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文檔簡介
1、第三章 生物信息傳遞(上)王印王印制作第1頁第1頁DNA是遺傳信息貯存者,蘊藏于DNA遺傳信息傳遞到RNA分子,然后再傳給蛋白質,蛋白質是遺傳信息表示者,這就是遺傳信息流向中心法則,也是基因表示基本環節。王印制作第2頁第2頁王印制作第3頁第3頁主要內容一、RNA轉錄二、啟動子與轉錄啟始三、原核生物和真核生物mRNA特性比較四、終止與抗終止五、內含子剪接、編輯及化學修飾王印制作第4頁第4頁一、RNA轉錄王印制作第5頁第5頁一、RNA轉錄基因轉錄是基因表示第一步,也是最關鍵環節。一個基因能否表示關鍵往往是在轉錄階段。因此闡明轉錄分子機制是理解基因表示極為主要內容。王印制作第6頁第6頁一、RNA轉錄
2、基因表示完畢必須通過遺傳信息從DNA到RNA然后從RNA到蛋白質。RNA分子以DNA分子一條鏈為模板在依賴于DNARNA聚合酶催化下合成。依賴于DNARNA聚合酶也簡稱為RNA聚合酶。RNA分子合成被起始、被延長、被終止過程叫轉錄。 王印制作第7頁第7頁一、RNA轉錄轉錄是由RNA聚合酶催化、通過互補堿基配對來合成RNA反應。基因DNA總是以mRNA相一致(除了T和u之間差別外) 非模板鏈序列來表示。非模板鏈稱為故意義鏈,又稱為編碼鏈。合成RNA轉錄模板DNA稱為反義鏈或模板鏈。王印制作第8頁第8頁一、RNA轉錄1、基本過程王印制作第9頁第9頁一、RNA轉錄1、基本過程1、基本過程(1)模板辨
3、認:RNA聚合酶與啟動子DNA雙鏈互相作用并與之相結合過程。 原核基因中進行起始反應所必要所有序列稱為 “啟動子”。王印制作第10頁第10頁一、RNA轉錄1、基本過程(2)轉錄啟始:起始是RNA聚合酶結合到基因雙鏈DNA上,局部解鏈,使底物dNTP與模板鏈堿基進行配對。伴隨第一個核苷酸參入,起始階段結束。第一個核苷酸參入部位稱為起始位點。 王印制作第11頁第11頁一、RNA轉錄1、基本過程(3)延伸:是底物核苷酸共價加入到生長多核苷酸鏈3端,在解螺旋區域形成暫時 RNADNA雜合分子。聚合酶沿著DNA移動,一段短雙螺旋解開,使模板鏈不斷暴露出新單鏈部分。伴隨聚合酶向前移動,合成RNA從模板DN
4、A脫開,模板DNA又與故意義鏈配對成為雙鏈。 王印制作第12頁第12頁一、RNA轉錄1、基本過程(4)終止:包括辨認某一個終止位點,堿基不再加到鏈上,磷酸二酯鍵形成停止,轉錄復合物移動終止,酶和RNA脫離模板,DNA重新形成雙螺旋。 王印制作第13頁第13頁一、RNA轉錄1、基本過程大腸桿菌中依賴于DNARNA轉錄過程圖王印制作第14頁第14頁一、RNA轉錄1、基本過程大腸桿菌中依賴于DNARNA轉錄過程圖王印制作第15頁第15頁一、RNA轉錄2、轉錄機器主要成份王印制作第16頁第16頁一、RNA轉錄2、轉錄機器主要成份2、轉錄機器主要成份(1)RNA聚合酶(2)轉錄復合物王印制作第17頁第1
5、7頁一、RNA轉錄2、轉錄機器主要成份(1)RNA聚合酶:RNA聚合酶最基本活性是在RNA合成中指導底物同模板DNA堿基配對以及催化磷酸二酯鍵形成。當前研究得最透徹是大腸桿菌聚合酶。 王印制作第18頁第18頁一、RNA轉錄2、轉錄機器主要成份王印制作第19頁第19頁一、RNA轉錄2、轉錄機器主要成份王印制作第20頁第20頁一、RNA轉錄2、轉錄機器主要成份王印制作第21頁第21頁一、RNA轉錄3、RNA合成基本特性王印制作第22頁第22頁一、RNA轉錄3、RNA合成基本特性3、RNA合成基本特性(1)底物前體:RNA合成前體是4種5核糖核苷三磷酸(5ATP、GTP、CTP和UTP)。在聚合反應
6、中,一個 NTP3OH基因與第二個NTP5P發生聚合,形成磷酸二脂鍵,釋放出焦磷酸和自由能,從而推動反應向聚合方向進行。這與DNA合成中發生反應基本相同。 王印制作第23頁第23頁一、RNA轉錄3、RNA合成基本特性(2)模板:被轉錄DNA區域總呈雙鏈形式,但在任何特定區域中只有模板鏈(反義鏈)作為RNA合成模板。按堿基配正確原則,依托NTP與DNA上堿基配正確親和性被選擇。因此在轉錄區域內DNA雙鏈必須部分解鏈,形成模板鏈DNA與轉錄產物RNA部分雙鏈,伴隨轉錄向前推動,釋放出RNA,又恢復成雙鏈DNA。 王印制作第24頁第24頁一、RNA轉錄3、RNA合成基本特性(3)RNA合成方向:新合
7、成RNA鏈總是按5-3方向進行延伸。底物5-NTP總是加到新生鏈3-OH末端,與DNA聚合反應鏈延伸方向相同。RNA鏈5-3合成方向與模板DNA方向總是反向平行。 王印制作第25頁第25頁二、啟動子與轉錄啟始王印制作第26頁第26頁二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子王印制作第27頁第27頁二、啟動子與轉錄啟始1、開啟子:開啟子是一段特定直接與RNA聚合酶及其轉錄因子相結合、決定基因轉錄起始是否DNA序列。不同開啟子對RNA聚合酶親和力不同,所結合反式作用因子(trans-acting factors)也不同,因此,基因轉錄活性也很不相同。 王印制作第28頁第28頁二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子典型
8、原核啟動子有四大要素 :轉錄起始位點,-10區,-35區和-10區與-35區之間間隔。 原核基因轉錄起始位點通常是嘌呤,其序列為CAT(A為起始位點)。-10區是一個6堿基保守序列(常以-10為中心)。T80A95t45A60A50T96,有助于DNA解鏈。-35區是另一個6堿基保守序列(常以-35為中心)。T82T84G78A65C54a45研究表明,當-10區和-35區中心位置相距16-18bp時,該啟動子功效較強;相距較近或較遠時,起始轉錄功效都相應削弱。 王印制作第29頁第29頁二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子王印制作第30頁第30頁二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子王印制作第31頁第31頁
9、二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子真核基因開啟子 :真核生物有3類RNA聚合酶,負責轉錄3類不同開啟子。王印制作第32頁第32頁二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子王印制作第33頁第33頁二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子由RNA聚合酶I負責轉錄rRNA基因,啟動子(I類)比較單一,由轉錄起始位點附近兩部分序列構成。第一部分是關鍵啟動子(core promoter),由-45+20位核苷酸構成,單獨存在時就足以起始轉錄。另一部分由-170-107位序列構成,稱為上游調控元件,能有效地增強轉錄效率。 王印制作第34頁第34頁二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子王印制作第35頁第35頁二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子由
10、RNA聚合酶II負責轉錄II類基因包括所有蛋白質編碼基因和部分snRNA基因,后者啟動子結構與III類基因啟動子中第三種類型相同,編碼蛋白質II類基因啟動子在結構上有共同保守序列。轉錄起始位點沒有廣泛序列同源性,但第一個堿基為腺嘌呤,而兩側是嘧啶堿基。這個區域被稱為起始子(initiator, Inr)。王印制作第36頁第36頁二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子由RNA聚合酶負責轉錄是5SrRNA、tRNA和一些核內小分子RNA(snRNA),其啟動子(類)構成較復雜,又可被分為三個亞類。兩類5S rRNA和tRNA基因啟動子是內部啟動子(internal promoter),位于轉錄起始位點下游,都由兩部分構成。第三類啟動子由三個部分構成,位于轉錄起始位點上游。 王印制作第37頁第37頁二、啟動子與轉錄啟始1、啟動子王印制作第38頁第38頁王印制作第39頁第39頁課堂測驗單號同窗原座位作測驗,其它同窗安靜離開教室靜王印制作第40頁第40頁課堂測驗課堂測驗規則:最高10分,最低1分,作弊0-n分,請假中間分數,未來(沒請假)0分。準備好后作下列試題,每人只作1題,如答錯題只計1分,多答無效。所有為簡答題。作完后親自交給我并馬上離開教室。
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