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文檔簡介
1、質粒DN碾取的原理及方法堿裂解法質粒DNA提取原理質粒DN破取主要包括以下幾個方面:如何將細胞裂解釋放質粒DNA如何將質粒DNA基因組DNA分離開來,如何去除 RNA虧染,如何去除蛋白質和其它雜質。質粒提取方法中,最常用的方法是堿裂解法,它具有得率高,適用面廣,快速,純度高等特點。其原理是:強堿性條件下,質粒 DN礙日基因組DNA同時從細胞中釋放出來,并發生變性。在pH中性,并有高鹽濃度存在的條件下,質粒DN慫迅速發生復性,仍為可溶性狀態,染色體DNQ間交聯形成不溶性網狀結構, 在去垢劑SDS作用下,染色體DNAf變性蛋白質和細胞碎片結合 形成沉淀,通過離心去除沉淀后,再用酚氯仿抽提進一步純化
2、質粒DNA用異丙醇或乙醇沉淀可將之純化出來。BIOMIGA公司質粒DNA屯化系列試劑盒,采用堿裂解法質粒提取原理,在高鹽環境下,采用 硅膠膜特異性的吸附質粒 DNA而蛋白質不被吸附,最后用低鹽洗脫液將DNAI膜上洗脫下來,方法簡單,快速,質量好,收獲量高。影響質粒提取的因素影響質粒提取的因素有很多種,如質粒拷貝數,宿主菌株的種類,細菌的培養時間、培養基種類、培養條件等等。質粒拷貝數質粒DNA最終收獲量取決于質粒的拷貝數和質粒的大小。BIOMIGA公司質粒DNA取系列試劑盒,操作步驟適用于高拷貝數質粒的純化, 對于低拷貝質粒純化提取, 應加大起始菌液量 的體積,并且相應地增加各種緩沖液的用量。下
3、表給出一些常用質粒載體的拷貝數:質粒種類復制起點拷貝數1 mL菌液質粒DNA攵獲量3 g)pSC101pSC10150.1-0.2pACYCP15A 10-120.4-0.6pSuperCospMB110-200.4-1pBR322pMB115-200.6-1pGEMRMuted pMB1300-4006-7pBluescriptRColE1300-5006-8pUCMuted pMB1500-7008-12宿主菌株宿主菌株的種類將會影響質粒的收獲量。含內源核酸酶的宿主菌株,如JM101, JM110, HB101,TG1以及它們的衍生菌株,通常因為內源核酸酶的存在,或者在提取過程中釋放出來的
4、核酸酶的作用下,將會顯著影響最終收獲量,或者純化到的質粒容易降解,推薦客戶將質粒轉化至不含內源核酸酶的宿主菌株中,如Top10, DH5a進行質粒純化。如果從含內源核酸酶的宿主菌株中純化質粒DNA請用試劑盒附送的核酸酶去除溶液,去除核酸酶的污染。或選用 HP系列試劑盒進行質粒的純化。下表給出一些常用的宿主菌株種類:EndA- Strains of E. ColiDH&DH1DH21JM106JM109SK2267SRBXLOTOP10DH10BJM103JM107SK1590MM294Stbl2 ?XL1-BlueBJ5182DH20JM105JM108SK1592Select96 ?
5、Stbl4 ?XL10-GoldEndA+ Strains of E. ColiC600JM110RR1ABLE? CCJ236KW251P2392BL21(DE3)HB101TG1TB1ABLE? KDH12S>LE392PR700BL21(DE3) pLysSJM101JM83TKB1HMS174ES1301M1061Q358BMH 71-18All NM strainsAll Y strains菌液培養BIOMIGA公司質粒DN砒取系列試劑盒,標準操作適用于在 LB培養基中培養1216小時, OD60g 2.03.0的菌液質粒 DNA勺提取。如果使用豐富培養基,如 TB, 2 x
6、YT培養基, 請保證OD600不超過3.0。菌液過量,將會影響最終的收獲量和純度。培養方式如果用于質粒小提,請從固體培養基平板上挑取新鮮單菌落,接種到加入篩選抗生素的培養基中,震蕩培養 1216小時。如果用于中提、大提或超大提,請按照以下方式制備菌液:挑取單克隆,接種到 15mL培養基中,進行初搖,然后按照1:1000的比例進行放大培養,培養瓶中培養基的體積最好不要超過培養瓶的1/4體積。抗生素濃度的選擇對含有抗性的質粒載體,在進行篩選或培養時應加入相應的抗生素。各種抗生素的工作濃度請參照下表:抗生素溶解性保存條件嚴緊型質粒松弛型質粒氨節青霉素50 mg/mL(溶于水)-20 C20 g/mL
7、60 g/mL愈節青霉素50 mg/mL溶于水-20 C20 1 g/mL60 g/mL氯霉素34 mg/mL溶于無水乙醇-20 C25 g/mL170 g/mL卡那霉素10 mg/mL溶于水-20 C10 g/mL50 g/mL鏈霉素10 mg/mL溶于水-20 C10 g/mL50 g/mL四環素5 mg/mL溶于無水乙醇-20 C10 g/mL50 g/mL質粒質量鑒定純化到的質粒DNA一般可以通過以下三種方式進行質量鑒定。瓊脂糖凝膠電泳檢測理想條件下,經堿裂解法純化到的質粒DNA應該只出現超螺旋一條帶。但在質粒提取過程中機械力,強堿溶液的作用等原因,純化到的質粒常常會出現三條帶,甚至有時候會出現四條帶(變性超螺旋),不管是哪種形式的超螺旋,經單酶切后,呈現一條帶,則說明提取結果正常,沒有基因組污染。酶切鑒定純化到的質粒,進行進一步的酶切操作,鑒定質粒的大小。紫外分光光度計檢測純化到的質粒,稀釋
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