5操作(監測) 樣品的加載 模塊溫度控制 樣品體積 啟動檢測項目 單個樣品的選擇 單個樣品類型的選擇 循環儀狀態 當前運行檢測項目的中斷 繼續運行檢測項目 終止檢測項目 mastercyclereprealplex作為pcr的使用 mastercyclereprealplex作為熒光計的

7、使用 關閉 6分析 概要 打開檢測項目 打開在運行的檢測項目 打開子檢測項目 單一檢測項目的選擇 使樣品處于不活動狀態 樣品類型的選擇 分析模式的選擇 圖標縮放 存儲默認設置 圖表的保存和復制 樣品數據的保存和復制 編輯報告 模板報告的應用 分析的保存 調用分析 定量 閾值確定 基準線測定 標準曲線 分析 multiplex分析 相對定量 閾值的測定 多plex分析的估算 單plex分析的估算 熔解曲線分析 閾值的測定 分析 終點測量 標準曲線 分析 +/-檢測項目 將終點測定作為數據源的+/-檢測項目分析模式 閾值的測定 pcr數據作為數據源的+/-assay 閾值測定 分析 多plex分析

8、 基因測定 閾值測定 分析 7維護 3.4 清潔儀器的一般方法 3.5 熱模塊的清潔 3.6 熱模塊的驗證與校準 8故障查找 一般故障 在sybr綠色分析中發生的錯誤 qrt-pcr過程中發生的錯誤 登陸 新用戶的建立 創建一個檢測項目 檢測項目的保存 執行檢測項目 概述 板布局 pcr程序 開始檢測項目 當前運行檢測項目的中斷 繼續運行檢測項目 退出檢測項目 分析 10技術數據1安全預防法 在使用Mastercyclereprealplex之前,請仔細閱讀該操作手冊。Mastercyclereprealplex僅可 用于實驗室內,并需由有資格的專家執行實時的聚合酶鏈反應和相關研究工作。 注意

9、:如果由于使用者沒有遵循廠商提供的操作手冊使用該儀器,那么導致的任何儀器壞損 的擔保索賠和責任都為無效。 儀器使用者必須無條件的接受如下使用說明: 該儀器用于實驗室內工作,必須保證時刻有人在旁邊觀察。為避免由冷凝引起的損壞, 在安裝后,儀器應該僅打開12個小時。當儀器被挪動位置時,同樣遵循這個規定。 一電源電壓必須與儀器標識牌上的電壓數值相匹配。儀器必須有接地線接地。在作儀器的 維護和清潔時,必須關上儀器開關并且切斷電源,等待模塊冷卻下來才可進行。在啟動儀器 前,必須檢查一下接線的正確性。 Mastercyclereprealplex必須被立放在一個穩固的工作臺面上,必須提供足夠大的空間以 保

10、證儀器前后端通風槽的通暢和保證冷空氣在儀器的下方流通。儀器后端通風槽離墻面的距 離至少為10厘米。確定通風槽處于易裝卸狀態,并且其進出口的通風不會發生堵塞。儀器下不應放置紙張等物品堵塞通風。 不應有物體放置在加熱蓋上。 一在清理加熱蓋時,帶有尖棱角的一些元件就被暴露在外面。所以在清理加熱蓋時,請注 意保護那些帶有尖棱角的卷筒形電線和導軌。 一開關加熱蓋時或把加熱蓋放在清潔位置時,不要把手指插入蓋子和機柜之間。打開加熱蓋時,不要碰蓋子下面的地方。 一樣品物質不可以直接裝入加熱模塊。 一當使用不經推薦的樣品試管時,將有可能導致模塊和加熱蓋的壞損。同時樣品試管也會 被弄破以至于造成樣品物質的外泄。所

11、以在使用具有傳染性的樣品物質時,這一點一定要引 起注意。 確保聚合酶鏈反應板被正確放置在模塊上,否則將會導致模塊和加熱蓋的壞損以及樣品 物質外泄。 如果試管在模塊中加熱的時候不使用加熱蓋,試管可能因為溫度太高而產生破裂,最后 將導致樣品物質的外泄。 加熱模塊,加熱蓋的內部及微測試管/聚合酶鏈反應板能迅速達到50攝氏度的高溫。小心不 要被灼傷。 直到加熱蓋溫度降為30攝氏度或者更低時,才可以打開加熱蓋。不要使用耐溫性(120攝 氏度)不夠的材料(試管、聚合酶鏈反應板、罩、箔片和墊子等)。加熱模塊上有如下標記: Caution:HotSurface El 提出了對加熱模塊和加熱蓋中潛在溫度的提醒

12、指明操作將導致右邊溫度高于左邊溫度。 一帶有爆炸、易燃、易揮發性質的物質禁止在Mastercyclereprealplex中進行加熱。儀器禁止在有潛在爆炸性危險的房間內使用,以防止產生爆炸。 一當使用致病物質、放射性物質和其它對人體健康有危害的物質工作時,必須遵守相關的 安全手則。 確保儀器內不進水。 一儀器的維修必須由經過EppendorfAG授權的專家來操作。該項授權僅可通過參加一個持證培訓課程獲得。 一轉交 如果儀器發生轉交時,必須附上本操作手冊。 處理 當儀器要被處理掉時,必須遵循相關的法律規定。 電器的清除請遵循歐共體基于 EUEU 指令 2002/96/EC2002/96/EC 的

13、對廢電子電氣裝置(WEEEWEEE)的國際規定 根據這些規定,在商業對商業領域內,0505 年 8 8 月 1313 號以后供應的設備將不再被歸類為城市或家庭 廢物,并有如下標記: 關于處理的規定可能存在國家與國家之間的不同,所以如果有需要請聯系你的供應商解決。2安裝 交貨包裝 交貨包裝中包含以下各個部分: 臺Mastercyclereprealplex的主體裝置 一個主電源電纜 一個PC控制器局域網絡總線電纜 一個控制器局域網絡總線電纜 一個USB控制器局域網絡適配器 一個3.0毫米帶把手的六角扳手 一個內裝有安裝使用手冊和軟件的CD 一個英文的安裝使用手冊(印刷本) 一對96tecPCR板

14、,全裙邊/半裙邊 一袋封口條,8根 一個熱封的薄膜,封裝(5X) 一份產品合格證明 儀器的安裝 為避免由于冷凝給儀器帶來的損害,安裝后,儀器僅可運行12個小時。當儀器被挪動位置 后,同樣要遵守該規定。 儀器必須被嚴格立式放置在穩固的工作臺面上。 確保儀器放置的位置遠離會產生震動的其他儀器(比如離心分離機等) 為保證儀器前后通風槽的通暢,以及儀器下端和空氣的接觸,放置時要留有足夠大的空間。 儀器的后通風槽與墻壁之間的距離應大于10厘米。 空間要求:寬度:26厘米 進深度:41厘米 高度:39.6厘米 電源設備:一個提供給熱模塊的安全插座。 Realplex模塊由熱模塊的主連線供電。 安裝時要確保

15、通風槽的拆卸空間,確保入口與出口的通風順暢。 為保證通風順暢,禁止在儀器下放置紙張或者其他物品。 電源電壓大小必須與儀器標識牌上的數據相符。 儀器必須帶有接地線。 儀器和供電電源的放置必須可以保證快速的切斷電源。 包裝儀器的紙箱應妥善保存以備日后儀器維修時的安全運輸。 注意:儀器運輸與貯存溫度不得超過50攝氏度。 儀器放置應避免直接日曬。 功能性單元 Mastercyclereprealplex 圖1:關閉的realplex模塊前面觀 realplex模塊 2狀態顯示 3密封壓板(鎖住狀態) 4控制面板的掛鉤(Mastercyclereprealplex不需要) 5熱模塊 圖2:打開的real

16、plex模塊前面觀 1密封壓板(開啟狀態) realplex模塊 3熱模塊 放入試驗樣本后,向前拉動realplex模塊,覆蓋住插入的試管。然后用壓板密封,程序開始 啟動。注意在把密封壓板歸位時小心不要弄傷手指。 當realplex模塊開啟時,不要觸碰蓋子下端以防被灼傷。Figure SeaJ re砒 Ther 圖4:realplex接線板 RS232:串行接口 Address:旋轉開關地址 圖三:后面觀 realplex模塊 realplex模塊的接線板(見圖4) 3熱模塊 4通風槽 5供電電源開關,0為關斷,1為接通 6供電電源插座 7熱模塊的接線板 3控制器局域網絡出口 4控制器局域網絡

17、人口5端部阻抗 次=亦紅園日 IIIlL 1 123456 圖5熱模塊接線板 Printer:并行接口 RS232:串行接口 controlpanel:控制面板的接線口(Mastercyclereprealplex不需要) 4控制器局域網絡(CAN)出口 5控制器局域網絡人口 6終端阻抗 7Address:旋轉開關地址。 注意:只有遵循EN/IEC60950和UL60950A標準的儀器才能與此串并行接口相連。 2.4開始安裝 2.4.1realplex模塊與熱模塊之間的連接 CAN_out CANout接口 CANin 將控制器局域網絡總線連接電纜的自由端接入 realplex模塊的CAN_i

18、n接口 Term ON將位于realplex模塊后部的開關項設定為開的位置, 將熱模塊的開關項設定為關的位 置 Address 將位于realplex模塊后部的旋轉開關地址設定為 都指向1的位置;將熱模塊后部的旋轉開關地址設定為02, 的位置,右邊旋轉開關上箭頭的指向2的位置。 注意:啟動前準確設定旋轉開關地址,可以使得儀器啟動后, 來。 11,即兩個旋轉開關上的箭頭即左邊旋轉開關上的箭頭指向 地址被軟件自動檢測并顯示出 2.4.2Mastercyclereprealplex與計算機之間的連接 Printer R62U CortrolPmaiGANPmaiGANmitCANhTrmAMCANh

19、TrmAMP P* 計算機硬件要求: AMDAthlon/IntelPentiumlll1.0GHz處理器,最低512MB內存 4GB硬板存儲空間(其中大約1GB用于軟件和數據存儲) USB1.0/1.1,或者USB2.0連接器 集成或者外帶的可寫CD-ROM存儲器 控制器局域網絡USB適配器,固件4.2(標準配件) 對計算機操作系統的要求: WindowsXP家庭版本或者更高版本 可選擇的網絡連接環境: 可以實現連接別的工作站計算機的網卡或者安裝TCP/IP網絡 CANjn 包各接 CAN_in 將計算機的控制器局域網絡總線的自由端接入USBCAN適配器 將USBCAN適配器接入方t算機的U

20、SB接口。 啟動儀器前,檢查供電電源,檢查供電電壓值是否與熱模塊左端標識牌上給出的數值相符。 將供電電源插入熱模塊,打開電源開關(見圖3,熱模塊后部圖)。Realplex模塊的供電通過 與熱模塊的連接實現。 當使用者啟動儀器以后,打開realplex軟件,已連接的Mastercyclereprealplex會由軟件自動 檢測出來并且顯示其當前狀態。 計算機不得在Mastercyclereprealplex運行過程中切斷與其之間的連接。 與其它零件的連接 注意:只有遵循EN/IEC60950和UL60950A標準的儀器可以接入接口 realplex軟件的安裝 安裝主程序 Figure7:Mast

21、ercyclerepreconnectingcables CANbuscableCANbuscable PCCANbuscable USBCANadapterUSBCANadapter Computer 圖7:帶有連接電纜的Mastercyclereprealplex 首先關閉計算機正在運行的各項程序,將USBCAN適配器插入USB接口。等待幾秒鐘后, 屏幕上將出現硬件安裝向導。 WfdcomutotheFoundNPW HardwareWizard 注意:在安裝結束前,不要移去USBCAN適配器! 現在請插入realplex光板,打開光板目錄下的setup.exe文件(如果計算機的自動運行功

22、能處 于激活狀態時,安裝將被自動運行)。然后軟件會提示關于安裝的各個選項: 點擊next,屏幕上會彈出幾個窗口, 接著點擊啟動計算機。 |Next Larcel next接受默認的設置。當安裝結束后,重新 從那里您可以打開剛剛安裝過的軟件。此 Thiiwizardhelpsjouinstallsoftwarefm: JSDJSDDeviceDevice :*)IfyourhardwarecamewithaninslallalionCDyourhardwarecamewithaninslallalionCD.心Aoirfloppydik.incortitnow.oirfloppydik.inco

23、rtitnow. WhatWhatdeyouwmntdeyouwmntthth白wizardtods?wizardtods? 6 6InalalHhcsoftwofcInalalHhcsoftwofcnJutndis的(A(Accomnicndcd)ccomnicndcd) InstilInstil; ;rnmrnmali$t*rsnerihesneriheInralinnlArlyanInralinnlArlyan史已日 CickNexttocontinue. 現在您會發現在計算機啟動組里有一組新的程序,外,軟件會自動在計算機桌面上生成一個圖標。 數據恢復 如果realplex軟件是安裝后的

24、第一次運行,那么軟件會識別出數據當前是不存在的,然后自 動打開數據工具欄(DatabaseTool)。您可以接受恢復數據(restoredatabase)表中給出的默認設定, 然后按開始恢復(startrestore)按鈕。恢復過程結束后,可以按右上端的startrealplex按鈕打開軟件。 如果realplex軟件以前被安裝過,那么數據的恢復操作是不需要進行的,原因是前次安裝的已存在數據可以繼續被使用。 開始realplex軟件的運行 打開mastercyclereprealplex的開關,等待位于開關上部的LED燈將變為綠色。現在您可以 開始運行realplex軟件了。 您也可以在mas

25、tercyclereprealplex處于關斷狀態下運行realplex軟件,甚至在不接任何硬件的狀態下運行該軟件。第二種情況下,軟件將會提示一條錯誤信息,可以忽略該信息繼續運行軟件。 注意:當使用realplex軟件時,不要運行其它會占用計算機大部分內存的軟件(如:CD創建器或者媒體播放器等)!決不可以使計算機工作在電池供電模式!調整計算機供電電源的設定值以保證在程序運行過 程中,計算機不會進入待機狀態。3.操作 管理者登陸 當realplex軟件第一次被打開時,將會顯示如圖3.2所示的一個登陸對話框,提示軟件管理 者為Eppendorf命名并輸入登陸密碼。這項是儀器的出廠設置,如有需要用戶

26、可以在User Administrator對話框中對此項進行修改(詳細情況請查閱3.4.2節)。此后軟件再次被打開時, 無論軟件管理者還是其他的軟件使用者,都必須建立一個用戶才能登陸使用realplex軟件。 登陸 在打開程序時,Mastercyclereprealplex用戶都必須先登陸才能進一步使用軟件。 所有用戶名都列在選取框中。我們要做的就是選出自己的用戶名并輸入相應密碼。 新用戶由軟件管理者建立。(請參閱3.4.1.1節) 如果登陸密碼輸入錯誤,則會顯示登陸失敗(loginfailed)。點擊OK鍵確認后,重新進入登陸程序。 如果點擊Cancel鍵,則顯示主屏幕(情參閱3.3節)。但

27、是此時所有的功能鍵都會處于無效 狀態。為進入工作狀態,使用者必須再次打開登陸對話框(情參閱3.2節)完成登陸手續。 注意:登陸以后,用戶可以對自己的文件夾和分析程序進行讀或者寫的操作,與Mastercycler eprealplex儀器連接后可以執行其他的實驗操作。而對軟件其他用戶的文件夾和分析程序只有讀的權限。如果想要執行或編輯其他用戶的分析程序的話,可以將其復制到自己的文件夾 中。 用戶變更當已有其他使用者登陸時,可以按照以下方法登陸系統: 通過點擊該圖標以退出登陸。 如果選擇登陸圖標,Userlogin對話框將被彈出,使用者可以按照 步驟進行登陸。 以上兩種功能也可以通過File菜單來實

28、現。 軟件在同一時刻僅允許一名用戶登陸,新用戶的登陸將自動使原來的使用者退出系統。 登陸后,主屏幕顯示為Administror或者User。主屏幕包括向導區,工作區和狀態區。如果在左邊的向導欄內選定某一程序函數時,該程序函數則會顯示在工作區內,而狀態欄中將顯 示熱模塊的狀態信息和當前使用者的用戶信息。3.2節中描述的登陸 CurrentUser:Beate 當前登陸用戶將被顯示在屏幕下方的狀態欄內O 1菜單欄 2工具欄 3向導區 4工作區 5狀態欄 、 通過選項show/hidenavigator,向導區可以被顯本或者隱臧。這一操作也可以通過setup 菜單實現。 注意:所有的對程序各個功能的

29、操作以及對系統配置的操作,都可以通過工具欄或者菜單欄 實現。選擇性的操作還可以通過點擊鼠標右鍵來實現。 系統配置 在setup菜單中選擇systemconfiguration項,貝U在菜單欄中顯示realplexsystemconfiguration 對話框。其中對話框左邊列出了所有的使用者名單以及處于連接狀態的模塊名單,此外還有 系統設置及其功能的結點選項。在向導欄內不同的層次顯示為不同的符號。當用光標選中某 個結點時,從屬文件夾將變為可見的,再選一次則可關閉該結點。如果某層或其從屬文件夾被選中,將在對話框的右邊顯示出相應的窗口內容。陀GiplciHESystemcofiliciurbon

30、-9 A占ndigy -fg恒 jCanada Eppandc廣 . .J JKOHKOH :0KuniscJi p-sijiIng -f用電rw)同kin J鼻中回 _ J口g加。NodJo S臀忸Fi dCIH 向IHlIIN-3H ilr 對使用者的管理 當選中User項,UserAdministration圖表顯示在對話框右邊,列出所有的用戶名單。軟件管理者登陸系統以后,可以使用該對話框進行建立新用戶,編輯和刪除已建立的用戶的操作。 LUlTSfltU5ST:匕即電必什 此功能只對已經登陸的軟件管理者開放。對于沒有軟件管理者權限的普通使用者來說,這些 功能鍵都是無效的。 新用戶建立 新

31、用戶的建立必須由登陸以后的軟件管理者來進行操作。具體建立方法為打開位于setup菜 單下的realplexsystemconfiguration對話框。 當選中User項,UserAdministration圖表顯示在對話框右邊。點擊功能鍵new,可以打開new user對話框。 在對話框的相應欄目中輸入新用戶的用戶名和密碼。 用戶的權限可以在用戶組中選擇,其中有兩個預設好的用戶組: administrator:有權操作所有程序和實行管理的各項功能。 Standarduser:有權操作所有程序 另外還可以在comment一欄中輸入一些對用戶的說明。確定以后,窗口關閉,同時一個新 建用戶名將在u

32、ser下的realplexsystemconfiguration對話框中顯示出來。其顏色則指明該用 戶所屬的用戶組:管理者顏色為紅色,一般用戶的顏色則為綠色。 兩組用戶組各自享有固定的權限,并且不能更改。 注意:如果用戶忘記了自己的登陸密碼,那么管理者可以登陸系統重新分配一個密碼給該用 戶(請參閱3.4.1.2節)。管理者看不到各個用戶的密碼。 編輯用戶 在realplexsystemconfiguration對話框中,所有已建立的用戶的資料信息都可以由管理者進 行編輯。具體方法為首先在useradministration窗口內選中某用戶,點擊edit功能鍵后,一 個edituser對話框就被

33、打開了。編輯完用戶信息以后,點擊ok鍵確認即可。 刪除用戶 只有管理者用戶才有權刪除用戶。首先必須如3.1節中描述的那樣登陸系統,打開realplex systemconfiguration對話框。在窗口useradministration中選中一個用戶,點擊delete功能鍵 刪除該用戶。 用戶層 當在realplexsystemconfiguration對話框中選中某一用戶時,該用戶的具體信息就被顯示在 對話框的右側窗口內。除了顯示其用戶名以及所屬用戶組以外,圖表中還包括由此用戶建立 的文件夾和程序的數量。該用戶最后操作的時間也有顯示。用戶登陸后可以在此窗口內修改用戶說明和密碼。 改變密碼

34、首先需要在password欄中輸入新密碼,然后在confirmation欄中再次輸入密碼以確認。接下來點擊ok功能鍵確認修改操作,最后通過點擊close鍵關閉對話框。軟件管理者看不到各用戶的密碼。 循環儀 在cycler結點處,可以得到已連接的循環儀的信息。 設備特性被列在properties圖表下。此外相應硬件的資料以及最后登陸的用戶名,還有最后運行的程序都會在此欄下顯示出來。 在incubate和lid圖表下,可以調整熱模塊和加熱蓋的溫度值。具體做法為首先在new temperature一欄中填入所需的溫度值,然后選擇incubate復選框以確認。如停止調溫,則釋 放incubate復選框

35、。 PCR程序文檔信息在protocol圖表下顯示。rcoIpJcn5mtemcarfigurDtioorcoIpJcn5mtemcarfigurDtioo user:Epperdorf 首先給出了啟動PCR程序的登陸用戶的信息以及該PCR程序的程序名和啟動時間。接下來 是相關的程序特性信息和熱蓋設置。除此之外,程序的運行各步驟也會在此顯示出來。 如果選中這個功能鍵,則原始記錄將被作為txt文件保存。 J如果選中這個功能鍵,則原始記錄將被與計算機相連的打印機打印出來。 在Cycler結點處雙擊鼠標,System結點就會顯示出來,其中包含有模塊的特性信息。. LppzrTOori -熱Utert

36、 (AntesBette 。Cflnidfl *EM切如 Jason 0 0Kuneci* .u整 -息覷 3 -rcdMfYnd“i- -邸士慰cm User:Aniet P-cgranGapdhRPCfiW*i SictjsIdk rreW期網2心fi 江田 Pogrom:GapfRIFCR以1 Caniri&it:Lh=i La時電十0ZMaj2UU5zl:J5i5U Ldu呷二106匚 ESPedlidON 5ixHeftM3(lowblxkternoat/s:ON MEt匕叼c 0Gradnt5 iIul.:l?LiJPotooal| CYCLERHUNPHJ1LJUUL LOGOm

37、I H HEHEH J RKI1dred5b即6Piiril IjurrigrtusarsEppendorf 特性:properties欄中顯示出模塊的型號以及熱模塊的序列號,同時熱模塊被最后驗定和校定的信息也會顯示出來。 Sensors:顯示當前傳感器的溫度值。 溫度驗定:通過溫度傳感器對儀器的溫度值進行測量,屬于儀器溫度驗定系統的一部分(請 詳見命令信息)。該過程在溫度驗定系統的操作手冊中有具體描述。 溫度校定:借助于溫度傳感器,對儀器的溫度值進行的調整操作。其性能在溫度驗定系統的 操作手冊中有具體描述。 閂bE口口cndc廣 4 4卷User?User? g gAndreiAndrei

38、BsleCsnsda Epprndnrf Jason .KunKun阮h h 5 5v vOngOng R/R/E E+Alton m 鼠號 &MIMI I 用 Mi i/ /加xMudLilxMudLil膽 王理司 式臼丁 Pi0口0加節|Ssnars|7einp.Vsliddoi|印叩Cdt)rbi| mioidkepgtErJpril5 寫帆里No,3474 Ir*rtTHipCdMjiditHBri Lwtleimp.V*Mj斌KMKM ApfX27/200410:39ApfX27/200410:39 J03D realplex模塊 在realplexmodule結點下將顯示realp

39、lex模塊的特定的系統信息。 rcalpbercalpbeKSystemconfigiralienSystemconfigiralien 命Useii An OD 除了顯示mastercyclereprealplex儀器的版本信息和軟件的版本信息以外,其他裝配件的序 列號也會在此顯示出來。同時還有濾波器設備資料和光電倍增器所選電壓值。Realplex module還會指明設置realplex模塊的CAN總線地址以及熱模塊和realplex模塊之間是否是 通過CAN總線電纜相連的。Coverstate一欄中顯示出加熱蓋的當前位置。 在realplexmodule結點處雙擊鼠標左鍵打開下層各結點。

40、Modulelog文件目錄下記錄了程序 運行中出現的所有出錯信息。這一圖表中的出錯信息可以通過選中save功能鍵以txt格式保 存下來,或者選中print功能鍵通過已連接的打印機打印出來。盯;匕milM。 ntrnclri * *i*i ,J右專制+葡1 1 tkigkig service *jtandartil SW-l&er 4 4區二里里 土WEBUHUB lalN*rEmpletn。工1 1B BMnclM工LEDwwidlNiManhndSaidNaPHIA-npfilerSentkiPHI1SarjIHiPM72 -ntwaft-iionNf. 二號哈丁情廿Omi泥忖n dionn

41、dA Tl-arpn?B izclpr?izclpr?4 00098 G3D2_805OttiK &3D2_e02O 7DB ADr2j3船工確 213 Apf/13;iK51Qi5 tkLUtkLUnrnri i ttUriTi Ft5nnr ,io na Zu(r?m*ITA:8配4Cnn.A二LTLT白nl鼻ITUcIE E. .C+nB 63 Qr Cancel 系統層 system結點給出當前軟件版本的信息,其中還包括了用戶登陸以及登陸出錯等信息,以監視 用戶的操作和任何操作失誤。 rp-fllfilrxSydtrimrnnrigurhnrii Fl已Eppri1?r不想U ts *

42、網1 1十串工 iFppprrlnff .riiun Kjnsch O1Q R-i-1-,址r +1昊匚沖 Llo c PiopehK|Ericruos|UMfLcg| LjfclerMladuleOnlin= RalPleuMnriulpOdi歸 StatLUILUIIde Currentw白:EDperd rf通過showsysteminfo圖標,可以打開可選的realplexsysteminfo對話框。 特性 在此處可以看到熱模塊和realplex模塊的狀態。 登陸出錯信息 登陸出錯信息中列出所有的出錯信息。該信息可以選中鍵打印。 用戶登陸 userlog中記錄了對mastercycle

43、reprealplex進行的所有操作。系統記錄了所有的登陸和退出 登陸的操作,記錄了所有有關用戶的資料,所有程序的開啟,暫停和退出的操作。Userlog 可以選中save功能鍵保存或者選中print功能鍵打印。 軟件更新 雙擊系統(system)結點后,顯示出其包含的兩個結點。點擊其中一個結點后,軟件將在右邊的工作區內運行更新程序。 save功能鍵保存或者選中print功能 LoadfirmwarefiIe Lookin:|bn 國:yderDin Filename:cyclerbin File:of即8:Firmwarefiles(cyclerbin 選中軟件的版本后,將在設定的源路徑(so

44、urcepath)中下載更新。選中start功能鍵后,軟 件開始運行更新程序。 檢測項目管理 在工具欄中可以實現以下的檢測項目的管理功能: 0eCJ厚怕耳 23456 1新檢測項目 2打開檢測項目 3保存檢測項目 4打印報告 5將文件輸入當前的選中部分 6將當前的選中部分輸出 注意:以上提及的各個功能還可以通過file菜單,或者把鼠標放在向導欄中點擊右鍵來實現。 建立檢測項目 當選中newassay圖標時,將出現一個仝白的板塊,標準的pcr程序將在工作區內被裝 載。 打開檢測項目 當選中openassay圖標以后,將彈出檢測項目對話框:00 TC-ncel| 如果一個用戶或者文件夾處于選中狀態

45、時。除了文本名、建立時間和更新時間會在assays 面板上顯示出來以外,所有保存其中的檢測項目也都會在右邊顯示出來。而且還會提示出各 文本的狀態。 目標有setup的文本代表從沒被打開過。打開文本時,文本將被裝載在assaysetup和analysis 中,而且在analysis中沒有數據資料。 目標有template的文本可以作為建立新文本的模板文本使用。更多相關信息請詳見3.5.4 和3.5.5節的關于模板文本的建立日期和使用的介紹。 且標有complete的文本代表數據獲得已經發生過的文本。 如果這樣的文本被打開, 數據將會顯示在analysis下。并且除非有其它文本當前正在被運行的情況

46、下,該文本才會顯示在 assaysetup中。詳見6.1.1.1節中的介紹。 當某個文本被選中,該文本中保存的所有分析數據都將被顯示在下方的據建立和執行這些分析的用戶名都會被在這里列出來。 因為斷電或者系統發生錯誤等原因造成失敗的文本都帶有這個發生失敗前獲得了足夠多的數據,那么該文本還是可以被拿來分析的。 保存檢測項目 檢測項目可以由登陸用戶在他的結點下或者文件夾中執行保存操作。只有登陸用戶才能執行 對這些程序文件的編輯操作。而其他使用者只能對這些文件執行讀或者復制的操作。 當saveassay的圖標被選中后,當前的檢測項目被執行保存操作。 analysis窗口中。數 aborted的標志。如

47、果在 當要把一個檢測項目保存在某目標文件夾下時,可以選中file菜單下的saveas功能鍵,打 開相關對話框來實現。 realplexMastercycler 輸入檢測項目名后,文本通過復選框assaytype被選中,點擊ok以確認。 保存模板文件 當一個檢測項目要在被創建以后多次重復使用時,該文件將被保存為模板文件。具體方法為 在保存文件的過程時,復選框中選擇template欄。 模板文件的使用 當創建簡單的新檢測項目時可以用到模板文件。具體方法:模板文件在assaysetup通過功能 鍵openassay中被裝載,以檢測項目的形式,命名后保存在用戶結點下。 復制檢測項目 用戶可以復制其它用

48、戶的文本到自己的文件夾,對這些文本與模板進行啟動和編輯。具體方 法為:在assay對話框中使用openassay選中和打開其他用戶文件夾下相關的檢測項目,然后通過saveas將文本復制到自己的結點下(請查閱3.5.3節)。 這時用戶就可以在連接mastercyclereprealplex以后,直接啟動和執行復制的檢測項目了。 檢測項目的輸出 檢測項目的輸入輸出功能用于幾個工作站之間的文本交換。在此檢測項目與板布局、PCR 程序和被測數據一同被輸入輸出。 槍圖標exportassaytofile用來以ASY格式保存當前的檢測項目到另一個工作站上的計算 在窗口的靠上一欄中選出檢測項目的保存位置,然

49、后輸入文本的名字,并在filetype一欄中選擇realplexexchange(*.asp)。 檢測項目的輸入 當選中圖標importassayfromfile時,一個格式為ASY的檢測項目就會被裝載到一個空白的文本中。 機上以便對文本做更多的處理。 當輸入一個檢測項目時,必須在窗口的靠上一欄內選中一個相關的保存位置,文件類型為realplexexchange(*.asp)。 立文件夾 登陸用戶可以在本人用戶結點下建立文件夾,相關的文件和文本都在這個文件夾中保存,以 方便日后的調用。根據如下的步驟建立文件夾: 通過圖標openassay打開檢測項目的對話框。 選中本人用戶結點后,通過功能鍵n

50、ew來添加一個新的文件夾。 Rename 可以首先通過選中文件夾,然后再點擊功能鍵 rename來重新命名。 刪除該檢測項目或者文件夾。 染料管理 選中dyes圖標后,將會彈出相應對話框。 這個對話框用于實現對染料的管理。在熒光測量中,染料是必須被適當設定的。相應染料的最大發射波長對于用戶選擇適當濾光片(如FAM520nm與一號濾光片520+/-5nm)濾光片是非常重要的。請向各自的生產商咨詢所需染料的最大放射量。 注意:在執行顏色校準(請查閱3.8.2節)前,必須先定義相應的染料。3.5.10刪除檢測項目和文件夾 通過圖標openassay,用戶可以在檢測項目對話框中,點擊功能鍵項目,最后點

51、ok確認刪除操作。同樣的刪除操作可以用來刪除文件夾。 delete來刪除選中的檢測 Delete 選中一個檢測項目或者文件夾后,可以通過點擊功能鍵 delete,和確認yes來 染料名稱 染料最大的發射波長,單位為納米(nm) 染料檢測通道。基于特定的染料波長有程序預先自動設定。 具體染料校準時的光電倍增器的敏感度。包含有四位數碼,用來為四個濾光片中的每一個設定相應數值(1代表低敏感度,9代表高敏感度)。該數碼由軟件預先設置。 Calibratedby最后一次執行染料校準的用戶 在點擊此鍵以后所顯示的對話框中,新染料的所有數據都可以在這里輸入進 Wavdength Channel Sensit

52、ivity Calibrationdate 最后一次校準時間。 NewDye Name 這個對話框用來輸入新染料的名稱和檢測新染料的濾光片。 來。 濾光片必須與新染料的發射波長相匹配。 注意:如果染料的濾光片發生改變的話,將會失去染料的校準資料。 探針管理 探針管理允許系統在檢測項目板布局完成后在選擇探針類型。這個功能僅僅用于文檔編制, 對pcr程序則沒有什么影響。為獲得數據而需要的測量點是在建立pcr程序時確定下來的。 (請查閱4.3.6節) 洋當圖標probes被選中后,會彈出相應的對話框。 OK|Cancel| Edit/Viewg 當前染料的所有數據都可以在點擊此鍵以后顯示的對話框中修

53、改。 按ok以確 認。 Delete| 點擊此鍵后,選擇 yes確認刪除的染料。 New 探針型在顯示的對話框中被命名,點擊 ok以確認命名。 在這個對話框下,任何用戶都可以在磁板布局時,實現對探針的管理。 Edrt 當前探針的名字可以在顯示的對話框中修改,點擊 ok以確認。 Delete 點擊yes以確認探針型的刪除操作。 校準 在使用mastercyclereprealplex做熒光試驗時,需要事先進行背景和顏色校準。校準應和隨后的試驗處于相同的溫度下。 注意:為保證密封蓋上沒有液體,溶液內沒有空氣泡,校準前應首先對校準板進行離心操作。 一定要確保沒有液體蒸發,否則使用新的校準板。在校準前

54、,要保證儀器已經啟動了至少 15分鐘。 注意:軟件會自動確定每個染料和濾光片所需的光電倍增器敏感度。所以用戶無需有任何輸 入。背景校準必須要在顏色校準之前執行。 背景校準 選中菜單欄setup后,就會彈出backgroundcalibration對話框,列出所有保存的背景校準。 該列表還列出了校準時間和執行校準的用戶名。除此之外還顯示了背景校準的狀態。 作為默認設置的背景校準,帶有十字標記。 SensrtivNv光電倍增器的敏感度在染料校準過程中以四位數碼的形式被確定下來。四個 Calibratedby執行背景校準的用戶一個新的背景校準過程會在點擊該欄后出現的對話框中進行。使用的板名稱 濾光片

55、中, 每個濾光片都對應確定一個數碼 (碼由軟件預先設定。 1代表低敏感度,9代表高敏感度)。這四個數 Calibrationdate 執行背景校準的日期 New Plate 一對話框new被打開后,輸入背景板的名稱。 一在右邊的對話框的incubation欄中,輸入模塊和蓋子的溫度值。模塊溫度的缺省值為60 攝氏度,蓋子溫度的缺省值為105攝氏度。 插入背景板以后,單擊功能鍵calibrate開始執行校準,單擊ok鍵確認操作。 一在加熱和第一次讀值完成后,軟件會提示翻轉背景板,請按照軟件的提示操作,翻轉背景板,單擊ok確認操作。 如果背景校準成功完成的話,背景板會顯示出96個綠色位置的板布局。

56、單擊 關閉“校準成功完成”提示框。 ok確認以 如果背景板在校準過程中的某些位置校準失敗時,單擊cancel來放棄校準數據。在這種情況 下,前次的校準數據將被用來使用。選中proceed鍵時,背景校準數據在任何情況下都會被13gd口匕Matirajsuad 在顯示的對話框內,可以改變當前背景校準的所有的數據,然后校準過程被重復進行。前次的背景校準的數據將被覆蓋。 當選中功能鍵default時, 對于所有的檢測項目來說, 校準都為默認設置。 此時在背景校準列表中,將顯示一個十字標志。 加卜忸點擊yes來確認對背景校準的刪除。 背景校準失敗的另一個原因可能是熱模塊內一些容器內的熒光污染造成的。熱模

57、塊的清潔請 詳見7.2節。 3.8.2顏色校準 在顏色校準過程中,要調整96個光路的不同的敏感度等級。 除此之外,顏色校準是基于多種染料檢測,進行多個檢測項目運行的前提條件。通常來講, 這些熒光染料的發射波波長很寬,以至于其發射的光波可以被多個濾光片檢測到。當進行多 檢測項目運行時,軟件可以使用顏色校準得出的校準數據來計算在別的濾光片中染料之間的干擾情況。 注意:在進行顏色校準時,可以使用實時PCR中適用的所有試管和密封蓋,應該記住一點, 在顏色校準時使用的背景校準必須用相同的物品來進行。 使用商業化的校準工具包進行的顏色校準 注意:只有96孔型的校準工具包適用于mastercyclerepr

58、ealplex的顏色校準。這些工具包必須包含一個板/染料(例如:ABI棱鏡7000SDS96孔光譜校準工具包)。當使用用于商業的校準工具包來進行顏色校準時,背景校準必須使用這個工具包提供的背景板來進行。 校準所需染料的選擇取決于裝在mastercyclereprealplex中的濾光片。 CalljrciUjii EIeEIeKiKiNonncKurtdNonncKurtd 匚dilateLciiKn; k-a4*j.a.a一上aRfdid, 排除。 View;Run. Default 一在setup菜單中打開colorcalibration對話框。 一打開colorcalibration對話

59、框以后, 用組合框來選擇工具包內的背景板。 染料的名稱同時在此被輸入進來。 一在右邊的對話框的incubation一欄中,輸入模塊與蓋子的溫度值。模塊的默認溫度設置 為60攝氏度,蓋子的默認溫度設置為105攝氏度。 一當插入顏色校準板后,點擊功能鍵calibrate來執行校準操作。點擊ok來確認操作。 一在加熱和首次讀值后,軟件提示用戶翻轉校準板,請翻轉校準板,然后點擊ok以確認。 如果顏色校準被成功運行,板布局顯示出96個顏色校準板的綠色位置。點擊ok以關閉 calibrationsuccessfullyfinished提示框。 如果顏色校準在某位置發生了失敗,可以選擇cancel鍵來放棄校

60、準數據。在此情況下,該染 料的前次校準數據將被使用。選擇proceed時,顏色校準數據在任何情況下都會被排除。 對每種染料,該過程都被反復執行。 當校準完成后,在calibration面板中將會顯示出一個敏感度碼。這個敏感度碼是一個數值組合,每一位數都確定著光電倍增器的敏感度級別,用來在校準過程中,測量相應濾光片里的 染料。校準工具包中的染料的敏感度級別是由軟件預先設定的。 3.8.2.2客戶特有的染料的校準 根據下列表格中顯示的推薦濃度值,每個染料都應事先準備出一個相應的濃度。對于每種濃 度,50微升的溶液逐一被移液到96孔板的每個孔內。密封好校準板后,對于每種染料濃度 開始執行顏色校準操作

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