家畜遺傳資源保種場保種技術規范 第1部分:總則 編制說明_第1頁
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文檔簡介

2《家畜遺傳資源保種場保種一、工作簡況2023年12月,全國畜牧總站等單位向全國畜牧業標準化技術委家標準化管理委員會關于下達2024年第三批推薦性國家標準計劃及相關標準外文版計劃的通知》(國標委綜合〔2024〕25號)批準項僅是育種的重要素材,也是歷史文化的見證。2021年中央全面深化改革委員會通過的種業振興行動方案中明確將資源保護列為首要行3實行分類分級保護。同時指出,“國務院農業農村主管部門根據畜禽遺傳資源分布狀況,制定全國畜禽遺傳資源保護和利用規劃,制定、瀕危的畜禽遺傳資源實行重點保護。”內家畜遺傳資源保種場保種技術規范(NY/T3450-2019),是2019資源品種名錄(2024年版)》公布結果,收錄畜禽地方品種、培育4地方豬、牛、羊、家禽等瀕危品種為76個。基于以上我國地方畜禽2024年6月成立起草工作組,成員包括xxx等。具體起草單位序號姓名職稱單位主要分工1xxx研究員xxx標準文本統籌安排2xxx高級畜牧師xxx標準文本起草,編制說明修改,預審及報送相關工作,調研、收集相關參考資料3xxx教授xxx標準文本、編制說明修改,技術指導,調研、收集相關參考資料4xxx教授xxx標準文本和編制說明修改,組織征求意見,調研、收集相關參考5xxx高級畜牧師xxx標準編制說明起草,調研、收集標準編制說明起草,調研、收集相關參考資料6xxx高級畜牧師xxx標準文本和編制說明修改,組織征求意見,調研、收集相關參考資料57xxx教授xxx標準文本和編制說明修改,組織征求意見,調研、收集相關參考8xxx高級畜牧師xxx標準文本和編制說明修改,組織征求意見,調研、收集相關參考9xxx高級畜牧師xxx標準文本和編制說明修改,組織征求意見,調研、收集相關參考xxx正高級畜牧師xxx標準文本和編制說明修改,組織征求意見,調研、收集相關參考xxx副教授xxx標準文本和編制說明修改,組織征求意見,調研、收集相關參考xxx高級畜牧師xxx標準文本和編制說明修改,組織征求意見,調研、收集相關參考xxx高級畜牧師xxx標準文本和編制說明修改,組織征求意見,調研、收集相關參考xxx研究員xxx標準文本和編制說明修改,組織征求意見,調研、收集相關參考議通過的中華人民共和國農業部令第64號《畜禽遺傳資源保種場保6以及在2011年國務院發布的《種畜禽管理條例(2011修訂)》的第二涉及與本標準的關1《標準化工作導則第一部分:標準化文件的提供行文和書寫規2《畜禽糞便無害化處為本標準保種場/基因庫生產管理提供3《畜禽遺傳資源調查為本標準監測方法4畜禽基因組選擇育種為本標準提供基因75NY/T《家畜遺傳資源保種場保種技術規范第1部分:總則》.為標準制定提供保種場要求、保護對6NY/T傳多樣性檢測技術規為本標準提供了遺7NY/T遺傳多樣性檢測技術為本標準提供了遺8NY/T《家畜遺傳資源瀕危為標準瀕危等級評5)國家畜禽遺傳資源委員會組編.中國畜禽遺傳資源志[M].北京:8農業大學.2001,22(1):1-4.13)馬月輝,吳常信,畜禽遺傳資源受威脅程度評價,家畜生態,2001,22(2):8-13.14)魯云風,吳克亮,夏敏,梁子安,王小立,畜禽保種群分子瀕危15)甘麥鄰.畜禽保種理論與方法在豬保種工作中的應用[J].豬業科學,報”.中國畜禽遺傳保護與利用(中國農業科學技術出版社,2003年出版):3-9.17)馬月輝,吳常信,畜禽遺傳資源受威脅程度評價,家畜生態,2001,22(2):8-13.Insightsintothegeneticdiversityofindigenousgoatsandtheirconservationpriorities.AnimBiosci2019;32(10):9marker-basedmethodforestimatinginbcomponentsinapopulationunderconservation.AnimBiosci2020;33(1):12-23.ZouJ,WuK.Genomicdiversitydynamicsinconpopulationsarerevealedbygenome-wideSNPs.BMC22)FAO,Invivoconservationofanimalgeneticresou23)Nishio,M.,Inoue,K.,Ogawa,S.etal.Comparingpedigreeandgenomicinbreedingcoefficients,andinbreedingdepressionof(2023).https://doi.ocattlepopulation.BMCGenom/10.1186/25)FAO,GenomicChracterizationofanimalgeneticresour26)AniManichaikul,JosyfC.Mychaleckyj,StephenS.Rich,Robustrelationshipinferenceingenome-wideassociationstudies.Bioinformaticsv26,22,2867-2873(2010).2024年9月,在收集整理國內畜禽遺傳資源保護相關法律、法部分:標準的結構和編寫規則》(GB/T1.1-2020)的規定,標準起草高級職稱人員發出30份征求意見表(表2、3),共收回28份,提表2定向征求意見單位123456789表3征求意見單位和數量1772398432國畜牧總站等單位起草的國家標準《家畜遺傳資源保種場保種技術規范第1部分:總則》(預審稿)進行了認真審查。專家組1.標準英文譯名修改為“Technicalspecificationforconservationoflivestockgeneticresourcein3.分子近交系數定義修改為“利用分子標記信息來估算的個體或4.將“4基本條件”和“5技術要求”進二、標準編制原則、主要內容及其確定依據本標準嚴格按照《標準化工作導則第1部分:標準化文件的結前國內家畜遺傳資源保種場保護的實際情況以及生產實踐的相關環保種場conservationfarm本定義參考中華人民共和國農業部令第64號《畜禽遺傳資源保本定義參考NY/T3450-2019《家畜遺傳資源保種場保種技名稱、出生日期等記錄的文件。”群體有效含量efectivepopulationsize本定義參考吳常信院士等編著的《動物比較育種學》P157對群體有效大小進行了解釋“通常對群體大小的方式有3種3)群體中繁殖者的有效數量,這是一個計算得出的數值,他是一個有N個繁殖個體,雌雄各半,隨機交配的理想群體相比較得來的一個當量”&Cie,Paris.提出來的“Malecot'scoancestrycoefficientisdefinedastheprobabilitythatanytwoalleles,sampledatrandom(onindividual),areidenti《家畜育種學》第二版P158提到的“Malecot(1948)將近交系數定率”。哈代-溫伯格奠定的理論基礎,到分子標記、測序技術的進步,推動義參考了鄧學梅主編的《動物遺傳學》第3版P355提到保種群體遺傳分子家系數量numberoffamilylinesbas本定義的制定,參考了Ani(2010)的研究,是進一步明確利用分子有效群體含量efectivepopulationsizebasedonmolecularmar和國農業部令(第64號))第二章第和國農業部令(第64號))第二章第疫病是畜禽遺傳遺傳資源保種場活體保種面臨的較大風險之一,標準》(農業農村部(2022)574號公告)的有關規定制定,《種用和國農業部令(第64號))第二章第五條訓掌握家畜遺傳資源保護的基本知識和技能”。和國農業部令(第64號))第二章第五條對不同家畜的保種群不完全隨機交配和隨機留種隨機交配四種留種選配制度下的群體遺),傳多樣性動態變化(圖2),說明不同保種方案對保種效果有影響,畜禽遺傳資源保種場保護區和基因庫管理辦法(中華人民共和國農業部令(第以上;三代之內沒有血緣關系的家系數不少以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少畜12頭以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少于6個。山東省省級畜禽遺傳資源保種場上,公兔不少于畜12頭以上,三代保護區和基因庫以上,三代之內以上,三代之內之內沒有血緣關系管理辦法沒有血緣關系沒有血緣關系沒有血緣關系的家系數不少于6的家系數不少的家系數不少的家系數不少個。廣東省省級畜禽遺傳資源保種場牛12頭以上,三代保護區和基因庫以上,三代之內以上,三代之內以上,三代之內之內沒有血緣關系管理辦法沒有血緣關系沒有血緣關系沒有血緣關系的家系數不少于6的家系數不少的家系數不少的家系數不少個。云南省省級畜禽遺傳資源保種場保護區和基因庫管理辦法以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少三代之內沒有血緣關系的家系數不少安徽省省級畜禽遺傳資源保種場保護區和基因庫管理辦法以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少畜12頭以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少于6個。海南省畜禽遺傳資源保種場和基因庫管理辦法以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少畜12頭以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少于6個。江蘇省畜禽遺傳資源保種場保護區和基因庫管理辦法以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少畜12頭以上,三代之內沒有血緣關系的家系數不少于6個。和國農業部令(第64號))第四章第十四條規定了畜禽遺傳配和隨機留種隨機交配四種留種選配制度下的群體遺傳多樣性的動態變化(圖1)。此外,本條制定還參考了《畜禽遺傳資源保種場保護區和基因庫管理辦法》(中華人民共和國農業部令(第64有相應的保種計劃和質量管理、出入庫管理、安全管理、消毒防疫、技術規程;有完整系統的技術檔案資料。”本章節內容制定主要參考2023年3月1日起施行的《中華人民務院農業農村主管部門根據全國畜禽遺傳資源保護和利用規劃及國保護對象分成三類列入國家級和省級家畜遺傳資源保護名錄的地方雖然《畜禽遺傳資源調查技術規范》(GBT27534)和第三次全群體有效含量和群體平均近交系數的計算參考了吳常信院士等第二版第九章第三節等繪制了附錄B的群體平均近交系數與群體有效含量的計算方法。保種群體的近交系數不超過0.125,該文本條目的制定參考了國標現行的行業標準NY/T3450-2019《家畜《家畜遺傳資源瀕危等級評定》(NY/T2995)是農業農村部對術規程(NY/T1673-2008)》詳細規定每個物種30個微衛星位點,然而隨著二代高通量測序技術的進步,基因組水平的SNP已經被廣泛應用,據2023年FAO《GenomicChracterizationofanimalgeneticresources》發布的文件中,提到了相比locationincodingregionphenotypicexpressioloci(QTL)ofinterest;and相比于傳統的微衛星,全基因組水平的SNP遺傳標記在檢測效率上有較大的提升中某位點雜合子的概率,對于雜合度的計算參考了1998年Nagylaki其中Pi表示k位點等位基因i的頻率。而對于多個位點的雜合度的基于分子標記的近交系數的計算參考了Nishio(2023)和Bem(2024)文獻中的計算內容,Nishio(2023)比較了基于系譜的近交系數到近交衰退,基因組近交系數FROH可以鑒定近交衰退,更準確的反式中,LROHj代表基因組上不同長度連續純和片段;LGenome代表注:FPED,基于家譜的近交系數;FGRM,基于基因組關系矩陣的近交系數;FUNI,基于聯合配子相關性的近交系數;FHOM,基于觀察到的純合基因型與預期純合基因型數量之比的近交系數;FROH,基于同源性片段(ROH)的近交系數;FROH30,基于ROH的近交系數,其中ROH包含的最少連續純合SNP數量為30;FROH_15,基于ROH的近交系數,其中ROH包含的最少連續純合SNP數量為15;FHBD,基于同源血統(HBD)的近交系數。基于分子標記的親緣關系系數(kinshipcoefficient,?)的計算參考了ManichaikulA(2010)文獻中的計算內容(2010-Robustrelationshipinferenceingenome-wideassociatio2φ=-m1Σ(xim-2φ=-mij2Σm2pm(1-pm)/Mij式中:φij——個體i和個體j之間的親緣關系系數;xim——個體i在第m個SNP位點上的基因型值(0,1,2);xjm——個體j在第m個SNP位點上的基因型值(0,1,2pm——該位點m的等位基因頻率;Mij——SNP位點的數量;記間的連鎖不平衡的方法(Lin

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