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文檔簡介
序號(hào):編碼:第十一屆“挑戰(zhàn)杯”全國大學(xué)生課外學(xué)術(shù)科技作品競(jìng)賽華南農(nóng)業(yè)大學(xué)選拔賽作品申報(bào)書作品名稱:結(jié)合計(jì)算機(jī)模擬的蛋白質(zhì)分離純化實(shí)驗(yàn)所在學(xué)院:生命科學(xué)學(xué)院申報(bào)者姓名(集體名稱):劉文彬類別:√□自然科學(xué)類學(xué)術(shù)論文□哲學(xué)社會(huì)科學(xué)類社會(huì)調(diào)查報(bào)告和學(xué)術(shù)論文□科技發(fā)明制作A類□科技發(fā)明制作B類
A2.申報(bào)者情況(集體項(xiàng)目)說明:1.必須由申報(bào)者本人按要求填寫;2.申報(bào)者代表必須是作者中學(xué)歷最高者,其余作者按學(xué)歷高低排列;3.本表中的學(xué)籍管理部門簽章視為對(duì)申報(bào)者情況的確認(rèn)。申報(bào)者代表情況姓名劉文彬性別男出生年月1987-03-16學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院系別、專業(yè)、年級(jí)06級(jí)生物科學(xué)4班學(xué)歷本科學(xué)制4年入學(xué)時(shí)間20069作品名稱結(jié)合計(jì)算機(jī)模擬的蛋白質(zhì)分離純化實(shí)驗(yàn)畢業(yè)論文題目還沒有確定通訊地址華南農(nóng)業(yè)大學(xué)躍進(jìn)南40棟117郵政編碼辦公電住地通訊地址華南農(nóng)業(yè)大學(xué)躍進(jìn)南40棟117郵政編碼住宅電他作者情況姓名性別年齡學(xué)歷所在單位張鵬男22本科華南農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院就讀占磊男20本科華南農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院就讀資格認(rèn)定學(xué)院學(xué)籍管理部門意見以上作者是否為2009年7月1日前正式注冊(cè)在校的全日制非成人教育、非在職的高等學(xué)校中國籍本科生、碩士研究生或博士研究生。□是□否(學(xué)院蓋章)年月日院、系負(fù)責(zé)人或?qū)熞庖姳咀髌肥欠駷檎n外學(xué)術(shù)科技或社會(huì)實(shí)踐活動(dòng)成果。□是□否負(fù)責(zé)人簽名:年月日
B1.申報(bào)作品情況(自然科學(xué)類學(xué)術(shù)論文)說明:1.必須由申報(bào)者本人填寫;2.本部分中的科研管理部門簽章視為對(duì)申報(bào)者所填內(nèi)容的確認(rèn);3.作品分類請(qǐng)按作品的學(xué)術(shù)方向或所涉及的主要學(xué)科領(lǐng)域填寫;4.碩士研究生、博士研究生作品不在此列。作品全稱結(jié)合計(jì)算機(jī)模擬的蛋白質(zhì)分離純化實(shí)驗(yàn)作品分類(D)A.機(jī)械與控制(包括機(jī)械、儀器儀表、自動(dòng)化控制、工程、交通、建筑等)B.信息技術(shù)(包括計(jì)算機(jī)、電信、通訊、電子等)C.?dāng)?shù)理(包括數(shù)學(xué)、物理、地球與空間科學(xué)等)D.生命科學(xué)(包括生物、農(nóng)學(xué)、藥學(xué)、醫(yī)學(xué)、健康、衛(wèi)生、食品等)E.能源化工(包括能源、材料、石油、化學(xué)、化工、生態(tài)、環(huán)保等)作品撰寫的目的和基本思路目的和思路:目前在生化分離提純實(shí)驗(yàn)中對(duì)于分離純化效果的優(yōu)劣判斷,是根據(jù)純化倍數(shù)和回收率作大概判斷的,這種判斷較為粗糙,帶有很強(qiáng)的主觀性,而且回收率和純化倍數(shù)往往具有此消彼長的關(guān)系,有時(shí)候很難對(duì)純化效果的優(yōu)劣作出客觀的判斷;為此我們用數(shù)學(xué)建模的方法,將純化倍數(shù)和回收率綜合在一起,創(chuàng)造出一個(gè)衡量純化效果優(yōu)劣的實(shí)驗(yàn)指標(biāo)——純化效益。沉淀法是較為常用的一類分離純化方法,目前用沉淀法進(jìn)行分離純化實(shí)驗(yàn)往往是通過改變沉淀劑的用量,進(jìn)行大量的對(duì)照試驗(yàn)從而摸索出最佳的試劑用量,用這種方法摸索出的最佳試劑用量,其準(zhǔn)確性很大程度上受到對(duì)照實(shí)驗(yàn)試劑用量密度間隔的制約,故效率不高;我們從理論上推導(dǎo)出試劑用量與沉淀效果可能存在的函數(shù)關(guān)系,并通過少量的對(duì)照實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)對(duì)函數(shù)進(jìn)行求解和檢驗(yàn),然后利用求解的函數(shù)關(guān)系式進(jìn)行計(jì)算機(jī)模擬沉淀實(shí)驗(yàn),從而高效準(zhǔn)確地確定最佳試劑用量。進(jìn)行計(jì)算機(jī)模擬實(shí)驗(yàn)不僅不需很多的實(shí)際操作,減少了資源消耗和工作量,而且可以在短時(shí)間內(nèi)完成大量的對(duì)照實(shí)驗(yàn),使實(shí)驗(yàn)的效率得到大大提高;但其前提條件是,必須先求解出來試劑用量與實(shí)驗(yàn)結(jié)果之間的關(guān)系,并且這個(gè)關(guān)系式便于應(yīng)用;目前關(guān)于沉淀的數(shù)學(xué)模型并不少,但限于其表達(dá)形式復(fù)雜,很難用于分離純化實(shí)驗(yàn);本文用數(shù)學(xué)建模的方法來求解便于應(yīng)用的試劑量與沉淀效果之間的函數(shù)關(guān)系,并且將其與計(jì)算機(jī)結(jié)合起來,提供了一個(gè)結(jié)合計(jì)算機(jī)模擬的蛋白質(zhì)分離純化模板。(我們即將完成蛋白質(zhì)沉淀模擬軟件的開發(fā))作品的科學(xué)性、先進(jìn)性及獨(dú)特之處提出了衡量純化效果優(yōu)劣的定量指標(biāo)——純化效益,消除了生化分離純化過程中純化效果優(yōu)劣判斷的不確定性。對(duì)現(xiàn)有沉淀假說進(jìn)行擴(kuò)充和數(shù)學(xué)化,建立便于應(yīng)用的數(shù)學(xué)模型。對(duì)現(xiàn)有不便于應(yīng)用的數(shù)學(xué)沉淀模型進(jìn)行數(shù)學(xué)簡化處理,建立便于應(yīng)用的數(shù)學(xué)模型。將建立的數(shù)學(xué)模型與計(jì)算機(jī)技術(shù)結(jié)合起來,建立了便利應(yīng)用的計(jì)算機(jī)模擬的蛋白質(zhì)分離純化模板。實(shí)現(xiàn)了生化分離技術(shù)和計(jì)算機(jī)的結(jié)合,開拓了計(jì)算機(jī)模擬生化分離純化實(shí)驗(yàn)的先河,將生化基礎(chǔ)研究的高速發(fā)展推向一個(gè)高科技水平,使生化實(shí)驗(yàn)變得更加精準(zhǔn)高效。開發(fā)了一個(gè)模擬蛋白質(zhì)分離純化實(shí)驗(yàn)的軟件。作品的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值和現(xiàn)實(shí)意義根據(jù)本文提供的模型進(jìn)行分離純化的計(jì)算和模擬實(shí)驗(yàn),可以快速找到實(shí)驗(yàn)的最優(yōu)方案。減少了實(shí)驗(yàn)的工作量和實(shí)驗(yàn)藥品的用量。根據(jù)我們提供的純化效益的公式對(duì)分離純化的效果進(jìn)行分析,這樣可以快速找出實(shí)驗(yàn)的最優(yōu)方案。使分離純化效果的分析變得簡單、高效、客觀。讓分離純化與計(jì)算機(jī)結(jié)合起來,實(shí)現(xiàn)了分離純化在計(jì)算機(jī)上進(jìn)行模擬。學(xué)術(shù)論文文摘本文利用數(shù)學(xué)建模的方法首次提出了衡量分離純化效果優(yōu)劣的定量指標(biāo)——純化效益;并對(duì)回純系數(shù)的確定進(jìn)行解釋,以便讓大家根據(jù)自己的需要選擇適當(dāng)?shù)臉?biāo)準(zhǔn),從而達(dá)到最佳的實(shí)驗(yàn)效果。建立了便于應(yīng)用推廣的聚乙二醇(polyethyleneglycol,PEG)和硫酸銨沉淀分離純化模型并對(duì)模型進(jìn)行求解、檢驗(yàn)和應(yīng)用。提出了PEG和硫酸銨分級(jí)沉淀的最優(yōu)實(shí)驗(yàn)方案求解模型,并對(duì)其步驟進(jìn)行解釋,以海芋過氧化物酶分離純化為例,提供了求解的模板。作品在何時(shí)、何地、何種機(jī)構(gòu)舉行的會(huì)議上或報(bào)刊上發(fā)表及所獲獎(jiǎng)勵(lì)無鑒定結(jié)果請(qǐng)?zhí)峁?duì)于理解、審查、評(píng)價(jià)所申報(bào)作品具有參考價(jià)值的現(xiàn)有技術(shù)及技術(shù)文獻(xiàn)的檢索目錄1王建龍,文湘華.現(xiàn)代環(huán)境生物技術(shù).北京:清華大學(xué)出版社,20012郭勇.酶的生產(chǎn)與應(yīng)用.化學(xué)工業(yè)出版社.2003,9:84-853趙亞華,高向陽.生物化學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)教程高等教育出版社.2005.9:95-964劉憲華,魯逸人.環(huán)境生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)教程.科學(xué)出版社.2006,9:70-825BramL.H.M.Sperber,HenkA.Schols,MartienA.CohenStuart,WillemNorde,AlphonsG.J.Voragen.Influenceoftheoverallchargeandlocalchargedensityofpectinontheplexformationbetweenpectinandβlactoglobulin.FoodHydrocolloids,2009,23(3):7657726胡瓊英.生物化學(xué)實(shí)驗(yàn).化工出版社,20077郭勇.酶的生產(chǎn)與應(yīng)用.化學(xué)工業(yè)出版社,2003,9:84-858LuísaA.Ferreira,EugéniaA.Macedo,Sim?oP.Pinho.Theeffectofammoniumsulfateonthesolubilityofaminoacidsinwaterat(298.15and323.15)
K.TheJournalofChemicalThermodynamics,2009,41(2):1931969RameshDandu,ArthurVonCresce,RobertBriber,PaulDowell,JosephCappello,HamidrezaGhandehari.Silk–elastinlikeproteinpolymerhydrogels:Influenceofmonomersequenceonphysicochemicalproperties.Polymer,2009,50(2):36637410鐘譚衛(wèi).大學(xué)數(shù)學(xué).科學(xué)出版社,2003.8:73-7411ShijunLiao.Notesonthehomotopyanalysismethod:Somedefinitionsandtheorems.municationsinNonlinearScienceandNumericalSimulation,2009,14(4):983997
申報(bào)材料清單(申報(bào)論文一篇,相關(guān)資料名稱及數(shù)量)共兩份:申請(qǐng)表論文科研管理部門簽章年月日作品全稱結(jié)合計(jì)算機(jī)模擬的蛋白質(zhì)分離純化實(shí)驗(yàn)作品分類(D)A.機(jī)械與控制(包括機(jī)械、儀器儀表、自動(dòng)化控制、工程、交通、建筑等)B.信息技術(shù)(包括計(jì)算機(jī)、電信、通訊、電子等)C.?dāng)?shù)理(包括數(shù)學(xué)、物理、地球與空間科學(xué)等)D.生命科學(xué)(包括生物、農(nóng)學(xué)、藥學(xué)、醫(yī)學(xué)、健康、衛(wèi)生、食品等)E.能源化工(包括能源、材料、石油、化學(xué)、化工、生態(tài)、環(huán)保等)作品撰寫的目的和基本思路目的和思路:目前在生化分離提純實(shí)驗(yàn)中對(duì)于分離純化效果的優(yōu)劣判斷,是根據(jù)純化倍數(shù)和回收率作大概判斷的,這種判斷較為粗糙,帶有很強(qiáng)的主觀性,而且回收率和純化倍數(shù)往往具有此消彼長的關(guān)系,有時(shí)候很難對(duì)純化效果的優(yōu)劣作出客觀的判斷;為此我們用數(shù)學(xué)建模的方法,將純化倍數(shù)和回收率綜合在一起,創(chuàng)造出一個(gè)衡量純化效果優(yōu)劣的實(shí)驗(yàn)指標(biāo)——純化效益。沉淀法是較為常用的一類分離純化方法,目前用沉淀法進(jìn)行分離純化實(shí)驗(yàn)往往是通過改變沉淀劑的用量,進(jìn)行大量的對(duì)照試驗(yàn)從而摸索出最佳的試劑用量,用這種方法摸索出的最佳試劑用量,其準(zhǔn)確性很大程度上受到對(duì)照實(shí)驗(yàn)試劑用量密度間隔的制約,故效率不高;我們從理論上推導(dǎo)出試劑用量與沉淀效果可能存在的函數(shù)關(guān)系,并通過少量的對(duì)照實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)對(duì)函數(shù)進(jìn)行求解和檢驗(yàn),然后利用求解的函數(shù)關(guān)系式進(jìn)行計(jì)算機(jī)模擬沉淀實(shí)驗(yàn),從而高效準(zhǔn)確地確定最佳試劑用量。進(jìn)行計(jì)算機(jī)模擬實(shí)驗(yàn)不僅不需很多的實(shí)際操作,減少了資源消耗和工作量,而且可以在短時(shí)間內(nèi)完成大量的對(duì)照實(shí)驗(yàn),使實(shí)驗(yàn)的效率得到大大提高;但其前提條件是,必須先求解出來試劑用量與實(shí)驗(yàn)結(jié)果之間的關(guān)系,并且這個(gè)關(guān)系式便于應(yīng)用;目前關(guān)于沉淀的數(shù)學(xué)模型并不少,但限于其表達(dá)形式復(fù)雜,很難用于分離純化實(shí)驗(yàn);本文用數(shù)學(xué)建模的方法來求解便于應(yīng)用的試劑量與沉淀效果之間的函數(shù)關(guān)系,并且將其與計(jì)算機(jī)結(jié)合起來,提供了一個(gè)結(jié)合計(jì)算機(jī)模擬的蛋白質(zhì)分離純化模板。(我們已經(jīng)開發(fā)了蛋白質(zhì)沉淀模擬軟件)作品的科學(xué)性、先進(jìn)性及獨(dú)特之處提出了衡量純化效果優(yōu)劣的定量指標(biāo)——純化效益,消除了生化分離純化過程中純化效果優(yōu)劣判斷的不確定性。對(duì)現(xiàn)有沉淀假說進(jìn)行擴(kuò)充和數(shù)學(xué)化,建立便于應(yīng)用的數(shù)學(xué)模型。對(duì)現(xiàn)有不便于應(yīng)用的數(shù)學(xué)沉淀模型進(jìn)行數(shù)學(xué)簡化處理,建立便于應(yīng)用的數(shù)學(xué)模型。將建立的數(shù)學(xué)模型與計(jì)算機(jī)技術(shù)結(jié)合起來,建立了便利應(yīng)用的計(jì)算機(jī)模擬的蛋白質(zhì)分離純化模板。實(shí)現(xiàn)了生化分離技術(shù)和計(jì)算機(jī)的結(jié)合,開拓了計(jì)算機(jī)模擬生化分離純化實(shí)驗(yàn)的先河,將生化基礎(chǔ)研究的高速發(fā)展推向一個(gè)高科技水平,使生化實(shí)驗(yàn)變得更加精準(zhǔn)高效。開發(fā)了一個(gè)模擬蛋白質(zhì)分離純化實(shí)驗(yàn)的軟件。作品的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值和現(xiàn)實(shí)意義實(shí)驗(yàn)工作者可以根據(jù)本文提供的模型進(jìn)行分離純化的計(jì)算和模擬實(shí)驗(yàn),可以用快速找到實(shí)驗(yàn)的最優(yōu)方案。減少了實(shí)驗(yàn)的工作量和實(shí)驗(yàn)藥品的用量。實(shí)驗(yàn)工作者可以根據(jù)我們提供的純化效益的公式對(duì)分離純化的效果進(jìn)行分析,這樣可以快速找出實(shí)驗(yàn)的最優(yōu)方案。使分離純化效果的分析變得簡單、高效、客觀。讓分離純化與計(jì)算機(jī)結(jié)合起來,實(shí)現(xiàn)了分離純化在計(jì)算機(jī)上進(jìn)行模擬。學(xué)術(shù)論文文摘本文利用數(shù)學(xué)建模的方法首次提出了衡量分離純化效果優(yōu)劣的定量指標(biāo)——純化效益;并對(duì)回純系數(shù)的確定進(jìn)行解釋,以便讓大家根據(jù)自己的需要選擇適當(dāng)?shù)臉?biāo)準(zhǔn),從而達(dá)到最佳的實(shí)驗(yàn)效果。建立了便于應(yīng)用推廣的聚乙二醇(polyethyleneglycol,PEG)和硫酸銨沉淀分離純化模型并對(duì)模型進(jìn)行求解、檢驗(yàn)和應(yīng)用。提出了PEG和硫酸銨分級(jí)沉淀的最優(yōu)實(shí)驗(yàn)方案求解模型,并對(duì)其步驟進(jìn)行解釋,以海芋過氧化物酶分離純化為例,提供了求解的模板。作品在何時(shí)、何地、何種機(jī)構(gòu)舉行的會(huì)議上或報(bào)刊上發(fā)表及所獲獎(jiǎng)勵(lì)無鑒定結(jié)果請(qǐng)?zhí)峁?duì)于理解、審查、評(píng)價(jià)所申報(bào)作品具有參考價(jià)值的現(xiàn)有技術(shù)及技術(shù)文獻(xiàn)的檢索目錄[1]王建龍,文湘華.現(xiàn)代環(huán)境生物技術(shù).北京:清華大學(xué)出版社,2001[2]郭勇.酶的生產(chǎn)與應(yīng)用.化學(xué)工業(yè)出版社.2003,9:84-85[3]趙亞華,高向陽.生物化學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)教程高等教育出版社.2005.9:95-96[4]劉憲華,魯逸人.環(huán)境生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)教程.科學(xué)出版社.2006,9:70-82[5]BramL.H.M.Sperber,HenkA.Schols,MartienA.CohenStuart,WillemNorde,AlphonsG.J.Voragen.Influenceoftheoverallchargeandlocalchargedensityofpectinontheplexformationbetweenpectinandβlactoglobulin.FoodHydrocolloids,2009,23(3):765772[6]胡瓊英.生物化學(xué)實(shí)驗(yàn).化工出版社,2007[7]郭勇.酶的生產(chǎn)與應(yīng)用.化學(xué)工業(yè)出版社,2003,9:84-85[8]LuísaA.Ferreira,EugéniaA.Macedo,Sim?oP.Pinho.Theeffectofammoniumsulfateonthesolubilityofaminoacidsinwaterat(298.15and323.15)
K.TheJournalofChemicalThermodynamics,2009,41(2):193196[9]RameshDandu,ArthurVonCresce,RobertBriber,PaulDowell,JosephCappello,HamidrezaGhandehari.Silk–elastinlikeproteinpolymerhydrogels:Influenceofmonomersequenceonphysicochemicalproperties.Polymer,2009,50(2):366374[10]鐘譚衛(wèi).大學(xué)數(shù)學(xué).科學(xué)出版社,2003.8:73-74[11]ShijunLiao.Notesonthehomotopyanalysismethod:Somedefinitionsandtheorems.municationsinNonlinearScienceandNumericalSimulation,2009,14(4):983997申報(bào)材料清單(申報(bào)論文一篇,相關(guān)資料名稱及數(shù)量)共兩份:申請(qǐng)表論文科研管理部門簽章年月日
C.當(dāng)前國內(nèi)外同類課題研究水平概述說明:1.申報(bào)者可根據(jù)作品類別和情況填寫;2.填寫此欄有助于評(píng)審。就我們所查的資料而言,并沒有發(fā)現(xiàn)有人對(duì)這方面進(jìn)行深入的研究。對(duì)于純化效益也是本文最先提出的。而對(duì)PEG沉淀的原理也是處于假設(shè)階段,現(xiàn)在比較多人認(rèn)可的是空間阻排學(xué)說,但是這個(gè)學(xué)說并沒有證實(shí)。對(duì)于硫酸銨沉淀的原理則研究得比較深入,而且也比較成熟,但是提出的公式很難直接用于硫酸銨沉淀的分析。因此對(duì)于這方面的知識(shí)需要加以改進(jìn)以便更好的應(yīng)用于實(shí)際工作中。
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