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文檔簡介
利 用 ITS 進 行 菌 種 鑒 定 是 目 前 較 多 采 用 的 方 法 。 ITS 是 內 源 轉 錄 間 隔 區 ( Internally Transcribed Spacer)的英文縮寫, 位于rRNA 編碼基因18S,5. 8S和28S之間的小基因片段。其優 點有: 具有高拷貝數,整個序列的長度在600800 bp,利用rDNA通用引物能夠很容易被擴增出來; 同時包含保守與變異序列, 能根據保守序列中的變異位點設計特殊引物進行特異性擴增比較, rRNA基因(rDNA)在微生物的鑒定應用中,具有檢測微生物種水平的多態性特征。這些rDNA高度保守地分布在染色體的不同位置,在每個單倍染色體基因組中的拷貝數超過200個,這使得保守區域 能夠很容易被擴增出來。每個重復的rDNA 序列的存在方式為由一前一后的18S rDNA 小亞基單元 (SSU) , 5.8S rDNA, 28S rDNA大亞基單元(LSU)組成,已設計出通用引物來擴增ITS序列分析相關 真菌種水平之間的差異。 本研究通過絲狀真菌ITS保守序列的擴增, 同源序列的對比分析 ,結合傳統鑒定方法,對從土壤中分離篩選的一株絲狀真菌進行了分析鑒定,并對鑒定結果和方法進行了比 較分析。 種內變異還顯示在rDNA基因間內轉錄間隔區和(分別為ITS和ITS)的片段大小上。 ITS區在核糖DNA中進化較快,可在同一屬間甚至群體間發生變化。其中ITS區在種間變異性較高(22),種內變異性較低(3) 。選擇的兩對引物均以ITS區的序列為靶目標,其中引物(ITS1和ITS4)擴增的是ITS區、5.8SrDNA和ITS區的基因序列,可以鑒別出念珠菌屬的3個菌種; 引物(ITS4和ITS86)擴增的是5.8S rDNA和28S rDNA之間的ITS區的保守順序,可以鑒別出念珠菌屬的7個菌種。因而筆者更推薦采用引物,它不僅有很強的通用性,能識別更多菌種,而且具有更高的屬種特異性。1、通用引物: ITS1 5-TCCG TAGG TGAA CCTG CGG一3ITS4 5-TCCT CCGC TTAT TGAT ATGC一3通用引物 ITS4 5-TCCT CCGC TTAT
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