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《人類基因體計劃》幻燈片本課件PPT僅供大家學習使用學習完請自行刪除,謝謝!本課件PPT僅供大家學習使用學習完請自行刪除,謝謝!《人類基因體計劃》幻燈片本課件PPT僅供大家學習使用Thesequenceofthehumangenome人類基因體計劃(續)Thesequenceofthehumangeno《人類基因體計劃》教學課件人類基因體計劃(HumanGenomeProject,HGP)1985年美國能源部(DOE)健康總署和環境部門提出1987年啟動1988年9月美國國家衛生院(NIH)建立專門機構1988年Celera公司加入基因定序研究2001年2月宣布人類基因輿圖完成
→完成人類DNA中30億個鹼基的排序→辨識出人類DNA中30,000個基因→生物技術進入人類基因圖譜后世代(Post-genomicera)人類基因體計劃1985年美國能源部(DOE)健康總署和環境部人類基因體計劃(續)人類基因體計劃(續)人類基因體計劃人類基因體計劃已完成排序的大基因體1995-2002About35bacterialgenomes;細菌0.5-5Mb;hundredsto2000genes1996AprilYeast(Saccharomycescerevisiae)12Mb,5,500genes酵母1998Dec.-Worm(Caenorhabditiselegans)97Mb,19,000genes線蟲2000March-Fly(Drosophilamelanogaster)137Mb,13,500genes果蠅2000Dec.-Mustard(Arabidopsisthaliana)125Mb,25,498genes阿拉伯芥2000JuneHuman(Homosapiens)1stroughdraft2001Feb15/16Human,“workingdraft"人類3000Mb,35,000~40,000genes已完成排序的大基因體CBL@NCU已完成排序的大基因體1995-2002About3SequencedeukaryoticgenomesSequencedeukaryoticgenomes人類基因體的定序概況人類基因體方案在草圖完成主要的突破人類遺傳圖譜的完成定序技術進步任意定序方式(shotgun)EST的開展其他物種定序的完成最困難的局部異染色絲(Heterochromatin)重復性的序列(repetitivesequence)重復區段(duplicate)人類基因體的定序概況人類基因體方案在草圖完成主要的突破霰彈槍法決定全基因體序列由上而下的策略需做基因庫(library)與定序兩種人才決定圖譜(mapping)是的速率決定步驟霰彈槍法決定全基因體序列做完基因庫后,只需定序人才增加定序儀,即可增加定序的速率單一步驟,可平行處理霰彈槍法決定全基因體序列由上而下的策略具爭議性的CraigVenter表現序列標幟(expressedsequencetag,EST)以霰彈槍法決定微生物的全基因體序列以霰彈槍法決定果蠅與人的全基因體序列Picturetakenfrom/time/poy2000/mag/venter.html具爭議性的CraigVenter表現序列標幟(expres人類基因體的根本特性人類基因體初估3200Mb,可找到30000多個基因基因的密度約為每12~15Mb出現一個基因在染色體富含G,C的地方,通常基因較多在3.2Gb的基因體中,2.95Gb為真染色絲(euchromatin)超過一半的基因體都是一些重復性的序列估計有1.4×106個SNP在染色體中節及末端附近有許多從染色體其他處甚至其他染色體復制來的區段(duplicate)基因大小平均為30kb,差異很大人類基因體的根本特性人類基因體初估3200Mb,可找到300人類基因體的根本特性人類基因的復雜性高,不需以增加基因數量來進化蛋白質的復雜性較高一個基因產生多個蛋白質產物基因的調控方式較精致人類基因數量可能被低估人類基因的intron較長有些地方尚未定序完成-異染色絲區基因預測軟件是根據的基因為根底預測序列中含有基因之可能性,對于一些完全未知的基因那么無法偵測人類基因體的根本特性人類基因的復雜性高,不需以增加基因數量來人類基因體及基他已定序生物的比較負責根本生命現象的基因仍占多數人類在演化上并未增加太多新的domain人類在每個蛋白質家族中的數量較其他動物多人類基因體及基他已定序生物的比較負責根本生命現象的基因仍占多人類基因序列能給我們什么信息人類基因體包含約三十一億六千四百七十萬個〔3,164,700,00〕核甘酸鹼基〔A,C,T,G〕一般的基因平均含有三千個鹼基,但其大小變異很大,最大的人類基因是dystrophin,含有二百四十萬個鹼基基因總數估計在30,000至35,000之間,這比以前估計的在80,000至140,000之間少,原因是以前是根據富含基因區域基因數推延所估計,相對于現在是基因富含區與基因貧乏區所組合而成所有的人類中,幾乎是所有的〔99.9%〕的核甘酸鹼基是完全一樣的在已發現的基因中,超過的50%基因其功能仍是未知人類基因序列能給我們什么信息人類基因體包含約三十一億六千四百生物信息的應用(1/2)生物醫學:找尋造成疾病的基因遺傳學:DNA序列的變異個人識別
(基因指紋技術)人類學:SNPs個體間之遺傳變化分類學:序列分析生物分類演化學:序列比對物種演化關系診斷疾病的方法了解疾病的成因尋找治療疾病的藥物個人化醫療族群大小遷移方式歷史性變化線索生物信息的應用(1/2)生物醫學:診斷疾病的方法族群大小生物信息的應用(2/2)藥理學:蛋白質構造與功能預測藥物設計營養學:SNPs:探討造成此類個體差異之來源個人化的營養規劃「飲食營養因子」與基因之交互作用飲食營養因子影響基因之表現。基因變異影響營養之吸收轉運、貯存、代謝利用,進而影響功能,最終影響安康。生態學:物種分布信息與生態環境因子之關系預測未來生物的分布。生物信息的應用(2/2)藥理學:分子醫學〔MolecularMedicine〕增進疾病的診斷由于遺傳產生疾病的早期偵測合理的藥物設計基因療法和藥物的控制系統基因藥物學---量身定作的藥分子醫學〔MolecularMedicine〕增進疾病的診生物信息生物信息生物學突破性進展1959:DNA構造的發現有具體模型去了解遺傳原理 分子生物學蓬勃開展對復制現象有深入了解1973:遺傳工程技術的建立有改變活細胞性質的能力使某一段特定DNA片段能被增值出來做探針使某一段特定DNA片段能被大量表現為蛋白質為基因體分析定良好根底1990:「人類基因體」分析方案:生物、數理、與信息科學的整合生物情報學科學月刊2002年1月生物信息生物學突破性進展科學月刊2002年1月生物信息YM-Biochem發現DNA結構遺傳工程技術的建立「人類基因體」分析計劃?數學、物理、化學、統計、電腦科學的整合195319731990生物信息(續)YM-Biochem發現DNA結構遺傳工程技「人類基因體」生物技術產業PotentialBiotechIndustries生物醫學Biomedical生物食品Biofood-products生物材料Biomaterial生物農業Bioagriculture生物資源Bioresurces生物環保Bioenvironmental生物電子Bioelectronics生物制程BioindustrialProcess生物技術產業PotentialBiotechIndus9008012000年之前,瓶頸:信息產出1990US$3-5/base1997
US$0.5/base2000US$0.2/base2002US$0.1/base2003US$0.01/base2004US$0.05/base2000年之后,瓶頸:信息解讀基因信息發展趨勢9008012000年之前,瓶頸:信息產出1990US$900801Bioinformatics生物情報學生物情報學(Bioinformatics)是有系統地收集、分類、比對、整理、連結生物分子的基因序列與各層次生物構造及其互動機制之科學與技術,其目的在了解生物細胞生理機制,提供解決生物及醫學難題之方法。DNADNARNAProteinReplicationTranscriptionTranslationCell復制轉錄轉譯Lead-targetinteractiondataClinicaltrialdataDrugResponsedataDNAandProteinsequencedataGenomesandmapsExpressiondataProtein3-Dstructureandactivitydata900801Bioinformatics生物情報學生物情利用大量信息做觀察,形成假說,再測試假說。(不全靠實驗做觀察)主要任務是將紊亂的數據(data)整理為信息(information),再消化這些信息而轉化為知識(knowledge)。即利用ComputationalBiology的理論根底及分析方式來了解序列中存在的信息。Comparativegenomics藉由不同物種(或族群)間基因序列變異性或相似性來重建分子演化歷史。Functionalgenomics分析鑒定不同發育過程中相關的功能性基因及不同組織中相關基因的表現程度。Proteomics/structuralgenomics藉由同源及基因表現的分析定性基因產物proteomics或預測基因產物(蛋白質)構造及相關蛋白質交互作用structuralgenomics
Bioinformatics生物情報學利用大量信息做觀察,形成假說,再測試假說。(不全靠實驗做觀900801ExperimentApplications
&ServicesSpecializedDatabaseUser-InterfaceSoftware
DevelopmentProgramming&ComputingMethodology&AlgorithmSequenceAlignmentPatternRecognitionDataFilteringOptimizationStatisticalAnalysisComputer
ProgrammingParallelComputingTesting&
VerificationExperimentalBiologyMicrarrayCrystallography生物信息技術及應用
BioinformaticsTechnologies&ApplicationsDataIntegrationDatabase
ManagementStandardizationClinicalInformationData
SourcingGenomeSequencingMicroarrayCrystallographyLiteratureHardwareDevelopmentGeneDiscoveryGeneFunctionsDrugTargetsGeneVariantsProteomicsPhylogenics900801ExperimentApplications
多態性(polymorphisms)我們每一個人的遺傳基因,多少含有一些遺傳變異。大部分的遺傳變異不會致病,稱為(遺傳的)多態性(polymorphisms)。人類的ABO血型就是一種多態性,由于ABO血型基因的多態性(正常變異)(normalvariations)。導致人類有A型、B型、AB型、及O型種種不同血型。☆SNP在人類基因組中約分布著1,420,000個單鹼基多態性(single
nucleotide
polymorphisms,
SNPs)分布密度非常大每1910個鹼基就有一個SNP多態性(polymorphisms)我們每一個人的遺傳基因,重復片段序列STRs(ShortTandemRepeats)VNTR:VariableNumberofTandemRepeatsHypervariableRegionsofHumanDNAShortsequenceofDNAthatisrepeatedinahead-to-tailfashionOccurataspecificchromosomallocusInterspersedthroughoutthehumangenomeNumberofrepeatedunitsvarybetweenindividuals1aatttttgtattttttttagagacggggtttcaccatgttggtcaggctgactatggagt61tattttaaggttaatatatataaagggtatgatagaacacttgtcatagtttagaacgaa121ctaacgatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagacagat181tgatagtttttttttatctcactaaatagtctatagtaaacatttaattaccaatatttg241gtgcaattctgtcaatgaggataaatgtggaatcgttataattcttaagaatatatattc301cctctgagtttttgatacctcagattttaaggccExample:D7S280重復片段序列STRs(ShortTandemRepea微生物基因體學
〔MicrobialGenomics〕病源菌的快速偵測與治療新能源〔生物燃料〕環境監測以偵測污染物保護免于生物和化學戰的傷害平安、有效的有毒廢棄物去除微生物基因體學
〔MicrobialGenomics〕病源風險評估〔RiskAssessment〕評估放射線暴露對安康所帶來的風險與傷害評估暴露于致突變化學物和致癌毒物對安康所帶來的風險與傷害降低遺傳性突變的可能性風險評估〔RiskAssessment〕評估放射線暴露對安古生物學、人類學、演化和人類遷移〔Bioarchaeology,Anthropology,Evolution,andHumanMigration〕在系譜中經由生殖細胞的突變研究演化基于母系遺傳研究不同族群的遷移變化研究染色體的突變,以追溯男性的系譜和遷移將突變演化中之轉折點與族群的年齡和歷史事件作比較古生物學、人類學、演化和人類遷移〔Bioarchaeolo比較蛋白質/DNA序列可找出
基因/物種的親緣關系簡化生命樹人類酵母大腸桿菌人類/線蟲/果蠅核受體蛋白質親緣樹CBL@NCU真細菌真核生物古細菌比較蛋白質/DNA序列可找出
基因/物種的親緣關系簡化生命有很多方法比較生命序列的異同有很多方法比較生命序列的異同簡化生命樹紅:序列比對法黑:寡核甘酸頻率法真細菌真核生物古細菌CBL@NCU+內蒙古大學有很多方法比較生命序列的異同有很多方法比較生命序列的異同簡化DNA指認〔法醫學〕
DNAIdentification(Forensics)指認可能的嫌犯,其DNA與留在犯罪現場的證據相符合為被錯誤指控的無辜人員洗清嫌疑。指認犯罪和災難的受害者。建立親子與其他親屬的關系。指認瀕臨絕種和保育類動物,以協助保育動物官員執行任務。偵測可能污染空氣、水源、土壤和食物的細菌和其他病媒。在器官移植手術中,檢查捐獻者與承受者的吻合性。決定植物種子或家畜品種的系譜。對消費品的認證,如魚子醬或葡萄酒等DNA指認〔法醫學〕
DNAIdentification農業、家畜品種和生物加工
Agriculture,LivestockBreeding,andBioprocessing抗病、抗蟲害、抗乾旱的作物較安康、生產效能較高、抗疾病的家畜營養價值較高的農產品生物性殺蟲劑與食物產品結合的可食用疫苗使用植物做為去除環境污染之用農業、家畜品種和生物加工
Agriculture,Liv我們仍未知的〔1〕基因總數、確定位置、和其功能基因調控DNA序列的組織構造染色體的構造與組織非編碼DNA的種類、數量、分布、信息內容和功能基因表現、蛋白質合成、和轉譯后事件的協調在復雜的分子機器中蛋白質的交互作用預期相對于實驗證明的基因功能有機體之間在演化上的保守性〔conservation〕我們仍未知的〔1〕基因總數、確定位置、和其功能我們仍未知的〔2〕蛋白質的保守性〔包括構造與功能〕有機體的蛋白質體學〔Proteomes〕〔所有的蛋白質內容與功能〕SNPs(single-baseDNAvariationsamongindividuals)與安康和疾病的相關性基于基因序列變異程度所做的疾病易感性牽涉到復雜特性的基因與多基因相關的疾病復雜的生物系統,包括對環境復育有幫助的微生物組合族群發育遺傳學、基因體學我們仍未知的〔2〕蛋白質的保守性〔包括構造與功能〕人類基因體方案的后續工作比較更多其他物種序列,都能讓我們更進一步了解自己的基因體找出新的方法工具及新的目標來解讀基因體的序列以較寬廣的角度來了解基因遺傳信息來增加基因體在醫療上的研究價值改進基因預測及分析的工具人類基因體方案的后續工作比較更多其他物種序列,都能讓我們更進ELSI的議題人類基因序列的解讀后所引發的問題Ethical,Legal,andSocialIssues(ELSI)ELSI的議題人類基因序列的解讀后所引發的問題ELSI的議題〔1〕個人遺傳信息的隱私權和機密性保險業者、雇主、法院、學校、認養機構和軍隊,對使用個人遺傳信息的公平性由于個人遺傳差異所造成的心理上的沖擊、恥辱和歧視。生殖的問題,包括在做生殖決定時,適當和充分告知的同意與使用遺傳信息臨床上的問題,包括對醫生及其他醫護人員、被檢出有遺傳問題的人、和一般群眾,使用遺傳信息的潛在力、局限性和社會風險的教育;施行標準程序與品質管制作業。ELSI的議題〔1〕個人遺傳信息的隱私權和機密性ELSI的議題〔2〕對疾病易感性和復雜問題如心臟病、糖尿病和阿茲海默癥,所做基因測試帶來的不確定感。對取得高級基因技術的公平性有關于人類責任感、自由意志相對于基因決定論、安康與疾病的觀念,在觀念上和哲學上的含意。有關于基因改進食品和微生物對于安康與環境沖擊的議題基因產品的商業化,包括財產權、專利、著作版權和貿易機密,以及對資料與數據的可取得性。ELSI的議題〔2〕對疾病易感性和復雜問題如心臟病、糖尿病《人類基因體計劃》幻燈片本課件PPT僅供大家學習使用學習完請自行刪除,謝謝!本課件PPT僅供大家學習使用學習完請自行刪除,謝謝!《人類基因體計劃》幻燈片本課件PPT僅供大家學習使用Thesequenceofthehumangenome人類基因體計劃(續)Thesequenceofthehumangeno《人類基因體計劃》教學課件人類基因體計劃(HumanGenomeProject,HGP)1985年美國能源部(DOE)健康總署和環境部門提出1987年啟動1988年9月美國國家衛生院(NIH)建立專門機構1988年Celera公司加入基因定序研究2001年2月宣布人類基因輿圖完成
→完成人類DNA中30億個鹼基的排序→辨識出人類DNA中30,000個基因→生物技術進入人類基因圖譜后世代(Post-genomicera)人類基因體計劃1985年美國能源部(DOE)健康總署和環境部人類基因體計劃(續)人類基因體計劃(續)人類基因體計劃人類基因體計劃已完成排序的大基因體1995-2002About35bacterialgenomes;細菌0.5-5Mb;hundredsto2000genes1996AprilYeast(Saccharomycescerevisiae)12Mb,5,500genes酵母1998Dec.-Worm(Caenorhabditiselegans)97Mb,19,000genes線蟲2000March-Fly(Drosophilamelanogaster)137Mb,13,500genes果蠅2000Dec.-Mustard(Arabidopsisthaliana)125Mb,25,498genes阿拉伯芥2000JuneHuman(Homosapiens)1stroughdraft2001Feb15/16Human,“workingdraft"人類3000Mb,35,000~40,000genes已完成排序的大基因體CBL@NCU已完成排序的大基因體1995-2002About3SequencedeukaryoticgenomesSequencedeukaryoticgenomes人類基因體的定序概況人類基因體方案在草圖完成主要的突破人類遺傳圖譜的完成定序技術進步任意定序方式(shotgun)EST的開展其他物種定序的完成最困難的局部異染色絲(Heterochromatin)重復性的序列(repetitivesequence)重復區段(duplicate)人類基因體的定序概況人類基因體方案在草圖完成主要的突破霰彈槍法決定全基因體序列由上而下的策略需做基因庫(library)與定序兩種人才決定圖譜(mapping)是的速率決定步驟霰彈槍法決定全基因體序列做完基因庫后,只需定序人才增加定序儀,即可增加定序的速率單一步驟,可平行處理霰彈槍法決定全基因體序列由上而下的策略具爭議性的CraigVenter表現序列標幟(expressedsequencetag,EST)以霰彈槍法決定微生物的全基因體序列以霰彈槍法決定果蠅與人的全基因體序列Picturetakenfrom/time/poy2000/mag/venter.html具爭議性的CraigVenter表現序列標幟(expres人類基因體的根本特性人類基因體初估3200Mb,可找到30000多個基因基因的密度約為每12~15Mb出現一個基因在染色體富含G,C的地方,通常基因較多在3.2Gb的基因體中,2.95Gb為真染色絲(euchromatin)超過一半的基因體都是一些重復性的序列估計有1.4×106個SNP在染色體中節及末端附近有許多從染色體其他處甚至其他染色體復制來的區段(duplicate)基因大小平均為30kb,差異很大人類基因體的根本特性人類基因體初估3200Mb,可找到300人類基因體的根本特性人類基因的復雜性高,不需以增加基因數量來進化蛋白質的復雜性較高一個基因產生多個蛋白質產物基因的調控方式較精致人類基因數量可能被低估人類基因的intron較長有些地方尚未定序完成-異染色絲區基因預測軟件是根據的基因為根底預測序列中含有基因之可能性,對于一些完全未知的基因那么無法偵測人類基因體的根本特性人類基因的復雜性高,不需以增加基因數量來人類基因體及基他已定序生物的比較負責根本生命現象的基因仍占多數人類在演化上并未增加太多新的domain人類在每個蛋白質家族中的數量較其他動物多人類基因體及基他已定序生物的比較負責根本生命現象的基因仍占多人類基因序列能給我們什么信息人類基因體包含約三十一億六千四百七十萬個〔3,164,700,00〕核甘酸鹼基〔A,C,T,G〕一般的基因平均含有三千個鹼基,但其大小變異很大,最大的人類基因是dystrophin,含有二百四十萬個鹼基基因總數估計在30,000至35,000之間,這比以前估計的在80,000至140,000之間少,原因是以前是根據富含基因區域基因數推延所估計,相對于現在是基因富含區與基因貧乏區所組合而成所有的人類中,幾乎是所有的〔99.9%〕的核甘酸鹼基是完全一樣的在已發現的基因中,超過的50%基因其功能仍是未知人類基因序列能給我們什么信息人類基因體包含約三十一億六千四百生物信息的應用(1/2)生物醫學:找尋造成疾病的基因遺傳學:DNA序列的變異個人識別
(基因指紋技術)人類學:SNPs個體間之遺傳變化分類學:序列分析生物分類演化學:序列比對物種演化關系診斷疾病的方法了解疾病的成因尋找治療疾病的藥物個人化醫療族群大小遷移方式歷史性變化線索生物信息的應用(1/2)生物醫學:診斷疾病的方法族群大小生物信息的應用(2/2)藥理學:蛋白質構造與功能預測藥物設計營養學:SNPs:探討造成此類個體差異之來源個人化的營養規劃「飲食營養因子」與基因之交互作用飲食營養因子影響基因之表現。基因變異影響營養之吸收轉運、貯存、代謝利用,進而影響功能,最終影響安康。生態學:物種分布信息與生態環境因子之關系預測未來生物的分布。生物信息的應用(2/2)藥理學:分子醫學〔MolecularMedicine〕增進疾病的診斷由于遺傳產生疾病的早期偵測合理的藥物設計基因療法和藥物的控制系統基因藥物學---量身定作的藥分子醫學〔MolecularMedicine〕增進疾病的診生物信息生物信息生物學突破性進展1959:DNA構造的發現有具體模型去了解遺傳原理 分子生物學蓬勃開展對復制現象有深入了解1973:遺傳工程技術的建立有改變活細胞性質的能力使某一段特定DNA片段能被增值出來做探針使某一段特定DNA片段能被大量表現為蛋白質為基因體分析定良好根底1990:「人類基因體」分析方案:生物、數理、與信息科學的整合生物情報學科學月刊2002年1月生物信息生物學突破性進展科學月刊2002年1月生物信息YM-Biochem發現DNA結構遺傳工程技術的建立「人類基因體」分析計劃?數學、物理、化學、統計、電腦科學的整合195319731990生物信息(續)YM-Biochem發現DNA結構遺傳工程技「人類基因體」生物技術產業PotentialBiotechIndustries生物醫學Biomedical生物食品Biofood-products生物材料Biomaterial生物農業Bioagriculture生物資源Bioresurces生物環保Bioenvironmental生物電子Bioelectronics生物制程BioindustrialProcess生物技術產業PotentialBiotechIndus9008012000年之前,瓶頸:信息產出1990US$3-5/base1997
US$0.5/base2000US$0.2/base2002US$0.1/base2003US$0.01/base2004US$0.05/base2000年之后,瓶頸:信息解讀基因信息發展趨勢9008012000年之前,瓶頸:信息產出1990US$900801Bioinformatics生物情報學生物情報學(Bioinformatics)是有系統地收集、分類、比對、整理、連結生物分子的基因序列與各層次生物構造及其互動機制之科學與技術,其目的在了解生物細胞生理機制,提供解決生物及醫學難題之方法。DNADNARNAProteinReplicationTranscriptionTranslationCell復制轉錄轉譯Lead-targetinteractiondataClinicaltrialdataDrugResponsedataDNAandProteinsequencedataGenomesandmapsExpressiondataProtein3-Dstructureandactivitydata900801Bioinformatics生物情報學生物情利用大量信息做觀察,形成假說,再測試假說。(不全靠實驗做觀察)主要任務是將紊亂的數據(data)整理為信息(information),再消化這些信息而轉化為知識(knowledge)。即利用ComputationalBiology的理論根底及分析方式來了解序列中存在的信息。Comparativegenomics藉由不同物種(或族群)間基因序列變異性或相似性來重建分子演化歷史。Functionalgenomics分析鑒定不同發育過程中相關的功能性基因及不同組織中相關基因的表現程度。Proteomics/structuralgenomics藉由同源及基因表現的分析定性基因產物proteomics或預測基因產物(蛋白質)構造及相關蛋白質交互作用structuralgenomics
Bioinformatics生物情報學利用大量信息做觀察,形成假說,再測試假說。(不全靠實驗做觀900801ExperimentApplications
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DevelopmentProgramming&ComputingMethodology&AlgorithmSequenceAlignmentPatternRecognitionDataFilteringOptimizationStatisticalAnalysisComputer
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多態性(polymorphisms)我們每一個人的遺傳基因,多少含有一些遺傳變異。大部分的遺傳變異不會致病,稱為(遺傳的)多態性(polymorphisms)。人類的ABO血型就是一種多態性,由于ABO血型基因的多態性(正常變異)(normalvariations)。導致人類有A型、B型、AB型、及O型種種不同血型。☆SNP在人類基因組中約分布著1,420,000個單鹼基多態性(single
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polymorphisms,
SNPs)分布密度非常大每1910個鹼基就有一個SNP多態性(polymorphisms)我們每一個人的遺傳基因,重復片段序列STRs(ShortTandemRepeats)VNTR:VariableNumberofTandemRepeatsHypervariableRegionsofHumanDNAShortsequenceofDNAthatisrepeatedinahead-to-tailfashionOccurataspecificchromosomallocusInterspersedthroughoutthehumangenomeNumberofrepeatedunitsvarybetweenindividuals1aatttttgtattttttttagagacggggtttcaccatgttggtcaggctgactatggagt61tattttaaggttaatatatataaagggtatgatagaacacttgtcatagtttagaacgaa121ctaacgatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagacagat181tgatagtttttttttatctcactaaatagtctatagtaaacatttaattaccaatatttg241gtgcaattctgtcaatgaggataaatgtggaatcgttataattcttaagaatatatattc301cctctgagtttttgatacctcagattttaaggccExample:D7S280重復片段序列STRs(ShortTandemRepea微生物基因體學
〔MicrobialGenomics〕病源菌的快速偵測與治療新能源〔生物燃料〕環境監測以偵測污染物保護免于生物和化學戰的傷害平安、有效的有毒廢棄物去除微生物基因體學
〔MicrobialGenomics〕病源風險評估〔RiskAssessment〕評估放射線暴露對安康所帶來的風險與傷害評估暴露于致突變化學物和致癌毒物對安康所帶來的風險與傷害降低遺傳性突變的可能性風險評估〔RiskAssessment〕評估放射線暴露對安古生物學、人類學、演化和人類遷移〔Bioarchaeology,Anthropology,Evolution,andHumanMigration〕在系譜中經由生殖細胞的突變研究演化基于母系遺傳研究不同族群的遷移變化研究染色體的突變,以追溯男性的系譜和遷移將突變演化中之轉折點與族群的年齡和歷史事件作比較古生物學、人類學、演化和人類遷移〔Bioarchaeol
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