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1、問題:融解曲線前端不太正常。1:融解曲線形成原理融解曲線是不斷升溫至95 過程中采集的熒光值。也就是說在不同溫度條件下, DNA 進行解鏈,從雙鏈中游離出來,從而出現熒光值的降低。但是當溫度達到 DNA 解鏈一半的溫度時,也就是Tm 值時,會大量游離出來,從而使熒光值迅速降低,最后轉換成導數后形成高峰。利用熒光染料可以指示雙鏈DNA 熔點的性質, 通過熔點曲線分析可以識別擴增產物和引物二聚體,因而區分非特異性擴增。圖一:縱坐標為將熒光強度的變化對溫度的變化求導。(-dI/dT)(融解曲線呈單一峰時,表示無非特異性產物,熒光定量準確)2:融解曲線的兩種不同形式圖二對圖二曲線每一個位置求導,負導數

2、(-dI/dT )作為縱坐標,得到圖三:圖三3:紅色框位置曲線解釋圖四融解曲線的采集過程中,溫度的變化為每上升,buffer成分( Tris-HCl )隨著溫度的上升, pH 降低,導致SYBR Green的熒光信號強度降低。因此在68 -75 度之間,雖然沒有DNA 雙鏈解開,但是熒光信號發生降低。溫度在 65 -68 之間(紅色框框位置),雖然溫度逐漸上升,但是熒光信號強度不變,可能的原因是:( 1)雖然溫度上升, pH 值降低,但是如果 pH 值依舊在 SYBR Green 完全發光的范圍內,則熒光信號不發生變化。( 2)起始熒光信號過強,熒光信號在一定范圍內的減弱不能被儀器檢測到,因此顯示的熒光信號不發生變化。4:AceQ 融解曲線問題 - 為什么有時候在融解曲線的前端出現凹下去的曲線。以 stepone one為例:圖五AceQ 促解鏈成分相對較多,抑制退火延伸;因此在退火延伸階段(60 度,1min )存在部分鏈退火不充分;因此在信號剛開始采集階段,部分鏈會繼續退火形成雙鏈, 熒光信號增強, 退火充分后熒光信號達到最大值,此后隨著溫度的上升,pH 降低,導致

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