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文檔簡介
1、實驗一 質粒的提取酶切實驗目的掌握質粒小量快速提取法。用瓊脂糖凝膠電泳法鑒定其純度。實驗原理質粒是一種染色體外的穩定遺傳因子。 大小在1200kb之間,具有雙鏈閉 合環狀結構的DNA分子。主要發現于細菌、放線菌和真菌細胞中。質粒具有自主 復制和轉錄能力, 能使子代細胞保持它們恒定的拷貝數, 可表達它攜帶的遺傳信 息。他可獨立游離在細胞質內, 也可整合到細菌染色體中, 它離開宿主的細胞就 不能存活,而它控制的許多生物學功能卻賦予宿主細胞的某些表型。采用溶菌酶可破壞菌體細胞壁,十二烷基磺酸鈉(SDS可使細胞壁裂解, 經溶菌酶和陰離子去污劑(SDS處理后,細菌DNA纏繞附著在細胞壁碎片上, 離心時易
2、被沉淀出來,而質粒DNA則留在上清液中。用酒精沉淀洗滌,可得到質 粒 DNA。在細胞內,共價閉環DNA(cccDNA常以超螺旋形式存在。若兩條鏈中有一 條鏈發生一處或多處斷裂, 分子就能旋轉而消除鏈的張力, 這種松弛型的分子叫 作開環DNA(ocDNA。在電泳時,同一質粒如以 cccDNA形式存在,它比其開環 和線狀DNA的泳動速度都快,因此在本實驗中,質粒 DNA在電泳凝膠中呈現3 條區帶。限制性內切酶是一種工具酶,這類酶的特點是具有能夠識別雙鏈 DNA分子上 的特異核苷酸順序的能力,能在這個特異性核苷酸序列內,切斷DNA的雙鏈,形 成一定長度和順序DNA片段。EcoR I和Bgl II的識
3、別序列和切口是:EcoR I : GJ AATTCBgl II : A J GATCTG, A等核苷酸表示酶的識別序列,箭頭表示酶切口。限制性內切酶對環狀 質粒DNAt多少切口,就能產生多少酶切片段,因此鑒定酶切后的片段在電泳凝 膠的區帶數, 就可以推斷酶切口的數目, 從片段的遷移率可以大致判斷酶切片段 大小的差別。用已知分子量的線狀DNA為對照,通過電泳遷移率的比較,就可以 粗略推測分子形狀相同的未知 DNA的分子量。實驗步驟(一)質粒的提?。ǘ?.培養細菌 將帶有質粒DHa勺大腸桿菌接種于5ml含100卩g/ml氨芐青 霉素的1X LB中,37C培養過夜。2. 取液體培養菌液置塑料離心管
4、中,10 000r/min離心lmin,去掉上清液。加入 150卩l溶液I,充分混勻,在室溫下放置10min。3. 加入200卩l新配制的溶液II,加蓋后溫和顛倒510次,使之混勻,冰上放 置 2min。4. 加入150卩l冰冷的溶液III,加蓋后溫和顛倒510次,使之混勻,冰上放置 10mi n。5. 用臺式高速離心機,10 000r/min離心5min,將上清液移入干凈的離心管中。6. 向上清液中加入等體積酚/氯仿(1: 1, v/v ),振蕩混勻,轉速10 000r/min , 離心2min,將上清液轉移至新的離心管中。7. 向上清液加5mol/LNaCI至終濃度為L,混勻,再加入2倍體積無水乙醇,混 勻,室溫放置2min,離心5min,倒去上清乙醇溶液,把離心管倒扣在吸水紙上, 吸干液體。8. 加70%乙醇,振蕩并離心,倒去上清液,真空抽干或室溫自然干燥。9. 加入50卩l含RNase A 20卩g/ml的TE緩沖液溶解提取物,室溫放置 30min 以上,使DNA充分溶解待用或置-20 C備用(也可用試劑盒按操作步驟提取質粒)10. 將抽提出來的質粒進行瓊脂糖凝膠電泳(三)質粒的酶切和鑒定質粒DNA酶切的加樣重組質粒5 yL10X
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