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5、.代序二. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .作者導讀 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .112447第一章1.41.5歷史餅圖和線圖的霍亂傳染之謎. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .的玫瑰圖 . . . . . . . .

6、 . . . . . . . . . . . . . . . . .拿破侖的俄羅斯遠征 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .小結與開始 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .11111317第二章工具選擇作圖工具 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .R語言簡介安裝R語言. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

7、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .第三章3.13.2細節par()函數的參數詳解 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .plot()及相關函數的參數說明 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2122303334343638第四章4.1元素顏色 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ..24.1.3固定顏色選擇函數. . .

8、 . . . . . . . . . . . . . . . . .顏色生成和轉換函數 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .特定顏色主題調色板 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .I4.1.4漸變色的簡單原理及應用. . . . . . . . . . . . . . . .4043444850525354.8點 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .曲線、直線、線段、箭頭、X-樣條 .

9、 . . . . . . . . . . . . . .矩形、多邊形 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .網格線 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .標題、任意文本、周邊文本 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .圖例 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

10、. . . . . . . . . . . . . . . .坐標軸59596367717374778084878889919598100103105108110111113116118第五章4圖庫 直方圖莖葉圖箱線圖條形圖散點圖關聯圖. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

11、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .條件密度圖 . . . . . . . . . . . . . . .

12、 . . . . . . . . . . . . . .等高圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .條件分割圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .一元函數曲線圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Cleveland點圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .顏色等高圖 . . . . . . .

13、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .四瓣圖顏色圖矩陣圖. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .馬賽克圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .散點圖

14、矩陣 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .三維因素效應圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .坐標軸須 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .平滑散點圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

15、. . . . . .棘狀圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .星狀圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .帶狀圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .II5.255.265.275.285.295.305.315.325.335.345.355.365.375.385.39向日葵散點圖 . . . . . . . . . . . . .

16、 . . . . . . . . . . . . . .符號圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .餅圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .熱圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .交互效應圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .圖 . . .

17、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .生存函數圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .120122125128128128131133135136138139139139139分類與回歸. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .小提琴圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .地圖 . . . . . .

18、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .臉譜圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .平行坐標圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .調和曲線圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .二元箱線圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

19、. . . .習題 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .第六章系統網格圖形 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .lattice圖形 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .ggplot2圖形 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .141141142142143

20、143144144144144144144144145145145145第七章模型線性回歸模型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .方差分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .非參數回歸模型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7.3.1局部回歸散點平滑法. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

21、 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7.107.11穩健回歸模型廣義線性模型分類數據模型和列聯表 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .混合效應模型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .主成分分析和因子分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .聚類分析判別分析對應分析

22、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .III47.157.16標度分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .時間序列模型 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

23、 . . . . . . . .生存分析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .空間統計學 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .145145146146146146146146學習 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .數據挖掘和分類與回歸樹 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Bootstrap.

24、 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .機. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .支持第八章8.1數據離散數據147147147147148148148148148148148148. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ..2一維數據 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .數據 . . . . . . . . . . . . .

25、. . . . . . . . . . . . .8.2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .連續數據.28.2.3一維數據二維數據數據. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8.3. . . . . . . . . . . . . . .

26、. . . . . . . . . . . . . . .混合數據.28.3.3. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .一維數據二維數據數據附錄 AA.1149149149153154157158160160161161程序初步對象類型A.1.1. . . . . . . . . . . . . . . . . . .

27、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .A.1.2A.1.3A.1.4A.1.5因子. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .數組和矩陣. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .數據框和列表 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .函數. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

28、. . . . . . .A.2操作方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .A.2.1A.2.2選擇與循環. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .輸入與輸出. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .A.3習題 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .IV附錄 BB.1B.216316316516516516617017

29、0170171171174174174作圖技巧添加數學公式 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .一頁多圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .B.2.1B.2.2B.2.3設置圖形參數 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .設置圖形版面 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .拆分設備屏幕 . . . . . . . . . . . . . .

30、 . . . . . . . . .B.3交互操作 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .B.3.1B.3.2B.3.3獲取鼠標位置的坐標識別鼠標附近的數據響應鼠標鍵盤的動作. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .B.4分類變量散點圖示 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .B.4

31、.1B.4.2向日葵散點圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .隨機打散方法 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .B.5. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .圖形設備附錄 C177統計動畫附錄 DD.1D.2本書R包函數說明數據說明179179180. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

32、 . . . . . . . . . . . . . . . . . .181參考文獻189索引VVI插圖1.41.5William Playfair的時序線圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .William Playfair的餅圖(史上第一幅餅圖) . . . . . . . . . .23568John Snow的霍亂傳染探索圖 . . . . . . . . . . . . . . . .Florence Nightingale的極坐標面積圖 . . . . . . . . . . . . . .Charles Joseph M

33、inard的拿破侖遠征圖 . . . . . . . . . . . . .2.1正態分布密度曲線及其5%到95%分位數區間表示 . . . . . . .3.4參數adj、mgp、tcl和ljoin設置演示 . . . . . . . . . . . . . . . .其它主要參數的效果演示:bty,font,las,family等 . . . . .圖形的各種區域說明 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .plot()作圖的九種樣式 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

34、. .2324283RColorBrewer所有調色板顏色的演示 . . . . . . . . . . .414244454749515456New Haven地區的年均氣溫(1912) . . . . . . . . .點的類型:pch參數取值從0到25及其它符號 . . . . . . . . . .鳶尾花的花瓣長寬散點圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .曲線、直線、直線段、箭頭的展示說明 . . . . . . . . . . . . .X-樣條各種形狀的展示 . . . . .

35、. . . . . . . . . . . . . . . . .多邊形和矩形結合使用的一個巧妙圖示 . . . . . . . . . . . . .添加標題、任意文本和周邊文本的一個演示 . . . . . . . . . .出口額雙坐標軸圖示 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .噴泉間隔時間直方圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .直方圖與密度曲線的結合 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .世界各地大陸塊面積莖葉圖 . .

36、. . . . . . . . . . . . . . . . .606164VII45.255.265.275.285.295.305.315.325.335.345.355.36泊松分布隨機數莖葉圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .各種殺蟲劑下昆蟲數目的箱線圖 . . . . . . . . . . . . . . . . .箱線圖的凹槽與統計推斷 . . . . . . . . .

37、. . . . . . . . . . . .率數據條形圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .半透明散點圖中的規律 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .眼睛顏色與頭發顏色的關聯圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . .航天飛機O型環在不同溫度下失效的條件密度圖 . . . . . . . .網格數據的示意圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .65697072757678808182858789909296979

38、9101104106107109111112114117119121123126127129中國31地區和高學歷人數密度等高圖 . . . . . .圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .預期與等高圖對應的三維經緯度條件分割圖 . . . . . . . . . . . . .給定震源深圖的函數f (x) = sin(cos(x) exp(x/2)的曲線圖 . . . . . . . . .率數據的Cleveland點圖 . . . . . . . . . . . . .新西蘭Maunga Whau火山高度數據顏色等高圖 . . . . . . . .加

39、州伯克利分校錄取數據四瓣圖 . . . . . . . . . . . . . . . . .顏色圖中色塊與數值的對應關系 . . . . . . . . . . . . . . . . .新西蘭Maunga Whau火山高度數據顏色圖 . . . . . . . . . . .用矩陣圖畫出的一系列正弦曲線 . . . . . . . . . . . . . . . . .乘客生存數據馬賽克圖 . . . . . . . . . . . . . . .鳶尾花數據的散點圖矩陣 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .新西蘭Maunga Whau火山的三維

40、圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .向三維圖中添加圖形元素的展示經紗斷裂數據的因素效應圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .帶坐標軸須的噴泉間隔時間密度曲線圖 . . . . . . . . . . . . .BinormCircle數據的平滑散點圖 . . . . . . . . . . . . . . . .航天飛機O型環在不同溫度下失效的棘狀圖 . . . . . . . . . .Motor Trend雜志1974年汽車數據的星狀圖 . . . . . . . . . . .各種殺

41、蟲劑下昆蟲數目的帶狀圖 . . . . . . . . . . . . . . . . .鳶尾花花瓣長和寬的向日葵散點圖 . . . . . . . . . . . . . . .符號圖提供的六種基本符號 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .中國31地區五大素質特征分布溫度計圖 . . . . . . . . . .各類餡餅銷售數據的餅圖 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .噴泉間隔時間的正態分布圖 . . . . . . . . . . . . . . . . .VIII5.375.385.395.40生存函

42、數圖 . . . . . . . . . . . . . . .131134135137急性髓細胞白血病. . . . . . . . . . . . . . . . . .脊椎矯正手術結果的分類三組雙峰數據的小提琴圖比較 . . . . . . . . . . . . . . . . . .2005年世界各國農業競爭力地圖 . . . . . . . . . . . . .B.1B.2B.3B.4B.5B.6正態分布密度函數公式的表示 . . . . . . . . . . . . . . . . . .函數layout()的版面設置示意圖 . . . . . . . . . . . . .

43、 . . . . .回歸模型中邊際分布的展示 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .拆分作圖設備屏幕區域的示例 . . . . . . . . . . . . . . . . . .鼠標在圖形窗口中移動的效果圖 . . . . . . . . . . . . . . . . .分類變量的散點圖示方法示例 . . . . . . . . . . . . . . . . . .164166167169172173IXX表格5.1二維列聯表的經典形式 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93XIXII序言代序一代序

44、二作者導讀我們“一圖勝千言”,然而現實情況是我們了解的圖形種類太少、使用的作圖工具缺乏靈活性,這在很大程度上制約了統計圖形的發展,使得統計圖形在數據分析中應有的潛力沒有被充分挖掘出來,正是這樣的背景催生了本書的寫作。本書根據統計圖形制作的需要,將所有內容分為七章:第一選擇性回顧歷史上的四幅著名統計圖形,在欣賞前人智慧的基礎上說明統計圖形在生活的各個方面所能體現的價值;第二章圖形工具,本書主要以R軟件為制圖工具,因此本章也會關于R語言的一些基礎知識;第三章詳細圖形參數,用以對圖形進行細節調整,若讀者對圖形細節要求不高則可直接跳過這一章;第四章講解基礎圖形元素的使用,包括點、線、多邊形、顏色和文本

45、等,本章會給那些期望能自定義統計圖形的讀者提供方便的解決方案;第五章是本書的一大,集中講解現有的統計圖形種類如直方圖、條形圖、莖葉圖、餅圖、箱線圖等,此外還會引入若干較特殊和不太常見的圖形種類和數據圖示方法,并且配以相應的統計數據分析實例深入說明統計圖形的用法和含義;第六章基礎圖形系統(base graphics)之外的其它圖形系統如grid、lattice和ggplot2,第七第八章對各種統計圖形分別從模型方法和數據類型的角度給出一些實例并作出歸納總結,以便讓讀者清楚區分統計圖形運用的條件和場合;附錄中i給出了一些作圖方面的技巧。本書的所有圖形文件和程序代碼可以從作者的個人主頁(http:/

46、/cn/publication/),另外本書也配有相應的R包MSG(Xie, 2010b),使用說明參見附錄D。閱讀本書過程中若有任何疑問請作者:。關于本書中R程序代碼,記號說明如下:> 表示一段R程序的開始;在R中可以用options(prompt = > )設置程序行的起始符號,默認為“> ”;后文中只要遇到這個標記,則說明該標記之后的程序語句可以直接在R中運行(讀者在運行書中的示例時不要把這個符號也敲進命令行中)+ 續行符;當一段程序在某一行中沒有完整時,就會折到下一行,此時R會以“+”表示程序語句上整,正在繼續n 其中“n

47、”表示一個整數,中括號括上一個整數表示R程序輸出的行號,比如1表示這是第1行輸出# 表示R程序注釋,即的“標記”)被執行的語句(只是為了增強程序的可讀性而做另外,本書R代碼以等寬斜體排版,代碼中帶有程序起始符以及續行符,左側以數字標出行號,例:>>+plot(x, y)plot(cumsum(rnorm(80), type = "l", col = "blue", xlab = "Step", ylab = "Brownian Motion")123代碼的輸出以等寬正體排版,左側不帶行號提示,例:>

48、;>>library(MSG)data(PlantCounts) summary(lm(counts 12altitude, PlantCounts)3Call:lm(formula = counts altitude, data = PlantCounts)Residuals: Min1Q Median3QMax 6.4965.79-27.63 -10.27-3.78iiCoefficients:Estimate (Intercept) -26.6722Std. Error6.45290.0111tvalue-4.137.37Pr(>|t|) 4.1e-055.6e-13*

49、altitude-0.0816Signif. codes:0 '*'0.001'*' 0.01'*' 0.05'.' 0.1 ' ' 1Residual standard error: 15.3 Multiple R-squared: 0.0833,on 598 degrees of freedom Adjusted R-squared: 0.0818F-statistic: 54.4 on 1 and 598 DF,p-value: 5.61e-13正文中的代碼以等寬正體表示,如“inline R code”,函

50、數名稱以斜體表示,如“function()”,對象類名稱和參數名稱用無襯線字體表示,如“class using sans serif”,R程序包用粗體表示,如“package”。本書以LATEX結合R(Sweave,參見Leisch (2002))寫成,所有圖形均為R代碼動態生成,因此整本書稿具有可重復性(reproducible),讀者可從網上書稿源代碼并配合適當的工具編譯生成本書稿。習慣了閱讀Word書稿的讀者可能對本書的圖表排版有所不適,因為圖表看似與正文脫離,即:圖/表不一定緊接著出現在正文中提到該圖/表的位置,這是因為LATEX排版哲學是讓讀者專注于閱讀正文,而圖表為陪襯,因此讀者在

51、閱讀本書時,請以正文為主,如果正文提到圖表時,再按序號去找相應的內容。在日知錄有一句話:“形而上者謂之道,形與下者謂之器。”對本書來講,統計作圖的(計算機)技術本身即為“器”,而數據處理以及統計圖形的靈活應用則為“道”。本書的寫作目的正是希望能夠基于“器”的練習和啟發,讓讀者在統計數據處理和分析中真正得“道”,使統計圖形在數據的探索分析中發揮探案般的功效。于愛荷華州立大學統計系2010年7月iiiiv第一章歷史“這易如反掌,”他說,“我看到你左腳穿的鞋的內側,也就是爐火剛好照到的地方,皮面上有六道幾乎平行的劃痕。顯然, 這些劃痕是有人為了去掉沾在鞋跟上的泥疙瘩,極其粗心大意地順著鞋跟刮泥而造成

52、的。因此,現在你就明白了我得出的這兩個推斷:其一,你曾經在惡劣的天氣外出過;其二,你穿的皮靴上面的特別難看的劃痕是的女傭所為。至于你開業行醫,這么說吧,如果一位先生走進房間,身上帶有碘的氣味,右手食指上有硝酸銀腐蝕的黑斑,黑色大禮帽的右側鼓起一塊,那里面藏著聽診器,而我不斷言他是醫務界的一位活躍不是太遲鈍了嗎?”,那我波希米亞統計圖形的意義在于引導我們觀察到統計數據中的信息。用著名統計學家John Tukey的話來講,就是“圖形的最大價值就是使我們注意到我們從來沒有料到過的信息”(The greatest value of a picture is when it forces us to notice what we never expected to see)。從這個意義上講,統計圖形的重要性自然不言而喻。在統計圖形歷史上,能夠達到“揭示人們不曾料到的信息”這種高度的圖形并不多,那么這里我們首先欣賞四幅前人創造出的名垂青史的統計圖形。1.1餅圖和線圖都是餅圖和線圖的中常用的統計圖形,它們是由有著“統計圖形奠基人”之稱的蘇格蘭工程師兼政治學家William Playfair發明的。12第一章歷史圖 1.1: Playfair (1786)繪制的線圖。這幅圖主要展示了1700年至1780英格蘭

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