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文檔簡介

1、(三)DNA的高級結構:(1)1953年Watson與Crick提出的DNA雙螺旋結構模型,主要有三方面依據:核酸化學結構和核苷酸鍵長和鍵角數據。DNA X-射線衍射分析。DNA堿基組成的Chargaff規則;同一物種不同組織和器官,DNA堿基組成 具有生物種特異性。且摩爾數為A=T,G=C,A+C=G+T。(2)DNA二級結構:W- C DNA分子雙螺旋結構模型見P480圖13-5,要點如下:兩條反向平向的多核苷酸鏈圍繞同一中心軸相互纏繞,兩條鏈均為右手螺旋。堿基位于雙螺旋內側,核酸與核糖在外側,彼此通過3 ,5 -磷酸二酯鍵相連 接,形成DNA分子骨架。堿基平面與縱軸重直,糖環平面與縱軸平

2、行。多核 苷酸鏈方向3一5為正向(P487圖13- 6),形成一條大溝和一條小溝。雙螺旋平均直徑為2nm,兩個相鄰堿基對之間相距高度為0.34nm,兩核苷酸 之間夾角為360沿中心軸每旋轉一周有10個核苷酸,每一轉的高度(螺距) 為 3.4nm。兩條鏈被堿基之間形成的氫鍵連成一體,互相匹配,A與T配對,形成兩個氫 鍵,G與C配對,形成三個氫鍵。堿基在一條鏈上的排列順序不受任何限制,一條鏈序列確定后則決定另一條互 補鏈序列。遺傳信息由堿基序列所攜帶。DNA結構可受環境影響而改變,有A、B、C、D、E和Z型等不同構象存在。A、B型是DNA基本構象,E型為左手雙螺旋。B型:為W- C雙螺旋結構,DN

3、A鈉鹽在較高濕度下(92%)制得的纖維結構。A型:螺體較寬而短,RNA分子雙螺旋區以及RNA- DNA雜交雙鏈具有與A- DNA相似結構。P489表13-6 A、B和Z型DNA的比較。DNA二級結構主要是形成雙螺旋,但在某些情況下也能形成三股螺旋,第三 股的堿基可與W- C堿基對中嘌吟堿形成配對。P489圖13-10三股螺旋DNA 堿基配對。H-DNA是通過分子內折疊形成的三股螺旋(P490圖13-11 H- DNA結構), 它存在于基因調控區,因而有重要生物學意義。(3) DNA三級結構:DNA三級結構指DNA分子(雙螺旋),通過扭曲和折疊形成的特定構象,包 括不同二級結構單元間的相互作用,

4、單鏈與二級結構單元間的相互作用以及DNA 的拓撲特征。超螺旋是DNA三級結構的一種形式,是雙螺旋的螺旋。將環狀DNA分子再額外多轉幾圈或少轉幾圈,都會使雙螺旋中存在張力,為 抵消張力,環狀DNA分子的軸再曲繞而形成超螺旋,左旋為負,右旋為正。DAN分子十分巨大,要組裝到有限的空間,壓縮比達1000-2000,組裝成染色 體則高達8000-10000 (p492表13-7)。為此絕大多數DNA以超螺旋形式存在, 把很長的DNA壓縮成很小的體積內。如人類第一號染色體DNA長7.2cm,經彎 曲纏繞后只有近10m(壓縮約7700倍)。由于DNA雙螺旋為右旋,負超螺旋(左旋)有利于雙螺旋解旋,自然界存

5、在 的環狀DNA幾乎全是負超螺旋。DNA復制、重組或轉錄時,必須解旋解鏈,暴露出DNA結合位點,使各種調 控蛋白發揮作用,隨后再形成超螺旋,存在拓撲學問題。生物過程需負超螺旋程 度不同,可通過DNA拓撲異構來調節其功能。環狀DNA的一些重要拓撲學性質:(拓撲學是數學的一個分支,研究物體變形后仍保留下的結構特性。)連環數L:為一條鏈以右手螺旋繞另一條鏈纏繞次數,為一個整數。L值不同,則為拓撲異構。扭轉數T:指DNA分子中的Watson- Crick螺旋數。天然DNAT變化不大,變化時 有張力。超螺旋數W:為超螺旋的超繞數,右旋為正,左旋為負。L、T、W三者關系:L=T+W L為整數,T、W可帶小

6、數。比連環差入:表示超螺旋程度入=L- L0/L0 L0為松弛環形DNA (無超螺旋)的L值。P491圖13- 12環狀DNA不同構象: 人:線型DNA。B:環狀 DNA,松弛型 DNA,L=25,T=25,W=0。C:解鏈環狀:擰松兩周后,可形成兩種環狀DNA,一種即為解鏈環狀L=23, T=23, W=0有張力;另一種為超螺旋DNA,為D。D:負超螺旋:形成超螺旋(左旋)消除解鏈影響,在力能學上有利,為自發過 程,L=23,T=25,W=- 2。DNA拓撲異構:除連環數不同外(如上述L=25, L=23),其他性質均相同的DNA 分子。雙螺旋DNA在拓撲異構變化中T相同,是W不同導致L不同

7、。DNA拓撲異構現象:為DNA超螺旋狀態與解旋狀態之間的相互轉換,不發生堿 基組成或順序(一級結構)的任何變化,是DNA復制、重組或轉錄時所必需的。拓撲異構酶:引起DNA拓撲異構之間轉變的酶,可改變DNA拓撲異構體的L值, 有兩類:I類:使雙鏈超螺旋DNA轉變成松弛型環狀DNA,每一次催化作用可消除一個 負超螺旋,L值增加1。II類:使松弛型環狀DNA轉變成負超螺旋型DNA,每次催化作用使L減少2, 又稱促旋酶。兩類酶含量嚴格控制,使細胞內DNA保持一定超螺旋水平。(2) DNA與蛋白質復合物的結構(四級結構)病毒、細菌擬核和真核生物的染色體都存在DNA的組裝和一定程度的壓縮。核小體是真生物染

8、色質的基本結構單位,由核小體鏈形成纖維,進而折疊螺旋化, 組裝成不同層次結構的染色質和染色體。病毒:通常只有幾個至幾十個基因,主要由核酸和蛋白質組成,有時還含有脂 質和糖類。病毒的侵染性由核酸決定。核酸位于內部,蛋白質包裹著核酸為衣殼,有的還有脂蛋白被膜。由宿主不同,病毒分為噬菌體(宿主細菌與放線菌),植物病毒和動物病毒。 動物病毒含DNA或含RNA,有的還有被膜,如流感病毒(冠狀病毒),表面有 許多突起,見P494圖13- 14,流感病毒為RNA病毒。(二)RNA的高級結構:RNA通常是單鏈線型分子,但可自身回折形成局部雙螺旋(二級結構)進而折疊 (三級結構),除tRNA外,幾乎全部細胞中的RNA都與蛋白質形成核蛋白復合物(四 級結構)。RNA病毒是具有感染性的RNA復合物。(1)tRNA的高級結構:二級結構都是呈三葉草形,P496圖13-18,雙螺旋區構成葉柄,另外有幾個 突環區。氨基酸臂:3 -末端CCA,可接受活化的氨基酸。二氫尿嘧啶環:有兩個DHU。反密碼環:環中部為反密碼子,由3個堿基組成,次黃嘌吟核苷酸常出 現于反密碼子中,反密碼子可識別mRNA的密碼子。額外環:是tRNA分類重要指標。Tw C環:幾乎所有tRNA

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