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文檔簡介
慢性進展期肝病數字化管理平臺需求說明一、項目情況目前我院收集了大量慢性進展期肝病患者醫療數據,但鑒于慢性進展期肝病患者醫療收治患者的病種特殊性,我國門靜脈高壓聯盟(CHESS)打造國際一流的門靜脈高壓與肝硬化臨床研究及轉化科學平臺,我院計劃加入慢性進展期肝病數字化管理行動計劃,為我院各種病因導致的慢性進展期肝病人群提供數字化管理服務,為醫院建設軟硬件一體的數字化管理中心,可以更好地服務我院醫生,充分利用臨床醫療數據,提高科研效率。二、技術標準通過慢性進展期肝病數字化管理的建設,將醫院內積累的慢性進展期肝病疾病患者數據匯聚到平臺,對數據進行治理,完成數據的清洗、標準化、結構化和建模等流程;通過專業臨床專家的醫學術語標注和自然語言處理技術,將非結構化文本轉化成結構化數據,創建出更多的患者數據維度,實現專科數據挖掘分析與數據建模;實現數據的智能檢索、智能篩選,滿足醫院個性化的科研需求,滿足疾病專科化的科研項目管理、數據管理、專科疾病模型的建立的需求。同時慢性進展期肝病數字化管理平臺也為醫院提供創新研究開展、沿技術轉化、適宜技術培訓、標準指南制定等支持。三、技術要求1.數據采集與匯聚需要將肝臟硬度大于10kPa的患者病歷相關信息系統的歷史數據及增量數據進行集成接入并上傳至慢性進展期肝病數字化管理平臺中心端,主要包括下列系統及系統中的信息:(1)醫療機構信息系統(HIS):患者、掛號、入出轉、就診、處方/醫囑、申請、收費三測單等信息。(2)實驗室系統(LIS):標本、檢驗結果等信息。(3)超聲信息系統:超聲檢查、超聲報告等信息。(4)病理信息系統:病理檢查、病理標本、病理報告等信息。(5)內鏡信息系統:內鏡檢查、內鏡報告等信息。(6)放射信息系統:放射檢查、放射報告等信息。(7)心電信息系統:心電檢查、心電報告等信息。(8)電子病歷系統(EMR):入院記錄、出院記錄、病程等病歷信息。(9)護理系統:護理記錄、觀察記錄、護理文書、用藥記錄等信息。(10)病案管理系統:病案首頁信息。(11)手術麻醉系統:手術記錄、事件、用藥等信息。通過數據庫同步技術和ETL等技術,對數據進行抽取、同步、匯集,實現針對醫院多源異構數據的采集和匯聚。數據更新按照要求為按周更新或者按月更新。支持標準消息傳遞協議,具備數據存儲和訪問功能;支持自定義數據源類型和字段mapping,智能適配異構數據源,自定義數據處理流程,根據數據情況靈活執行數據處理策略,支持定義數據輸入輸出參數和數據處理流程;支持數據采集端脫敏,支持增量脫敏和實時脫敏,脫敏算法靈活可配置;支持對多源異構源數據進行自動分析,智能生成mapping建議,大幅提升多源異構數據集成效率;支持對多源異構數據采集效果進行分析,評估數據質量以及字段映射準確率;支持數據溯源,支持圖形化方式展示最終數據字段與原始數據字段之間的關系、數據計算邏輯以及中間計算結果;支持通過標準RESTful協議和XML/JSON標準格式存儲/訪問數據;2.患者主索引平臺中心端須通過患者主索引(EMPI),整合患者歷次就診數據,建立患者維度的數據集,實現患者全景視圖的展現;對多源、異構的數據進行處理,形成統一、標準的數據視圖。3.數據脫敏與加密處理對患者數據進行數據脫敏和加密處理,去除或隱藏患者個人信息中的敏感信息(如:患者姓名、身份證號、電話、地址等)。通過脫敏或加密規則進行數據的變形,實現敏感隱私數據的可靠保護,同時依然保持其它數據的格式和屬性,保證其可識別性和可用性。4.數據治理在平臺中心端須參考人民衛生出版社出版的《肝硬化標準數據集》,結合實際需要,制定數據集,并進行數據治理,包括但不限于下列要求:(1)提供數據清洗:將醫療數據中,因各種歷史原因或不明原因導致的不規范、錯誤的字段信息進行清洗,避免因部分明顯錯誤的信息導致上層應用服務的結論錯誤;(2)提供數據標準化處理:基于國內、國際、醫療行業、國際疾病指南等標準,例如ICD10\ICD9、HL7CDA\醫學主題詞表(MeSH),觀測指標標識符邏輯命名與編碼系統(LOINC)\藥品詞典規范-CFDA\ATC分類\國家醫療機構診療科目名錄\國際性腫瘤數據庫結構\腫瘤學國際診治指南等,對采集數據進行標準化、歸一化處理;(3)提供后結構化(自然語言)處理:通過自然語義處理(NLP)技術,結合醫療專業術語的語義結構,將醫療語義信息從原始的自然語言表達,為后續的應用、挖掘、機器學習提供基礎數據支持;(4)提供數據質控管理:針對數據處理過程中的多層數據,采用定量、定性綜合校驗方法,提供多維質量監控、問題預警功能,發現數據完整性、一致性、準確性、唯一性等方面數據質量問題。(5)配套的在線科研臨床服務功能內容。5.慢性進展期肝病數字化管理平臺醫院端功能要求模塊項參數數據質控報告數據接入報告、填充率報告報告。數據字典疾病標準數據集,包括:指標名稱、指標說明、值域標準、參考標準、數據類型、提取規則、來源邏輯等內容,便于查閱和檢索。數據洞察通過搜索找到目標人群,支持通過篩選再次鎖定細分人群,實時統計疾病相關指標,可視化查看患者特征分布。病例搜索支持簡單搜索;條件樹搜索、事件搜索、精確搜索組合的高級搜索;特點是支持復雜醫學事件的搜索、支持多種方式組合搜索、支持搜索結果的目標患者的展示。搜索結果統計分析提供基于搜索結果的患者指標描述性統計分析,快速得到目標患者特點。患者詳情及時間軸、原始病歷展示支持查看患者全生命周期數據,并以時間軸的可視化方式展示醫療事件次序。患者特征動態分布探索通過對熱門臨床路徑中關鍵指標的設置,根據探索方向實時繪制人群流向,動態展示患者特征分布。統計分析提供基于線上科研項目的智能統計分析,包括多因素邏輯回歸、多因素線性回歸、生存分析cox回歸、生存曲線、相關分析、單因素分析、描述性統計;支持基于上傳的Excel或CSV文件進行統計分析;支持下載統計圖;支持連續變量分段。患者隨訪項目內的隨訪支持門診、電話、短信多種方式:一個研究可以配置多個隨訪階段,每個隨訪階段支持靈活配置隨訪點數量、隨訪頻率、隨訪觸發機制和開始時間,可以滿足所有隨訪方案要求。創建CRF模板支持使用標準數據集指標作為CRF題目;支持用戶自定義建題;支持拖拽和點選兩種建題方式;支持設置題目一些特定屬性;支持設置題目間隱藏和
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