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文檔簡介
1、50個腫瘤核心基因·ABL1·全名:Abelson murine leukemia viral oncogene homolog 1。ABL1基因位于第9號染色體上臨床作用:當BRA基因與ABL1基因型成BRA-ABL1融合基因的時候,新的BRA-ABL1融合蛋白就會使細胞的增生脫離細胞因子的控制,細胞癌化BRA-ABL1融合基因是慢性粒細胞性白血病的一個重要病因治療藥物:依馬替尼Imatinib mesylate是針對BRA-ABL1融合基因的抑制劑,也是治療此種癌癥的靶向治療藥物AKT1全名:RAC-alpha serine/threonine-protein kina
2、se。位于第14號染色體上。AKT1是細胞分裂、生長的正調控元件。AKT1可以抑制細胞的凋亡,促進細胞生長在橫紋肌實體瘤中有發現AKT1過表達抑制劑:Selleck公司出品的“MK-2206 2HCl是一種高度選擇性的Akt1/2/3抑制劑。ALK全名:Anaplastic lymphoma kinase,位于2號染色體上功能:ALK在神經發育過程中起重要作用,是正調控元件與腫瘤的關系:EML4-ALK融合基因占非小細胞肺癌中的35%,EML4有一個強啟動子,與ALK融合之后,EML4-ALK基因的表達水平大幅升高,ALK酶活性也大幅升高。抑制劑,克唑替尼crizotinib是針對ALK的抑制
3、劑,對ALK融合基因導致的肺癌有良好療效APC全名:Adenomatous polyposis coli,位于5號染色體長臂APC基因是一個腫瘤抑制基因,主要通過調節其下游的-catenin發揮作用APC的失活突變缺失、截斷、無義點突變會導致細胞分裂的失控,帶有APC突變的人,在40歲左右發生結直腸癌的可能性大幅升高ATM全名:Ataxia telangiectasia mutated,位于11號染色體ATM基因是一個腫瘤抑制基因,主要在DNA雙鏈受到損傷的時候,阻止細胞進入分裂周期而起作用ATM失活與多種白血病、淋巴瘤相關BRAFBRAF基因編碼B-raf蛋白,是一個激酶,位于7號染色體上B
4、RAF蛋白激活后導致MEK/ERK的激活,使細胞不進入凋亡程序BRAF蛋白的完全活化需要T598和S601兩個位點的磷酸化。但是如果BRAF發生V600E突變,那么無需T598和S601兩個位點的磷酸化,BRAF就已獲得持續的活性,并刺激細胞進入分裂周期抑制劑,維羅非尼Vemurafenib、和索拉菲尼Sorafenib是獲FDA批準的BRAF V600E突變腫瘤的靶向藥物CDH1全名:Cadherin-1,位于16號染色體CDH1是一種依賴于鈣離子的細胞粘合蛋白,是一種抑癌基因。CDH1與癌細胞的浸潤、癌細胞轉移相關當CDH1基因發生突變失活時,細胞更容易突破基底膜、侵入到周圍的組織中去CD
5、KN2A全名:cyclin-dependent kinase inhibitor 2A,又名P16基因,位于9號染色體CDKN2A是一種抑癌基因,其蛋白可以抑制或延緩細胞從G1期轉到S期CDKN2A的突變與缺失與多種癌癥的發生相關CSF1R全名:Colony stimulating factor 1 receptor,位于5號染色體CSF1R編碼一個跨膜蛋白,這個蛋白是colony stimulating factor 1CSF1的受體。CSF1能夠促進巨噬細胞的分裂、增殖CSF1R和慢性骨髓單核細胞性白血病、以及M4急性成髓細胞白血病相關。CSF1R和CSF1都和乳腺癌相關EGFR全名:ep
6、idermal growth factor receptor,又名HER1。位于7號染色體上。功能:是重要的細胞生長的細胞膜外表受體。EGFR是表皮細胞生長的重要調控蛋白,EGFR下游的信號轉導通路主要有兩條:一條是Ras/ Raf/ MEK/ERK-MAPK 通路,而另一條是PI3K/Akt/mTOR通路。多種癌癥都與EGFR的過量表達有關系。與腫瘤的關系:EGFR的mRNA表達水平上下,對EGFR靶向治療效果,會有顯著差異。mRNA表達水平高的非小細胞肺癌患者,往往經針對EGFR的靶向治療后有良好效果。而mRNA表達水平低的非小細胞肺癌患都,經EGFR的靶向治療,往往沒有太好的效果。與治療
7、藥物的關系:針對EGFR的小分子藥物有吉非替尼gefitinib、iressa、厄洛替尼erlotinib、tarceva和拉帕非尼lapatinib、 tykerb等。針對EGFR的單抗藥物有西妥昔單抗cetuximab、erbitux、帕尼單抗panitumumab、vectibix、尼妥珠單抗nimotuzumab、泰欣生。經臨床實踐證明,上述藥物都對多種腫瘤有明顯的抑制作用。基因檢測:各種基因突變,有些會導致耐藥、另一些會導致藥物敏度。廈門艾德、上海透景等公司都開發了一系列的突變檢測試劑盒,來檢測EGFR的各種可能的突變目前是檢測29種突變。ERBB2也稱HER2全名:Receptor
8、 tyrosine-protein kinase erbB-2,又稱HER2,human epidermal growth factor receptor 2。位于第17號染色體的長臂。功能:ERBB2參與MAPK、PI3K/Akt、PKC、STAT等一系列的信號通路。與腫瘤的關系:乳腺癌中30%有ERBB2的突變。與治療藥物的關系:赫賽汀Herceptin,曲妥珠單抗是對針對ERBB2的靶向藥物,另外帕妥珠單抗Pertuzumab也是針對ERBB2的藥物。基因檢測:赫賽汀十分昂貴,而且有心臟毒性,所以用赫賽汀之前應做ERBB2的基因檢測,ERBB2基因表達升高的、拷貝數增加的病人,赫賽汀的治
9、療效果會更好。erbB4·全名:Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4,又名:HER4。位于2號染色體上功能:和其它的erbB基因一樣,erbB4也是一個膜受體蛋白,也同樣是酪氨酸激酶與腫瘤的關系:erbB4與多種腫瘤相關尤其與乳腺癌相關EZH2全名:Histone-lysine N-methyltransferase,位于7號染色體上功能:把3個甲基化基團加到組蛋白3Histone 3的第27號賴氨酸基團上,這會導致染色體的收緊。與腫瘤的相關性:EZH2的過量表達會導致多種原發的癌癥,原因是它過量表達后,會抑制多種抑癌基因的表達。
10、;FBXW7全名:F-box/WD repeat-containing protein 7。位于4號染色體。功能:FBXW7直接與細胞周期蛋白Ecyclin E作用,并很可以導向細胞周期蛋白E參與泛素介導的降解作用。與腫瘤的關系:在卵巢癌、乳腺癌和結直腸癌發現有FBXW7的突變。FGFR1§全名:Fibroblast growth factor receptor 1 。是成纖維細胞生長因子家族的一員。功能:這是一個膜受體蛋白,也是一個酪氨酸激酶。與腫瘤的相關性:與肺鱗癌相關。FGFR2全名:Fibroblast growth factor receptor 2。是成纖維細胞生長因子家
11、族的一員。功能:它是一個酪氨酸激酶。與腫瘤的相關性:一個第2內含子的點突變與一種高乳腺癌風險相關。FGFR3全名:Fibroblast growth factor receptor 3。與腫瘤的相關性:缺少FGFR3與膀胱癌相關FLT3全名:Fms-like tyrosine kinase 3,又名:Cluster of differentiation antigen 135 (CD135).功能:它是一個三類受體酪氨酸激酶與腫瘤的相關性:FLT3的串聯持拷貝數增加是急性髓性白血病中最常見的突變,而且有這種突變也意味著預后不好相關藥物:有發現索拉非尼對FLT3陽性的急性髓性白血病有良好的療效G
12、NA11·全名:Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11。又名:Gq亞基。位于第9號染色體上。功能:GNA11是一種G蛋白其功能是激活磷酯酶Cphospholipase C,進爾參與一系列的信號通路。GNAS全名: G-protein alpha subunit。位于20號染色體上。與腫瘤的相關性:與腦垂體瘤相關GNAQ全名:Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha。位于第9號染色體上。HNF1A全名:hepatocyte nuclear factor 1
13、homeobox A。位于第12號染色體。功能:這是一個轉錄因子,與幾種肝臟特異的基因表達調控有關。HRAS§全名:GTPase HRas,又名:transforming protein p21。位于第11號染色體。功能:這是一個小的G蛋白,也是small GTPases的一員。一旦結合到GTP上,HRaf就會激活c-Raf之類的Raf kinase,并進一步激活MAPK/ERK通路。與腫瘤的相關性:HRAS與膀胱癌有密切的關系HRAS假設發生G12V、G12S突變,那么其活性就永久激活HRAS的突變與甲狀腺癌、腎癌也有關系IDH1全名:Isocitrate dehydrogenas
14、e 1 (NADP+,異檸檬酸脫氫酶)。該基因位于2號染色體上。功能:異檸檬酸脫氫酶催化異檸檬酸轉變成戊鄰酮二酸與腫瘤的相關性:IDH1的突變會導致干骺端軟骨瘤病,并且IDH1與膠質母細胞瘤相關.JAK2·全名:Janus kinase 2。該基因位于9號染色體。功能:這是一種不依賴于受體的酪氨酸激酶。與腫瘤的關系:在白血病人中發現在TEL-JAK2融合基因。JAK3§全名:Janus kinase 3。該基因位于第19號染色體功能:JAK3是一個酪氨酸激酶,主要在造血細胞中表達,如NK細胞、T細胞和B細胞,這一點與同基因家族的JAK1、JAK2在各種細胞中的廣泛表達不一樣
15、。JAK3主要在免疫細胞中表達,主要是在被白介素激活后發揮其酪氨酸激酶的功能而起作用。與腫瘤的關系:JAK1、JAK2、JAK3的活化突變,都已被確認是血液性的癌癥的病因。藥物:有一種編號為CP-690550Tofacitinib,星熠艾克的JAK3抑制劑,已經在臨床驗證中顯示出很明確的療效。IDH1全名:Isocitrate dehydrogenase 1 (NADP+),異檸檬酸脫氫酶1。位于第2號染色體上。功能:IDH1催化異檸檬酸的氧化脫羧2-酮戊二酸。與腫瘤的關系:膠質母細胞瘤與IDH1有關系。 IDH1突變往往是在低級別膠質瘤開展的第一步,IDH1基因突變在這些腦腫瘤形成的關鍵事件
16、。IDH1突變與生存期延長相關。膠質母細胞瘤與野生型IDH1基因有只有1年的中位總生存期,而IDH1突變的膠質母細胞瘤患者有2年以上的中位總生存期。JAK2全名:Janus kinase 2。位于第9號染色體。功能:JAK2是一個非受體酪氨酸激酶,是催乳素受體的下游,被催乳素受體激活。與腫瘤的關系:在白血病人中有發現JAK2和TEL的融合基因,也發現有JAK2和PCM的融合基因JAK3全名:Tyrosine-protein kinase。位于第19號染色體上。功能:JAK3主要表達于免疫細胞,并且響應白細胞介素受體的磷酸化信息號再向下傳遞激活信號。與腫瘤的關系:JAK3突變會導致免疫能力低下,
17、而免疫力低下是腫瘤不被免疫排除的重要原因。IDH2·全名:Isocitrate dehydrogenase,異檸檬酸脫氫酶2。位于第15號染色體。功能:是三羧酸循環中的一個重要的酶,把異檸檬酸脫氫,變成-酮戊二酸。與腫瘤的關系:IDH酶通常將異檸檬酸轉化為-酮戊二酸鹽KG。然而,與癌癥(cancer)相關的IDH突變產生了一種酶,能夠將KG轉化為2-羥戊二酸2HG。2HG能夠競爭性地抑制KG的靶點,后者具有DNA和組蛋白脫甲基酶活性。因此,2HG產物導致了基因表達中的變化,這些變化之前被報告能夠導致受損的分化。IDH2突變導致了分化抑制,并在不同的腫瘤背景下改變了DNA甲基化和過度增
18、殖。藥物:當用一種小分子化合物AGI-6780治療IDH2突變的小鼠白血病AML細胞時,AML細胞停止了增生和分化。KDR全名:Kinase insert domain receptor,也叫VEGFR-2vascular endothelial growth factor receptor 2 ,血管內皮生長因子2,。位于4號染色體功能:KDR那么主要介導內皮細胞的增殖,導致血管通透性的增高,并阻止內皮細胞凋亡,維持內皮細胞的存活,與胚胎期內皮細胞的分化有關與癌癥的關系:腫瘤的生長和擴散依賴于血管生成。腫瘤血管生成對于腫瘤的發生、開展、轉移及預后具有重要作用,腫瘤血管生成是一系列復雜的調控過
19、程,其中VEGF及其受體發揮著重要作用抑制劑:Regorafenib是KDR的特異性抑制劑,并已得到FDA的批準,用于結腸癌Foretinib是KDR的抑制劑,同時也是c-Met的抑制劑lenvatinib, motesanib, Pazopanib等也是KDR的抑制劑KITCD117全名:Mast/stem cell growth factor receptor,又名:CD117。功能:CD117是在造血干細胞外表表達的一種細胞因子受體。這個受與與干細胞因子結合后形成一個二聚體,這個二聚體激活其內在的酪氨酸激酶的活性,然后在細胞內激活下游的信號途徑與腫瘤的關系:精細胞腫瘤中經常會有CD117
20、的第17個外顯子的突變,而且這種腫瘤中還常常有CD117的過表達。CD117與白血病、黑色素瘤、胃腸道間質腫瘤相關藥物:Gleevec格列衛,Imatinib,如果病人有CD117在17號外顯子的突變,Gleevec就會有效。dasatinib和nilotinib也有應用KRAS全名: V-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog。位于12號染色體功能:KRAS是一個分子開關,一旦它翻開,它就會活化多種分裂、增殖因子,例如:c-Raf和PI 3-kinase。KRAS會和GTP結合,把GTP的最末一個磷酸基切掉,讓它變成GDP。在把G
21、TP變成GDP后,KRAS就關閉了。正常情況下,KRAS活化后,會馬上失活。但是KRAS基因突變后,KRAS蛋白持續保持活化狀態,導致細胞持續增生與腫瘤的關系:與結直腸癌的關系密切。20%的非小細胞肺癌中有KRAS突變與藥物的關系:KRAS是EGFR信號通路的下游結點。如果KRAS發生持續活化突變,那么針對EGFR的抑制劑藥物,如:易瑞沙Iressa,gefitinb和特羅凱erlotinib,Tarceva,往往無效。所以,用針對EGFR的靶向藥物治療前,建議檢測KRAS的突變狀態METHGFR全名:MNNG HOS Transforming gene,又名HGFR、c-MET。位于7號染色
22、體功能:Hepatocyte growth factorHGF是MET的配體,它是可激活MET。被激活的MET啟動一系列的生物反響,并會引起入侵性生 長。MET參與的信號通路:RASPI3KSTATbeta-cateninNotch異常的MET活性會導致血管的生長,并以此支持腫瘤的營養。與腫瘤的關系:激活關鍵的生長通路促進血管生長促進細胞的分散,這也導致腫瘤的轉移MET基因倍培是透明細胞瘤的一個潛在生物標記物與藥物的關系:有MET基因倍增的結直腸癌腫瘤,對抑EGFR的治療有抗性一系列的MET抑制劑被研發出來:K252aSU11274PHA-665752ARQ197ForetinibSGX523
23、MP470HGF的抑制劑HGF是唯一的MET配體,所以能夠阻斷HGF作用的物質,也可能會是有效的抑制MET活性的物質MET的假底物CGEN241是MET酶的借底物,對動物模型中,對阻止腫瘤的生長和轉移有很有效主動免疫治療白介素2IL-2被FDA批準用于腎細胞癌、和轉移的黑色素瘤,這兩種瘤都常常有MET活性失控的情況。MLH1§全名:MutL homolog 1。位于3號染色體上。功能:MLH1是人類基因中與大腸桿菌MutL同源的一個基因,MutL在大腸桿菌中負責對DNA錯配的修復。與腫瘤的關系:MLH1基因的突變與遺傳性非息肉結直腸癌有密切關系。MPLCD110§全名:My
24、eloproliferative leukemia virus oncogene,又名Thrombopoietin Receptor促血小板生成素受體、CD110。位于1號染色體上。功能:MPL是一個細胞因子受體,與配體結合后,能把下游的信號蛋白STAT、MAPK等的酪氨酸殘基磷酸化。與腫瘤的關系:MPL與骨髓增生白血病有關系。NOTCH1全名:Notch homolog 1。位于3號染色體。功能:Notch1基因在發育過程中控制細胞的分化命運。與腫瘤的相關性:Notch1與白血病相關。NPM1全名:Nucleophosmin,又名:nucleolar phosphoprotein B23、n
25、umatrin。位于5號染色體上。功能:NPM1與核仁核糖體蛋白相關,能與單鏈或雙鏈的核酸相結合。與腫瘤的相關性:在多種腫瘤中都發現NPM1的上調、突變、或者染色體易位。當NPM1高表達時,會抑制P53/ARF通路NRAS·全名:Neuroblastoma RAS viral oncogene homolog。位于1號染色體。功能:與KRAS基因相近,對細胞的生長起調控作用。也是GTP酶,可以將GTP分解成GDP。與腫瘤的相關笥:與多種腫瘤相關。PDGFRA§全名:Alpha-type platelet-derived growth factor receptor,是PDG
26、FR的a亞基。位于4號染色體。功能:是血小板衍生生長因子家族的受體,也是一個細胞外表的酪氨酸激酶。激活MAPK通路激活PI3K通路與腫瘤的關系:與胃腸道間質瘤有關系相關藥物:Crenolanib (CP-868596)是一種有效的,選擇性的PDGFR/抑制劑,Kd為2.1 nM/3.2 nM,也有效抑制FLT3,對D842V突變型而不是V561D突變型敏感,作用于PDGFR比作用于c-Kit, VEGFR-2, TIE-2, FGFR-2, EGFR, erbB2,和Src選擇性高100倍以上。PIK3CA全名:phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-k
27、inase, catalytic subunit alpha,是PIK3的亞基。又名:P110。位于第3號染色體上。功能:PIK3激活PI3K/AKT/mTOR通路中的蛋白激酶B的活性。PIK3是一個重要的信號通路的關鍵酶。與腫瘤的關系:在許多腫瘤中,都存在PIK3的突變。這些突變大多數是導致激酶的活性更高。抑制劑:Wortmannin是一種PI3K抑制劑PTEN全名:Phosphatase and tensin homolog。位于10號染色體。功能:是一個磷酸酯酶,專門使PIP3脫掉磷酸基團。這個活性的作用是阻斷AKT信號通路。是一個抑癌基因。可以抑制細胞的分裂生長,并可以導致細胞的凋亡。
28、與腫瘤的關系:在人類腫瘤中,PTEN是最常見的被喪失的基因。在前列腺腫瘤中,70%都有喪失至少一個拷貝。在膠質母細胞瘤、子宮內膜癌、和前列腺癌中經常發現PTEN的失活突變。PTEN的突變也會導致各種癌變傾向。PTPN11全名:Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11,又名Shp2。位于12號染色體。功能:PTPN11是一個酪氨酸磷酸酯酶。它可以把結合在酪氨酸殘基上的磷酸基團水解下來。與腫瘤的關系:帶有PTPN11突變的患者,很容易得少年單核細胞白血病。在神經母細胞瘤,黑色素瘤,急性髓細胞性白血病,乳腺癌,肺癌,結腸直腸癌中有發現PTPN
29、11的活化突變。有報道:PTPN11既有促癌的作用,也有抑癌的作用RB1全名:retinoblastoma protein。位于第13號染色體功能:這是一種抑癌基因,可以抑制E2F因子的作用,而E2F-DF是一種把細胞推進到S期的重要因子。這也是一個染色體重新組織的因子,它可以召集甲基化酶和乙酰化酶。與腫瘤的關系:如果兩個RB1等位基因都突變了,這人就會視網膜母細胞瘤,并因此瞎掉。RET全名:RET proto-oncogene。位于10號染色體上。功能:RET是一個受體酪氨酸激酶,參與神經的形成。缺少這個基因的人會得先天性巨結腸癥因為腸子沒有神經控制,就不會蠕動,大便把腸子撐得很大。與腫瘤的
30、關系:RET功能增強性的突變,會導致:甲狀腺髓樣癌,多發性內分泌瘤形成2A型,和2B型,嗜鉻細胞瘤和甲狀旁腺增生相關藥物:凡德他尼(vandetanib)是EGFR、VEGFR和RET酪氨酸激酶的抑制劑。卡博替尼Cabozantinib是VEGFR2, Met, FLT3, Tie2, Kit and Ret的強效抑制劑。SMAD4全名:Mothers against decapentaplegic homolog 4。位于第18號染色體上。功能:SMAD4和SMAD1、SMAD2等因子相結合,型成復合物,結合到DNA上以轉錄因子的形式起作用。與腫瘤的關系:在結直腸癌和胰腺癌中經常發現有SMA
31、D4的突變。它也在常染色體顯性遺傳病幼年性息肉綜合癥中被發現有突變,這些息肉很可以開展成結腸癌。SMARCB1全名:SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1。位于第22號染色體。功能:這個基因所編碼的蛋白,是解開染色體壓縮結構的復合蛋白的一個組成局部。它能使轉錄復合體能夠更高效地結合到目標基因區域上。將編碼核蛋白質也可結合并增強HIV-1整合酶對DNA的結合活性。與腫瘤的關系:這是一個腫瘤抑制基因,與惡性橫紋肌樣瘤有關系。SMO全名:Smoothened。位于第7號染色體。功能:SMO是hedgehog pathway信號通路中的主要蛋白。SMO在細胞中的位置有很重要的作用,用hedgehog配體刺激patched受體,會導致SMO從細胞外表轉移到原纖毛上。與腫瘤的關系:SMO是一個原癌基因,如果發生活化突變,會導致hedgehog p
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