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文檔簡介
第十四章核酸的生物合成第一節(jié)DNA的生物合成第二節(jié)RNA的生物合成1基因信息的傳遞2基因(gene)基因是DNA分子的功能片段基因是為生物活性產(chǎn)物編碼的DNA功能片段,這些產(chǎn)物主要是蛋白質(zhì)或是各種RNA.AgeneisasequenceofDNAthatcodesforanRNA;inprotein-codinggene,theRNAinturncodesforaprotein.編碼序列、非編碼序列3單細胞真核生物5000條基因多細胞真核生物13000條基因高等植物25000條基因哺乳動物40000條基因人與黑猩猩的基因僅有2%差異45細胞或生物體中全部DNA包括全部基因和基因間隔區(qū)域人類基因組:核基因組(22條常染色體和X/Y性染色體)、線粒體基因組基因組62001/2/152001/2/16人類基因組(24條染色體):3.3×109bp基因數(shù)目:30000~35000條基因序列僅占總序列的5%7一、復制(replication)以親代DNA為模板合成子代DNA,將遺傳信息準確地傳遞到子代DNA分子的過程。8(一)DNA復制的基本特點⒈半保留復制
子代DNA雙鏈中的一條鏈來自母鏈,另一條鏈重新合成。
9AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+復制過程中形成的復制叉母鏈DNA子代DNA10復制叉:DNA復制區(qū)解鏈點的結(jié)構(gòu)呈Y形從起點向兩個方向解鏈,形成兩個復制叉雙向復制2個復制叉單向復制1個復制叉⒉從復制起點雙向復制
11E.Coli基因圖12oriter原核生物只有1個復制起點13原核生物只有1個復制起點145’3’oriorioriori5’3’5’5’3’3’真核生物的染色體有多個復制起點153.半不連續(xù)復制3
5
3
5
3′5′3′解鏈方向5′163
5
3
5
3′5′3′3′5′解鏈方向5′3.半不連續(xù)復制173
5
3
5
3′5′3′3′5′前導鏈后隨鏈解鏈方向?qū)槠涡骆湹难娱L只可沿5→3
方向進行隨從鏈的合成方向與解鏈方向相反5′3.半不連續(xù)復制184.DNA復制必須有引物
5.DNA復制具有高保真性
DNA復制的精確率極高,在細菌中其誤差率只有10-8~10-1019參與DNA復制的主要物質(zhì)模板:解開成單鏈的DNA母鏈底物:dNTP
(dATP,dGTP,dCTP,dTTP)RNA引物酶和蛋白質(zhì)因子20(二)參與DNA復制的主要酶類1、解鏈、解旋酶類2、引物酶和引物3、DNA連接酶4、DNA聚合酶(DNA-pol)211、解鏈、解旋酶類(1)解旋酶(helicase)(2)拓撲異構(gòu)酶(topoisomeraseI、II)
(3)單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)22(1)解旋酶(helicase)解螺旋酶ATP23(2)拓撲異構(gòu)酶(TopoI、II)
負超螺旋正超螺旋DNA雙螺旋盤繞過分盤繞不足2410
8局部解鏈后25切割DNA雙鏈切割雙鏈DNA中的一鏈TopoⅠ:TopoⅡ:Topo酶:切割DNA鏈,使其松弛后再連接26(3)
單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)
作用:防止單鏈DNA重新形成雙鏈, 防止單鏈DNA被核酸酶水解。272、引物酶
5′
5′
RNA引物5′
3′5′
3′28DnaA引發(fā)體:包括解螺旋酶、DnaC、引物酶及DNA復制的起始區(qū)域。5′
3′3′5′
引物酶DnaC引發(fā)體解螺旋酶293、DNA連接酶(DNAligase)DNA連接酶ATP切口切口:雙鏈DNA一股上的3′,5′-磷酸二酯鍵被水解304、DNA聚合酶(DNA-pol)即依賴DNA的DNA聚合酶真核生物有多種:
DNA-pol
、
、
、
、
…原核生物至少有3種:
DNA-polⅠ、Ⅱ、Ⅲ
315′端3′端CGAH底物:dNTP32復制的化學反應(yīng)33DNA-polⅢ5′
3′聚合作用最強3’5’5’3’3’5’DNA-pol5’3’OHP
5′
3′聚合作用343′
5′外切
5′
3′外切5’3’內(nèi)切酶5’3’3′
5′外切
5′
3′外切核酸外切酶與內(nèi)切酶
3′
5′外切酶活性355′
AGCTTCAGGATA
3′
|||||||||||3′TCGAAGTCCTAGCGAC5′?DNA-polI3′
5′外切酶活性36DNA-pol
?
3′
5′外切酶活性與即時校讀37
DNA-pol
I
5′
3′外切酶活性切除引物;切除突變片段5’3’385′→3′外切酶活性聚合活性填補空隙DNA連接酶連接切口切口平移39大腸桿菌中DNA聚合酶
DNA-pol
性質(zhì)
ⅠⅡⅢ5'→3'
聚合功能有有有5'→3'聚合速度
16-2040250-10005'→3'外切酶活性有無
無3'→5'
外切酶活性有有有主要功能校讀,修復
修復復制切除引物
40
(三)DNA復制過程1.起始2.延長3.終止41⑴
DNA解成單鏈特定蛋白質(zhì)識別復制起點解旋酶、Topo酶及SSBDNA解鏈,解旋,形成復制叉
倒Y1、復制的起始42(2)合成RNA引物
5′
5′
RNA引物5′
3′5′
3′433
5
3
5
引物是由引物酶催化合成的短鏈RNA分子。
引物3'HO5'Primase44參與復制起始的成員名稱功能DnaA
辨認起始點解螺旋酶解開DNA雙鏈DnaC
協(xié)助解螺旋酶引物酶催化RNA引物生成SSB穩(wěn)定解開的單鏈拓撲異構(gòu)酶理順DNA鏈OriC
E.coli復制起始點45
5'
3'5'dATPdGTPdTTPdCTPdTTPdGTPdATPdCTPOH3'3'DNA-pol2、復制的延長465’47岡崎片段引物的消除和連接RNA引物DNApolI聚合活性填補空隙DNA連接酶DNApolI
5′→3′外切酶活性水解引物485′→3′外切酶活性水解引物聚合活性填補空隙DNA連接酶連接切口岡崎片段引物的消除和連接——切口平移49原核生物復制有終止區(qū):和Tus蛋白結(jié)合,阻止解鏈酶發(fā)揮作用拓撲酶向DNA分子引入超螺旋結(jié)構(gòu),進一步裝配3、復制的終止50E.Coli基因圖51G1SG2MG0
GrowthandpreparationforcelldivisionQuiescentcellsphasephasephasephase哺乳動物的細胞周期DNA合成前期DNA合成期8hDNA合成后期有絲分裂期52DNA復制的保真性(fidelity)1.嚴格遵守堿基配對規(guī)律2.DNA-pol在復制過程中對堿基的選擇性3.復制出錯時有即時校讀功能ATGC
DNApolⅢ在催化磷酸二酯鍵形成之前完成對堿基的選擇4.DNA聚合酶對模板的依賴53DAVIDBALTIMORE,RENATODULBECCOandHOWARDMARTINTEMIN
fortheirdiscoveriesconcerningtheinteractionbetweentumourvirusesandthegeneticmaterialofthecell.
改寫中心法則—逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)1975Nobel二、逆轉(zhuǎn)錄54逆轉(zhuǎn)錄RNA模板逆轉(zhuǎn)錄酶(逆轉(zhuǎn)錄活性)DNA-RNA雜化雙鏈單鏈DNA逆轉(zhuǎn)錄酶(DNApol活性)雙鏈DNA逆轉(zhuǎn)錄酶(RNaseH活性)逆轉(zhuǎn)錄酶沒有3’→5’DNA外切酶活性,沒有校讀功能,變異大5556三、DNA損傷(突變)與修復
DNA損傷或突變:DNA分子一級結(jié)構(gòu)改變大多數(shù)突變屬此類,原因不明由理化及生物因素誘發(fā)自發(fā)突變:誘發(fā)突變:57
UV(一)引發(fā)突變的因素物理因素紫外線TT胸腺嘧啶二聚體58化學因素烷化劑:(如氮芥類),使鳥嘌呤的N7烷基化后 脫落,成為無鳥嘌呤的位點亞硝酸鹽:使堿基氧化脫氨基C→UA→IG→X堿基類似物如5-溴尿嘧啶(5-BU)與T類似,但5-BU可與G配對羥胺類:C被羥胺化后與A配對—A—5-BU—G—5-BU59(二)突變的類型1.點突變GAGGluGTGValHbA
肽鏈HbA
基因HbS
基因HbS
肽鏈60Sickle-CellAnemiaIsaMolecularDiseaseofHemoglobin612.缺失、插入和移碼突變5′….UCACGACAUAUG….3′絲
精
組
蛋
5′….UCAGACAUAUG….3′絲
天
異亮
缺失
正常移碼突變突變點以后的遺傳密碼全部改變,造成蛋白質(zhì)的氨基酸組成和序列改變。
5′….UCAGCGACAUAUG….3′絲
丙
蘇
酪
插入
623.重排與重組DNA分子發(fā)生較大片段的交換63(三)DNA損傷的修復光復活酶(可見光)T-T1.光修復TT642.切除修復切除DNApol修復DNA連接酶連接5'5'3'3'5'5'3'3'5'5'3'3'5'5'3'3'5'5'3'3'切開內(nèi)切酶外切酶65由于DNA損傷范圍較大、來不及修復就進行復制,復制后再修復.3.重組修復66DNA損傷復制2.recA蛋白識別并結(jié)合缺損鏈3.鏈置換4.母鏈修補recA復制鏈置換母鏈修補121212674.SOS修復:DNA損傷嚴重時的應(yīng)急性修復細胞能繼續(xù)生存,但引起DNA較長期的廣泛的突變。后果:68
第二節(jié)RNA的生物合成69
轉(zhuǎn)錄生物體以DNA為模板合成RNA的過程。TranscriptionRNADNA
mRNA,tRNA,rRNA70一、參與轉(zhuǎn)錄的主要物質(zhì)原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:DNA酶:RNA聚合酶(RNA-pol)其他蛋白質(zhì)因子71(一)轉(zhuǎn)錄模板2結(jié)構(gòu)基因能轉(zhuǎn)錄出RNA的DNA區(qū)段1不對稱轉(zhuǎn)錄
DNA雙鏈一股鏈轉(zhuǎn)錄,另一股鏈不轉(zhuǎn)錄3轉(zhuǎn)錄具有選擇性72人體:1個受精卵→1012細胞,103細胞類型生命體的統(tǒng)一性源于基因組生命體的復雜性基于蛋白質(zhì)組基因組相同蛋白質(zhì)組不同73
模板鏈
編碼鏈5’3’5’3’RNA的合成方向總是5'→3'745’…GCAGTACATGTC…3’3’…CGTCATGTACAG…5’DNAmRNAN…AlaValHisVal…C多肽鏈轉(zhuǎn)錄翻譯編碼鏈模板鏈5’…GCAGUACAUGUC…3’75核心酶全酶
1、原核生物(E.Coli)的RNA聚合酶α2ββ′ωα2ββ′ω
σ核心酶全酶σ亞基+σ
(二)RNA聚合酶(RNApol)
ωω76
β
聚合功能
σ識別轉(zhuǎn)錄起始點
β′解鏈
大腸桿菌RNA聚合酶亞基的功能類型主要功能
α
決定哪些基因被轉(zhuǎn)錄
ω
未知772、真核生物的RNA聚合酶種類轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物
RNApolⅠ
RNApolⅡ
RNApolⅢmRNA
snRNAtRNA、5SrRNA、snRNA
5.8S、18S和28SrRNA783、原核、真核RNA聚合酶的共同特點①不需要引物;②RNA合成方向均為5‘→3’;③能識別轉(zhuǎn)錄終止信號;④只以1條鏈為模板;⑤按模板的堿基順序,遵守堿基互補原則,嚴格挑選正確底物,催化磷酸二酯鍵生成,從而把底物NTP聚合成RNA鏈;⑥合成是連續(xù)進行的;⑦沒有校讀活性;⑧與調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的多種蛋白因子相互作用,調(diào)節(jié)基因表達79二、轉(zhuǎn)錄過程(一)原核生物:起始、延長、終止(二)真核生物:起始、延長、終止、轉(zhuǎn)錄后加工80一個轉(zhuǎn)錄區(qū)段(一)原核生物轉(zhuǎn)錄過程
1、轉(zhuǎn)錄起始5
3
3
5
結(jié)構(gòu)基因調(diào)控序列
RNA-pol啟動子8110-10TTGACATATAAT轉(zhuǎn)錄開始0翻譯開始-35(Pribnowbox)RNA-pol識別位點轉(zhuǎn)錄起始點大腸桿菌基因的啟動子82原核生物的轉(zhuǎn)錄起始σ亞基辨認-35區(qū)RNApol全酶移向-10區(qū)合成第一個磷酸二酯鍵5’-pppGpN-OH-3’σ亞基脫落(閉合復合物)(開放復合物)轉(zhuǎn)錄起始不需引物!83ααββ’
TTGACATATAAT-35σ-10RNA聚合酶全酶在轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的結(jié)合84
原核生物的轉(zhuǎn)錄空泡 ααββ′RNA2、轉(zhuǎn)錄延長RNA聚合酶的核心酶-DNA-RNA8586重新結(jié)合與卷曲活性中心解旋模板鏈RNA-DNA雜合區(qū),含8堿基對RNARNA聚合酶非模板鏈轉(zhuǎn)錄空泡轉(zhuǎn)錄方向5’DNA3’873、轉(zhuǎn)錄終止(1)不依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止(2)依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止88RNA轉(zhuǎn)錄后,形成特殊的結(jié)構(gòu),以終止轉(zhuǎn)錄。(1)不依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止莖環(huán)或發(fā)夾結(jié)構(gòu)8990(2)依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止ρ因子1.識別結(jié)合富含C的RNA鏈2.ATPase活性3.解螺旋酶活性91ρ因子+ATP5′3′Polymerase富含C92DNApol5′3′RNApol失活ρ因子解螺旋,使RNA脫落935
3
DNARibosomeRNARNAPol多個轉(zhuǎn)錄同時進行轉(zhuǎn)錄延長與蛋白質(zhì)合成同時進行原核生物94Electronmicrographoftranscription95真核生物的RNA聚合酶種類轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物
RNApolⅠ
RNApolⅡ
RNApolⅢmRNA
snRNAtRNA、5SrRNA、snRNA
5.8S、18S和28SrRNA(二)真核生物轉(zhuǎn)錄過程96真正轉(zhuǎn)錄終止點GCGC-CAAT-TATA-ATG
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