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文檔簡介
1、中醫藥行業數據庫建設現狀分析中國中醫研究院中醫藥信息研究所崔蒙中醫藥行業的數據庫建設起源于上個世紀80年代,經過20余年的建設已經取得了初步的成果。到目前為止,已經有數十個中醫藥大學、學院及研究院所建設了各種規模不同的、近百個中醫藥信息數據庫,初步實現了中醫藥信息數字化。1 現代文獻型及事實型數據庫建設現狀分析中醫藥現代文獻型及事實型數據庫的建設開始于上個世紀80年代,至今已經開展了20余年。目前,已經形成了以國家中醫藥管理局中國中醫藥文獻中心及其分中心為主體的中醫藥文獻型及事實型數據庫群,這些數據庫已經均投入使用。其主要數據庫如下表所示:數據庫名稱研制單位年限及數據量數據源形式中國中醫藥期刊
2、文獻數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄1984-2003年的40余萬條數據國內900余種生物醫學期刊文獻型中國中醫藥新聞數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄1989-2003年的3萬余條數據國內中醫藥相關報刊文獻型疾病診療數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄4000余種疾病的相關中西醫診斷及治療數據權威書籍事實型中國中藥數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄了約8500種中藥相關數據權威書籍事實型中國方劑數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄了約90000余首方劑相關數據權威書籍事實型中藥化學數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄了3000余種中藥化學成份的相關數據權威書籍事實型中國醫藥產品數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收
3、錄了7000多種中西藥品的相關數據各藥品生產機構的介紹材料事實型國家基本藥物數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄了列入國家基本藥物的825種中西約品的相關數據權威書籍事實型中藥新藥品種數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄了85年以來的中藥新藥品種的相關數據相關資料事實型中藥非處方藥數據庫中國中醫藥文獻檢索中收錄了中國政府四批發布的2000余種非處方藥的權威書籍事實型心中藥信息中國藏藥數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄了約500條數據權威書籍以及近年來藏藥臨床應用的最新信息事實型中國醫藥企業數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄了7000余家醫藥企業的相關數據相關資料事實型方劑現代應用數據庫中國中醫藥文獻檢索中
4、心收錄了7000余條現代中醫約文獻中后關方劑應用的相關數據相關期刊及書籍事實型中國醫院數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄了全國各地區級以上14000余家醫院的相關信息數據相關資料事實型中國醫藥衛生科技成果數據庫中國中醫藥文獻檢索中心收錄了1979年至2002年全國3900項中醫約科研成果的相關數據相關資料文獻型中醫藥題錄數據庫上海市中醫藥科技情報所分中心1950-1996年相關期刊文獻型中醫藥文摘數據庫上海市中醫藥科技情報所分中心1993-1998年相關期刊文獻型中藥數據庫上海市中醫藥科技情報所分中心1994-1995年相關期刊文獻型中醫約專題數據庫上海市中醫藥科技情報所分中心1993-1998
5、年共分為13個專題相關期刊文獻型中醫中西醫結合腫瘤數據庫上海市中醫藥科技情報所分中心1993-1998年相關期刊文獻型上海百名老中醫學術經驗資料多媒體光盤數據庫上海市中醫藥科技情報所收錄了上海市百名老中醫學術經驗數據相關資料事實型上海市中醫資源及運行情況綜合統計信息管理系統上海市中醫藥科技情報所分中心收錄了上海市中醫資源的統計數據相關資料事實型上海市中醫藥科研成果庫上海市中醫藥科技情報所分中心1960-2003年上海市中醫藥科研成果數據相關資料文獻型上海市中醫藥專家庫上海市中醫藥科技情報所分中心每年更新上海市副局以上中醫約專家的數據相關資料事實型中醫藥學術期刊外科專病全文檢索系統上海中醫藥大學
6、分中心1990-2001年相關期刊文獻型中國中醫藥年鑒數據庫上海中醫藥大學分中心1995-1997年相關期刊文獻型美國FDA與中醫藥相關政策文獻檢索系統上海中醫藥大學分中心2001年相關資料文獻型中醫藥學術期刊題錄數據庫上海中醫藥大學分中心1982-2001年相關期刊文獻型中藥藥性、藥效、藥理成方數據庫上海中醫藥大學分中心收錄了500余種中藥藥性、藥效、藥理成方數據相關資料事實型中醫脈管炎文摘數據庫上海中醫藥大學分中心1990-2001年相關期刊文獻型古今氣功數據庫浙江中醫藥研究院分中心1949-1998年相關期刊、書籍文獻型浙江省建國以來中醫藥科研成果管理數據庫浙江中醫藥研究院分中心1949
7、-1995年浙江省中醫藥科研成果的相關數據庫相關資料文獻型吉林省中醫中藥研究科技成果數據庫吉林中醫中藥研究院分中心1958-1999年吉林省中醫中藥研究科技成果的相關數據相關資料文獻型高血壓病專題文獻數據庫河南省中醫藥研究院分中心1949-2003年相關期刊文獻型心腦血管病專題文獻數據庫河南省中醫藥研究院分中心1949-2003年相關期刊文獻型糖尿病專題文獻數據庫河南省中醫藥研究院分中心1949-2003年相關期刊文獻型湖南省中醫藥科技資料管理系統湖南中醫藥研究院分中心湖南省中醫藥科技資料相關數據相關資料事實型全國醫藥期刊中醫藥文獻目錄文檔微機動態處理系統湖南中醫藥研究院分中心1991-200
8、1年相關期刊450種文獻型全國中醫藥、中西醫結合科技文獻綜述微機檢索系統湖南中醫藥研究院分中心1995-2001年相關期刊450種文獻型中醫藥治療肝病文獻檢索系統湖北中醫學院分中心1980-1992年相關期刊文獻型男性計劃生育文獻湖北中醫學1980-1992年相關期刊文獻型檢索系統院分中心中醫藥治療腦血管疾病文獻檢索系統湖北中醫學院分中心1980-1992年相關期刊文獻型氣功文獻檢索系統湖北中醫學院分中心1980-1992年相關期刊文獻型中醫藥治療風濕類疾病專題數據庫湖北中醫學院分中心1984-2001年相關期刊文獻型臺灣醫藥衛生文獻數據庫福建中醫學院分中心收錄1970-1998年24460余
9、條數據。40余種臺灣生物醫學類、衛生類期刊文獻型臺灣研究機構數據庫福建中醫學院分中心收錄1998年臺灣1291研究機構的相關資料相關資料事實型臺灣名人數據庫福建中醫學院分中心收錄1998年臺灣2701名人的相關資料相關資料事實型臺灣中醫藥分析咨詢系統福建中醫學院分中心包括臺灣中醫藥科研課題庫、臺灣中醫約專家庫、臺灣中醫約紀事庫、臺灣中醫期刊庫、臺灣中醫約文摘庫、臺灣中醫約學位論義庫、臺灣中醫師名錄庫、臺灣中醫約教育庫、臺灣中醫機構庫臺灣中醫約圖書庫等10個數據庫相關期刊、資料文獻型及事實型臺灣野生食用植物庫(多媒體)福建中醫學院分中心收錄臺灣地區可供食用的86科256種野生或栽培植物相關資料事
10、實型臺灣藥用植物資源庫福建中醫學院分中心收錄1028條臺灣藥用植物資源的相關數據相關資料事實型臺灣制藥產業數據庫福建中醫學院分中心收錄了臺灣制藥產業的相關數據相關資料事實型臺灣醫療機構數據庫福建中醫學院分中心收錄了臺灣醫療機構的相關數據相關資料事實型臺灣信息產業數據庫福建中醫學院分中心收錄了臺灣信息產業的相關數據相關資料事實型全球暢銷藥品數據庫福建中醫學院分中心收錄了全球暢銷藥品的相關數據相關資料事實型中藥方劑研究數據庫廣州中醫藥大學分中心收集中藥和方劑的相關信息相關資料事實型從上述資料不難看出,中醫藥現代資料數據庫的建設已經具有一定的規模,幾乎涉及到中醫藥信息的各個方面。但同時也存在著嚴懲的
11、問題。這主要表現為:一是重復建設的現象嚴重,造成大量資源浪費;二是持續性建設狀態不好,相當一批數據庫沒有能夠保持維護;三是無論是事實型還是文獻型數據庫,多為單表型數據庫,給數據的進一步利用和挖掘造成了很大的困難。因此,在今后的工作中,應注意盡可能集中全國中醫藥行業的數據庫建設力量,共建共享,最大可能的避免資源重復建設;同時注意對已建數據庫的維護,使其能夠持續發展,不斷更新;另外,還要注意對數據庫的深層加工,提高數據庫的附加值,增加數據的可利用度,更好的為中醫藥事業的發展做出貢獻。2 結構型數據庫建設現狀分析由于目前文本挖掘技術,尤其是中文文本挖掘技術還很不成熟,因此,提高數據利用度的一個重要方
12、面就是建設結構型數據庫,只有在結構型數據庫的基礎上才有可能較好地實現數據挖掘。目前,國內外中醫藥結構型數據庫的建設還很不完善,尚未涉及到中醫藥信息的各個方面,但已經開展的工作,為中醫藥結構型數據庫的建立,以及進一步的數據挖掘奠定了較好的基礎。北京中醫藥大學的任廷革教授開發研制的結構型古代中藥數據庫已經具有一定規模。國家中醫藥管理局中國中醫藥文獻檢索中心利用虛擬研究中心平臺,聯合全國十多家中醫藥大學、學院及科研機構于2002年開始建設結構型中藥科技基礎信息數據庫。該數據庫共設計了中藥單味藥、中藥品種、中藥生藥材鑒定、中藥藥理、中藥臨床藥理、中藥毒理及中藥化學成分等七個單表數據庫,七個數據庫共設立
13、了158字段,通過關聯形成了一個統一的結構型數據庫,使用戶可通過該數據庫方便地獲得相關中藥的全部權威的科技基礎信息數據。為了保證數據加工的一致性,該數據庫設計了26張標準表,為全國十多家參與工作的技術人員提供標準詞匯。到2003年底,該數據庫收錄的中藥單味藥數據將達到11000種。為了保證中藥科技基礎信息數據庫的數據的準確性,收入該數據庫的全部數據均來自國家或行業標準、權威工具書以及中醫院校的統編教材。目前該數據庫已經通過國際互聯網投入使用。通過該數據庫的關聯檢索功能,專業人員可方便地檢索到所需資料,并可方便地獲得所需要地歸類資料,如歸屬某一經、歸屬某一性味、含有某一化學成、具有某一功效、能夠
14、治療某一證候、某一癥狀、某種疾病等的全部中藥材資料。但從總體情況看,中醫藥行業的結構型數據庫的開發還很不完善,尤其是涉及中醫醫療領域的結構型數據庫幾乎還是空白,需要加大開發力度,以便為中醫藥數據的深度挖掘和充分利用奠定基礎。3 數據倉庫建設現狀分析研究數據倉庫技術是為了更好地對具有高維、小樣本特點的中醫藥科學實驗數據實現統計分析,提高數據的利用程度?;谝陨峡紤],中國中醫藥文獻檢索中心及其分中心在2001年利用虛擬研究中心平臺開展了基于數據倉庫技術的中藥科學實驗信息數據庫建設的研究。該數據倉庫收錄了自1990年以來公開出版的中文生物醫學期刊上的有關中藥單味藥、方劑、化學成份在藥理、臨床藥理、毒
15、理方面進行研究的一次實驗文獻。收錄原則為全面收錄中藥實驗研究的一次文獻數據,轉載或綜述性文章均不進行收錄。該項研究采用計算機數據倉庫技術,以忠實原文獻內容為原則,首先對中藥實驗數據進行了調研,認為中藥科學實驗研究范圍廣泛、內容不集中,因此具有數據分散及高維、小樣本的特點,難以進行統計分析,嚴重阻礙了中藥科學實驗數據的利用。為此,該項研究建立了具有十五個空間維(文獻出處、單味藥、化學成分、方劑、劑型、疾病、證候、癥狀、病理生理、效應部位、微生物、藥理分類、臨床藥理分類、毒理分類、指標)的中醫藥科學實驗信息數據庫,十五個維基本全面表達了中藥科學實驗數據的內涵值,可以支撐數據的分析。十五個維表均采用
16、了規范的數據,同時又擁有靈活的排列組合方式,可以根據需要進行數據組合。中藥科學實驗信息數據庫提供了用戶應用平臺,構建了數據查詢與應用界面,作為中藥實驗數據倉庫首次服務于用戶,成為中藥學科及相關專業必備的工具。由于中藥數據倉庫技術起點高、結構清晰、數據抽取主題概念明確,因而提供了最大的服務與應用空間。同時,本平臺具備數據統計與頻次排序,提供了數據評價的功能。本數據庫具有以下特點:(1)數據結構設計合理,數據加工規范,具備一般數據庫查詢的功能。(2)提供了檢索數據的自身評估功能,存在著遠期數據增值能力:應用平臺提供的十五維檢索途徑,從不同的入口進入以獲得不同的統計結果;如:通過疾病入口,可以進行與
17、中藥材、化學成份、方劑研究相關的數據組合檢索,用戶根據研究需求,擴充或限定檢索,獲得所需的研究數據,并同時獲得數據頻次的統計,為研究提供一定的思路。中藥科學實驗信息數據庫應用平臺有可能為中藥知識發現與挖掘提供新的途徑。4 古代文獻數據庫建設現狀分析中醫藥古代文獻是中醫學的寶貴財富,中醫學的發展是在繼承基礎上的發展,因此,中醫古代文獻的利用對中醫學的發展具有至關重要的作用。中醫藥古代文獻數字化的工作起源很早,但早期建設的數據庫多是單本或數本著作的數據庫,如陜西省中醫藥研究院開發的13種古代文獻數據庫。以后雖然開發了具有數百種中醫藥古代文獻的光盤數據庫,但由于中醫古代文獻的特殊性,這些數據庫基本只
18、能作為電子圖書館進行使用,也就是說,其主要功能是電子圖書的功能。此外,亦有一些專病的古代文獻數據庫,如上海中醫藥大學開發的中醫膽道疾病古籍文獻數據庫,但規模均較小。直到近年,中國中醫研究院中國醫史文獻研究所副所長柳長華教授提出了基于知識元知識表示體系的結構化中醫古代文獻據庫建設的構想,才較好地解決了中醫古代文獻的數字化問題。柳長華教授認為,傳統文獻型數據的全文檢索、關鍵字檢索不能夠滿足用戶對中醫古代文獻知識獲取的需求,其關鍵問題主要在于沒有適合于古代文獻的知識表示方法以及文獻結構化處理技術。因此,柳長華教授在研究分析古代中醫文獻知識結構的基礎上,提出了以知識元為核心的知識表示體系,建立了結構化的古代中醫文獻數據庫。柳長華教授認為,知識表示是研究知識從自然記載形式過渡到適合計算機處理的表示形式,只有在此基礎上才能實現對知識的處理(包括知識的存儲、推理與獲取等);此外,中醫藥古代文獻中的知識具有高度復雜性,通常存在不完全性、不確定性、模糊性等,這些給知識的表示與處理帶來很大困難,因此必須建立以知識元為核心的知識
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