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產(chǎn)品中文名稱:尿路上皮癌相關(guān)8種基因檢測(cè)試劑 3 3 3 3 4 4 6 10 11 14杭州可幫基因科技有限公司浙江省杭州市臨平區(qū)余杭經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)新顏路22號(hào)7幢301M杭州市臨平區(qū)龍船塢路157號(hào)3幢5層502室;杭州市臨平區(qū)龍船塢路157號(hào)5幢3層1309、1310室一、產(chǎn)品概述(一)產(chǎn)品主要組成成分產(chǎn)品主要組成成分見表1:表1試劑盒主要組成成分123DNA聚合酶、脫氧核糖核苷三磷酸4567具體內(nèi)容詳見產(chǎn)品說明書。(二)產(chǎn)品預(yù)期用途本產(chǎn)品用于體外定性檢測(cè)人尿液脫落細(xì)胞樣本中編碼RNACA9、CCL18、ERBB2、IGF2、MMP12、PPP1R14D、SGK2和非編碼RNASWINGN共8種尿路上皮癌相關(guān)基因的表達(dá)水平。本產(chǎn)品用于疑似尿路上皮癌初診患者的輔助診斷。本產(chǎn)品采用熒光PCR方法對(duì)上述8個(gè)基因的表達(dá)水平進(jìn)行檢測(cè),適用于有血尿、膀胱刺激癥等臨床癥狀,或經(jīng)影像學(xué)等非侵入性方法顯示異常,臨床可能需進(jìn)一步檢查的疑似尿路上皮癌初診患者的輔助診斷,尤其是經(jīng)影像學(xué)等非侵入性方法無法決策病例是否進(jìn)行鏡檢的輔助診斷,可為患者提供一種尿路上皮癌的無創(chuàng)輔助診斷選擇,但不能作為腫瘤早期診斷或確診的依據(jù)。臨床醫(yī)生應(yīng)結(jié)合患者病情及其他實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)指標(biāo)等因素對(duì)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行綜合判斷。(三)產(chǎn)品包裝規(guī)格24測(cè)試/盒。(四)產(chǎn)品檢驗(yàn)原理本產(chǎn)品檢驗(yàn)原理主要包括RNA提取、逆轉(zhuǎn)錄及熒光定量PCR三個(gè)步驟。通過核酸提取試劑提取尿液脫落細(xì)胞中的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)產(chǎn)生cDNA。采用雙重PCR分別檢測(cè)8個(gè)尿路上皮癌相關(guān)靶基因,每個(gè)反應(yīng)管分別檢測(cè)1個(gè)靶基因和人源管家基因(GAPDH)的表達(dá)水平,通過ΔCt值反映細(xì)胞中8個(gè)靶基因的表達(dá)水平。人源管家基因GAPDH作為內(nèi)部參照(以下簡(jiǎn)稱內(nèi)參,InternalControl(IC))系統(tǒng),對(duì)樣本RNA提取、逆轉(zhuǎn)錄和PCR反應(yīng)過程進(jìn)行質(zhì)量控制,其Ct值參與計(jì)算。本產(chǎn)品利用特異性的引物對(duì)8個(gè)尿路上皮癌相關(guān)基因及內(nèi)標(biāo)基因GAPDH進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并通過TaqMan探針對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè),在實(shí)時(shí)熒光PCR平臺(tái)上獲取樣本尿路上皮癌相關(guān)基因的表達(dá)Ct值。采用《尿路上皮癌基因分析軟件》對(duì)待測(cè)樣本的各基因表達(dá)Ct值進(jìn)行分析,計(jì)算樣本的綜合評(píng)分,獲得分析結(jié)果。二、臨床前研究概述(一)主要原材料1.主要原材料的選擇該產(chǎn)品的主要原材料包括引物、探針、dNTP、DNA聚合酶及對(duì)照品等。其中對(duì)照品為申請(qǐng)人自行生產(chǎn),其他原材料均通過外購的方式獲得。申請(qǐng)人對(duì)主要原材料進(jìn)行了供應(yīng)商的選擇,通過功能性實(shí)驗(yàn)篩選出合格供應(yīng)商,制定了各主要原材料的技術(shù)要求和質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)并經(jīng)檢驗(yàn)合格。2.企業(yè)參考品和對(duì)照品的設(shè)置情況該產(chǎn)品企業(yè)參考品包括陽性參考品、陰性參考品、檢測(cè)限參考品和重復(fù)性參考品,均由臨床樣本制備而成。陽性參考品:8份,來源于試劑盒涵蓋的不同臨床分期和病理分級(jí)的尿路上皮癌樣本。陰性參考品:5份,來源于試劑盒檢測(cè)范圍外的其他泌尿系統(tǒng)良惡性疾病樣本。檢測(cè)限參考品:2份,分別為產(chǎn)品檢出限參考品和基因表達(dá)檢出限參考品。重復(fù)性參考品:4份,包含弱陽性、強(qiáng)陽性濃度水平的產(chǎn)品重復(fù)性參考品和基因表達(dá)重復(fù)性參考品。基因表達(dá)檢出限參考品和重復(fù)性參考品均由臨床尿路上皮癌RNA樣本經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄得到cDNA后,采用數(shù)字PCR方法測(cè)定拷貝數(shù)后進(jìn)行制備而成;其余參考品均由臨床樣本提取的RNA制備而成。該試劑盒同時(shí)設(shè)置了陽性對(duì)照和陰性對(duì)照,用于檢測(cè)過程中試劑和儀器的質(zhì)量控制。此外,每個(gè)樣本均檢測(cè)內(nèi)參基因,用于結(jié)果的判讀及評(píng)估樣本的質(zhì)量。(二)生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系研究申請(qǐng)人對(duì)試劑盒反應(yīng)體系的研究包括引物探針濃度、PCR擴(kuò)增預(yù)混液用量、逆轉(zhuǎn)錄酶和逆轉(zhuǎn)錄預(yù)混試劑用量的確定等;對(duì)反應(yīng)條件的研究包括逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)程序、PCR反應(yīng)程序和基線的確定等;對(duì)樣本采集處理、樣本保存時(shí)間、樣本用量和核酸提取進(jìn)行了研究。通過功能性實(shí)驗(yàn),最終確定了最佳的反應(yīng)體系。申請(qǐng)人根據(jù)試劑盒中試劑及組件的主要生產(chǎn)工藝的研究結(jié)果,確定了最佳的生產(chǎn)工藝。(三)分析性能評(píng)估該產(chǎn)品分析性能評(píng)估內(nèi)容包括準(zhǔn)確度、分析特異性(交叉反應(yīng)和干擾物質(zhì)研究)、檢出限和精密度。1.準(zhǔn)確度研究在準(zhǔn)確度研究中,申請(qǐng)人收集了若干例經(jīng)臨床確診為尿路上皮癌或泌尿系統(tǒng)其他良惡性疾病的臨床樣本,進(jìn)行真實(shí)臨床樣本的陽性/陰性符合率的測(cè)試,以評(píng)估產(chǎn)品檢測(cè)的準(zhǔn)確度。測(cè)試結(jié)果符合要求。2.分析特異性分析特異性研究采用三批次試劑盒進(jìn)行了交叉反應(yīng)和干擾物在交叉反應(yīng)研究中,申請(qǐng)人對(duì)臨床確診為非尿路上皮癌的樣本,包括泌尿系統(tǒng)良性病變和其他泌尿系統(tǒng)惡性腫瘤;以及對(duì)靶基因的同源序列進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果均顯示申報(bào)產(chǎn)品無交叉反應(yīng)。在干擾物質(zhì)研究中,申請(qǐng)人對(duì)18種與尿液相關(guān)的內(nèi)源和外源性潛在干擾物質(zhì)(血、葡萄糖、蛋白質(zhì)、乙醇、氯化鈉、血紅蛋白、左氧氟沙星、布洛芬、維生素C、大腸桿菌、白色念球菌、金黃色葡萄球菌、淋球菌、解脲脲原體、絲裂霉素、吡柔比星、吉西他濱、卡介苗)進(jìn)行了不同濃度下的對(duì)比測(cè)試,分析干擾物質(zhì)在高濃度條件下對(duì)樣本檢測(cè)結(jié)果的影響,結(jié)果表明產(chǎn)品特異性良好,均未產(chǎn)生非特異性反應(yīng)。3.檢出限研究檢出限研究包括產(chǎn)品檢出限和基因表達(dá)檢出限研究。申請(qǐng)人采用多例樣本和多批試劑分別進(jìn)行了建立和驗(yàn)證研究,建立確定產(chǎn)品檢出限為RNA濃度不高于6.5ng/μL,基因表達(dá)檢出限為不高于40拷貝/μL;并使用三批次試劑盒進(jìn)行驗(yàn)證,均符合要求。4.精密度在精密度研究中,申請(qǐng)人采用三批次試劑盒對(duì)不同的臨床樣本進(jìn)行連續(xù)檢測(cè),統(tǒng)計(jì)其檢測(cè)結(jié)果,并對(duì)批內(nèi)、批間、日內(nèi)、日間、不同操作者以及實(shí)驗(yàn)室間精密度等進(jìn)行了評(píng)價(jià)。研究結(jié)果表明,各基因擴(kuò)增Ct值的變異系數(shù)CV均不高于5%,檢測(cè)結(jié)果(綜合評(píng)分)的變異系數(shù)CV均不高于15%。對(duì)三批次試劑盒采用企業(yè)強(qiáng)陽性產(chǎn)品重復(fù)性參考品和弱陽性產(chǎn)品重復(fù)性參考品進(jìn)行重復(fù)性檢測(cè),每批試劑盒每份參考品重復(fù)檢測(cè)10次,檢測(cè)結(jié)果均一致。對(duì)三批次試劑盒采用企業(yè)強(qiáng)陽性基因表達(dá)重復(fù)性參考品和弱陽性基因表達(dá)重復(fù)性參考品進(jìn)行重復(fù)性檢測(cè),每批試劑盒每份參考品重復(fù)檢測(cè)10次,每個(gè)靶基因的Ct值變異系數(shù)CV均不高于5%。(四)陽性判斷值研究本研究分為陽性判斷值的建立和驗(yàn)證兩部分。納入的陽性病例120例,包括膀胱尿路上皮癌、腎盂尿路上皮癌和輸尿管尿路上皮癌;陰性病例共納入192例,包括泌尿系統(tǒng)良性病變、泌尿系統(tǒng)其他腫瘤等,共計(jì)312例。本產(chǎn)品根據(jù)各基因檢測(cè)結(jié)果Ct值,使用《尿路上皮癌基因分析軟件》計(jì)算分析獲得樣本的綜合評(píng)分。采用ROC曲線分析對(duì)綜合評(píng)分進(jìn)行分析,確定本產(chǎn)品的陽性判斷值:綜合評(píng)分50;然后再采用驗(yàn)證集進(jìn)行獨(dú)立樣本驗(yàn)證,確認(rèn)本試劑盒的陽性判斷值設(shè)置合理。(五)穩(wěn)定性研究申請(qǐng)人對(duì)產(chǎn)品的貨架穩(wěn)定性(實(shí)時(shí)穩(wěn)定性)、運(yùn)輸穩(wěn)定性和使用穩(wěn)定性(包括開瓶穩(wěn)定性、凍融穩(wěn)定性)及樣本穩(wěn)定性進(jìn)行貨架有效期穩(wěn)定性:將三批次試劑盒置于規(guī)定儲(chǔ)存條件下保存,分別于不同時(shí)間點(diǎn)領(lǐng)取完整包裝的試劑盒,使用企業(yè)參考品對(duì)試劑盒的性能進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果表明試劑盒產(chǎn)品有效期為12個(gè)此外,申請(qǐng)人對(duì)產(chǎn)品的運(yùn)輸穩(wěn)定性、使用穩(wěn)定性和樣本穩(wěn)定性分別進(jìn)行了研究。結(jié)果顯示,產(chǎn)品的性能均滿足產(chǎn)品說明書的三、臨床評(píng)價(jià)概述申請(qǐng)人在復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院、浙江省人民醫(yī)院、浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬邵逸夫醫(yī)院3家臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)進(jìn)行臨床試驗(yàn),采用試驗(yàn)體外診斷試劑與臨床參考標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比較研究,確認(rèn)本產(chǎn)品的臨床性能。其中,尿路上皮癌和其他惡性腫瘤病例采用病理診斷確診,其他疾病根據(jù)相關(guān)診療指南進(jìn)行綜合診斷確診。入組病例包括:有血尿、膀胱刺激癥等臨床癥狀的病例,或經(jīng)影像學(xué)等非侵入性方法顯示異常,臨床需進(jìn)一步檢查的疑似尿路上皮癌初診患者,以及經(jīng)影像學(xué)等非侵入性方法無法決策是否進(jìn)行鏡檢的病例。樣本類型為尿液。臨床試驗(yàn)共納入臨床有效病例955例,其中尿路上皮癌病例338例(覆蓋尿路上皮癌的所有分期及病理分型),非尿路上皮癌的其他病例617例(包括其他易產(chǎn)生干擾的腫瘤及各種良性疾病病例)。試驗(yàn)結(jié)果顯示:本產(chǎn)品臨床靈敏度為95.86%(95%CI:93.17%-97.52%),臨床特異度為94.49%(95%CI:92.40%-96.03%),總符合率為94.97%(95%CI:93.40%-96.19%)。上述結(jié)果顯示試驗(yàn)體外診斷試劑具有較好的臨床靈敏度和特異度,滿足臨床使用需求。此外,采用試驗(yàn)體外診斷試劑對(duì)41例尿路上皮癌患者手術(shù)前后的樣本進(jìn)行監(jiān)測(cè),41例樣本術(shù)前檢測(cè)結(jié)果為陽性,其中39例術(shù)后檢測(cè)結(jié)果為陰性;2例術(shù)后檢測(cè)結(jié)果仍為陽性。結(jié)果表明尿路上皮癌患者手術(shù)切除后尿液中mRNA水平降低。綜上所述,臨床試驗(yàn)結(jié)果顯示該產(chǎn)品臨床性能滿足技術(shù)審四、產(chǎn)品受益風(fēng)險(xiǎn)判定根據(jù)《YY/T0316-2016醫(yī)療器械風(fēng)險(xiǎn)管理對(duì)醫(yī)療器械的應(yīng)用》及其內(nèi)部質(zhì)量管理體系規(guī)定執(zhí)行風(fēng)險(xiǎn)管理相關(guān)活動(dòng),對(duì)該產(chǎn)品進(jìn)行受益風(fēng)險(xiǎn)判定。(一)受益評(píng)估本產(chǎn)品采用熒光PCR方法對(duì)上述8個(gè)基因的表達(dá)水平進(jìn)行檢測(cè),適用于有血尿、膀胱刺激癥等臨床癥狀,或經(jīng)影像學(xué)等非侵入性方法顯示異常,臨床可能需進(jìn)一步檢查的疑似尿路上皮癌初診患者的輔助診斷,尤其是經(jīng)影像學(xué)等非侵入性方法無法決策病例是否進(jìn)行鏡檢的輔助診斷,可為患者提供一種尿路上皮癌的無創(chuàng)輔助診斷選擇,但不能作為腫瘤早期診斷或確診的依據(jù)。臨床醫(yī)生應(yīng)結(jié)合患者病情及其他實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)指標(biāo)等因素對(duì)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行綜合判斷。臨床應(yīng)用的主要受益為:該產(chǎn)品為臨床上疑似尿路上皮癌患者提供了一種輔助診斷方法的選擇。依據(jù)現(xiàn)有的臨床試驗(yàn)結(jié)果,其對(duì)尿路上皮癌的診斷性能與臨床參考標(biāo)準(zhǔn)相比,具有較好的一致性,可滿足臨床應(yīng)用基本要求。(二)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估申請(qǐng)人對(duì)已知危險(xiǎn)(源)進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)價(jià),按照風(fēng)險(xiǎn)可接受準(zhǔn)則判斷每個(gè)危險(xiǎn)(源)的風(fēng)險(xiǎn)是否達(dá)到可接受水平,對(duì)合理可行降低的風(fēng)險(xiǎn)、不經(jīng)過風(fēng)險(xiǎn)/收益分析既判定為不可接受的風(fēng)險(xiǎn)采取控制措施,并對(duì)具體措施進(jìn)行實(shí)施驗(yàn)證,同時(shí)重新對(duì)采取措施后的風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行估計(jì),確認(rèn)其風(fēng)險(xiǎn)水平是否可接受。盡管目前認(rèn)為該試劑盒的受益大于風(fēng)險(xiǎn),但為保證用械安全,基于對(duì)主要剩余風(fēng)險(xiǎn)的防控,已在該試劑盒說明書中提示以下信1.預(yù)期用途本產(chǎn)品采用熒光PCR方法對(duì)上述8個(gè)基因的表達(dá)水平進(jìn)行檢測(cè),適用于有血尿、膀胱刺激癥等臨床癥狀,或經(jīng)影像學(xué)等非侵入性方法顯示異常,臨床可能需進(jìn)一步檢查的疑似尿路上皮癌初診患者的輔助診斷,尤其是經(jīng)影像學(xué)等非侵入性方法無法決策病例是否進(jìn)行鏡檢的輔助診斷,可為患者提供一種尿路上皮癌的無創(chuàng)輔助診斷選擇,但不能作為腫瘤早期診斷或確診的依據(jù)。臨床醫(yī)生應(yīng)結(jié)合患者病情及其他實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)指標(biāo)等因素對(duì)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行綜合判斷。2.警示及注意事項(xiàng):該試劑盒說明書中明確了該試劑盒檢驗(yàn)方法的局限性及使用中的注意事項(xiàng)。依據(jù)《醫(yī)療器械監(jiān)督管理?xiàng)l例》(國(guó)務(wù)院令第739號(hào))、《體外診斷試劑注冊(cè)與備案管理辦法》(國(guó)家市場(chǎng)監(jiān)督管理總局令第48號(hào))等相關(guān)醫(yī)療器械法規(guī)與配套規(guī)章,經(jīng)對(duì)申請(qǐng)人提交的注冊(cè)申報(bào)材料進(jìn)行系統(tǒng)評(píng)價(jià),申報(bào)產(chǎn)品符合安全性、有效性的要求,符合現(xiàn)有認(rèn)知水平,建議準(zhǔn)予注冊(cè)。通用名稱:尿路上皮癌相關(guān)8種基因檢測(cè)試劑盒(PCR熒本產(chǎn)品采用熒光PCR方法對(duì)上述8個(gè)基因的表達(dá)水平進(jìn)行檢測(cè),適用癥等臨床癥狀,或經(jīng)影像學(xué)等非侵入性方法顯示異常,臨床可能需進(jìn)皮癌初診患者的輔助診斷,尤其是經(jīng)影像學(xué)等非侵入性方法無法決策病助診斷,可為患者提供一種尿路上皮癌的無創(chuàng)輔助診斷選擇,但不能診的依據(jù)。臨床醫(yī)生應(yīng)結(jié)合患者病情及其他實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)指標(biāo)等因素尿路上皮癌的診斷主要依靠尿脫落細(xì)胞學(xué)檢查和膀胱鏡/輸尿管鏡檢查等是診斷尿路上皮癌最可靠的方法,但是內(nèi)鏡檢查是侵入性檢查,不僅適,還可能造成感染和創(chuàng)傷[2,3]。隨著測(cè)序和芯片技術(shù)的發(fā)展,研究表明,液中的高頻率以及基因表達(dá)譜的信息性,通過尿液樣本進(jìn)行RNA表達(dá)譜檢測(cè)可癌的檢測(cè)[4]。通過核酸提取試劑提取尿液脫落細(xì)胞中的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反采用雙重PCR分別檢測(cè)8個(gè)尿路上皮癌相關(guān)靶基因,每個(gè)反應(yīng)管分別檢測(cè)1個(gè)靶源管家基因(GAPDH)的表達(dá)水平,通過ΔCt值反映細(xì)胞中8個(gè)靶基因的表達(dá)水平。人源基因GAPDH作為內(nèi)部參照(以下簡(jiǎn)稱內(nèi)參,InternalControl(IC系統(tǒng),對(duì)樣本RNA提取、逆轉(zhuǎn)錄和PCR反應(yīng)過程進(jìn)行質(zhì)量控制并通過TaqMan探針對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè),在實(shí)時(shí)熒光PCR圖1檢測(cè)流程圖表1試劑盒組成及組分表編號(hào)1劑2液3Mg2+4條567探針引物預(yù)混條采用8聯(lián)PCR管設(shè)計(jì),每一個(gè)8聯(lián)PCR管可檢測(cè)1份樣本,8聯(lián)PCR管上標(biāo)1-8(8聯(lián)PCR管示意圖請(qǐng)見圖2)。8聯(lián)PCR管1-8號(hào)管內(nèi)裝有相應(yīng)的尿(Gene1~Gene8)和內(nèi)參基因(GAPDH)檢測(cè)試劑(IC尿路上皮癌相關(guān)基因探編號(hào)檢測(cè)試劑熒光信號(hào)123456782)核酸提取或純化試劑:杭州可幫基因科技有限公司的尿液脫落細(xì)胞RNA提取試劑盒(吸3)分析軟件:杭州可幫基因科技有限公司的尿路上皮癌基因分析軟件,醫(yī)療器械注冊(cè)證書編微量紫外分光光度計(jì)、掌上離心機(jī)(帶適用于8聯(lián)PCR管的轉(zhuǎn)子)、移液器、4.運(yùn)輸條件:本試劑盒可在-15℃~-25℃溫度下運(yùn)輸;也可在泡沫箱加冰袋的條件下運(yùn)輸,箱時(shí)溫度應(yīng)不超過8℃,運(yùn)輸時(shí)間不超過84小時(shí)。本試劑盒適用于西安天隆科技有限公司的全自動(dòng)醫(yī)用PCR分析系統(tǒng)(Gentier96E)。2.樣本收集和保存:直接采用杭州可幫基因科技有限公司的樣本保存液(浙杭械備20201184號(hào))進(jìn)行尿液收集和保存。樣本保存液被預(yù)置分裝在材質(zhì)為聚烯烴塑料的收集管中,規(guī)格為4mL/瓶。使用裝有樣本保存液的收集管直接3.使用杭州可幫基因科技有限公司的尿液脫落細(xì)胞RNA提取試劑盒(吸附柱法浙杭械備/3)取1μLRNA溶液,測(cè)定其濃度和純度。RNA濃度應(yīng)≥6.5ng/μL且RNA吸注意:1)微量紫外分光光度計(jì),其RNA吸收光譜的掃描波長(zhǎng)范圍應(yīng)涵蓋220nm-2)可根據(jù)計(jì)算公式計(jì)算RNA濃度或微量紫外分光光度計(jì)直接給出濃度所需檢測(cè)樣本數(shù)量按下表比例計(jì)算,并在無核酸酶的離心管/PCR管中配個(gè)待測(cè)樣本RNA上樣濃度應(yīng)≥6.5ng/μL;每次檢測(cè)應(yīng)),體積(μL)/管422.2將所有反應(yīng)管充分混勻,≥5000rpm瞬時(shí)離心10秒,放入PCR儀或恒溫金屬浴中進(jìn)行表3逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)程序∞2.3逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)完成后,反應(yīng)產(chǎn)物cDNA溶液可用于后續(xù)PCR擴(kuò)增,若不能立即進(jìn)行擴(kuò)增將cDNA溶液存放在2℃~8℃,保存時(shí)間不宜超過24小時(shí);或者-15℃~-25℃保存,保存時(shí)間不3.1取離心管或PCR管,在管中加入:90μLPCR擴(kuò)增預(yù)混液、20μL待測(cè)樣本的cDNA和33.2將探針引物預(yù)混條解凍,≥5000rpm轉(zhuǎn)速離心1分鐘,使得每個(gè)反應(yīng)孔3.3使用移液器吸取步驟3.1中的混合液16μL,分別加入至探針引物預(yù)混條4.1將探針引物預(yù)混條放入熒光PCR儀;其中1號(hào)管朝上放置。對(duì)應(yīng)PCR反應(yīng)布局見表4。123…1…2…3…4…5…6…7…8…4.3選擇“樣本設(shè)置”,樣本類型設(shè)定為“待測(cè)”。選擇熒光信號(hào)“FAM”和“V“ROX”。本試劑盒內(nèi)包含陽性對(duì)照品和陰性對(duì)照品作為質(zhì)控,應(yīng)在每批次檢測(cè)中添加,通過質(zhì)控情況采用《尿路上皮癌基因分析軟件》進(jìn)行分析,綜合評(píng)分應(yīng)≥85,判讀結(jié)果為尿<30<36<27<31<33<36<36<38陰性對(duì)照品的內(nèi)參基因的Ct值均應(yīng)≤30;將檢測(cè)結(jié)果采用《尿路上皮癌5.4待測(cè)樣本的內(nèi)參基因的Ct值應(yīng)≤30,如果不符合,說明該樣本RNA可能存5.5待測(cè)樣本應(yīng)至少有1個(gè)靶基因Ct值(FAM38,如果不符合,說明該樣本RNA未能提供6.2打開《尿路上皮癌基因分析軟件》(軟件版本:1.0)客戶端,上傳P6.3《尿路上皮癌基因分析軟件》自動(dòng)分析PCR數(shù)據(jù),獲得分析結(jié)果(見圖3尿路上皮癌基因本產(chǎn)品根據(jù)各基因檢測(cè)結(jié)果Ct值,使用《尿路上皮癌基因分析本產(chǎn)品共采用312例臨床尿液樣本(尿路上皮癌陽性樣本12),ROC曲線下面積─約登指數(shù)法,進(jìn)行陽性判斷值的確定與驗(yàn)證研究。陽性樣本包括皮癌、腎盂尿路上皮癌、輸尿管尿路上皮癌;陰性樣本包括泌尿系統(tǒng)良性病變、綜合評(píng)分≥50,判定為尿路上皮癌陽性;綜合評(píng)分<50,判定為尿路圖3尿路上皮癌基因檢測(cè)結(jié)果圖2.不合理的樣本采集、轉(zhuǎn)運(yùn)及處理,以及不當(dāng)?shù)膶?shí)驗(yàn)操作和實(shí)驗(yàn)環(huán)境均有可能1)試劑盒應(yīng)組分齊全,包裝外觀清潔、無泄漏、無破損;標(biāo)識(shí)、標(biāo)簽字跡清楚。試劑融化4)最低檢測(cè)限:檢測(cè)1份濃度3次,每個(gè)靶基因的Ct值均應(yīng)<38。5)精度密:通過檢測(cè)產(chǎn)品重復(fù)性參考品、基因表達(dá)重復(fù)性參考品和臨床樣本對(duì)本試劑盒的②檢測(cè)2份基因表達(dá)重復(fù)性參考品,各重復(fù)檢測(cè)10次③檢測(cè)臨床樣本,評(píng)價(jià)本試劑盒不同重復(fù)、批次、時(shí)間、儀器、操作者和地點(diǎn)間的精6)分析特異性:檢測(cè)非尿路上皮癌的其他泌尿系統(tǒng)惡性腫瘤臨床樣本,均未發(fā)生交叉反應(yīng);檢測(cè)泌尿系統(tǒng)良性疾病樣本,均未發(fā)生交叉反應(yīng);檢測(cè)相關(guān)靶基因的同源序列,均未發(fā)生交叉反應(yīng)。檢測(cè)以下:血液(2%v/v)、葡萄糖(55mmol/L)、蛋白質(zhì)(4g/L),左氧氟沙星(200mg/dL)、布洛芬(10mg/dL),維生素C(0.8mmol/L),白色念珠菌(1×109CFU/mL)、大腸桿菌(1×109CFU/mL)、金黃色葡萄球菌(1×109CFU/mL)、淋球菌(1×107CFU/mL)、解脲脲原體(5×106CFU/mL),絲裂霉素(200mg/L)、吡柔比星(170mg/L)、吉西他濱(6700mg/L)、卡介苗(400m
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