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文檔簡介
第39章細胞代謝與基因調控10/16/20231細胞代謝生命活動的基礎物質代謝能量代謝信息代謝新陳代謝:完整、統一的過程復雜的調節機制10/16/20232物質代謝一覽生命:代謝的正常運轉維持生命有限空間:同時有那么多復雜的代謝途徑在運轉必須有靈巧而嚴密的調節機制使代謝適應外界環境的變化與生物自身生長發育的需要調節失靈→代謝障礙,出現病態甚至危及生命漫長生物進化歷程:機體結構、代謝和生理功能越來越復雜代謝調節機制也隨之更為復雜。10/16/20233一、細胞代謝的調節網絡TCA:糖、脂肪和蛋白質三大物質互相轉化的樞紐物質代謝---聯系---轉化(一)代謝途徑交叉形成網絡關鍵代謝物:G-6-P,丙酮酸、乙酰輔酶A10/16/202341、糖代謝與蛋白質代謝的相互關系糖代謝:提供碳源和能源(Pr合成)10/16/202351)糖→非必需AA,但不能合成必需AA2)蛋白質→AA,生糖AA→α-酮酸→糖(多數)AA脫氨→丙酮酸,糖原異生,糖(生糖AA)10/16/2023610/16/202372、脂類代謝與蛋白質代謝的關系脂類分解產生較多的能量→體內貯藏能量的物質脂類與蛋白質之間可以相互轉化10/16/202383、糖代謝與脂類代謝的關系饑餓:與糖尿病類似的情況10/16/202394、核酸代謝與糖、脂肪及蛋白質代謝的關系Gly、Asp、Gln嘌呤、嘧啶AMP輔酶、組氨酸等蛋白酶核苷酸、核酸的合成蛋白因子核苷酸、核酸的合成10/16/20231010/16/202311(二)代謝的單向性和多酶系統1.相對立的單向反應(opposingunidirectionalreaction):2.糖代謝的例子:3.脂代謝的例子:10/16/202312(三)代謝與能量:NADPH、ATP、構造單元綠色植物、光合細菌:光合作用利用太陽能其他生物:有機物分解代謝的化學能
氧化分解釋放能量→ATP(能量的貯存、傳遞)→需能過程1、ATP:通用的能量載體ATPADP+Pi太陽能化學能生物合成細胞運動膜運輸10/16/2023132、NADPH以還原力形式攜帶能量還原性有機物分解代謝氧化產物NADPH+H+NADP+還原性生物合成產物還原性生物合成反應氧化前體通過NADPH循環將還原力由分解代謝→生物合成NADPH:生物合成中的良好還原劑產生:光反應、磷酸戊糖途徑、線粒體乙酰CoA的輸出10/16/2023143、代謝的基本要略:形成ATP、還原力和構造單元用于生物合成在存在NADPH、ATP、各種構造單元的基礎上,進行生物合成10/16/202315大分子降解成基本結構單位(構造單元)構造單元形成共同的中間產物(如丙酮酸、乙酰CoA等),產生NADPH、ATP中間物進入TCA,徹底氧化H2O、CO2,產生大量ATP10/16/202316二、代謝調節代謝調節的四級水平:
酶水平調節細胞水平調節激素水平調節神經水平調節多細胞整體水平調節代謝反應:酶控制酶的生物合成和活性:機體調節自身代謝和重要措施酶水平調節是最根本、最基礎的調節10/16/202317(一)酶水平的調節酶水平調節酶活性調節(酶結構調節)變(別)構調節快速調節(微調)酶合成的誘導與阻遏長期調節(粗調節)酶含量調節
(基因表達水平調節)化學修飾調節酶的降解反義核酸的調節別構調節:別構效應物引起酶分子構象變化而引起活力改變10/16/202318別構效應物別構激活劑——別構激活(正別構)——增加活性別構抑制劑——別構抑制(負別構)——降低活性底物、產物或ATP、ADP、AMP等10/16/20231910/16/202320代謝物別構中心活性中心反饋調節中酶活性調節的機制10/16/2023211、酶的別構效應
酶活性的前饋和反饋調節前饋(feedforward)、反饋(feedback)底物、代謝產物對代謝過程的調節作用正作用:反應物使代謝過程速度加快的作用。負作用:反應物使代謝過程速度變慢的作用。10/16/2023221)前饋作用代謝途徑中前面的底物對其后某一催化反應的調節酶的作用(1)前饋激活(feedforwardactivation)(2)前饋抑制(feedforwardinhibition)10/16/2023232)反饋作用代謝產物對前面的某一酶有作用(1)反饋激活(feedbackactivation)(2)反饋抑制(feedbackinhibition)A一價或單價反饋抑制(monovalentfeedbackinhibition)10/16/202324B二價或多價反饋抑制(divalentormultivalentfeedbackinhibition)B1同工酶調節LysMetIle合成時的反饋抑制B2順序反饋抑制芳香族氨基酸合成10/16/202325B3協同反饋抑制Lys、Thr的合成B4累積反饋抑制谷氨酰胺合成酶:受各終產物的累積反饋抑制10/16/202326葡萄糖丙酮酸羧化酶乙酰CoA磷酸烯醇式丙酮酸1,6-二磷酸果糖草酰乙酸
-酮戊二酸擰檬酸天冬氨酸氨基酸蛋白質嘧啶核苷酸核酸氨甲酰天冬氨酸——+++磷酸烯醇式丙酮酸羧化反應的調節控制10/16/202327氨基酸合成的反饋調控反硝化作用氧化亞氮氨甲酰磷酸分支酸脫氧庚酮糖酸-7-磷酸天冬氨酸天冬氨酰磷酸赤蘚糖-4-磷酸脫氫奎尼酸莽草酸谷氨酸磷酸烯醇式丙酮酸+預苯酸TryPheTrpIleTrpHisCTPAMPGlnLysMetThr酮丁酸GlyAla谷氨酰胺合酶天冬氨酰半醛高絲氨酸氨基苯甲酸10/16/2023282、產能反應與需能反應的調節細胞能量狀態指標0.85~0.95能荷<0.85,產能(分解)代謝加強能荷>0.95,貯能(合成)代謝加強10/16/202329丙酮酸
G細胞液檸檬酸乙酰CoA檸檬酸草酰乙酸-酮戊二酸乙酰CoA丙酮酸線粒體
G-6-PF-6-PF-1.6-2P
磷酸果糖激酶PEPADP+PiATPADP+PiATP
NADH
O2ATP
ADP+PiAMP+ATP2ADP
PiPi
PEP羧激酶+++---++----
己糖激酶
丙酮酸脫氫酶
檸檬酸合成酶-酮戊二酸
脫氫酶糖酵解與TCA途徑的調節10/16/2023303、酶的共價修飾和級聯系統1)共價修飾(covalentmodification):酶蛋白肽鏈上的基團可與某種化學基團發生可逆的共價結合,從而改變酶的活性,這種改變酶活性的調節方式~(1)共價修飾調節酶:通過共價修飾調節活性的酶(2)共價修飾的類型:磷酸化/去磷酸化(最常見),乙酰化/去乙?;佘挣;?去腺苷?;?,尿苷酰化/去尿苷?;谆?去甲基化,氧化(S-S)/還原(2SH)10/16/20233110/16/202332(3)特點修飾過程,酶活性在無活性(低活性)與有活性(高活性)兩種狀態中互變共價修飾互變由不同的酶催化
快速調節激素信號啟動的共價修飾會引起級聯放大效應10/16/202333糖原磷酸化酶和糖原合成酶活性的調節10/16/202334受共價修飾調節的酶酶來源改變反應對酶活力的影響糖原磷酸化酶真核細胞磷酸化/脫磷酸化+/-磷酸化酶b激酶哺乳類磷酸化/脫磷酸化+/-糖原合成酶真核細胞磷酸化/脫磷酸化-/+丙酮酸脫氫酶真核細胞磷酸化/脫磷酸化-/+谷氨酰胺合成酶原核細胞(大腸桿菌)腺苷?;?脫腺苷?;?/+10/16/2023352)級聯系統(cascadesystem):連鎖代謝反應中一個酶被激活后,連續地發生其它酶被激活,導致原始信號的放大——級聯系統。腎上腺素→膜受體,效應器活化,引發一系列胞內連鎖反應10/16/202336意義:由于酶的共價修飾反應是酶促反應,只要有少量信號分子(如激素)存在,即可通過加速這種酶促反應,而使大量的另一種酶發生化學修飾,從而獲得放大效應。這種調節方式快速、效率極高。10/16/202337cAMP激活蛋白激酶的作用機理10/16/2023384、酶原與酶原激活酶原:某些酶的無活性前體蛋白(如不是酶,蛋白原)酶原激活:無活性的酶原形成活性酶的過程實質:活性中心的形成或暴露過程常見形式:切下一段多余的肽段10/16/2023391)為什么胃蛋白酶存在前體胃蛋白酶原?2)酶原為什么大多是蛋白酶原?3)為什么唾液淀粉酶不存在唾液淀粉酶原?10/16/202340胃蛋白酶原的激活10/16/20234110/16/202342胰蛋白酶原的激活及其功能胰蛋白酶原六肽腸激酶胰蛋白酶胰凝乳蛋白酶原胰凝乳蛋白酶彈性蛋白酶原彈性蛋白酶羧肽酶原羧肽酶水解ArgLys羧基形成的肽鍵10/16/202343三、代謝的區域化細胞結構對代謝途徑的分隔控制調節(一)細胞結構與酶的空間分布酶定位的區域化10/16/202344細胞質:酵解;磷戊糖途徑;糖原合成;脂肪酸合成;線粒體:丙酮酸氧化;三羧酸循環;
-氧化;呼吸鏈電子傳遞;氧化磷酸化細胞核:核酸合成內質網:蛋白質合成;磷脂合成10/16/202345(二)細胞膜結構對代謝的調節和控制作用
控制濃度梯度
膜的基本功能:物質運輸、能量轉換、信息傳遞與離子、電位梯度的產生、控制有關質子梯度:合成ATPNa+梯度:運輸AA、糖
Ga2+:細胞內信使10/16/202346控制細胞和細胞器的物質運輸內膜系統對代謝途徑的分隔作用通過底物、產物的運輸調節代謝
G代謝限速步驟:G進入肌肉、脂肪細胞的運輸胰島素可促進G主動運輸,降低血糖膜與酶的可逆結合分隔區;濃集酶、輔因子防止反應間互相干擾,有利于對不同區域代謝的調控某些酶與膜可逆結合而改變性質(雙關酶)離子、代謝物、激素等都可改變其狀態發揮迅速、靈敏的調節作用10/16/202347(三)蛋白質的定位和壽命控制1、蛋白質的定位控制
信號肽(分泌蛋白導引至細胞外的信號肽)分泌蛋白、膜蛋白、溶酶體蛋白必須先進入內質網分泌蛋白完全通過內質網膜,膜蛋白的羧基固定在膜中導肽(胞內運輸導引信號肽)線粒體、葉綠體等的蛋白,先翻譯后跨膜運輸,需要導肽通常位于氨基端,富含堿性、羥基AA,,易形成兩性α-螺旋可通過內外膜的接觸點穿越膜需能過程,跨膜電位為運輸提供能量,蛋白解折疊需ATP
不同的導肽含不同信息,可將蛋白送入線粒體不同部位10/16/2023482、蛋白質壽命的控制隨細胞內外環境改變選擇性降解系統,需ATP供能,活化泛肽
泛肽分布廣泛,結構保守標記需要降解的蛋白質,使水解酶能識別并攻擊蛋白10/16/202349四、激素調節和跨膜信號轉導1、含氮激素作用模式2、甾醇類激素作用模式10/16/202350
ATP
cAMP+PPi內在蛋白質的磷酸化作用改變細胞的生理過程細胞膜細胞膜cR蛋白激酶(無活性)c+RcATP蛋白激酶(有活性)受體環化酶激素G蛋白肽類激素通過cAMP-蛋白激酶調節代謝示意圖10/16/202351甾醇類激素作用原理10/16/202352五、基因表達的調控中心法則(thecentraldogma):(一)基因表達1、基因表達(geneexpression):基因轉錄及翻譯的過程rRNA、tRNA的合成10/16/2023532、基因表達的時空特異性
(temporalandspatialspecificity)Hb(hemoglobin)
α珠蛋白基因簇:ζ(胚胎型)、αβ珠蛋白基因簇:
ε(胚胎型)、γ(胎兒型)、β、δζ2ε2→α2γ2→α2β2時間特異性(temporalspecificity)某一基因的表達嚴格按特定的時間順序發生10/16/202354空間特異性(spatialspecificity)在個體生長全過程,某種基因產物在個體按不同組織空間順序出現同形異位盒基因(homeobox):高度保守的一段核苷酸序列(180bp),控制胚胎發育的基因同形異位現象(homeosis):果蠅頭部長觸角部位長出腳來10/16/2023553、基因表達的方式1)組成型表達(constitutive
gene
expression)
個體發育的任一階段都能在大多數細胞中持續進行的基因表達。其基因表達產物通常是對生命過程必需的或必不可少的,且較少受環境因素的影響持家基因(housekeeping
gene)看家基因(housrkeepinggenes)表達連續、不受調控機體結構蛋白、TCA的代謝酶等10/16/2023562)誘導和阻遏表達DNA損傷→修復酶基因激活乳糖→利用乳糖的三種酶表達誘導(induction):在特定環境因素刺激下,基因被激活,從而使基因的表達產物增加。這類基因稱為可誘導基因10/16/202357阻遏(repression):在特定環境因素刺激下,基因被抑制,從而使基因的表達產物減少。這類基因稱為可阻遏基因色氨酸—色氨酸合成酶系10/16/2023584、基因表達調控的環節——多級調控轉錄水平:轉錄前、轉錄、轉錄后翻譯水平:翻譯、翻譯后10/16/2023595、基因表達調控的生物學意義適應環境、維持生長和增殖維持個體發育與分化10/16/202360(二)原核和真核基因組基因(gene):DNA分子中的最小功能單位RNA(tRNA、rRNA)(蛋白質編碼的)結構基因(無轉錄產物的)調節基因10/16/202361基因組(genome):某一特定生物單倍體所含的全體基因原核細胞:“染色體”DNA分子包含一個基因組真核細胞:一套單倍染色體的的全部基因10/16/202362(三)原核生物基因表達的調控:轉錄水平
研究意義:為探索更復雜的真核細胞基因表達調控機制提供重要線索對基因工程重要的指導意義轉錄水平的調控(controloftranscription)翻譯水平的調控(controloftranslation)10/16/2023631、轉錄水平的調控1)影響轉錄的因素(1)啟動子(promoter):能被RNA聚合酶識別、結合并啟動基因轉錄的一段DNA序列A、決定轉錄方向及模板鏈B、決定轉錄效率三個功能區:啟始部位(+1區)、結合部位(-10區)、
識別部位(-35區)10/16/202364(2)σ因子:識別基因的啟動子,控制轉錄時序σ70:識別大多數基因的啟動子σ32:識別熱休克誘導基因的啟動子,控制熱休克蛋白(heatshockprotein,Hsp)基因表達10/16/202365(3)阻遏蛋白與激活蛋白:調控轉錄阻遏蛋白(repressiveprotein):與操縱子結合后能減弱或阻止其調控基因轉錄的調控蛋白介導的調控方式:負性調控(negativeregulation),抑制轉錄;激活蛋白(activatingprotein):與操縱子結合后能增強或起動調控基因轉錄的調控蛋白介導的調控方式:正性調控(positiveregulation)促進轉錄。10/16/202366位于結構基因上游前導區具有終止子結構的短序列通過前導序列轉錄產生的mRNA形成類似于終止子的二級結構達到終止轉錄的目的。(4)弱化子(attenuator)10/16/2023672)轉錄的調控機制(1)乳糖操縱子調控的機制A、操縱子模型的提出FrancoisJacob(1920-)JacqucesMonod(1910-67)獲1965年諾獎10/16/2023681、操縱子模型:原核生物酶合成調節的遺傳機制操縱子:轉錄水平控制基因表達的協調單位啟動子(premotor,P
)操縱基因(operator,O)結構基因(編碼蛋白質,S)控制部位操縱子=調控序列+轉錄單位10/16/202369絕大多數基因:按功能相關性成簇串聯,密集于染色體,共同組成一個轉錄單位——操縱子(operon)操縱子:一個啟動序列(啟動子)幾個可轉錄的編碼基因(2~6個,有的>20個)同一啟動序列控制,轉錄產生多順反子mRNA
原核基因的協調表達:通過調控單個啟動序列的活性完成10/16/2023701)操縱子模型——負性調控阻遏蛋白結合于操縱基因,阻止結構基因轉錄阻遏蛋白結合于操縱基因抑制結構基因轉錄當有信號分子(誘導物)時阻遏蛋白從DNA上脫離信號分子(誘導物)阻遏蛋白無誘導物(信號分子存在)(1)分解代謝酶系的誘導表達10/16/202371乳糖操縱子模型的建立(JacobandMonod,1961)FrancoisJacob(1920-)JacqucesMonod(1910-67)獲1965年諾獎10/16/202372乳糖操縱子(lacoperon)調控區CAP(代謝產物激活蛋白)結合位點啟動序列操縱序列結構基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙酰基轉移酶ZYAOPDNA10/16/202373mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol沒有乳糖存在時阻遏基因與操縱序列結合,RNA聚合酶則不起作用,不轉錄乳糖操縱子:乳糖可作為誘導物,誘導分解利用乳糖的酶的基因轉錄10/16/202374mRNA阻遏蛋白有乳糖存在時IDNAZYAOPpol啟動轉錄mRN
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