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文檔簡介

分子力學基本原理課件本課件將重點介紹分子力學的基本原理,包括分子模擬的基本理論、優化分子結構的方法、應用領域等。什么是分子力學?分子力學是一種基于牛頓定律和量子力學原理的分子模擬方法,可預測分子在不同條件下的力學行為,具有廣泛的應用前景。系統的建立與描述生物體系建立與描述微生物、蛋白質、多肽、核酸、細胞膜等生物體系。納米結構建立與描述金屬、半導體、多壁碳納米管、納米顆粒等納米結構體系。二維材料建立與描述石墨烯、石墨烯衍生物、二硫化鉬等二維材料的分子結構。分子力學中的力場模型經典力場使用原子尺度勢函數描述分子內相互作用關系,能夠快速計算大分子體系的力學行為。量子力場基于量子力學描述分子內相互作用關系,精度高但計算量大,主要用于小分子體系的計算。多尺度模型通過將不同粒度的力場模型耦合起來,可以在不同尺度下模擬分子力學行為。能量最小化方法1力學最小化通過優化分子的構象和能量來預測分子在不同條件下的穩定構型。2晶格最小化通過調整晶格中原子的位置和晶格參數來得到最穩定的晶格結構。3擬合能量面法構建一個具有最小化平坦區域和最佳擬合精度的能量勢面,然后通過能量最小化方法確定穩定構象。蒙特卡羅模擬方法隨機走動模擬通過隨機走動模擬來獲得各種物理參數,如熱力學平衡常數、狀態方程等。蛋白質折疊模擬通過模擬各種轉換狀態的過程,探究蛋白質的三維空間結構和折疊機理。材料結構模擬通過蒙特卡羅模擬方法研究不同材料的晶體結構、分子構象、雜質分布等。分子動力學模擬方法1經典分子動力學基于經典力場模型,模擬分子中原子的運動軌跡,預測分子在不同條件下的力學行為。2量子分子動力學基于量子力場模型,模擬分子內原子間的運動狀態,可以精確預測小分子體系的力學行為。3并行計算利用并行計算技術,提高計算效率和準確度,適用于大分子體系或高精度計算。統計力學與分子模擬Boltzmann分布法通過計算體系的熵和熱力學平衡常數,預測體系的熱力學行為。動力學理論預測分子在液相和固相中的動力學行為,如擴散、輸運和界面反應等。相變分析結合統計物理學和分子模擬,預測各種物質的相變行為,如液-固、液-液、溶液濃度等。海洋能源利用中的應用利用分子模擬技術可以模擬水波、潮流、水力渦輪等現象,進行海洋能源的預測、開發和利用,為全球能源轉型做出貢獻。分子模擬中的光譜學1紫外-可見光譜預測分子的吸收和發射光譜,研究分子的光化學反應和電子結構。2核磁共振光譜探究分子中原子間的相互作用關系,通過調整核自旋造成的巨磁效應,得到分子的核磁共振譜圖。3拉曼光譜通過測量光譜射線的散射光,分析分子中原子的振動模式和鍵的鍵級等信息。模擬結果分析方法對分子模擬得到的海量數據進行分析,可以提取體系的物理參數、構象信息、能量表面等,為科學研究和工業應用提供支持。分子力學在工程中的應用材料設計通過材料分子動力學模擬,設計更符合特定需求的材料結構和性能。油氣開采預測油藏的孔

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