1、For For 2009s2009s Doctors Doctors BioMacroMolecular InterActionologyBiommialogy生物生物分子相互作用學分子相互作用學Proteins, ProteomicsProteins, ProteomicsRNAs, RNomicsRNAs, RNomicsLipids, LipomicsLipids, LipomicsBiomoleculars and its interaction生物分子及其相互作用生物分子及其相互作用Others, Otheomics Others, Otheomics DNAs, GenomicsD

2、NAs, GenomicsSaccharides, SacchariomicsSaccharides, SacchariomicsFigure 12.3916S rRNA in E. coli1542 nt, 90 loop21 proteinRibosomemRNA+tRNA+rRNA+ProteinCollagen- 1()CNCollagen- 1() in glomerular basement membranePoly(Gly-Pro-Pro) in tropocollagenPoly(Gly-Pro-Pro) in tropocollagen GPPGPPGPGPPGPPGPGPP

3、GPPPPC CH HC CN NO OH HH HC CC CO ON NH HC CC CO ON NH HHO來自于日常生活的啟示來自于日常生活的啟示-1門的啟示門的啟示A AB BC CE E在一個相對獨立的功能體中，各種活動性功能組件往往是后來在一個相對獨立的功能體中，各種活動性功能組件往往是后來逐步加上去或加工完成的。逐步加上去或加工完成的。功能體上的每一個關鍵組件所處的位置，以及各位置之間的相功能體上的每一個關鍵組件所處的位置，以及各位置之間的相互關系是高度協調的，合理的，與整個的功能體的功能的發揮互關系是高度協調的，合理的，與整個的功能體的功能的發揮相一致。相一致。功能體上的關

4、鍵組件是隨環境變化，不斷向前發展變化的。功能體上的關鍵組件是隨環境變化，不斷向前發展變化的。D DNHCHCH2CH2CH2NHCNHNHCO(Adenosine diphosphate ribose)NHCHCH2SCOADP-ADP-ribosylation ribosylation of Gof Gssby cholera toxin.by cholera toxin.N NH HC CH HC CH H2 2C CH H2 2C CH H2 2C CH H2 2N NH H3 3+C CO ON NH HC CH HC CH H2 2C CH H2 2C CH H2 2C CH H2

5、2N NH H2 2+C CO OC CH H3 3N NH HC CH HC CH H2 2C CH H2 2C CH H2 2C CH H2 2N NH H+C CO OC CH H3 3H H3 3C CN NH HC CH HC CH H2 2C CH H2 2C CH H2 2C CH H2 2N N+C CO OC CH H3 3H H3 3C CC CH H3 3N NH HC CH HC CH H2 2C CH H2 2C CH H2 2C CH H2 2N NH HC CO OC CC CH H3 3O OLysine -HydroxylysineN-Acetyllysine

6、HydroxylaseAcyltransferase -N-Methyllysine Methylase -N,N-Dimethyllysine -N,N,N-Trimethyllysine MethylaseMethylaseModification of LysineN NH HC CH HC CH H2 2C CH H2 2C CH HC CH H2 2N NH H2 2C CO OH HO ON NH HC CH HC CH H2 2C CH H2 2C CH HC CH H2 2N NH H3 3+C CO OH HO OFigure 1.5-CH3-CH3-CH3-CH3methy

7、lationCpG islandcoding region來自于日常生活的啟示來自于日常生活的啟示-2目的地、方向指示與信號辨認目的地、方向指示與信號辨認共同規則的制定、遵守與維護共同規則的制定、遵守與維護違規現象與規則修改違規現象與規則修改信號燈的啟示信號燈的啟示Cell signal transduction web975319753來自于日常生活的啟示來自于日常生活的啟示-3汽車修理工具：扳手與套筒的啟汽車修理工具：扳手與套筒的啟示示A AB BC CF FGGHHJ JI IL LKKNNMMD DE E扳手：傳力器扳手：傳力器/信號轉導信號轉導各種形式的套筒接頭，一種特殊形式的扳手的

8、一部分，克服各種形式的套筒接頭，一種特殊形式的扳手的一部分，克服空間位阻障礙，使許多不可能的過程變為可能，化繁為簡?？臻g位阻障礙，使許多不可能的過程變為可能，化繁為簡。PPPPPPPPY579Y581Y716Y740Y751Y771Y1009Y1021P85SrcGrb2GAPPLC SH-PTP-2PDGF- (platelet derived growth factor )receptorKinase insert domainKinase domainGrb2：AdapterGAP：GTPase activating proteinPLC ：PLC gammaSH-PTP-2：Phosp

9、hatase-2P85：PI3K subunitSrc：KinaseFor examplesSH3SH3SH3SH3SH3SH2SH2SH2SH2SH2SH2SH1, tyrosine kinasePhospholipase CPhospholipase CGTPase activating proteinSrcGrb2GAPPLC 1 1 ME 1 ME AIAKAIAKY Y* *D DF F* *KATADDKATADDE E* *LSFKRGDILKVLNEECDQNLSFKRGDILKVLNEECDQN 36 36 WW* *YKAELNGKDGFIYKAELNGKDGFIP P*

10、*KNKNY Y* *IEIE MKPHMKPH PWFFGKIPRAKAPWFFGKIPRAKA 71 71 EEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDV106 106 QHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVS0 0R R143 143 NQQIFLR NQQIFLR DIEQVPQQPTDIEQVPQQPT YVQALYVQALF F* *D DF F* *DPQEDGDPQEDGE E* *

11、LGFRRGLGFRRG181 181 DFIHVMDNSDPNDFIHVMDNSDPNWW* *WKGACHGQTGMFWKGACHGQTGMFP P* *RNRNY Y* *VTPVTP VNRNVVNRNV Primary structure of Grb2 proteinSH3-3SH3-2SH2+73-5459-149160-212+2* proline-rich ligand binding siteMKPHPWFFGKIPRAKAEEMLSKQRHDGAFLIRESESAPGDFSLSVKFGNDVQHFKVLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYHRSTSVSRNQQI

12、FLRDIEQVP Tertiary structure of SH2MKPHPWFFGKIPR67AKAEEMLSKQRHDGAFLIR86ESESAPGDFSLSVKFGNDVQH107F108K109VLRDGAGKYFLWVVKFNSLNELVDYH135RSTSVSRNQQIFLRDIEQVP R67R86H107K109pTyr binding pocket F108H135unique binding pocket structural and functional integrationCHP: calcineurin homologous proteinCHP: calcin

13、eurin homologous proteinPIP2: phosphatidylinositol 4,5-bisphosphatePIP2: phosphatidylinositol 4,5-bisphosphateROCK1: Rho kinase 1ROCK1: Rho kinase 1ERM: ezrin, radixin or moesin ERM: ezrin, radixin or moesin p90RSK: p90-ribosomal protein S6 kinase p90RSK: p90-ribosomal protein S6 kinase NIK: Nck-int

14、eracting kinaseNIK: Nck-interacting kinaseCaM: calmodulinCaM: calmodulinHsp70: heat shock pritein 70 Hsp70: heat shock pritein 70 CAII: carbonic anhydrase II CAII: carbonic anhydrase II Na+/H+ exchanger isoform 1 (NHE1)14-3-3: serin binding protein14-3-3: serin binding proteinEzrinEzrin、FascinFascin

15、和和NGALNGAL在細胞中的定位及其功能聯系在細胞中的定位及其功能聯系EzrinEzrin主要在細胞膜蛋白主要在細胞膜蛋白CD44與細胞骨架微絲與細胞骨架微絲F-Actin之間發揮一種連之間發揮一種連接蛋白的作用接蛋白的作用FascinFascin主要在細胞骨架微絲主要在細胞骨架微絲F-Actin之間發揮一種連接捆綁蛋白的作用之間發揮一種連接捆綁蛋白的作用NGALNGAL，一種分泌性蛋白，具有保護基質金屬蛋白酶，一種分泌性蛋白，具有保護基質金屬蛋白酶MMP9MMP9的活性，促的活性，促進細胞外基質降解的功能，同時還與細胞骨架的重組有某種關聯。進細胞外基質降解的功能，同時還與細胞骨架的重組有某

16、種關聯。9 91. J Histochem Cytochem, 2006,54:889-96 (IF 2.45)2. Int J Cancer. 2009,124(11):2549-58. (IF 4.69)3. J Biol Chem, 2009,284:7995-8004 (IF 5.52)李恩民課李恩民課題組論文題組論文EzrinEzrin與食管癌發生發展相關，部分實驗證據與食管癌發生發展相關，部分實驗證據307例例下游靶基因表達下游靶基因表達mRNA水平水平下游靶基因表達下游靶基因表達蛋白水平蛋白水平Smad2/3通路通路生存期生存期組織表達組織表達細胞表達細胞表達獨立的預后不良判定因

17、子獨立的預后不良判定因子RNA干擾干擾克隆形成能力克隆形成能力分裂增殖能力分裂增殖能力裸鼠成瘤能力裸鼠成瘤能力裸鼠瘤重裸鼠瘤重移動能力移動能力侵襲能力侵襲能力黏附能力黏附能力MMP2/MMP9活性活性癌癌正常正常Cyr61Cyr61EzrinEzrin克隆數下降克隆數下降移動能力下降移動能力下降侵襲能力下降侵襲能力下降EzrinEzrin激活激活Smad2/3Smad2/3，上調，上調Cyr61Cyr61，一種細胞分裂增殖、侵襲轉移相關基因的實驗證據一種細胞分裂增殖、侵襲轉移相關基因的實驗證據敲降敲降Cyr61Cyr61李恩民課題組李恩民課題組. Int J Cancer. 2009,124(

18、11):2549-58. (IF 4.69)李恩民課題組李恩民課題組, , J Biol Chem, 2009,284:7995-8004 (IF 5.52)李恩民課題組李恩民課題組, , Int J Cancer, 2009,124:2549-58 (IF 4.69)李恩民課題組李恩民課題組, , J Histochem Cytochem, 2006,54:889-96 (IF 2.45)Ezrin部分主要結論主要結論：1. Ezrin在食管癌中顯著異常過表達，與食管癌細胞的增殖、侵襲移動、在食管癌中顯著異常過表達，與食管癌細胞的增殖、侵襲移動、淋巴結轉移，以及患者的生存期縮短等密切相關，是

19、獨立的預后不淋巴結轉移，以及患者的生存期縮短等密切相關，是獨立的預后不良判定因子。良判定因子。2. Ezrin的異常表達處于食管癌由早期階段向中晚期階段發展過渡的關的異常表達處于食管癌由早期階段向中晚期階段發展過渡的關鍵環節上，發揮著承上啟下的作用，通過激活鍵環節上，發揮著承上啟下的作用，通過激活Smad2/3和和 -catenin信信號通路，促使下游的號通路，促使下游的MMP2、MMP9、CTGF和和Cyr61等腫瘤侵襲轉等腫瘤侵襲轉移相關基因上調表達，可能會形成多個正反饋調控環，介導著食管移相關基因上調表達，可能會形成多個正反饋調控環，介導著食管癌的侵襲轉移發展。癌的侵襲轉移發展。101029Summary about function and regulation of ezrin in ESCCTGF-beta