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文檔簡介
企業主權式AI:醫療應用KG的創新設計By高煥堂教授/神櫻AI團隊一、此項創新設計的涵意:l這是針對乳腺癌癥領域型<基因中游KG的>設計和AI模型訓練。l此項整體設計與訓練策略,是針對乳腺癌領域構建中游知識圖譜(MidstreamKG)來生成語意嵌入的任務上,具有多個角度的優點與深度:二、實作案例:乳腺癌癥領域的中游KG實踐knowledgegraph,中文譯:藥物再利用知識圖譜其支持下游的精準醫療AI任務上,表現非常亮麗。同時,人們也從生物知識庫中整合了以疾病和基因為中心的多種關系,開發了一個使用交互張量分解來識別疾病基因關聯的通到不同關系的內涵,賦予生物實體和關系更全面、更精確的表示,有利于疾病基因預測。如下圖:這些上游大KG的預訓練知識,能有效節省中、下游模型的訓練速度和成本。本案例是針對<乳腺癌癥>領域,使用神櫻AI團隊自己開發的下圖所示:成為這中游MutationKG的<藥物>節點的起始特征(InitialFeatures)。同時,也從上游KDGene里讀取基因實體的嵌入向量(Embeddings),成為這中游MutationKG的<基因>節點的起始特征。然后,搭配本地機構自主性癌癥及其類型數據,展開訓練中游GNN模型,如下圖所示:于是,已成功訓練出一個能夠把突變數據轉換成嵌入向量的GNN模型,而且嵌入已儲存于mutation_embeddings_gin.csv檔案里,可供后續下游任務使用(如分類、群聚、可視化、或與影像特征融合等)。此下游任務結合了醫學影像特征(Ultrasound/MRI)進行多模態推論,分類等)。如下圖所示:關于超音波影像中的疑似的腫瘤評估,定義于美國放射學會所制定BI-RADS分級標準被廣泛應用于乳腺的各種影像學檢查,如乳腺鉬靶X線攝影、彩超、核磁共振,是用來評價乳腺病變良惡性程度的一種評估分類法。本范例采取Ultralytics的RT_DETR模型:反事實推理(CounterfactualInference)與KG的結合愈來愈重要?;谕评砟軌驇椭藗兝斫夂头治鰣D結構中的因果關系。例如,本案例的決策式利用反事實分析來理解不同治療方案的潛在效果,進行個性化的治療決策支持。如下圖所示:(圖-6、降低決策風險)三、實機演
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