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DNA芯片馬永平第八章基礎醫學院生物化學與分子生物學教研室DNA芯片馬永平第八章基礎醫學院生物化學與分子生物1內容提要什么是DNA芯片?DNA芯片的原理DNA芯片的種類DNA芯片的應用領域DNA表達譜數據分析DNA芯片技術的發展與展望內容提要什么是DNA芯片?2第一節概述DNA芯片也叫基因芯片(Genechip)是指在固相載體(玻璃、硅等)上有序地、高密度地(點間距<500m)排列固定了大量的靶基因或寡核苷酸,也叫探針。這些被固定的分子探針在基質上形成高密度的DNA微陣列,因此,DNA芯片又叫DNA微矩陣(DNAMicroarray)。第一塊基因芯片1992年誕生在美國。第一節概述DNA芯片也叫基因芯片(Genechip)是3DNA芯片屬于生物芯片(biochip)的范疇,生物芯片分為DNA芯片、蛋白質芯片及其它芯片(樣品制備芯片、核酸擴增芯片、毛細管電泳芯片等)三類。DNA芯片屬于生物芯片(biochip)的范疇,生物芯片分為4第二節DNA芯片的基本原理1.基因芯片技術是建立在Southernblot基礎之上的,可以說它是Southernblot的改進和發展,它的原理是:變性DNA加入探針后在一定溫度下退火,同源片段之間通過堿基互補形成雙鏈雜交分子。S;DNA-DNA/RNA;N:RNA-DNA/RNA;W:Protein-protein/DNA;E:GenomeDNA-DNA/RNA(Dotblot)第二節DNA芯片的基本原理1.基因芯片技術是建立在Sou52.基因芯片與Southernblot之比較基因芯片的基本原理與Southernblot技術一脈相承,點樣技術和數據讀取技術的發展是基因芯片技術對傳統核酸雜交的技術性突破,因此,基因芯片技術是基因功能研究領域的一次革命。通過基因芯片人們可以大規模、高通量(海量)地對成千上萬個基因進行同時研究。與Southernblot相比較,基因芯片具有高密度、高通量、并行性、微量化、自動化的特點。2.基因芯片與Southernblot之比較基因芯片的基本63.基因芯片基本操作流程制備總RNA→mRNA經RT-PCR用Cy3(正常對照組)和Cy5(實驗組)熒光標記目的基因,得到cDNA探針→混合標記探針→與表達譜芯片上核苷酸片段(或基因)雜交→掃描→分析雜交結果→結論載體+寡核苷酸-探針分子+熒光染料-點樣儀-掃描儀-計算機+專業軟件3.基因芯片基本操作流程制備總RNA→mRNA經RT-P7第三節DNA芯片的種類表達譜芯片診斷芯片檢測芯片第三節DNA芯片的種類表達譜芯片8用于基因功能的研究。原理:用不同的熒光染料通過RT-PCR標記不同來源的細胞mRNA制備成探針,將探針混合后與芯片上的基因雜交、洗滌、掃描,得到這些基因在不同組織或個體中的表達譜,再通過計算機分析這些基因在不同組織或個體中的表達差異,得出這些基因表達的重要信息。即高表達、低表達或不表達。1.表達譜基因芯片用于基因功能的研究。原理:用不同的熒光染料通過RT-P9HBV、HCV、結核桿菌等病原體檢測,商檢等。2.診斷芯片在DNA和/或RNA水平上用于疾病診斷,如肝癌、糖尿病等。3.檢測芯片HBV、HCV、結核桿菌等病原體檢測,商檢等。2.診斷芯片10第四節基因芯片的應用基因測序及基因圖繪制檢測基因突變基因表達分析在藥物研究中的應用在微生物菌種鑒定和致病機制研究中的應用在農林業生產中的應用在軍事、司法領域的應用第四節基因芯片的應用基因測序及基因圖繪制111.雜交測序和基因作圖雜交測序(SBH)是發展基因芯片技術的初衷,希望能夠提供一種新的、快速的測序方法。原理:理論上有4n個長度為n的序列,可以被分析的目標長度大約等于點陣上寡核苷酸數目的平方根。基因繪圖:用光蝕刻技術在載體上合成大規模有序的寡核苷酸序列(標簽序列),然后與克隆文庫中的每個克隆進行雜交,通過鑒定基因與基因間的大量標簽序列(EST,STS等),以較低的等價基因組數把他們繪制成重疊圖。1.雜交測序和基因作圖雜交測序(SBH)是發展基因芯片技術的12附:標簽序列expressedsequencetags,EST:表達序列標簽,為cDNA的部分序列,平均為300-500bp,它可以確定基因的種類和所代表基因表達的拷貝數。目前,公共數據庫中可利用的人類EST超過100萬個,它可能代表所有人類基因的50%-90%。sequencetaggedsite,STS:序列標簽位點,是指染色體定位明確,而且可以用PCR擴增的單拷貝序列,一般每隔100kb距離就有一個標記。附:標簽序列expressedsequencetags132.檢測基因突變如果基因易發生突變區段的核苷酸序列是已知的,則DNA芯片能很容易地通過再測序鑒別出僅1個堿基的錯配。以下面的15nt的探針為例,每個探針只有中間一個核苷酸不同,以紅體下劃線表示。1.GCTACTCATGCGTAC2.CTACTCATGCGTACT3.TACTCATGCGTACTC4.ACTCATGCGTACTCC5.CTCATGCGTACTCCG6.TCATGCGT
ACTCCGT2.檢測基因突變如果基因易發生突變區段的核苷酸序列是已知的,14TACGCATACTCAACGTA
CGTTACGCAT152.CTACTCATGCGTACT
3.
TACTCATGCGTACTC4.ACTCATGCGTACTCC1.ACTCATGAGTACTCC
TACTCA2.CTACTCA163.基因表達分析1)肺癌相關基因的表達研究
黃達輝毛裕民等用含4096條cDNA基因的表達譜芯片研究一組肺癌組織樣本的基因表達譜,共篩選出差異表達的基因370條,包含已知基因146條,未知基因224條,其中107條表達增加,263條表達降低。(第二軍醫大學學報,2000,21(9):827-830)3.基因表達分析1)肺癌相關基因的表達研究172)基因芯片對PMA激活的血管內皮細胞早期反應基因的研究吳超群,李瑤,毛裕民,等.摘要:用含4096條人類基因的DNA芯片研究PMA激活的血管內皮細胞ERG的表達譜,作用6h后,17條基因表達上調,11條基因下調。數據分析表明17條上調基因中13條屬于蛋白質磷酸酶和轉錄調控因子基因,而下調基因中9條為細胞分裂相關蛋白,從而證明PMA激活的人血管內皮細胞ERG主要是轉錄調控因子基因和蛋白質磷酸酶基因。2)基因芯片對PMA激活的血管內皮細胞早期反應基因的研究184.基因芯片在腫瘤研究中的應用 1)尋找腫瘤相關基因2)腫瘤基因表達譜研究3)腫瘤相關基因功能研究4)腫瘤分子生物學研究5)腫瘤診斷4.基因芯片在腫瘤研究中的應用 1)尋找腫瘤相關基因191)尋找腫瘤相關基因Welford等結合消減雜交技術,用基因芯片分析了兩例具有不同生物學活性的Ewing肉瘤標本,一例為生長迅速的轉移灶,另一例為被成功治愈的局限灶。經差異表達后,將消減文庫插入質粒,制成cDNA文庫,與不同熒光標記的肉瘤組織雜交,共得到173條差異表達的基因,其中有50條為新基因(28.9%)。1)尋找腫瘤相關基因Welford等結合消減雜交技術,用基202)腫瘤基因表達譜研究Kononen等用含有4000條已知基因和2000個EST的cDNA芯片對兩株分別為激素依賴(CWR22)和非激素依賴(CWR22R)的前列腺癌細胞進行雜交,將其表達譜與269例前列腺癌組織及正常前列腺組織比較,發現在芯片的5148條基因中,有3條基因(0.7%)在非激素依賴中表達超過2倍,有135條基因(2.6%)下調超過50%,其中上調的IGFBP2和HSP27基因在臨床激素抵抗復發腫瘤標本中分別有100%和31%也是上調的。2)腫瘤基因表達譜研究Kononen等用含有4000條已知基213)腫瘤分子生物學研究Alizadeh等用基因芯片對DLBCL(diffuselargeB-celllymphoma)進行的病理分型研究發現,依據基因表達差異,DLBCL還可以分為三個亞型。(Nature,2000,403:503-511).3)腫瘤分子生物學研究Alizadeh等用基因芯片對D224)腫瘤診斷國外有一個病人臨床表現出典型的白血病癥狀,但形態學檢測不典型,根據相關檢查,診斷為AML(acutemyeloidleukaemia),治療幾個月后未見好轉。后來用DNA芯片與病人骨髓的mRNA雜交,結果顯示AML和ALL(acutelymphoblasticleukaemia)基因都表達較低,而在數據分析中發現,編碼原肌球蛋白的基因表達極高,從而確診為肺泡彈狀肌肉瘤,改變治療方案,病情出現緩解。4)腫瘤診斷國外有一個病人臨床表現出典型的白血病癥狀,但形態235.基因芯片在藥物研究中的應用1)藥物篩選直接檢測化合物對生物大分子如受體、酶、離子通道等的結合及作用。檢測化合物作用于細胞后基因表達變化。選擇合適的藥物作用靶標
有人用5,766個基因的芯片分析正常與癌變的卵巢組織的mRNA,發現二者有30%的基因表達差異為2倍以上,其中癌變組織9%的基因表達上調,尤以CD9、上皮糖蛋白、P27蛋白等。5.基因芯片在藥物研究中的應用1)藥物篩選直接檢測化合物對生24不同個體結合藥物的靶標存在差異。小分子藥物在體內的作用靶標不可能有絕對專一性。2)指導合理用藥不同個體結合藥物的靶標存在差異。2)指導合理用藥256.基因芯片在微生物菌種鑒定中的應用菌種鑒定細菌基因分型及菌種鑒定監測細菌抗藥性基因6.基因芯片在微生物菌種鑒定中的應用菌種鑒定267.基因芯片在病原體致病機制中應用1)致病機制研究研究病原體基因組,了解其致病基因,抗藥機制及抗藥基因等。分析藥物作用下病原體基因表達情況監測宿主在染病狀態下基因表達的變化7.基因芯片在病原體致病機制中應用1)致病機制研究272)病原體致病機制的研究1996年Kozal等首次用基因芯片技術發現HIV-1包膜B蛋白酶極其多變,其中許多氨基酸的改變與抗蛋白酶抑制劑的抗藥性有關。
2)病原體致病機制的研究1996年Kozal等首次用基因芯288.基因芯片在軍事司法方面的應用檢測生物戰病原體,研制生物戰保護劑。DNA指紋鑒定、血型鑒定;8.基因芯片在軍事司法方面的應用檢測生物戰病原體,研制生物291)DNA指紋DNAfingerprint:人類基因組內散布著許多串聯重復的短小DNA序列,叫小衛星DNA(MSDNA),由于不受選擇壓力,衛星DNA呈現高度的多態性,具有孟德爾式穩定遺傳的特性。因此,用MSDNA探針與總DNA限制性酶切片段(酶切位點在MSDNA之外)雜交,可以得到個體特異的DNA指紋圖譜。1)DNA指紋DNAfingerprint:人類基因組內30第五節數據分析1.圖象分析(Imageanalysis)2.標準化處理(Normalization):是指以持(管)家基因(housekeepinggene)的表達率為參照,對原始數據進行校正的過程。實際操作中常常剔除Cy3和Cy5信號強度均小于400的基因表達,使數據標準化。3.散點圖分析(scatterplot)第五節數據分析1.圖象分析(Imageanalysis31基因芯片的掃描示意圖MMMCy3Cy5Cy3/Cy5基因芯片的掃描示意圖MMMCy332基因芯片掃描結果圖基因芯片掃描結果圖33ScatterplotofdifferentiallyexpressedgeneScatterplotofdifferentially341)數據分析4.Ratio值分析
Ratio=Cy3/Cy5,一般認為Ratio值在0.5-2.0范圍內(即2倍以下)的基因不存在顯著表達差異,該范圍之外的基因表達認為具有顯著差異,由于實驗條件不同,此域值區間會根據可信度有所調整。5.聚類分析(Clustering
):就是根據統計分析原理對具有相同統計行為的多個基因或樣本進行歸類的分析方法,歸為一類(簇)的基因或樣本可能具有相似的功能或類型。1)數據分析4.Ratio值分析Ratio=Cy3/35聚類示意圖ABa1a2a3a4a5b1b2b3b4b5聚類示意圖ABa1a2a3a4a5b1b2b3b4b5362)對基因芯片結果的驗證RT-PCRNorthernblot2)對基因芯片結果的驗證RT-PCR37第六節基因芯片的發展與展望2003年HGP完成后,人們面臨的問題是如何了解10萬條基因中每一個基因的功能,以及基因之間的相互關系等,從而衍生出人類基因組多樣性計劃、環境基因組學、腫瘤基因解剖學計劃、藥物基因組學等。基因芯片以其無可比擬的高信息量、高通量、高自動化和快速準確的優勢必將成為后基因組時代最重要最常用的技術,因此,它被譽為“微縮芯片實驗室”(lab-in-a-chip)。第六節基因芯片的發展與展望2003年HGP完成后,人們面臨381)中藥開發中醫藥體系一直是在“整體觀念,辨證施治”理論指導下完善發展而成的,現代醫學也正是朝“整體觀念,辨證施治”的方向發展。因此,中醫藥里既有巨大的寶藏,又有無限的商機。基因芯片為中醫藥的研究提供了平行、快速、高通量、多參數的研究手段和篩選方法。
大黃治療糖尿病全反式維甲酸;三氧化二砷治療白血病1)中藥開發392)SNPs(singlenucleotidepolymorphisms)染色體的某個位點上存在單個堿基的變化如果在人群中的頻率超過1%,則認為是單核苷酸多態(SNPs)。SNPs是近年來出現的第三代遺傳標記。另兩個是RFLP,MSDNA;用途:1)基因連鎖分析,用于基因作圖和疾病基因定位;2)人群中尋找SNPs位點;3)檢測保守基因中的點突變;4)病例與對照間的相關分析等。SNPs分析的前提是所研究基因的DNA序列必須是已知的。2)SNPs(singlenucleotidepolym40DNA芯片馬永平第八章基礎醫學院生物化學與分子生物學教研室DNA芯片馬永平第八章基礎醫學院生物化學與分子生物41內容提要什么是DNA芯片?DNA芯片的原理DNA芯片的種類DNA芯片的應用領域DNA表達譜數據分析DNA芯片技術的發展與展望內容提要什么是DNA芯片?42第一節概述DNA芯片也叫基因芯片(Genechip)是指在固相載體(玻璃、硅等)上有序地、高密度地(點間距<500m)排列固定了大量的靶基因或寡核苷酸,也叫探針。這些被固定的分子探針在基質上形成高密度的DNA微陣列,因此,DNA芯片又叫DNA微矩陣(DNAMicroarray)。第一塊基因芯片1992年誕生在美國。第一節概述DNA芯片也叫基因芯片(Genechip)是43DNA芯片屬于生物芯片(biochip)的范疇,生物芯片分為DNA芯片、蛋白質芯片及其它芯片(樣品制備芯片、核酸擴增芯片、毛細管電泳芯片等)三類。DNA芯片屬于生物芯片(biochip)的范疇,生物芯片分為44第二節DNA芯片的基本原理1.基因芯片技術是建立在Southernblot基礎之上的,可以說它是Southernblot的改進和發展,它的原理是:變性DNA加入探針后在一定溫度下退火,同源片段之間通過堿基互補形成雙鏈雜交分子。S;DNA-DNA/RNA;N:RNA-DNA/RNA;W:Protein-protein/DNA;E:GenomeDNA-DNA/RNA(Dotblot)第二節DNA芯片的基本原理1.基因芯片技術是建立在Sou452.基因芯片與Southernblot之比較基因芯片的基本原理與Southernblot技術一脈相承,點樣技術和數據讀取技術的發展是基因芯片技術對傳統核酸雜交的技術性突破,因此,基因芯片技術是基因功能研究領域的一次革命。通過基因芯片人們可以大規模、高通量(海量)地對成千上萬個基因進行同時研究。與Southernblot相比較,基因芯片具有高密度、高通量、并行性、微量化、自動化的特點。2.基因芯片與Southernblot之比較基因芯片的基本463.基因芯片基本操作流程制備總RNA→mRNA經RT-PCR用Cy3(正常對照組)和Cy5(實驗組)熒光標記目的基因,得到cDNA探針→混合標記探針→與表達譜芯片上核苷酸片段(或基因)雜交→掃描→分析雜交結果→結論載體+寡核苷酸-探針分子+熒光染料-點樣儀-掃描儀-計算機+專業軟件3.基因芯片基本操作流程制備總RNA→mRNA經RT-P47第三節DNA芯片的種類表達譜芯片診斷芯片檢測芯片第三節DNA芯片的種類表達譜芯片48用于基因功能的研究。原理:用不同的熒光染料通過RT-PCR標記不同來源的細胞mRNA制備成探針,將探針混合后與芯片上的基因雜交、洗滌、掃描,得到這些基因在不同組織或個體中的表達譜,再通過計算機分析這些基因在不同組織或個體中的表達差異,得出這些基因表達的重要信息。即高表達、低表達或不表達。1.表達譜基因芯片用于基因功能的研究。原理:用不同的熒光染料通過RT-P49HBV、HCV、結核桿菌等病原體檢測,商檢等。2.診斷芯片在DNA和/或RNA水平上用于疾病診斷,如肝癌、糖尿病等。3.檢測芯片HBV、HCV、結核桿菌等病原體檢測,商檢等。2.診斷芯片50第四節基因芯片的應用基因測序及基因圖繪制檢測基因突變基因表達分析在藥物研究中的應用在微生物菌種鑒定和致病機制研究中的應用在農林業生產中的應用在軍事、司法領域的應用第四節基因芯片的應用基因測序及基因圖繪制511.雜交測序和基因作圖雜交測序(SBH)是發展基因芯片技術的初衷,希望能夠提供一種新的、快速的測序方法。原理:理論上有4n個長度為n的序列,可以被分析的目標長度大約等于點陣上寡核苷酸數目的平方根。基因繪圖:用光蝕刻技術在載體上合成大規模有序的寡核苷酸序列(標簽序列),然后與克隆文庫中的每個克隆進行雜交,通過鑒定基因與基因間的大量標簽序列(EST,STS等),以較低的等價基因組數把他們繪制成重疊圖。1.雜交測序和基因作圖雜交測序(SBH)是發展基因芯片技術的52附:標簽序列expressedsequencetags,EST:表達序列標簽,為cDNA的部分序列,平均為300-500bp,它可以確定基因的種類和所代表基因表達的拷貝數。目前,公共數據庫中可利用的人類EST超過100萬個,它可能代表所有人類基因的50%-90%。sequencetaggedsite,STS:序列標簽位點,是指染色體定位明確,而且可以用PCR擴增的單拷貝序列,一般每隔100kb距離就有一個標記。附:標簽序列expressedsequencetags532.檢測基因突變如果基因易發生突變區段的核苷酸序列是已知的,則DNA芯片能很容易地通過再測序鑒別出僅1個堿基的錯配。以下面的15nt的探針為例,每個探針只有中間一個核苷酸不同,以紅體下劃線表示。1.GCTACTCATGCGTAC2.CTACTCATGCGTACT3.TACTCATGCGTACTC4.ACTCATGCGTACTCC5.CTCATGCGTACTCCG6.TCATGCGT
ACTCCGT2.檢測基因突變如果基因易發生突變區段的核苷酸序列是已知的,54TACGCATACTCAACGTA
CGTTACGCAT552.CTACTCATGCGTACT
3.
TACTCATGCGTACTC4.ACTCATGCGTACTCC1.ACTCATGAGTACTCC
TACTCA2.CTACTCA563.基因表達分析1)肺癌相關基因的表達研究
黃達輝毛裕民等用含4096條cDNA基因的表達譜芯片研究一組肺癌組織樣本的基因表達譜,共篩選出差異表達的基因370條,包含已知基因146條,未知基因224條,其中107條表達增加,263條表達降低。(第二軍醫大學學報,2000,21(9):827-830)3.基因表達分析1)肺癌相關基因的表達研究572)基因芯片對PMA激活的血管內皮細胞早期反應基因的研究吳超群,李瑤,毛裕民,等.摘要:用含4096條人類基因的DNA芯片研究PMA激活的血管內皮細胞ERG的表達譜,作用6h后,17條基因表達上調,11條基因下調。數據分析表明17條上調基因中13條屬于蛋白質磷酸酶和轉錄調控因子基因,而下調基因中9條為細胞分裂相關蛋白,從而證明PMA激活的人血管內皮細胞ERG主要是轉錄調控因子基因和蛋白質磷酸酶基因。2)基因芯片對PMA激活的血管內皮細胞早期反應基因的研究584.基因芯片在腫瘤研究中的應用 1)尋找腫瘤相關基因2)腫瘤基因表達譜研究3)腫瘤相關基因功能研究4)腫瘤分子生物學研究5)腫瘤診斷4.基因芯片在腫瘤研究中的應用 1)尋找腫瘤相關基因591)尋找腫瘤相關基因Welford等結合消減雜交技術,用基因芯片分析了兩例具有不同生物學活性的Ewing肉瘤標本,一例為生長迅速的轉移灶,另一例為被成功治愈的局限灶。經差異表達后,將消減文庫插入質粒,制成cDNA文庫,與不同熒光標記的肉瘤組織雜交,共得到173條差異表達的基因,其中有50條為新基因(28.9%)。1)尋找腫瘤相關基因Welford等結合消減雜交技術,用基602)腫瘤基因表達譜研究Kononen等用含有4000條已知基因和2000個EST的cDNA芯片對兩株分別為激素依賴(CWR22)和非激素依賴(CWR22R)的前列腺癌細胞進行雜交,將其表達譜與269例前列腺癌組織及正常前列腺組織比較,發現在芯片的5148條基因中,有3條基因(0.7%)在非激素依賴中表達超過2倍,有135條基因(2.6%)下調超過50%,其中上調的IGFBP2和HSP27基因在臨床激素抵抗復發腫瘤標本中分別有100%和31%也是上調的。2)腫瘤基因表達譜研究Kononen等用含有4000條已知基613)腫瘤分子生物學研究Alizadeh等用基因芯片對DLBCL(diffuselargeB-celllymphoma)進行的病理分型研究發現,依據基因表達差異,DLBCL還可以分為三個亞型。(Nature,2000,403:503-511).3)腫瘤分子生物學研究Alizadeh等用基因芯片對D624)腫瘤診斷國外有一個病人臨床表現出典型的白血病癥狀,但形態學檢測不典型,根據相關檢查,診斷為AML(acutemyeloidleukaemia),治療幾個月后未見好轉。后來用DNA芯片與病人骨髓的mRNA雜交,結果顯示AML和ALL(acutelymphoblasticleukaemia)基因都表達較低,而在數據分析中發現,編碼原肌球蛋白的基因表達極高,從而確診為肺泡彈狀肌肉瘤,改變治療方案,病情出現緩解。4)腫瘤診斷國外有一個病人臨床表現出典型的白血病癥狀,但形態635.基因芯片在藥物研究中的應用1)藥物篩選直接檢測化合物對生物大分子如受體、酶、離子通道等的結合及作用。檢測化合物作用于細胞后基因表達變化。選擇合適的藥物作用靶標
有人用5,766個基因的芯片分析正常與癌變的卵巢組織的mRNA,發現二者有30%的基因表達差異為2倍以上,其中癌變組織9%的基因表達上調,尤以CD9、上皮糖蛋白、P27蛋白等。5.基因芯片在藥物研究中的應用1)藥物篩選直接檢測化合物對生64不同個體結合藥物的靶標存在差異。小分子藥物在體內的作用靶標不可能有絕對專一性。2)指導合理用藥不同個體結合藥物的靶標存在差異。2)指導合理用藥656.基因芯片在微生物菌種鑒定中的應用菌種鑒定細菌基因分型及菌種鑒定監測細菌抗藥性基因6.基因芯片在微生物菌種鑒定中的應用菌種鑒定667.基因芯片在病原體致病機制中應用1)致病機制研究研究病原體基因組,了解其致病基因,抗藥機制及抗藥基因等。分析藥物作用下病原體基因表達情況監測宿主在染病狀態下基因表達的變化7.基因芯片在病原體致病機制中應用1)致病機制研究672)病原體致病機制的研究1996年Kozal等首次用基因芯片技術發現HIV-1包膜B蛋白酶極其多變,其中許多氨基酸的改變與抗蛋白酶抑制劑的抗藥性有關。
2)病原體致病機制的研究1996年Kozal等首次用基因芯688.基因芯片在軍事司法方面的應用檢測生物戰病原體,研制生物戰保護劑。DNA指紋鑒定、血型鑒定;8.基因芯片在軍事司法方面的應用檢測生物戰病原體,研制生物691)DNA指紋DNAfingerprint:人類基因組內散布著許多串聯重復的短小DNA序列,叫小衛星DNA(MSDNA),由于不受選擇壓力,衛星DNA呈現高度的多態性,具有孟德爾式穩定遺傳的特性。因此,用MSDNA探針與總DNA限制性酶切片段(酶切位點在MSDNA之外)雜交,可以得到個體特異的DNA指紋圖譜。1)DNA指紋DNAfingerprint:人類基因組內70第五節數據分析1.圖象分析(Imageanalysis)2.標準化處理(Normalization):是指以持(管)家基因(housekeepinggene)的表達率為參照,對原始數據進行校正的過程。實際操作中常常剔除Cy3和Cy5信號強度均小于400
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