1、PubMed 檢索完全攻略免疫細胞研究bioworld微信號 antibody-king 新朋友點圖片上方藍字免疫細胞研究bioworld 關注，記錄你探索生命科學的軌跡，分享科研旅途中的點點滴滴。第一章進入PubMed 魔法學校 -PubMed 概述有位退休的老教授不止一次的向我感嘆：'你們現在真是幸福，我們那時候要查一篇相關的文獻，要到圖書館一本一本目錄去檢索。尤其是做一些別人不太做的課題時，要搜集幾篇有用的文獻，竟要花上3， 4 個月時間，而你們現在 。'趁他打頓的時候，我告訴他，'快的話，可能只要3 秒鐘 '。從他兩個厚厚的酒瓶底后面露出一絲羨慕的眼神。

2、我可以想見他當時在一大堆期刊中埋頭查閱的情形，但對于現在的醫學工作者來說，我已經無法想像，如果我們失去PubMed，世界將會怎樣。盡管在因特網上，類似于PubMed 的醫學文獻檢索系統并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed 都首屈一指。還有非常重要的一點，正如它的名字（PubMed Public+Medicine ）所暗示的 , PubMed 是免費向公眾開放的。無論何時何地，你只要在瀏覽器地址欄中輸入：/pubmed/就可以立刻進入PubMed 的界面并開始享受PubMed 所給你帶來的無窮便利。俗話說

3、，喝水不忘掘井人。PubMed 是美國國家醫學圖書館(NLM)所屬的國家生物技術信息中心(NCBI)開發的因特網生物醫學信息檢索系統，位于美國國立衛生研究院（NIH）的平臺上。有不少西方人有在飯前祈禱感恩的習慣，不知道我們是否也有必要每次使用 PubMed 前都感謝 NCBI 呢？ PubMed 覆蓋了全世界 70 多個國家 4300 多種主要生物醫學期刊的摘要和部分全文。其覆蓋的時間段也非常長，早的可以追溯到 20 世紀 60 年代，通常而言，這已經足夠早了，很少有人會需要查閱在此之前的文獻。當然，研究生物醫學史的工作者可能是個例外。而最新的文獻幾乎就在此時此刻。與 PubMed 掛鉤的出版

4、商會自動向PubMed 提供最新的文獻摘要，而往往在這個時候文獻還沒有正式出版。所以盡管生物醫學的文章從被期刊接受到出版往往要好幾個月的時間，但借助于 PubMed ，我們仍舊可以隨時掌握最新的動向，從而大大有利于自己的臨床和研究工作。還有些出版商通過PubMed 提供文獻的全文，有時甚至是免費的，這樣，我們就可以在 PubMed 上真正享受 '坐擁書城 '的感覺了（關于如何獲取全文將在以后的章節中詳述）。 進入 PubMed 的主界面后，首先映入我們眼簾的就是頁面上方的檢索框和功能鍵（如下圖）。這是 PubMed 的核心部分。大部分工作，我們只要利用這 ' 一框五鍵

5、'（檢索框， Limit 鍵, Preview/Index 鍵 , History 鍵，Clipboard 鍵和 Details 鍵）即可完成。 在主界面的左側框 （如左圖），有：· Journal Browser 期刊瀏覽· MeSh Browser 可以用它來分層流覽 MeSH 表· Single Citation Matcher 輸入期刊的信息可以找到某單篇的文獻或整個期刊的內容。· Batch CitutionMatcher 用一種特定的形式輸入期刊的信息一次搜索多篇文獻。· Clinical Queries 這一部分為臨床醫生

6、設置，通過過濾的方式將搜索的文獻固定在4 個范圍：治療、診斷、病原學與預后。· Old PubMed ( 使用舊式的PubMed 查詢方式 )3)Related Resources· Order Documents 可以使用戶在當地得到文獻的全文，但這是要收費的，至于如何免費獲得文獻全文，我將在后面的有關章節中詳述。·Grateful Med是對另一個NLM基于網絡的查詢系統的鏈接。Grateful Med也提供MEDLINE的接入，并且還有一些其他的數據庫如AIDSLINE 、 HISTLINE等等。· Consumer Health 提供與MEDLI

7、NEplus的鏈接， MEDLINEplus是與消費者健康信息相關的國家醫學圖書館的網絡節點。· Clinical Alerts 此部分的目的是加快NIH 資助的臨床研究成果的發布。利用左側框的這些服務，我們不僅能夠進行功能更加強大的檢索，而且還能得到不少非常有用的服務。這些都將在后續章節中介紹。總體而言， PubMed 的界面相當簡潔清晰，幾乎是傻瓜式的。然而傻瓜式的界面并不意味著傻瓜式的操作。我看到很多人用了幾年的 PubMed ，還是只知道在檢索框里輸入一個關鍵字，然后按一下 'Go'按鈕這樣一種單一原始的檢索方式。雖然有一半左右的情況，這樣的操作就足以得到令人

8、滿意的信息，但對于另一半情況，就沒有那么幸運了，要么你真正所需的信息湮沒在大量紛繁蕪雜的'無用 '信息中，要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。令人費解的是，很多醫務工作者寧可在每次檢索時都花上成倍的時間，卻不愿花上幾個小時的時間去認真研究一下 PubMed 。'君欲善其事，必先利其器 '， PubMed 就好像一把功能強大的槍， 你決不能僅僅滿足于知道扣動扳機就可以發射子彈，更重要的是，你要知道如何利用準星瞄準，如何把這把槍的功能發揮到及至。在以后的章節中，我們將逐步深入地了解PubMed ，相信通過這些章節的學習，我們可以真正熟練掌握PubMed ，從而使自

9、己的工作事半功倍。第二章PUBMED 簡單檢索技巧一在這一章里，我們將對如何應用PUBMED 這一得力助手檢索文獻，作以簡單介紹。 1當你打開瀏覽器，在地址欄內鍵入 /PubMed/ 或是 http:/www.PubM/ 后，就進入了 PUBMED 檢索系統主頁,可以見到如下的頁面。 2在靠近頁面上部的地方，首先映入我們眼簾的，即是供我們輸入所需查詢內容的檢索框。在檢索框中輸入查詢詞，然后單擊'go'按鈕或按回車鍵，PubMed 將會自動開始檢索，并將檢索到的相關條目顯示在屏幕上。在檢索框前面，你還可以選定所要檢索

10、內容的數據庫范圍，除 NCBI 的數據庫以外， 可供選擇的還有： PROTEIN,STRUCTURE, POPSET 等等。說到這里，很多人可能以為只需傻瓜式的輸入幾個字符然后回車一敲便可萬事大吉，其實不然。每個人搜索效率的高低往往存在很大差別。在這里提供以下建議僅供讀者參考：明確你索要檢索的關鍵概念及詞語，即關鍵字；考慮到關鍵字的類似說法，即有可能出現的同義詞；通過限定 DATES, STUDY GROUP等，精煉你的檢索范圍；多向有經驗的人求教，因為不同的專業背景以及個人的差異，都有可能形成不同的方法和技巧。3通過布爾（ BOOLEAN ）運算來提高你的效率最常用的三種布爾運算即是AND,

11、OR, 和 NOT 。 AND 提供的運算方式即不管所輸入的兩個關鍵詞語所出現的位置在哪，只要他們都出現在索引文章的某一處，就將其列出。而 OR 則是將出現至少一個關鍵詞的文章列出，這種運算在想將相似主題的文章羅列在一起時，十分有效。NOT 運算可以在你的檢索范圍內將某些不需要的部分除去。但是在使用的時候要特別注意，會有可能將一些你所需要的文章漏掉。比如當你的檢索詞為 LEAD POISONING NOT CHILDREN時，除了會刪除掉那些僅討論兒童的文章，同時也會刪去那些同時討論兒童及其他年齡組的文章。4 PUBMED 檢索類型通常我們所要查詢的單詞類型大致可以分為：詞語（主題）檢索這時我

12、們在 PubMed 主頁的檢索框中鍵入的是英文單詞或短語（大寫或小寫均可） 。然后回車或點擊'Go'， PubMed 即使用其詞匯自動轉換功能進行檢索，并將檢索結果直接顯示在主頁下方。例如：鍵入 'vitamin c common cold' 后回車或點擊 'Go' ，PubMed 開始檢索并將檢索結果顯示出來。著者檢索當我們所要查詢的是著作者時，在檢索框中鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母縮寫，格式為：'著者姓空格名字首字母縮寫'，例如 smith ja ，然后回車或點擊 Go，系統會自動到著者字段去檢索，并顯示檢索結果。 刊名檢索

13、 在檢索框中鍵入刊名全稱或 MEDLINE 形式的簡稱、 ISSN 號，例如：molecularbiology of the cell,或mol biol cell,或 1059-1524，然后回車或點擊 Go,系統將在刊名字段檢索，并顯示檢索結果。日期或日期范圍檢索可以在檢索框中鍵入日期或日期范圍，然后回車或點擊Go，系統會按日期段檢索，并將符合條件的記錄予以顯示。日期的錄入格式為YYYY/MM/DD；如：1999/09/08 也可以不錄月份和日子， 如：2000 或 1999/12。 檢索期刊子集（輯） 檢索的格式為：檢索詞 AND jsubseta, 如： neoplasm AND js

14、ubseta。可供檢索的期刊子庫有 3 種：Abridged Index Medicus( 有 120 種重要核心期刊 )、 Dental 和 Nursing 。分別使用 jsubseta, jsubsetd, jsubsetn進行限定。 檢索帶文摘的記錄 檢索的格式為：檢索詞 AND has abstract, 如： liver cancer AND has abstract 。要注意的是在 1975 年前出版的文章，其 MEDLINE 記錄中沒有文摘。 布爾邏輯檢索 PubMed 系統允許使用布爾邏輯檢索， 只要在檢索框中鍵入布爾邏輯運算符（ AND ， OR 或 NOT ）。具體使用時要

15、注意的問題，詳見上第 3 點所述。5如何處理檢索結果當你點擊 GO 或回車后， PubMed 將會自動運行檢索命令，在屏幕的下方顯示出符合檢索要求的項目，并且在查詢框內保留原檢索詞。此時要注意的是符合檢索要求的項目是以SUMMARY （簡要格式）顯示出來的，就是列出作者，文章題目，以及文章來源的一些信息。在 DISPLAY 鍵后還可以選擇別的顯示格式，點擊DISPLAY 鍵后，系統按所選格式全部檢索結果。 如果只需要顯示其中一部分記錄，則需點擊該記錄左邊的查詢框，使標記后，再點擊Display 鍵；如果只需顯示一條記錄，則可直接點擊該記錄中的作者姓名超鏈接，系統會自動顯示該記錄的文摘格式。還有一點，系統所設定的默認值為每頁顯示20 條選項，這點可以在 SHOW后