1、如何查找基因序列？在Genbank中尋找目的基因的實例1.根據文獻搞reasearch肯定要讀文獻的，如果你曾經在文獻中看到過你感興趣的基因，而且文中還提到了該基因在Genbank中的ID號，那就好辦了，直接打開,在Search后的下拉框中選擇Nucleotide,把GenbankID號輸入GO前面的文本框中，點“GQ就可以找到他了。舉例說明，例如：在2003年JBC的文章（ConditionalKnock-outofIntegrin-linkedKinaseDemonstratesanEssentialRoleinProteinKinase

2、B/AktActivation中出現了“calreticulin（GenBankaccessionnumbergi16151096那么把“16151096俞入GO前面的文本框中，點“GO,就可以找到該基因了（當然包括基因序列等相關信息）。在出現了檢索結果界面（下圖）后，直接點擊紅箭頭所指的AY047586就可以看到基因的相關信息了.（呵呵，是不是有點太.easy了）這里需要指出一下，在顯示基因的頁面右側有一個Link,點擊后出現一個小菜單，里面是與該基因相關的鏈接，很有用的，值得一個一個地去看看，這里我就不多說了。點擊AY047586后出現的界面如下：如果你只想獲得序列（例如去設計PCR引物的

3、時候），那就可以選擇FASTA這樣就得到了FAST的式的序列文件，沒有其他數字和格式的干擾。EIEIDIEDEEEIEEEDUPGAKDEL*ma匚口Ept.LctcS.593，QfCJtW/product-vasesin/notf*derivedfromcalrclcuLIhfollouingpojt-tranalationalcleavage,rORIGINL611211日LML501*1421白LS415D15617217&13419EJ196Latffccffgagggtcgtzttaei舊匚DGjtqGcqctqct*口LUftaggagcdgtcrcrggacaqtuagam；tc

4、aaattcaaaaggtctgcagacaag口三：aguaa。口國鐵。guGmq專。口，uq貝。？q明cqqug*acggaartcteatgtgcaa.crg-atga呵/g-a.agaiztecacccaaagaAtecaacu&匚七七七七也七0三n七一七actgaeaetcagcqaciq已七ccaaga.tcgfttgatcccacactg(2cctgatgct.aii.jaacccagtgattc-agaacrccrtca3attacaaqgqcaettqqctfhatitetacacctflft1081LL4L101125Ljjaacgagacqtggegtaitjigcaga

5、s。工工eiaq口考號miga門aaqq弓gqaiqjgga工首800區1321usq/qcig口力etgaggeetg1331cvgtgragactegagaaerttftggycccyc-ggiQGCVGGVCgggagacgggccggfTgcac值二寸u二QqQQQ5gO0GQLaicatgtctgtacaagggeicsczctgtcicacaggrggagtgatcctgatgactccaagccccgaggact(孑七raEij-farccacccafflaeictttoacrtett5aesa3a&aggcrsg口小州總中只3口gmoammgmgcccagcctsggaQCCT

6、Ctcctgcac3iI1615109JobIATO458t.11Hennasnpien?CBlretLculinICALR)ruRNA,ceiftpletscdsCTGXGGAGflCTCGTTTIAiAGGG-CCGGCGCGTTGCCGGCCCTGGGCCCGCCATGCTGCTATCCG7GCCMTWTGCTCCOCCTCiTCM-MTCGCCdTCCeCGAdCeTCeeGTCTICTTClAMiMljCTrTCTCGjGGAGXCGGGTiTGJICT7CCCGCTGGATCGAATCCX1ACACAATCAG*TTTT&GAAATTCGTTlTC1GTTCCOKARGTTCTK匚

7、8TO*CGAi(jAGA.AAiJATkAA7GTTTGCAOA：AAGCCJITGCAC(jCTTTTJlTtKTUTGTCSCCAGTTTCGJIGCCTTTCAKAACAJLAGCCAGAfCACCk.；AAjTTC1T6TqATr-TTC*二丁耳匚N中HGa05gqtqaTAA(；aXXACATC：C4TTGCA*8；*丁。問T74匚4CACCTGTACACACTGATTGTGCGCCIGACAACiCCTATGACGTGAACATTC-ACAACA(XCAGGTCC1GT:GGCTCCrrCMAkiMCGATTCKiGACTTCCTGCCICCC1G1AG1TJULAGiSATCC

8、TG1TGCTTCAJUiACC2.根據已經獲得的基因的相關信息進行查找如果只是知道基因的名字，怎么查序列呢？還是舉例說明，比如我想做的基因名稱是人的VEG現因，那么怎么在Genbank中找到它呢？還是一步一步來.打開/在search后面的下拉框中選擇Gene,然后在中間的文本框中輸入基因名稱“VEGF點擊GO.搜索結果出來了，letmesee.啊，怎么這么多？689條，哪一條是我想要的基因呢？點擊箭頭所指的Limits我們接著來，在Limits這個界面，先選擇查詢的限定范圍。我們要找什么基因來著？想起來了，是人的VEGFfflU,那就開始選

9、擇：先選Genename儂因名稱）；然后再選擇LimitbyTaxonomy（生物分類BS定）中的Homosapiens（人類），然后再點擊“GO直接點擊基因名稱“VEGFA可以看到有關基因的信息了。需要指出的是，在Genbank中，基因有很多別名（Aliases）,和Genbank中記錄的名稱有可能不一致，大家要睜大眼睛哦。比如在這里，VEGFAIGenbank中記錄的基因名稱，而它還有很多別名，比如MGC70609,VEGF（這就是我們要找的基因名稱），VEGF-A,VRF還有，在這里可以看到該基因在染色體上的位置.點擊VEGFAf出現界面再往下看，可以看至UGenomicregions,transcripts,andproducts這里顯示了該基因在基因組中的位置，以及轉錄本的生成情況：就看見了目的基因的mRNA的鏈接（如NM_001025366.1）和蛋白質的鏈接（如NP_001020537.2)這里得說兩句，有的基因也許只有一個編碼序列，但有的基因有很多的mRNA剪接體，但都是歸在一個基因名稱下面。比如，在VEGF基因下面有7個序列，分別是vascularendothelialgrowthfactorAisoforma,isoform