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文檔簡介

熒光定量PCR方法:探針法VS染料法?PCRqPCR常常見的分子生物學實驗技術。熒光定量PCR熒光為基礎對核酸進行定量分析,其應用非常廣泛,可以用于檢測基因的表達量(RNA的豐度),驗證表達譜芯片或轉錄組測序的數據,確定病原體的載量,對片段的拷貝數(CNV)進行分析,對基因進行分型等等。大部分研究者主要的應用是對基因的表達量進行測定,其原理為通過監控反應體系中熒光強度的變化,記錄檢測熒光達到閾值時的循環數(Ct值)。從理論上板量和Ct值密切相關,因此我們通過判讀Ct值從而對樣本進行定PCR時,從技術和產品來說,我們往往會有許多選擇,尤其至關重要。熒光定量PCR從方法上來說可以染料法相對較低,因此會有很多國內研究者會選擇使用染料法進行后續實驗。在染料法熒PCR實驗中,染料能夠與雙鏈結合,從而發光,而在游離狀態下,SYBR量呈比列,且會隨擴增產物的增加而增加。但是染料法檢測的是體系中的所有雙鏈DNA性擴增或者引物二聚體的出現,會極大的影響真實結果的準確ROX為內部熒光參考標準,用來校正背景,但是即便法與探針法相比。另外染料法無法在同一個反應中檢測多個目的片段,對于復雜序列,如果難以擴增的話,也會受到脫靶效應(如引物二聚體)的影響。在這種情況下,就需要在實驗前期進行熔解曲線分析,判斷二、TaqMan探針法TaqMan探針法PCR擴增時,在加入一對擴增引物的同時再加入一個特異性的 (FAM或Hex等)和一個熒光淬滅基團,當探針完整時,報告基團發射的熒光信號被淬滅基團吸收,PCR儀檢測不到熒光信號;當PCR擴增時(在延伸階段),熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現了熒光信號的累積與PCR產物形成完全同步,這也就是探針法定因此我們可以看到,在選擇熒光定量實驗時,探針法在特異性和準確性方面遠遠優于廉價的染料法,但在實際使用時,TaqMan探針高昂的價格常常

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