豬流感病毒的進化與進化

豬感染（sw）是由甲狀流感病毒引起的豬急性呼吸道感染的。雖然也從豬體內(nèi)分離到了丙型流感病毒,但感染豬的主要還是甲型流感病毒。目前該病呈世界分布,但主要以地方流行性為主。世界各地流行的豬流感病毒(Swineinfluenzavirus,SIV)包括3種主要的亞型:H1N1,H3N2和H1N2亞型,其中又包括不同的基因型:古典豬H1N1,類禽H1N1,類人H3N2,基因重配的H3N2以及多基因型的H1N2亞型。豬流感一年四季都可發(fā)生,但以春秋多發(fā),各種日齡的豬都可感染。豬流感病毒對養(yǎng)豬業(yè)和人類公共衛(wèi)生都有重大影響。1流感病毒的宿主—甲型流感病毒的宿主限制性在流感病毒大家族中,甲型流感病毒的宿主分布最廣,可感染禽、人、豬、馬、狗、貓、海洋哺乳動物(海豹、鯨等)等。在整個甲型流感病毒的生態(tài)分布中,野生水禽是主要的自然貯存宿主和基因庫,目前發(fā)現(xiàn)的所有甲型流感病毒亞型(16個HA和9個NA亞型)都存在于野生水禽中。一般認為流感病毒具有宿主限制性,這是流感病毒在不同宿主中長期適應(yīng)進化的結(jié)果。比如,感染馬的主要是H7N7和H3N8亞型;SIV主要是H1N1、H3N2和H1N2;人流感主要是H1N1、H1N2、H2N2及H3N2亞型。研究表明禽流感病毒不能有效地在人和非人靈長類動物體內(nèi)復(fù)制;同樣,人流感病毒也不能很好地在禽體內(nèi)復(fù)制。流感病毒的宿主限制特性涉及到病毒和宿主兩方面因素,但詳細機制尚不清楚;就病毒本身而言,可能是多個基因在起作用,包括HA和NA基因,以及其它內(nèi)部基因(NP、PB2、PB1等)。HA是宿主范圍限制性的一個主要決定因素。HA與宿主細胞上的受體結(jié)合是流感病毒感染的關(guān)鍵一步。HA識別的受體分為2類:α-2,3半乳糖苷唾液酸(SA2,3Gal)和α-2,6半乳糖苷唾液酸(SA2,6Gal)。禽和馬流感病毒對SA2,3Gal具有親嗜性,而人和豬流感病毒對SA2,6Gal的親和性最高。研究表明,馬呼吸道和禽腸道上皮細胞主要含SA2,3Gal,人呼吸道上皮細胞主要含SA2,6Gal受體,而豬的呼吸道上皮細胞同時含有兩種類型的受體。HA蛋白分子結(jié)構(gòu)分析表明,HA蛋白受體結(jié)合位點(Recepter-bindingsite,RBS)上的一些氨基酸殘基對流感病毒的受體結(jié)合特性有重要影響。對H3和H2亞型來說,人流感病毒HA受體結(jié)合位點的266位氨基酸為Leu,而禽或馬的為Gln。對于H1亞型來說,HA受體結(jié)合位點的190位氨基酸Glu→Asp和225位Gly→Glu的突變在禽流感病毒適應(yīng)新宿主人和豬的過程中起重要作用。NA蛋白在流感病毒的跨物種傳播過程中也起一定作用。HA的受體結(jié)合特性和NA的受體破壞特性之間的動態(tài)平衡能有效地確保流感病毒的感染和傳播。研究表明,NA具有底物特異性,但詳細機制尚不清楚。N2亞型禽流感病毒在人體內(nèi)適應(yīng)進化時,NA繼續(xù)保持α-2,3半乳糖苷鍵的酶切活性,同時α-2,6半乳糖苷鍵的酶切活性在增加,這與HA蛋白逐步具備SA2,6Gal受體結(jié)合活性這一過程相適應(yīng)。此外,NA的莖部長度對病毒的宿主限制性可能也有影響。2傳播能力顯著增強由于豬呼吸道上皮同時具有2種流感病毒受體,因此人和禽流感病毒都可以感染豬,豬被認為是禽、人流感病毒的中間宿主和基因“混合器”,豬體內(nèi)可能會產(chǎn)生引起人類流感大流行的新病毒。概括起來有三種可能:第一,禽流感病毒跨物種傳播給人并造成人際間傳播,首先要發(fā)生受體結(jié)合特性的轉(zhuǎn)變,即禽流感病毒在豬體適應(yīng)后如果獲得了SA2,6Gal受體結(jié)合特性,就可能具備了在人群中傳播的能力。有些學(xué)者認為1918年西班牙大流感就可能是禽流感病毒經(jīng)過豬體適應(yīng)后傳播給人群的。近年來高致病性禽流感H5N1病毒雖然可以跨物種感染人,但一直沒有獲得在人際之間的傳播能力,其中一個重要原因就是H5N1病毒的受體結(jié)合特性還是SA2,3Gal結(jié)合特性,尚沒有轉(zhuǎn)變?yōu)镾A2,6Gal受體結(jié)合特性。第二,這為禽流感病毒與人或豬流感病毒發(fā)生基因重配提供了機會,這種含有禽和/或豬流感病毒基因的重配病毒可能感染人并引起流行。越來越多的證據(jù)顯示,基因重配的流感病毒具有明顯的選擇優(yōu)勢,傳播能力顯著增強。比如20世紀人類發(fā)生的4次大流感中有2次就是由于基因重配而產(chǎn)生的新型流感病毒引起的。1957年的亞洲流感是當(dāng)時流行于人群中的H1N1病毒從禽流感病毒中獲得了HA、NA、PB1基因節(jié)段而產(chǎn)生的H2N2亞型病毒引起的。1968年香港流感是當(dāng)時人群中H2N2病毒從禽流感病毒獲得HA、PB1基因后產(chǎn)生的H3N2亞型流感病毒引起的。但這兩次基因重配是在豬體內(nèi)還是在人體內(nèi)發(fā)生的,目前還不清楚。第三,豬也可能成為人流感病毒(H1N1和H3N2亞型)的貯存宿主,某些人流感病毒在人群中消失后,可以在豬群中持續(xù)存在,這種病毒一旦重新傳染給人就可能在免疫空白人群中造成流行。已有多起報道證實這些在人群中消失的人流感病毒(人H1N1或H3N2)在豬體內(nèi)的存在。有人認為1977年的所謂“俄羅斯流感”(消失了近20年的H1N1重新在人群中出現(xiàn))就可能是由存儲在豬體中的人源H1N1病毒重新傳播給人引起的。3豬體內(nèi)其他基因的重組甲型流感病毒的進化方式包括病毒的宿主適應(yīng)性進化、抗原漂移、基因重配和RNA重組等,其中前三種方式在豬體內(nèi)都有發(fā)生。與人和禽流感病毒相比,基因重配是流感病毒在豬體內(nèi)進化的主要方式。3.1流感病毒的跨種傳播流感病毒的宿主適應(yīng)性進化也可稱之為宿主特異性(hostspecifity)進化。如前所述,甲型流感病毒進入不同的宿主,經(jīng)過長期適應(yīng),形成了宿主范圍限制性(hostrangerestriction),即特定宿主的流感病毒一般不容易傳給其他動物。但在自然條件下,甲型流感病毒的跨種傳播也時有發(fā)生,如由禽類傳播給人和其它哺乳動物。當(dāng)流感病毒發(fā)生跨物種傳播時,病毒要與新宿主進行相互作用,病毒對新宿主的適應(yīng)過程也是病毒自身進化的過程,這一過程決定病毒在新宿主中能否穩(wěn)定存在。比如1970年代,禽H1N1病毒跨物種傳播給歐洲的豬群后,與母源病毒相比,除了受體結(jié)合特性發(fā)生改變外,其抗原漂移明顯加快,Ludwig等認為這可能與病毒RNA聚合酶基因突變有關(guān),但顯然這并非主要原因。無疑這種快速的進化促進了禽H1N1病毒在豬體內(nèi)的適應(yīng)和持續(xù)存在。3.2siv的免疫改變流感病毒屬RNA病毒,在復(fù)制過程中RNA聚合酶缺乏校正功能,各基因都存在一定程度的點突變;其中,編碼表面抗原的HA和NA的突變率最高。宿主的免疫選擇壓力是影響HA和NA基因突變的重要外部因素。病毒為了逃避宿主的免疫壓力,點突變逐漸積累,直接導(dǎo)致抗原發(fā)生改變,即抗原漂移(antigenicdrift),使宿主針對先前流行株的抗體不能再中和新出現(xiàn)的毒株。流感病毒在不同宿主所受的免疫壓力不同。在水禽中,流感病毒與宿主高度適應(yīng),其進化幾乎處于停滯狀態(tài),稱之為進化靜止(evolutionstabilization)。相比之下,人流感病毒所受的免疫壓力最大,每隔2~3年就會發(fā)生一次抗原漂移。SIV(就古典豬H1N1病毒而言)所受的免疫壓力介于兩者之間。與人流感病毒相比,抗原漂移對SIV并不那么重要,而且HA蛋白氨基酸的改變往往不涉及抗原位點。這是由于豬的商品化養(yǎng)殖決定了豬群中總能及時地提供缺乏免疫力的易感個體,因此SIV所受的免疫壓力較小。當(dāng)然這一情況都是在不使用疫苗接種的情況下成立。而近年來H5N1和H9N2在陸生家禽中的抗原漂移異常明顯,這可能與密集的疫苗接種造成的群體免疫壓力密切相關(guān)。3.3跨物種傳播的病毒甲型流感病毒的基因組分為8個節(jié)段,當(dāng)兩個不同來源的病毒共同感染同一宿主時,在病毒的復(fù)制過程中就可能產(chǎn)生重配病毒,這種現(xiàn)象稱為基因重配。當(dāng)基因重配涉及到HA和NA亞型時,就會使流行株出現(xiàn)新的亞型,這種劇烈的抗原改變稱為抗原轉(zhuǎn)移(antigenicshift)。甲型流感病毒的跨物種傳播介入新宿主也是一種抗原轉(zhuǎn)移方式,如1918年人與豬群中出現(xiàn)的H1N1以及1979歐洲豬群中出現(xiàn)的類禽H1N1,就是一種甲型流感病毒跨物種傳播而引起的抗原轉(zhuǎn)移。抗原轉(zhuǎn)移是流感病毒逃避宿主免疫壓力的一種快速的進化方式。前面提及,流感病毒具有宿主限制性,禽流感病毒很難在人體增殖。而豬的上皮細胞同時具有SA2,3Gal和SA2,6Gal兩種受體。禽和人流感病毒都能感染豬,這就為兩種或兩種以上不同毒株在豬體內(nèi)發(fā)生基因重配提供了可能。從20世紀80年代起,已在豬群中分離到多種基因重配病毒,包括H3N2、H1N2、H1N7、H3N1等亞型。這些重配病毒有的涉及到抗原轉(zhuǎn)移,即產(chǎn)生了新亞型的病毒;有的亞型未變但內(nèi)部基因發(fā)生了重配。重配病毒大多表現(xiàn)出一定的選擇優(yōu)勢,在宿主范圍、致病性和進化速度等方面都與母源病毒有顯著的差別。4病毒的多樣性及傳播途徑全球范圍內(nèi)流行的SIV亞型主要有3種:H1N1、H3N2和H1N2亞型,其中各亞型內(nèi)病毒基因來源又不盡相同,包括豬古典H1N1(classicalswineH1N1)、類禽H1N1(avian-likeH1N1)、類人H3N2(human-likeH3N2)、基因重配H3N2(reassortmentH3N2)及各種基因型的H1N2亞型,表現(xiàn)為遺傳多樣性。所謂“類(like)”,表示病毒的最初宿主來源,這是流感病毒跨物種傳播的結(jié)果。此外,H1N7、H4N6、H9N2、H5N1、H3N3、H3N1和H2N3等亞型病毒也在豬體內(nèi)分離到,但沒有證據(jù)顯示這些病毒在豬體內(nèi)建立穩(wěn)定的譜系。每年全球人類季節(jié)性流感的流行毒株特性基本相同,相比之下,豬流感病毒在全球范圍內(nèi)的流行情況各不相同,具有明顯的地區(qū)差異。豬流感的資料主要集中在北美、歐洲和東亞地區(qū)(包括中國),其他地區(qū)的流行情況報道較少。在上述地區(qū)流行的豬流感病毒在基因型和抗原性等方面各不相同:4.1歐洲目前歐洲豬群中流行的主要是類禽H1N1、H1N2和H3N2病毒,其中后兩者是基因重配病毒。4.1.1豬siv,宿主病毒高通量病毒病毒的遺傳特性這類病毒的全部基因是禽源性的,是由禽H1N1流感病毒跨物種傳播給豬。1979年在歐洲的豬群中出現(xiàn)類禽H1N1的SIV,這類病毒在抗原和遺傳特性方面與古典豬H1N1病毒完全不同,但與禽源的H1N1病毒關(guān)系最密切,其8基因節(jié)段都是禽源的,是禽H1N1病毒跨物種傳播到豬的結(jié)果。這些類禽H1N1病毒與古典H1N1病毒相比,具有明顯的選擇優(yōu)勢,傳入豬群2年后,該類病毒已完全取代古典H1N1SIV,成為目前歐洲豬群中主要的H1N1亞型病毒。4.1.2ha和na基因1994年英國從發(fā)病的豬體內(nèi)分離到的H1N2亞型流感病毒,分子遺傳分析表明病毒的HA和NA基因分別來自人H1N1和H3N2亞型病毒,6個內(nèi)部基因來自已經(jīng)存在于歐洲豬群中的類禽H1N1病毒。之后此類病毒傳播到歐洲其他地方,在歐洲大陸的豬群中廣泛流行。4.1.3類畜禽s11病毒在豬群中的應(yīng)用這類病毒首次于1984年在意大利的豬體內(nèi)發(fā)現(xiàn),HA和NA基因來源于人H3N2病毒,而內(nèi)部基因則來自于流行于豬群中的類禽H1N1病毒,這是對豬作為流感病毒“混合器”假說的首次證實。這種基因重配的H3N2病毒也是目前歐洲豬群中的另一個優(yōu)勢流行株。總之,目前歐洲豬群中的H1N1病毒的8個基因片段都是禽源的,H1N2病毒是一種三源基因重配病毒,其6個內(nèi)部基因也是禽源的,而H3N2病毒除HA和NA外,其他6個基因也是禽源的。4.2豬流感病毒的類型1998以前北美豬群中流行的流感病毒基本上全都屬于古典豬H1N1亞型,但之后的幾年間由于基因重配的頻繁發(fā)生,北美地區(qū)的豬流感病毒的流行情況日趨復(fù)雜,不斷出現(xiàn)新亞型或新基因型的重配病毒,其中一些“人-豬-禽”三源基因重配病毒成為優(yōu)勢流行毒株。這些新出現(xiàn)的三源重配病毒都擁有相同的內(nèi)部基因(PB2、PB1、PA、NP、M和NS)構(gòu)成,Ma等稱之為“三源基因重配內(nèi)部基因盒”(TRIGcassette),并認為擁有這種內(nèi)部基因的SIV具有明顯的選擇優(yōu)勢。4.2.1古典豬s11病毒與人類s11病毒的起源比較1930年Shope等在美國的豬群中分離到第一株流感病毒,稱為豬古典H1N1亞型病毒。越來越多的證據(jù)表明,古典豬H1N1病毒與人類H1N1病毒起源于同一種病毒,與1918年西班牙大流感病毒的起源一致,現(xiàn)已明確其起源于禽流感病毒。但這種禽流感病毒是經(jīng)過豬體內(nèi)適應(yīng)后傳給人類,還是直接感染人然后再由人傳給豬,或者是這種禽流感病毒分別沿著兩種途徑傳給豬和人,然后在各自的宿主中獨立進化,目前不清楚。4.2.2人h32c、m、np、ns基因及病毒組成1998年,北美地區(qū)豬群中出現(xiàn)了新的人-禽-豬三源基因重配的H3N2病毒,并在該地區(qū)引起廣泛流行。這種病毒的基因組成是:HA、NA和PB1來源于人H3N2病毒,M、NP和NS基因來自于古典豬H1N1病毒,而PA和PB2則來自于禽流感病毒。與類人H3N2亞型相比,三源重配的H3N2病毒的致病性和傳染力都明顯增強,呈明顯的選擇優(yōu)勢。4.2.3豬古典s11病毒與h32c病毒的基因重配1999年在美國的豬群中出現(xiàn)了一種新的H1N2病毒,這種病毒是流行于北美豬群中的豬古典H1N1病毒與1998年新發(fā)現(xiàn)的人-禽-豬三源重配的H3N2病毒發(fā)生基因重配的產(chǎn)物。其基因組成包括:HA、M、NP和NS基因來自古典H1N1病毒,NA、PB1基因來自于人H3N2病毒,PB2和PA基因來自禽流感病毒。4.2.4ha和三源基因重配2005年以來,北美豬群中出現(xiàn)三源基因重配的H1N1病毒,其中HA來源于人H1N1病毒,而內(nèi)部基因則與三源基因重配的H3N2病毒相同。4.3古典豬h2和ssv在中國豬群中的傳播實行亞洲國家豬流感病毒的研究報道主要來自于中國、日本和韓國。在日本流行的豬流感病毒主要是古典豬H1N1、類人H3N2和重配的H1N2病毒(與歐洲和北美的豬H1N2病毒在抗原和遺傳特性方面完全不同)。國際流感病毒學(xué)界一直關(guān)注流感病毒在豬體內(nèi)的進化分布,與其他烈性傳染病相比SIV對豬的致死率低,且具有自限性特點,因此長期以來國內(nèi)獸醫(yī)界對豬流感的關(guān)注明顯不足。關(guān)于我國的豬流感流行情況許多資料來源于香港的一些早期研究。在中國,早在1918年Chun等就報道了類似豬流感的癥狀。研究表明古典豬H1N1病毒和類人H3N2病毒是我國豬群中流行的主要亞型。20世紀80年代初和90年代中期,從供應(yīng)香港地區(qū)豬中分離到類禽H3N2病毒和類禽H1N1病毒(與歐洲豬群中的類禽H1N1病毒完全不同),但沒有造成流行。香港學(xué)者在80年代初從華南地區(qū)的供港豬中分離到3株基因重配的H3N2病毒,它們的HA和NA基因來自類人H3N2病毒,而內(nèi)部基因來自于古典豬H1N1病毒,但這種重配病毒沒有造成流行,對豬體的致病性也不清楚。1998年香港的學(xué)者又從大陸供港豬群中分離到禽源H9N2和類人H3N2病毒。1991年郭元吉等從北京某豬群中分離到豬古典H1N1病毒,這是在中國大陸關(guān)于SIV的首次報道。關(guān)于我國古典豬H1N1病毒的起源,郭元吉等根據(jù)HA基因分析,認為是從國外傳入的。根據(jù)資料記載,我國豬流感的發(fā)生最早可追溯到1918年,那年歐洲西班牙流感大流行波及到中國。Shortridge等證實在20世紀70年代古典豬H1N1病毒就存在于中國豬群中。長期以來SIV在我國學(xué)術(shù)界未引起足夠的重視,事實上古典豬H1N1流感病毒可能在我國豬群中長期存在。最近大陸的一些研究者也從豬體內(nèi)分離到禽源H9N2和H5N1病毒,但二者在我國豬群中的流行情況尚不清楚。2003-2006年間,我們運用分子流行病學(xué)方法對我國部分地區(qū)SIV的流行情況進行了研究,并對我國SIV的基因重配現(xiàn)象給予了特別關(guān)注。2004年我們從華東地區(qū)某豬場分離到3株基因重配的H1N2病毒,遺傳進化分析表明,NA基因與1995年流行于中國人群中的H3N2亞型病毒的NA基因同源性最高,而其它7個基因則與1993年~1994年流行于中國豬群中的古典豬H1N1亞型病毒的相應(yīng)基因同源性最高,在遺傳特性上不同于世界其它地區(qū)流行的H1N2病毒,是流感病毒在中國豬群中獨立重配事件的產(chǎn)物,這也是我國大陸關(guān)于SIV基因重配現(xiàn)象的首次報道。1990年代,在中國南方的豬群中發(fā)現(xiàn)起源于歐洲的重配H3N2病毒,最近,起源于北美的豬H1N2病毒和歐洲類禽H1N1病毒陸續(xù)在我國南方豬群中被發(fā)現(xiàn)。這些外來病毒可能是通過豬種引進、豬肉進口等商業(yè)行為引入到我國豬群中,雖然詳細的流行情況還不清楚,但顯示出在我國豬群中流感病毒出現(xiàn)了新情況,其分布和進化越來越復(fù)雜。5傳播給豬的事件豬對禽流感病毒和人流感病毒都易感,自然條件下經(jīng)常發(fā)生禽和人流感病毒傳播給豬的事件。越來越多的證據(jù)表明,這種種間傳播不僅僅是單向傳播,SIV也可反傳給人和禽,這種雙向傳播對于整個甲型流感的進化和人類公共衛(wèi)生都意義重大。5.1siv在非織造布上的傳播人流感病毒,特別是H3N2亞型病毒,經(jīng)常跨物種傳播給豬,豬成為人流感病毒的重要儲存庫和潛在傳染源。反過來,SIV在自然條件下也可以跨物種感染人,從這個意義上講,SIV也是一種值得重視的人獸共患病。自1974年以來,北美、歐洲和亞洲(香港)不時報道人感染豬流感病毒的事件,報道的50多份病例中大部分是由古典豬H1N1病毒引起的。流行病學(xué)調(diào)查顯示大多數(shù)感染者都有與豬的接觸史。所幸,這些SIV感染人的事件除了1976年美國“新澤西州”事件外,都未造成在人群中的傳播。臨床表現(xiàn)上,人感染SIV與感染季節(jié)性流感病毒難以區(qū)分,大部分可以自限性恢復(fù),但也有致死性后果。感染人的SIV類型包括:古典豬H1N1病毒,北美地區(qū)三源基因重配的H1N1、H1N2和H3N2病毒,歐洲類禽H1N1和重配的H3N2病毒等。在了解SIV全球流行特點的基礎(chǔ)上,回顧歷史上SIV感染人事件,對于研究當(dāng)下人群中流行的所謂新甲型H1N1病毒的起源、進化及其發(fā)展趨勢有重要的意義。5.1.1豬s11病毒的分離早在1958年,Kluska等從發(fā)病人體內(nèi)檢測到豬H1抗體,從血清學(xué)上表面豬H1病毒可以在自然條件下感染人。1974年Smith等從一死亡病例中分離到豬H1N1病毒,從病原學(xué)上首次證實SIV可以在自然條件下傳給人并引起嚴重疾病。1976年美國新澤西州的一名士兵死于古典H1N1病毒引起的肺炎,另有至少500人受到了感染。之后一直到2005年北美報道了多起古典H1N1病毒在自然條件下傳染給人的事件,有些同樣導(dǎo)致了致死性的后果。5.1.2siv感染病例從2005年12月到2009年2月間,美國疾病預(yù)防控制中心陸續(xù)檢測到11起人感染SIV病例(其中8例是2007年6月后發(fā)生的),流行病學(xué)調(diào)查顯示其中9例有豬暴露史,所有11例都治療后康復(fù)。病毒遺傳分析表明10例是三源基因重配的豬H1N1病毒感染,1例是三源基因重配的豬H1N2病毒感染。5.1.3人類感染病毒v11的病毒研究表明流行于歐洲豬群中的類禽H1N1病毒也可以傳染給人,并引起發(fā)病。5.1.4香港流感病毒的細胞檢測1993年在荷蘭兩個不同地方的患病兒童體內(nèi)分離到2株H3N2亞型病毒,遺傳性和抗原性分析表明,與分離自歐洲豬體內(nèi)的基因重配H3N2病毒關(guān)系最密切。由于這類病毒的內(nèi)部基因全部來自于禽流感病毒,因此這次事件受到更大關(guān)注。1999年,從香港一位患病兒童體內(nèi)也分離到抗原性和遺傳性相似的病毒。值得注意的是,大約自1987年以來,歐洲豬群中流行的類禽H1N1、H1N2和重配H3N2病毒由于M2蛋白31位氨基酸殘基由Ser突變?yōu)锳sp,因此對抗流感病毒藥物金剛烷胺有抗性,如果這些病毒獲得了在人群中的傳播能力,則防治難度會加大。事實上,目前引起人類流感大流行的新甲型H1N1病毒的M基因就來自于歐洲SIV,其M2蛋白同樣具有金剛烷胺抗性。最近加拿大報道了兩起人感染北美三源基因重配的H3N2病毒的病例,表明北美地區(qū)重配的豬H3N2病毒也可以自然感染人。5.1.5siv在基因來源及傳播情況上的差異2009年3月份以來,源于北美地區(qū)新流感疫情在全球傳播,迅速演變?yōu)樽?968年以來人類新的流感大流行,其病原是一種新的重配H1N1亞型病毒,其中PB2、PB1、PA、HA、NP和NS基因與北美三源重配的SIV同源,而NA和M基因則與歐洲類禽H1N1病毒同源。可見這種病毒是美洲基因重配的SIV和歐洲SIV通過基因重配后自然選擇的產(chǎn)物,從基因的早期來源看,包含有人、豬、禽流感病毒基因片段。但目前還沒有足夠證據(jù)能夠說明是在人體內(nèi)還是在豬體內(nèi)發(fā)生的重配。在掌握全球SIV流行動態(tài)的提前下,通過基因分析,我們認為新甲型H1N1流感病毒產(chǎn)生于豬體的可能性更大,是流感病毒在歐美豬群中長期進化的產(chǎn)物。在探究新甲型H1N1流感病毒的基因來源方面,近期國外文獻將歐洲(European)SIV稱為歐亞(Eurasian)SIV,我們認為這種提法并不科學(xué)。從地理分布上,禽類的流感病毒可以分為歐亞和美洲兩大系,但這種分法用于SIV并不準確。綜上所述,SIV具有地區(qū)特性,亞洲(包括我國)與歐洲的SIV在抗原特性和基因來源上并不相同,近年來傳入我國豬群中的歐洲SIV病毒也只是“舶來品”,其流行情況尚不清楚,也不能證實歐洲SIV是否已在我國豬群中形成優(yōu)勢流行株。我們認為糾正這一錯誤對于了解“甲型H1N1”病毒的來源具有重要意義,而那些此前認為來自中國豬群以及“實驗室創(chuàng)造”等說法都是沒有科學(xué)依據(jù)的臆測。5.2群中的類獸s1na和s12病毒傳播許多研究證實SIV可以反向傳給禽。在北美已報道了多起古典H1N1SIV傳播給火雞的事件。歐洲豬群中的類禽H1N1病毒也反傳給火雞,并引致發(fā)病。最近北美又報道了豬群中三源重配H3N2和H1N2病毒傳播給野鴨、火雞,并引起發(fā)病。SIV反傳給禽類,特別是野禽可能會加大SIV的傳播范圍,同時也增加了禽流感病毒的基因多樣性,促進了流感病毒在禽體內(nèi)的進化,但SIV能夠感染禽的詳細分子機制還不清楚。6我國siv的流行現(xiàn)狀豬流感病毒在世界各地的流行情況各不相同,遺傳背景多樣,具有明顯的地區(qū)性。長期以來,古典SIV的遺傳變異并不明顯,但歐洲和北美地區(qū)分別從1979年(類禽H1N1)和1998(三源重配H3N2)年開始,SIV的進化速度突然加快,且以基因重配作為主要進化方式。基因重配的病毒含有禽、豬和/或人病毒基因,具有明顯的選擇優(yōu)勢,傳播能力明顯加強。近年來北美地區(qū)發(fā)生了多起人-豬-禽三源基因重配的SIV(H1和H3亞型)感染人的事件,而這些SIV又為當(dāng)前人類流感大流行病原“甲型H1N1”病毒提供了大部分基因。我國豬群中流感病毒的流行情況及遺傳背景與歐美國家并不相同。我國豬群中流行的流感病毒主要是古典豬H1N1和類人H3N2病毒。雖然目前尚未在中國豬體內(nèi)發(fā)現(xiàn)有禽流感病毒參與的基因重配現(xiàn)象,但有證據(jù)顯示禽H1,H9和H5亞型病毒已經(jīng)感染了豬。此外,近年來北美的H1N2和歐洲類禽H1N1、H3N2SIV在我國豬群中的發(fā)現(xiàn),使我國SIV的流行情況更加復(fù)雜。不同亞型、不同宿主來源的流感病毒以及歐美SIV在中國豬群的存在,加之我國傳統(tǒng)的畜禽養(yǎng)殖模式都為新亞型或新基因型流感病毒的產(chǎn)生提供了機會,而這些新病