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文檔簡介
1、提RNA,可是電泳后什么條帶都沒有,用的是REDzol,是因為細胞太少了還是別的什么原因,在加了氯仿后沒有出現3層,只有沉淀和上清,是不是因為加氯仿到離心隔的時間太久了?參考見解:1、 樣品量太??;2、 操作時沒有嚴格按照提RNA的要求做,一般需要帶手套,最好帶上口罩,所有塑料用品需要用DEPC處理并高壓,要在超凈臺上操作,盡量不讓外源的RNA酶降解RNA。3、 RNA電泳的電泳液和膠必須現配現用,并且要用DEPC處理,電泳槽、制膠板先用蒸餾水洗滌然后用75的酒精處理,還有,要單獨一個槽子跑,不要和其他膠一起跑。跑膠時間控制在10分鐘左右。4、 在加了氯仿后沒有出現3層,只有沉淀和上清,可能是
2、加的氯仿量不合適,一般是按0.2ml氯仿/mlTrizol加氯仿的。從加氯仿到離心隔的時間對這個應該沒有影響。5、 在提完RNA后可以測OD值,如果OD值在1.8-2.0之間,說明提的RNA比較純。RNA提取可不可以不用DEPC處理,多次滅菌(而不是長時間滅菌)也可以比較有效地滅活RNAse,這種方法確實可行嗎?參考見解:DEPC主要目的是防止RNA酶,其實還有很多其他的方法處理器皿的,如氯仿沖洗,NaOH處理,高溫烘烤等另外兩次滅菌也可以代替DEPC處理.提RNA的關鍵在于:防止內源性或外源性RNase降解RNA對付外源性RNase有兩種辦法:能烤者烤,能泡者泡。比起其他的核酸實驗來說,就多
3、這么一步。其二、RNase分子內部存在二硫鍵,一般條件變性后很快即可復性,所以極為穩定;而且其作用條件“簡單、快捷”與絕大多數DNase不同,不需要二價陽離子即可迅速發揮酶切作用。所以,要想長期保存RNA標本,DEPC處理溶液、Tip頭等都是必不可少的。RNase一般高壓不能滅活,如果不用DEPC的話,快速提取,快速使用,不能貯藏。3個關于乙醇單詞:ethanol;alcohol;mercaptoethanol,他們的主要區別是什么,可以互相代替嗎?參考見解:ethanol是乙醇的專業名詞,是用在醫學,工業等方面,主要是指工業酒精。alcohol也是乙醇,酒精的意思,但是主要是用在飲食行業的名
4、詞。mercaptoethanol 是巰基乙醇,不同于前兩種,是另外一種物質,是一種還原劑。RNA提取中DNA是怎么去掉的?在哪一步呢?參考見解:在加入氯仿離心吸取上清的時候,注意不要吸到中間層。一般都要用DNase處理,即使吸不到中間層,也可能有DNA污染。組織已經低溫保存了一年多了,用來提RNA可以嗎?參考見解:液氮中保存應該可以,但如果是在-70C低溫冰箱中則可能降解,建議在液氮中保存時盡量將組織塊切小,最好直徑在1CM之內,有利于保存并方便下一步RNA提取操作。當然如果條件允許,可以將組織塊放入RNAlater后低溫保存,只要普通冰箱即可,方便且效果很好。提取血細胞的RNA,但血凝很快
5、,應該注意什么問題?是不是要加EDTA?用什么方法會更好?參考見解: 全血提DNA或RNA要用抗凝血,可以用醫院里采血管,里面已經加了抗凝劑,或是自己配EDTA、ACD等來抗凝。EDTA抗凝用2.5%的溶液,與血液之間體積比一般是1:10 。ACD配方:單結晶水檸檬酸 (分子量210.1) 8.0g,檸檬酸三鈉(分子量 294.1) 22.0g,單結晶水D-葡萄糖 (分子量 198.2)24.5g,順次溶于蒸餾水中,定容至1000ml,過濾除菌。分裝后20C保存??鼓昧馨图毎蛛x液分離,得到單核細胞后,再加入trizol等提取RNA,步驟可按試劑盒操作進行。如果不分離單核細胞,血里面的紅
6、細胞對提取有影響,把紅細胞破壞掉也可以。采用淋巴細胞分離液分離外周血中的有核細胞,經細胞裂解液處理,上清提取RNA,沉淀提取 DNA,用分離液分離所得紅細胞沉淀制備血紅蛋白溶液。本法能從少量外周血中同時分離 RNA、DNA 及血紅蛋白,高效易操作,值得推廣。怎樣能更有效的降低材料的降解?參考見解:1、 新鮮細胞:如果試劑沒有問題,且外源性污染也可以排除,那么降解幾乎都來自裂解液的用量不足。如?果將裂解液直接加入培養皿中裂解細胞,一定要使裂解液能覆蓋住細胞。 2、 新鮮組織:某些富含內源核酸酶的樣品(如肝臟,胸腺等),即使使用電動勻漿器勻漿也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮條件下將組
7、織研碎,并且勻漿時使用更多裂解液。3、 冷凍樣品:樣品取材后應立即置于液氮中速凍,然后移至-70冰箱保存。樣品決不能未經液氮速凍而直接保存于-70冰箱中。冷凍樣品,即使是冷凍細胞,如果不在液氮條件下研磨碎,而直接加入裂解液中勻漿,RNA也比新鮮樣品更容易降解。樣品在與裂解液充分接觸前決不能出現融化,所以研磨用具必須預冷,在碾磨過程中要及時補充液氮。樣品研碎后,在液氮剛剛揮發完時,將樣品迅速轉移到含裂解液的容器中,立即混勻勻漿。4、 外源RNA酶的污染:試劑,器械及實驗環境中的RNA酶進入實驗系統。5、 內源RNA酶的污染:抑制劑失效或者用量不夠,實驗樣品過多;勻漿時溫度過高。OD260/OD2
8、80比值偏低?參考見解:1、 蛋白質污染:確保不要吸入中間層及有機相。減少起始樣品量,確保裂解完全、徹底。加入氯仿后首先要充分混勻,并且離心分層的離心力和時間要足夠。如果所得RNA的OD260/OD280比值偏低,則用氯仿重新抽提一次,再沉淀,溶解。2、 苯酚殘留:確保不要吸入中間層及有機相。加入氯仿后首先要充分混勻,并且離心分層的離心力和時間要足夠。3、 多糖或多酚的殘留:一些特殊的組織和植物中,多糖、多酚含量較多,這些殘留也會導致OD260/OD280比值偏低。因此,從這類材料中提取RNA時,需要注意多糖、多酚雜質的去除。4、 設備限制:測定OD260及OD280數值時,要使OD260讀數在0.1-0.5之間。此范圍線性最好。用水稀釋樣品:測OD值時,對照及樣品稀釋液請使用10mM Tris,pH7.5。用水作為稀釋液將導致比值偏低。RNA提取得率低?參考見解:1、 該組織或者細
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