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文檔簡介
15I本文件按照GB/T1.1—2020《標準化工作導則第1部分:標準化文件的結構和起草規則》的規定1SNP標記法鑒定油莎豆種質資源、品種和純度技術規程GB/T3543.2農作物種子檢驗規程扦樣GB/T3543.4農作物種子檢驗規程3.1SNP標記singlenucleotide3.2種質資源和品種鑒定中優先選用的一套SNP引物,其3.3品種在DNA分子標記基因分型方面一致的程度,用供檢樣品中本品種2從樣品中隨機抽取10粒塊莖發苗。分單株剪取0.1g幼苗葉片用液氮研磨成粉末。將研磨粉末轉入2mL離心管,加入0.7mLCTAB提取緩沖液充分混勻。在55℃~65℃恒浴1h。加入0.7mL氯仿:異戊醇(24:1),上下輕搖5min。10000×g,室溫下離心10min。取上清液,加入上清液三分之冷異丙醇,上下輕搖5min,-20℃冰箱放置30min。10000×g,4℃離心10min。注:以上為推薦用于種質資源和品種鑒定的DNA提取方法,其他能夠達到PCR擴增質量要求的DNA提取方法都適用于4.2PCR擴增72℃延伸45s,30個循環,72℃10m4.3基因分型檢測),4,4數據分析與判定——差異位點數≥3,判定為不同品種;對利用附錄A中73組引物仍未檢測到≥3個差異位點數的樣品,必要時可增加篩選引物進3品種純度計算公式:品種純度%=(供檢種子粒數4AACATGTCCCGGACTTTGCTAACTGCAGATGGGAGCATTAGAATCATTCCACAACTGGACTTTGACCAAATCCACAAAAGCTGAGTCCAATTGGGAGTTTGTTGAAATCAAGTGAGCAAGGCTACATCGTCCTCGTCGTAGATCAGTGAGAGAACTTTGCCTTACCATTAACATCTCGATCAGGGGTAGATGGTGAATTTAGATGCCGACCATACACAACATCATTGCAAGCAGAAACCGCTGAGAACTGGTACACAGAAAGAGCTCCCAGAAGCAAAAGGAAAACAGCCATCTGCAGACCCAATACCATTACGCAGAAGAAATGGGTCTAGCAGAAACCAATGGATGGATGAGGAAAGAACAAGCACAATCATCCGACCTCTAGTCCAGCGTTTATTATGCTCACTTCAATATGCGGTGAGGAT5AGATCATGGCAGAGTGGCTTTAACCGGACTAAAATAAGGGCAGGGAAGGAAAGAGTGAACATTTGTTCTTTACTCAGGCCTATGAACACTACGCATTGTGCAATTAGGGAGGAAGCCTGTCAAAGAGTCGGTGGTCTCTCTCTCAAATGTAAGCTTTTGACAAACCAGATATCCCTGACTCGTTCACATGCATGCAGAAGATGATGAGAGGAAATGCAGCTTTGCTATGATCATATTGTGATGGCAGCTGCAGGAGGAAACGTGATGACATTAACACCTCCAAGAGATCCACTTCAGTCGATAAAACAAGAGCATGGGGAATGTATCTGCACAA6AATCCAAATCTACTGCAGCGAAACTGTGATTCGATCTGTCACAATCCAAATCTACTGCAGCGAAAGAACTGTGATTCGATCTGTCACATGGGGAATGTATCTGCACAAAATAACCCATCCGAACCTAGCATTATTAGGGTTGTTGCTTGCTGGATACCACCATTGGAACCATACATCCTGAGGAATGGTTCTGACACTGAAGTGCCTCCAAACACTAAGCCAAATAGTGCTCGATCTGAAGGTTGAGAGACGTTTGAACAGTGGAGAGCGCCTTTTTATA7TCAATGTTATTTTCTGATATGTTCTCGGGCTAGTGAAACTTATGCAACGGTGGACCTAACTACATGATATATT[T/C]AGATAAGGGTTAAGCTAATTGAACCCCAAACTTTCCCCGGACTTGTACCCCGCAAAATTTCCATAATTCTCCAAAAAAGAAATTGTGCAAAGATCAATAATTTTATTTGAAATTAAGCATTTCGCTAAAAAAAAAA[A/T]ACAAATAATTTTTTTTTTTTGATTCATTGTGCTAATTATATATACTTCCAGAAAATAACACCACGAGTATCTAAACAGCTCGGAGGCTACACAGAAAAGCCGGCTAAATCTGTTTCCATGGAGAGATACAACA[G/A]ATCTTTAGCCAAGGTACTTACTTTCTTTTGTATAAACAACACTCGGATCATTGAAGTGAATCTACATAAATA8TCTATGTGCTGCAGTAAACTGAAATCTGGGACCCAGTCAAATACTCAATACAGACTGAGAATGTAACAA[T/C]TAGATCTGATTGTGTAAAATTGATCTGAGTTTGTACTATAGATGCTATGGACAGATATTCTATGGAAGCATCTGATCGTACGATATACTTGAAATTTAGAGAACGTGGTAACTCTGGGATAGCACATCAGCTTCC[A/G]TAATATTTAGTTCTCTAAGACCAAGGAGACTGTAGCCGGTAATGACTTTAGAGATTTTGCATTTTG8TCCAATTGAAGCCATCGCTGGTCGAGGCATTTACTATGCTATTCGCTGACCGGAAGGCTCTGCAAAGTG[T/C]GCCACTGGAGATGGAGATAACTCGGAAGATCGTTGTGAATTGAGGTTCATTTGTGCCTGAGCAGTTGTCATCCCTCCATATCCTCTGCAGCGCTGCACTGTGTAGGGCGAAATTTGAACTCATCTTGAGATCTGT[G/T]CTTGCTCAATCTTGAGATGATCTAACGGTTCACGCGCTACACAGTGCAGCGCTACAGAGGATGAG2TGAAATTTTAAGCTTCATCAGAAATTATTGTACCCCCTGGTCATGAGTCTAGCTAGCGTTCCTGCAAACATGT[T/G]AGCCAAAAAATGTTAACCCATGATCAATATATGCAGATCTAATTTTAGTTTTGCCGGTAAACGTAGAT2CTGTGAAGGAACTGCAGGATGAGAAGAATTAAGCAGCCAGATGGTATAAACGTACTGGCCAGACTTGAAACAG[C/T]GCTCACCCCATATGCAAATTAAACACCATTATTTGATATTGATTTTTCTGGACTTCTCATTCAAA5GTTCCACCTTATCTGCATTTGTCAGGTCATTGAATTTTTCCTCGAATGCTGAGGAAACGACTCGGGCTG[G/T]AAGAATTTTAGCAGGCTGAACATCTCGCCAAGGTTGTTCTGCAGGGGTGTCCCCGTCAATAAAACCCGC0GGCAGGGGATTAGGAAACTCGACGAATGGGTATTCGATTGGACTATTGGTATGAATGAGCAACACATT[G/GGA]GAAAGAAGAATATTCATACACTGCAAATCTAGAGTTCACACTTGATAGTTGATACAGATGTAAAA83TCCCCGCGGCTAGTTTGCAGCGCCAAGGTGCCCGTCCTTCACCATACACAACAAAGCAAGCTCCTTGCA[T/C]GACGTCCACCTCTAGGATCCCAGCAACGCACATCGTTGCTCCGCAAAGCAGTCCCTGCCACCTCGTCAAGTGATGCCAGTATAGGAACAGTATGTTCCATGAATACAAGTGATTCGTTTTGTTGTTATCTGCATTGTAA[C/A]GAAGGCGTTCTTAATTAGTAATTCTCGTATAAGAATATAATTACAAAAATTAAGATTTGTGAAAC3AGTGCGAGATGTACTCTTGCGTGCACTCCTCTGACATGCCACAGCAGGTGCACCCTCCACTTCTGATAT[A/G]GAGCTGAGTTTTGTCGACTCCTTCGCCTCCTTGCTCAAAAGAGAGGTCGGAAAGAGCCCGATGACTGAGAAGAGTTTAACGGTAGATTTACGCACCGCTGTTCAATGGTCAAGGTGCTGATTGAGCGGAGAGG[C/T]GGTGAGCTCACCGAGGCTCTTCAGAGAACCCCGACTGGAATTCTCAAGAAGCGCAGGGCACTATT1TCTTCAGGCAGCTGACACAGTCCCAAATCGACTACATGAATGACATCAGGAGCTGATCTACAACTACTG[T/C]TATGACACCAAGAGATTCAACGGCGCCATGAGTGCTACCTCCCTGCTTACTGATAAAGGCATGGT2CTTTATACCCTTTACAGCTTGTTCCTAATTAAATGAACTTTACCGATTCGATATCTATTCGTCTCTTAG[C/T]TGTCCCCAATTACAACCTTCCCTCTCCCCAATTTCTTTTATCTATATTATTTAAATGGAATAATTCAACAGCAACTATGCATGTGTGTTCTGTTCTCTTAATTAATTAATTAATGCTAATAATATAATATAATCTAC[T/C]CTAGCTAGCAAGCTGATGGAGCTGTTCAACCTTTTTGAACATAACAGCTAGGCCTAGGCCTAGGCATGGC6CAGAATTTTTTTCTTCTCATTTTGTTTTGGGAACATTTTCTTTTCCACCCTTTTAAAATTAAATGCACT[C/A]AAGTTCTCCTCTGAAACTTTCTAAAGCTGAAATTTCTTGACCAGATATAATTCAAACATAATAGC8CTAGTAACTTAATTAATCTTCAACATTTCAAGAAAACCGGGGAAAGCAAAATTTCACTGAATGATCCAATTGC[C/T]ATGCAAGTAACTAACACCTTCGAGCAACTGAGCCGCTTAACTTCGCTCGAGCTGAAGGGCTTAAT3GATTGGATTTCTGCAGGTAAACTGTTACAATCATCACCATCCGAGTCAGCTTTACCCATTTGCCTGGCC[G/A]GCAATGGACCGATATTAATGAATTTGCATCTGATTTGCTGAAAACCTTGACTTATGTTGAAAAGATGCGAAAGCGCTCCTACATGTTTTCCCTTTGACATTCGATTTCGGTCCCACCTTGCAAACCAAAGTCCACAACGCA[G/A]TCGCACCGTTGTACGAACCTCTGACCTCAACCACGAGCAGCAGCTCGCTCTCCTCCTCGACTCCGAGCTTGTGGCTATATATTTAATTAGGAGCTCCCCGGGAGCTTTGGCTGTCTGGAAAGAAAACCGCAGGC[A/G]TTTGAAATATCAACTTCTCTTCTTTTTCACTTGTATGGTGTTTAACTCCTGCTGAAGGCACAATGCTAG2CGAAAACACGCGGCAATTTCAAAATCGAGTTTGCTCGGCTAACCCCATCCAGAGCACATTCTTCTTCTTTCAG[C/G]CCATCATTCCTTGCTTCCTTAACTGCAGT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