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文檔簡介
mRNABt抗蟲蛋白抗蟲棉①檢測轉(zhuǎn)基因生物染色體DNA上是否插入了目的基因②檢測目的基因是否轉(zhuǎn)錄出了mRNA③檢測目的基因是否翻譯成蛋白質(zhì)④檢測是否具有抗蟲特性以及抗性程度等檢測水平:分子水平個體水平Bt基因結(jié)合Bt基因表達(dá)的過程,推測可以從哪些方面(或水平)進(jìn)行檢測與鑒定?檢測內(nèi)容:分子水平分子水平第2節(jié)
基因工程的基本操作程序(第3課時)轉(zhuǎn)Bt基因品系PCR瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果(1)方法1:PCR擴(kuò)增轉(zhuǎn)基因生物提取DNA根據(jù)目的基因的序列設(shè)計PCR引物PCR操作是否擴(kuò)增出目的基因電泳(常用)DNA測序技術(shù);DNA分子雜交技術(shù)等M:marker;1:陽性質(zhì)粒2:原始品系3-9:轉(zhuǎn)Bt品系判斷標(biāo)準(zhǔn):(一)分子水平檢測1檢測目的基因是否插入受體細(xì)胞染色體DNA上四目的基因的檢測與鑒定(2)方法2:DNA分子雜交技術(shù)探針目的基因帶標(biāo)記的基因探針,與目的基因DNA單鏈在一定條件下互補(bǔ)配對,結(jié)合成雙鏈,從而出現(xiàn)雜交帶,說明
了。探針是一段DNA片段(通常結(jié)合放射性同位素或熒光蛋白等),探針的序列應(yīng)與目的基因高度互補(bǔ),避免與其他基因發(fā)生非特異性結(jié)合變性堿基互補(bǔ)配對原則目的基因整合到受體生物染色體DNA上2檢測目的基因是否轉(zhuǎn)錄(mRNA)轉(zhuǎn)基因生物PCR操作電泳檢測是否擴(kuò)增出目的基因逆轉(zhuǎn)錄cDNA提取RNAmRNA作為模板(2)方法2:分子雜交技術(shù)(1)方法1:PCR擴(kuò)增基因探針轉(zhuǎn)基因生物的mRNA雜交分子(可檢測)變性堿基互補(bǔ)配對原則注射小鼠體內(nèi)蘇云金芽孢桿菌提取Bt抗蟲蛋白抗體標(biāo)記抗體提取蛋白電泳分離抗原抗體雜交轉(zhuǎn)基因生物放射性檢測
(雜交帶)3檢測目的基因是否翻譯(蛋白質(zhì))(1)方法:
抗原—抗體雜交抗原與抗體的特異性結(jié)合(2)原理:通過抗蟲、抗病的接種實(shí)驗(yàn)鑒定生物是否具有抗性以及抗性的程度等例:通過采摘抗蟲棉的葉片飼喂棉鈴蟲來確定Bt基因是否賦予了棉花抗蟲特性以及抗性的程度。如何檢測導(dǎo)入的Bt基因是否具有抗蟲特性?(二)個體水平的檢測轉(zhuǎn)基因生物鑒定方法成功標(biāo)志抗蟲植物抗病毒(菌)植物抗鹽植物抗除草劑植物獲取目的基因產(chǎn)物的轉(zhuǎn)基因生物(如胰島素)飼喂害蟲(抗蟲接種實(shí)驗(yàn))害蟲死亡病毒(菌)接種實(shí)驗(yàn)未染病鹽水澆灌正常生長噴灑除草劑正常生長提取細(xì)胞產(chǎn)物與天然產(chǎn)品進(jìn)行功能、活性比較功能、活性正常①檢測轉(zhuǎn)基因生物染色體DNA上是否插入了目的基因②檢測目的基因是否轉(zhuǎn)錄出了mRNA③檢測目的基因是否翻譯成蛋白質(zhì)——“抗原—抗體雜交技術(shù)”2.個體生物學(xué)水平鑒定1.分子水平檢測抗性檢測:功能活性比較:PCR技術(shù)或分
子雜交技術(shù)抗蟲、抗病接種實(shí)驗(yàn);基因工程產(chǎn)品與天然產(chǎn)品的功能活性比較——檢測是否具有抗性以及抗性強(qiáng)度等如:胰島素注射到糖尿病模型小鼠小結(jié)1.目的基因的篩選和獲取-前提利用PCR獲取和擴(kuò)增人工合成構(gòu)建基因文庫2.構(gòu)建基因表達(dá)載體-核心目的基因、啟動子、終止子、標(biāo)記基因等3.將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞-關(guān)鍵農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法(植物)、顯微注射法(動物)、
感受態(tài)細(xì)胞(如加Ca2+)轉(zhuǎn)化法(微生物);4.目的基因的檢測與鑒定-保證分子檢測:是否插入、轉(zhuǎn)錄、翻譯個體水平:是否具有抗性以及抗性強(qiáng)度等。總結(jié)
基因工程的基本操作程序(1)PCR利用了
原理,通過調(diào)節(jié)
來控制DNA雙鏈的解聚與結(jié)合,PCR儀實(shí)質(zhì)上就是一臺能夠自動調(diào)控溫度的儀器。(2)PCR擴(kuò)增DNA片段還利用了
的原理。一次PCR一般要經(jīng)歷
次循環(huán)。DNA的熱變性溫度DNA半保留復(fù)制305’--3’3’--5’3’--5’5’--3’5’--3’-5’5’-3’--5’5’--3’-5’5’-3’--5’3’--3’高溫變性中溫低溫復(fù)性延伸1次循環(huán)1實(shí)驗(yàn)原理探究
實(shí)踐DNA片段的擴(kuò)增及電泳鑒定(一)利用PCR在體外進(jìn)行DNA片段擴(kuò)增①PCR儀②微量離心管③微量移液器④一次性吸液槍頭2材料用具——自動控溫,實(shí)現(xiàn)DNA的擴(kuò)增——實(shí)際上是進(jìn)行PCR反應(yīng)的場所PCR儀微量離心管推動桿調(diào)節(jié)旋鈕卸槍頭按鈕體積刻度吸液桿槍頭(注意:加不同樣品時,需要更換槍頭)10倍濃縮的擴(kuò)增緩沖液(含Mg2+)5μL20mmol/L的4種脫氧核苷酸的等量混合液1μL20μmol/L的引物Ⅰ2.5μL20μmol/L的引物Ⅱ2.5μLH2O28~33μL1-5U/μL的TaqDNA聚合酶(即耐高溫的DNA聚合酶)1~2U模板DNA(1pg~1μg)5~10μL總體積50μL⑤PCR反應(yīng)體系的配方注意:酶和緩沖液要在冰塊上緩慢融化,用后置于-20℃冰箱中保存。酶和緩沖液一般分裝成小份,避免反復(fù)融化導(dǎo)致活性降低甚至失活(P85)(1)加樣:用微量移液器按照PCR反應(yīng)體系配方,在微量離心管中依次加入各組分。(2)離心:待所有組分都加入后,蓋嚴(yán)離心管的蓋子,將微量離心管放入離心機(jī)里,離心約10s,使反應(yīng)液集中在離心管的底部。——提高反應(yīng)速率3方法步驟(3)反應(yīng):參照右表的參數(shù),設(shè)置好PCR儀的循環(huán)程序。將裝有反應(yīng)液的微量離心管放入PCR儀中進(jìn)行反應(yīng)。循環(huán)程序變性復(fù)性延伸預(yù)變性94℃,5min——30次94℃,30s55℃,30s72℃,1min最后1次94℃,1min55℃,30s72℃,10min使DNA充分變性,雙鏈打開,以利于引物更好地和模板結(jié)合。問題1:預(yù)變性的目的是什么?問題2:為什么最后1次變性和延伸時間都延長了?Taq酶活性會隨著循環(huán)次數(shù)增加而下降。在每一輪循環(huán)中,部分片段可能沒有完全延伸完,Taq酶就脫落了。最后1次變性、延伸時間延長,讓這些DNA打開,重新充分延伸。問題1:PCR的產(chǎn)物是什么?問題2:如何鑒定PCR的產(chǎn)物?DNA片段瓊脂糖凝膠電泳(二)利用瓊脂糖凝膠電泳鑒定PCR產(chǎn)物(1)電泳:DNA分子具有_______________,在一定的_______下,這些基團(tuán)可以帶上正電荷或負(fù)電荷,在電場的作用下,這些帶電分子會向著與它所帶電荷________的電極移動,這個過程就是電泳。可解離的基團(tuán)pH相反1實(shí)驗(yàn)原理一般使用的電泳緩沖液pH=8,DNA分子帶
,在電場中DNA便向
泳動。負(fù)電荷正極磷酸電離形成的磷酸基團(tuán)帶負(fù)電樣品點(diǎn)樣孔應(yīng)靠近
極。負(fù)(2)鑒定方法:①PCR的產(chǎn)物一般通過
來鑒定。瓊脂糖為一種多糖,90℃以上溶解,溫度下降到35-40℃時形成良好的半固體狀的凝膠。瓊脂糖凝膠具有網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)(孔徑),孔徑大小與瓊脂糖凝膠濃度有關(guān),濃度越高,孔徑越
,能夠通過的核酸分子越
。瓊脂糖凝膠電泳②在凝膠中DNA分子的遷移速率與_____________、_________________和______等有關(guān)凝膠的濃度DNA分子的大小構(gòu)象小小瓊脂糖凝膠濃度越大,分離的DNA分子越小,遷移速率越快③DNA染色:凝膠中的DNA分子通過染色,可以在波長300nm的紫外燈下被檢測出來常用的核酸染色劑有EB(溴化乙錠)、GoldView等,EB能插入DNA分子中的堿基對之間,導(dǎo)致EB與DNA結(jié)合。嵌入核酸堿基間的EB能吸收300nm波長的紫外光,發(fā)出可見熒光。其熒光強(qiáng)度與DNA分子的含量成正比。標(biāo)準(zhǔn)參照物(Marker)DNAMarker是
的片段,在實(shí)驗(yàn)時和樣本DNA同時進(jìn)行凝膠電泳,通過對比兩者的遷移速率,可以大致估計
。樣本DNA的大小已知的DNA分子大小瓊脂糖凝膠電泳裝置2材料用具電泳緩沖液凝膠載樣緩沖液核酸染料制備凝膠觀察鑒定進(jìn)行電泳電泳緩沖液配制瓊脂糖溶液,一般配制質(zhì)量體積比0.8%~1.2%的瓊脂糖溶液。在沸水浴或微波爐內(nèi)加熱至瓊脂糖熔化。稍冷卻后,加入適量的核酸染料混勻。將溫?zé)岬沫傊侨芤貉杆俚谷肽>撸⒉迦牒线m大小的梳子,以形成加樣孔。待凝膠溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝膠放入電泳槽內(nèi)。①熔化:②倒模:③凝固:3方法步驟制備凝膠觀察鑒定進(jìn)行電泳將電泳緩沖液加入電泳槽中,電泳緩沖液沒過凝膠1mm為宜擴(kuò)增得到的PCR產(chǎn)物與凝膠載樣緩沖液(內(nèi)含指示劑)混合,再用微量移液器將混合液緩慢注入凝膠的加樣孔內(nèi)。留一個加樣孔加入指示分子大小的標(biāo)準(zhǔn)參照物(marker)。接通電源,根據(jù)電泳槽陽極至陰極之間的距離來設(shè)定電壓,一般為1~5V/cm。待
前沿遷移接近凝膠邊緣時,停止電泳①加液②加樣③電泳指示劑①有顏色,使樣品呈現(xiàn)顏色,便于加樣。②分子量較小,指示樣品遷移的速率及方向。制備凝膠觀察鑒定進(jìn)行電泳取出凝膠置于
下觀察和照相。紫外燈一條條帶(目的基因片段)1.本實(shí)驗(yàn)進(jìn)行電泳鑒定的結(jié)果應(yīng)該是幾條條帶?2.如圖所示,該片段大小約為
。
750bp思考·討論0次12次12次30次30次Marker
根據(jù)條帶的
及
來評價擴(kuò)增的結(jié)果3.判斷成功擴(kuò)增出DNA片段的依據(jù)是什么?分布粗細(xì)程度估計DNA的大小估計DNA的數(shù)量4.如果電泳鑒定的結(jié)果沒有條帶或不止一條條帶,請分析產(chǎn)生這個結(jié)果的可能原因?未出現(xiàn)擴(kuò)增條帶可能的原因有:①引物出現(xiàn)質(zhì)量問題;②變性時溫度
,變性時間
,模板DNA鏈未打開。③Taq酶失活;④Mg2+濃度過
。出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增帶可能的原因有:①引物特異性不強(qiáng)或容易聚合成二聚體②復(fù)性時的溫度過低,引物隨機(jī)連接到非目的基因片段③DNA聚合酶的濃度過高,即使引物與模板的結(jié)合并不完全匹配,酶仍可能催化延伸反應(yīng),生成非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物。④Mg2+濃度過高⑤模板DNA出現(xiàn)污染低低短注意:1.為避免外源DNA等因素的污染,PCR實(shí)驗(yàn)中使用的微量離心管、槍頭和蒸餾水等在使用前必須進(jìn)行
處理。2.該實(shí)驗(yàn)所需材料可以直接從公司購買,緩沖液和酶應(yīng)分裝成小份,并在
儲存。使用前,將所需試劑從冰箱拿出,放在冰塊上
。3.在向微量離心管中添加反應(yīng)組分時,每吸取一種試劑后,移液器上的槍頭都必須
。4.在進(jìn)行操作時,一定要戴好
。5.PCR擴(kuò)增不能隨意加大試劑用量。高壓滅菌-20℃緩慢融化更換一次性手套1.研究人員將一種海魚的抗凍蛋白基因afp整合到土壤農(nóng)桿菌的Ti質(zhì)粒上,然后用它侵染番茄細(xì)胞,獲得了抗凍的番茄品種。判斷下列相關(guān)表述是否正確。(1)afp基因是培育抗凍番茄用到的目的基因。()(2)構(gòu)建含有afp基因的Ti質(zhì)粒需要限制酶、DNA連接酶和核酸酶()(3)只要檢測出番茄細(xì)胞中含有afp基因,就代表抗凍番茄培育成功()√××一、概念檢測練習(xí)與應(yīng)用2.利用PCR既可以快速擴(kuò)增特定基因,也可以檢測基因的表達(dá)。下列有關(guān)PCR的敘述錯誤的是()A.PCR用的DNA聚合酶是一種耐高溫酶B.變性過程中雙鏈DNA的解開不需要解旋酶C.復(fù)性過程中引物與模板鏈的結(jié)合遵循堿基互補(bǔ)配對原則D.延伸過程中需要DNA聚合酶、ATP和4種核糖核苷酸D脫氧核苷酸二、拓展應(yīng)用1.研究人員在研究轉(zhuǎn)基因煙草中外源卡那霉素抗性基因的遺傳穩(wěn)定性時,發(fā)現(xiàn)44株轉(zhuǎn)基因煙草中有4株該基因的遺傳不符合孟德爾遺傳規(guī)律,在它們的自交后代中出現(xiàn)了較多的沒有卡那霉素抗性的植株。請查找相關(guān)資料,嘗試對這個問題作出解釋。外源基因插入基因組中可能為單位點(diǎn)插入,或者同一染色體多位點(diǎn)插入,或者不同染色體多位點(diǎn)插入。大多數(shù)情況下,插入的位點(diǎn)難以做到定點(diǎn)插入;插入的拷貝數(shù)也是隨機(jī)的。因此,外源基因在轉(zhuǎn)基因植物中的遺傳是很復(fù)雜的。例如,科研人員在對轉(zhuǎn)GUS基因(β-葡糖醛酸糖苷酶基因)的煙草進(jìn)行基因表達(dá)分析時,發(fā)現(xiàn)部分轉(zhuǎn)基因植株的染色體DNA中整合了多個拷貝的基因,從而導(dǎo)致GUS基因失活。除此之外,外源基因丟失、基因重排等也都可能影響外源基因的穩(wěn)定性。2.八氫番茄紅素合酶(其基因用psy表示)和胡蘿卜素脫飽和酶(其基因用crtl表示)參與β-胡蘿卜素的合成。pmi為磷酸甘露醇異構(gòu)酶基因,它編碼的蛋白質(zhì)可使細(xì)胞在特殊培養(yǎng)基上生長
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