1、應(yīng)用全外顯子組對(duì)CNS畸形胎兒病例的研究【研究對(duì)象】一般臨床資料范圍平均值孕婦年齡(歲)20-42妊娠周期(w)12-37產(chǎn)前診斷指征樣本類型例數(shù)中樞神經(jīng)系統(tǒng)異常臍血樣本119羊水樣本4絨毛樣本2合計(jì)125研究平臺(tái)：IlluminaHiseq2500研究目標(biāo)：檢測(cè)SNPindel等突變情況研究結(jié)果：(1) 概況:CNS奇形胎兒病例強(qiáng)陽(yáng)性病例數(shù)強(qiáng)陽(yáng)性率弱陽(yáng)性病例數(shù)弱陽(yáng)性率陰性病例數(shù)陰性率17%83%2520%備注突變的危害程度最高，基因型-表型之間關(guān)系明確蛋白預(yù)測(cè)該突變有害，突變的生物學(xué)意義傾向于陽(yáng)性，但基因型與表型的關(guān)系尚不明確，可結(jié)合家系分析或一代測(cè)序進(jìn)一步明確。通過MAF過濾等分析手段就可

2、判斷該突變?yōu)槎嚯摹?2) 強(qiáng)陽(yáng)性突變樣本癥狀基因核酸改變MAF雜合純合相關(guān)性說明疾病名稱P5471左側(cè)腦室增寬，小腦發(fā)育異常C5orf42>A(E27)雜合無義突變可能會(huì)導(dǎo)致蛋白翻譯提前終止Joubert氏綜合征17型AR>A(E16)雜合蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)為有害矢變P5845右側(cè)腦室擴(kuò)張變形，室管膜出血GRN>T(E8)雜合蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)為有害矢變泛素陽(yáng)性包涵體性額葉退化，ADP4489雙側(cè)腦積PIEZO2>A(E11雜合蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)MARDEN-WAL水)為有害矢變KE略合征，ADP5718左側(cè)腦積水，雙足內(nèi)翻PITX1>A(E1)0雜合蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)為有害矢變先天性畸

3、形足，ADEBP>C(E2)雜合蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)為有害矢變ConradiHunermann-Happle綜合征，XDP4533月并服體發(fā)育不全，小腦異常FREM1>A雜合蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)為有害矢變?nèi)穷^畸形2型ADJM103B月并服體發(fā)育不全，雙手雙足重疊指趾，握拳FGFR2>C0雜合有疾病相關(guān)報(bào)道JacksonWelss顱縫早閉綜合征ERCC27364T>C0雜合mRNA剪接可能會(huì)受影響腦頜骨綜合征2型.(3) 各組CNSW例強(qiáng)陽(yáng)性檢出率比較：?jiǎn)我籆NS奇形病例強(qiáng)陽(yáng)檢出率：8%(7/87)單一CNS奇形合并顱外畸形病例強(qiáng)陽(yáng)性檢出率：%(4/56%)復(fù)雜CNS奇形病例強(qiáng)陽(yáng)性檢出

4、率：%(7/46)1和2無統(tǒng)計(jì)差異，3和1,、3和2有顯著差異(4) CNS奇形胎兒病例其致病基因變異的遺傳模式具有多樣性：AD%(9/17);AR%(7/17);XD%(2/17);未知(2/17);(5) CNS奇形胎兒病例其致病的變異類型具有高度復(fù)雜性：強(qiáng)陽(yáng)性病例中，新發(fā)突變共11個(gè)(無rs號(hào))，占全部突變的50%病例之間多數(shù)為共享致病基因，卻不共享突變位點(diǎn)，占全部突變的而是同時(shí)合并多個(gè)多數(shù)病例不是表現(xiàn)為單一致病基因變異和單一變異位點(diǎn),致病基因變異或多個(gè)致病位點(diǎn)突變，從而合并多種疾病。（6）CNS奇形胎兒病例所對(duì)應(yīng)的疾病具有極高罕見性：突變的MAF®均在小數(shù)點(diǎn)后至少3位數(shù)（），

5、50嘛突變無MAF®收錄，并且病例的臨床特征高度異質(zhì)性，提示CNS奇形病例的產(chǎn)前診斷和遺傳咨詢的難度系數(shù)大，適合臨床應(yīng)用外顯子組測(cè)序技術(shù)進(jìn)行全譜基因篩查和診斷。病例分享：【1】孕婦吳XX孕29+,超聲提示胎兒右側(cè)腦積水，胎兒頭顱MRI提示腦干發(fā)育不良；染色體微陣列分析結(jié)果：未檢出致病性拷貝數(shù)變異（AffymetrixCytoScanHD芯片）。WES吉果：基因核酸改變MAF雜合/純合與疾病相關(guān)性相關(guān)性說明疾病名稱C5orf42>A(E27)雜合較局無義矢變可能會(huì)導(dǎo)致蛋白翻譯提前終止Joubert氏綜合征17型.AR>A(E16)雜合可能相關(guān)蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)為有害矢變Joube

6、rt氏綜合征17型：常染色體隱性遺傳，眼球運(yùn)動(dòng)受限；發(fā)作性過度換氣；呼吸模式異常；多指畸形（一些）；并指畸形（一些）；多趾畸形（一些）；整體發(fā)育遲緩，共濟(jì)失調(diào)；腦部核磁共振顯示磨牙征；腦積水；小腦蚓部發(fā)育不良。【2】孕婦林XXG2P0A1孕13W早孕期超聲提示：NT,枕后淋巴管瘤孕晚期超聲提示：做側(cè)腦室增寬（11mm胎兒染色體核型結(jié)果：46XY；染色體微陣列分析結(jié)果：1號(hào)染色體單親二倍體（UPD外顯子測(cè)序結(jié)果："TGPSM基因Sanger測(cè)序驗(yàn)證父親：11號(hào)外顯子“T雜合突變；母親：11號(hào)外顯子野生型；胎兒：11號(hào)外顯子“T純合突變；【3】孕婦孫XXG1P0孕28+,超聲提示胎兒Da

7、ndy-Walker畸形，功能性單心房室（右心房室），肺動(dòng)脈狹窄，雙上腔靜脈，無脾，胃泡反應(yīng)，考慮右側(cè)異構(gòu)綜合征。胎兒染色體核型結(jié)果：46XY；外顯子組測(cè)序分析結(jié)果：基因核酸改變MAF雜合/純合與疾病相關(guān)性相關(guān)性說明疾病名稱DNAH11IVS17-1G>A0純合較局突變?cè)诮?jīng)典剪切位點(diǎn)上原發(fā)性纖毛運(yùn)動(dòng)障礙7型，AR原發(fā)性纖毛運(yùn)動(dòng)障礙7型（伴或不伴內(nèi)臟異位）；AR由于纖毛運(yùn)動(dòng)受損導(dǎo)致反復(fù)呼吸道感染反復(fù)，精神運(yùn)動(dòng)發(fā)育遲緩，支氣管擴(kuò)張，男性生育能力仍然完好，纖毛顯示剛性和運(yùn)動(dòng)過度的軸絲跳動(dòng)。小結(jié)：1.外顯子組測(cè)序技術(shù)再產(chǎn)前診斷CNS畸形胎兒病例中能夠顯著提高檢出率，額外檢出強(qiáng)陽(yáng)性率至少達(dá)能夠可靠檢出SNPIndel以及低水平CNV變異的嵌合體;畸形胎兒病例其致病基因變異的遺傳模式具有多樣性；畸形胎兒病例其致病基因的變