RNA研究相關技術

RNAresearch-relatedtechniques

andtheirapplication

(進展)

2010級碩士徐文弟2010年9月28日導論再談中心法則RNA世界RNA生物學功能RNA組學再談中心法則4中心法則與RNA1961年,發現DNA依賴的RNA聚合酶1968年,提出RNA是最早的信息分子1982~1983年,發現核酶

1986年,提出“RNAworld”1947年,RNA第一次被描述1968年,提出中心法則中心法則與組學基因組：一種生物擁有的所有遺傳信息的總合是一個細胞（或病毒）所承載的全部遺傳信息，它代表了一種生物所具有的全部遺傳信息。真核生物基因組是指一套完整單倍體DNA（染色體DNA）及線粒體DNA或葉綠體DNA的全部序列，既有編碼序列，也有大量存在的非編碼序列。細菌基因組包含了擬核和質粒中的DNA序列。病毒基因組有的為DNA（DNA病毒），有的則為RNA（RNA病毒）。*基因組（genome）基因組學：包括結構基因組學、功能基因組學和比較基因組學基因組學（genomics）是闡明整個基因組的結構、結構與功能的關系以及基因之間相互作用的科學。研究內容：結構基因組學（structuralgenomics）:

遺傳圖譜、物理圖譜、序列圖譜以及轉錄圖譜和大規模DNA測序。功能基因組學（functionalgenomics）:分析鑒定基因組功能。比較基因組學（comparativegenomics）：基因組之間比較鑒定，研究生物進化，預測新基因。轉錄組學：研究全部RNA的表達及功能轉錄組（transcriptome）

指生命單元（通常是一種細胞）所能轉錄出來的所有RNA——包括指導蛋白質翻譯的mRNA和非編碼RNA(non-codingRNA,ncRNA)的總和。RNA功能基因組學

又稱RNA組學（RNomics）：是分析、鑒定非信使小RNA（smallnon-messengerRNA,snmRNA）在特定狀態下表達差異、功能及其與蛋白質的相互作用。RNA組學：研究全部非mRNA小RNA的集合人類基因組序列特點：2萬2.5萬個基因，與蛋白質合成有關的序列占整個基因組的2%左右，其余98%的基因組序列沒有得到注釋。RNA組學研究范疇：小分子RNA，包括

snRNA、snoRNA、scRNA、催化性小RNA（smallcatalyticRNA）、小片段干涉RNA（smallinterferingRNA，siRNA）、微小RNA（microRNA，miRNA）以細胞、組織或機體在特定時間和空間上表達的所有蛋白質即蛋白質組（proteome）為研究對象，分析細胞內動態變化的蛋白質組成、表達水平與修飾狀態；了解蛋白質之間的相互作用與聯系；并在整體水平上研究蛋白質調控的活動規律，故又稱為全景式蛋白質表達譜（globalproteinexpressionprofile）分析。

蛋白質組學（proteomics）蛋白質組：全景式蛋白質表達譜分析蛋白質組學的中心任務：

研究細胞內所有蛋白質組成及其活動規律蛋白質組學的研究內容：一、蛋白質組表達模式的研究，即結構蛋白質組學（structuralproteomics）二、蛋白質組功能模式的研究，即功能蛋白質組學（functionalproteomics）蛋白質組學的主要任務：蛋白質鑒定：可以利用一維電泳和二維電泳并結合生物質譜、Western印跡、蛋白質芯片等技術，對蛋白質進行全面的鑒定研究。翻譯后修飾的鑒定：磷酸化、糖基化、酶原激活等過程。蛋白質功能確定：包括蛋白質定位研究，蛋白質活性，蛋白質相互作用，酶活性和確定酶底物，細胞因子的生物分析，配基-受體結合分析等。與蛋白質組研究相關的數據庫疾病基因組學：

研究疾病相關基因、揭示疾病發病機制疾病基因組學研究的兩大任務：疾病基因或疾病相關基因疾病易感性的遺傳學基礎藥物基因組學：

研究遺傳變異對藥物效能和毒性的影響藥物基因組學（pharmacogenomics）是功能基因組學與分子藥理學的有機結合，它不是以發現人體基因組基因為主要目的，而是運用已知的基因組學知識改善患者的治療。以藥物效應及安全性為目標，研究各種基因突變與藥效及安全性的關系，是研究高效、特效藥物的重要途徑，通過它為患者或者特定人群尋找合適的藥物。使藥物治療模式：診斷定向治療→基因定向治療。腫瘤基因組解剖工程：

闡明腫瘤相關基因基因激活和/或失活及其復雜的相互作用是腫瘤發生的根本原因

癌癥基因組解剖計劃（CancerGenomeAnatomyProject，CGAP；又稱腫瘤cDNA工程）：擬逐步建立人類腫瘤細胞表達基因索引發展快速分析腫瘤細胞的技術獲知與腫瘤相關的基因、蛋白質及其他生物標記物建立腫瘤研究信息（數據與分析工具）、資源（克隆和文庫）及技術和方法學平臺代謝組學（metabonomics）

測定一個生物/細胞中所有小分子（Mr1000）組成，描繪其動態變化規律，建立系統代謝圖譜，并確定這些變化與生物過程的聯系。

生命過程的表觀、生物化學的終極目標。代謝組學：研究內源性代謝物質的動態變化

規律及與生物過程的聯系代謝組學分為4個層次：①代謝物靶標分析（metabolitetargetanalysis）②代謝譜分析（metabolicprofilinganalysis）③代謝組學（metabonomics）④代謝指紋分析（metabolicfingerprintinganalysis）代謝組學研究對象：生物體液——血樣、尿樣等完整的組織樣品、組織提取液和細胞培養液（一）代謝組學的任務：

分析生物/細胞代謝產物的全貌主要的分析工具①核磁共振（nuclearmagneticresonance，NMR）：

氫譜（1H-NMR）、碳譜（13C-NMR）及磷譜（31P-NMR）。②MS：

MS按質荷比（m/z）進行各種代謝物的定性或定量分析，可得到相應的代謝產物譜。③色譜及聯用技術：

使樣品的分離、定性、定量一次完成，具有較高的靈敏度和選擇性。（二）代謝組學的主要分析工具：

核磁共振、色譜及MS代謝組學研究側重于代謝物的組成、特性與變化規律，與生理學的聯系更加緊密。疾病→機體病理生理過程變化→代謝產物的改變→比較分析與正常人的代謝產物差異→發現和篩選出疾病新的生物標記物→對相關疾病作出早期預警→發展新的有效的疾病診斷方法。藥物代謝組學的研究，可闡明藥物在不同個體體內的代謝途徑及其規律，將為合理用藥和個體化醫療提供重要依據。（三）代謝組學：

是開展預測醫學和個體化醫學的重要手段RNA世瞞界RNA憤是一種可蔑以作為信失使、酶和堡結構組分參的多功能巡壽分子。RNA耍與DNA鎮、蛋白質施，甚至R菌NA本身冶都能發生粉相互作用折，在生命隱活動的各系個環節中貼發揮重要且功能。大塌量非編碼堪RNA的辣發現及其志生物學功叮能多樣性琴被揭示。核酶的發揚現使得人廟們相信在艱生命的進膨化過程中岔曾經存在炒著一個活致躍的RNA饅世界。人們認考識到R盆NA的插研究在揭示生漫命本質和疾病防治方面都有漏著不可或剖缺的意義死。1982循-198中3年，T侵homa戴sCe顛ch和處Sidn寧eyA莖ltma援n等分非別發現R癥Nase蛛P的RN亡A亞基和臨嗜熱四膜是蟲的前體族rRNA劇中的居間累序列(I令nter逗veni墳ngs愉eque樸nce．本IVS)宜都具有酶的的催化活眨性，它們瞞是最早被伶發現的具掙有催化作悄用的RN聯A分子—怖—核酶（冒ribo嶄zyme董），為R長NA轉錄亭后加工機裙制提供了圖新的認識趴，并為生汗命起源的貓探討開拓削了新的境售界。198問6年，搖Wal熔ter喜Gi粘lbe吃rt乒創造了怒“RN億Aw神orl墊d”這盈個名詞母，用于像描述其冰提出的逮關于分借子起源姓的假說廣：在生峽命進化絕的早期傍存在一武個只有揪RNA蘿，沒有頓DNA在和蛋白揪質的世山界；R施NA既捆是遺傳族信息載拐體又具郵有酶的我催化功屈能，它恒們催化篇自身的粉合成。“RN賺A世界憤”目錄The順RNA拍Worl通d(Thi秤rdE摸diti蘿on,2朝006)Raym館ond覽F.Ge墓stel塘andTho耕mas縫R.勁Cec央hJohn醬F.A效tkin壺sCol顛dS員pri諒ng喇Har程bor歪La界bor陰ato防ry嬸Pre究ss一、起堪源于R冊NA與屬RNA賄起源1.洞RNA剩的歷史攀、化學掏、地理傳生物學2.對總RNA世只界起源認郵識的進展3.瓣原始細谷胞：包附含遺傳同聚合體旨的膜囊沉泡二、建立佛功能RN換A4.核方糖開關與拔RNA世皮界5.兩自我切隙割核酸篇酶的催振化策略蛙：RN及A世界敘的遺跡集？6.迷I企型內含煩子如何報起作用搜：RN息A結構寄與功能靠的范例像研究三、退框出古老裂的RN騾A世界轎——合共成酶與暈核糖體7.只RNA迷、脂質佩、膜8.氨丈基酰-t鄉豐RNA合菊酶9.逝RNA訓在蛋白褲質合成惠中的作疊用10.幻玉從RNA農世界進化嗽而來的核腰糖體與蛋悟白質翻譯四、現代宰RNA世枯界中豐富劣的RNA吐角色11.貓核糖核蛋妄白世界12.除不斷移擴展的已小核內扛核糖核德蛋白世聾界13.移剪接班體結構觀與功能14.幣RN企A分子壇位點特姿異性修喝飾的范虎例：尿談嘧啶插互入、缺貸失RNA堡編輯15.薦端粒酶R敲NA16.壘形狀盲多變的音mRN蔬A：折應疊的得膜與失五、RN膝A繼續戰燈勝DNA17.憐I香I型內呈含子：況一類剪巷接RN魯A并入默侵DN巷A的核籌酶18.鵲SIN麻E和LI正NE：麻休煩制造者呆、破壞者泉、先行者19.爬短RN以A生物學20.鑒細奇菌內小和RNA啞調控子絡的多能客性21.李參與哺奶乳動物基徑因劑量調謝控的長鏈蠢非編碼R掉NA六、新興鍋工具22.魚RNA梢二級結構份預測23.泡一種用柱于全原子讀RNA建上模的模塊坐層次方法24.陵功賺能RN貍A序列役的自動臣化體外訓篩選與扁芯片應兆用25.技基寫于單分碑子方法型的RN黨A折疊并、展開消、動力畜學研究RNA有廳何基本特測點與功能惜？RNA腔與蛋白歸質共同理負責基隸因的表裳達和表崖達過程死的調控遞。RNA通捐常以單鏈潑的形式存遇在，但有棄復雜的局確部二級結屠構或三級莊結構。RNA比懲DNA小笑的多。RNA臨的種類犬、大小變和結構病遠比D向NA表謹現出多訪樣性。RNA旋的基本察特點RNA伯生物學拉功能構成核怖糖核蛋憤白體小核內核閑糖核蛋白云世界剪接體創結構與連功能RNA哈分子位尊點特異袖性修飾欺的范例伐：尿嘧精啶插入棟、缺失RNA踏編輯端粒酶逆RNA形狀多變懂的mRN壘A：折疊縮慧的得與失RNA奮的種類鵲、分布汽、功能Cry廚sta雷lS梯tru孝ctu扯re巴of敬the功Ri填bos墓ome擁at弓5.尿5

?你Re武sol裂uti最onScie愛nce.淹2陪001.犧2燙92:8槍83-8傲96.Mar剃at脆M.仰Yus看upo遭v,1*Guln系ara屠Zh.幟Yusu暴pova犯,1*Alb拐ion杜Ba呀uco盛m,1Kate歲Lie摘berm冶an,1Tho啊mas片N.賤Ea雄rne鋼st,2J.H蹲.

D.舅Cat守e,3Harr麥yF.誕Nol禁ler11Cen貴ter咱fo首rM棗ole陽cul密ar洲Bio辛log銳yo山fR希NA,治Si療nsh組eim漠er鄙Lab混ora分tor廚ies吸,U揚niv物ers千ity棗of障Ca等lif尼orn渣ia慚at抵San誼ta軌Cru火z,幻玉San卸ta子Cru昂z,欄CA擦950尺64,招US謠A.2Ber守kel排ey遇Cen呼ter速fo征rS故tru叼ctu斬ral練Bi記olo料gy,竿Ph姜ysi華cal翻Bi貸osc共ien只ces棉Di蜻vis盟ion開,L罰awr絞enc魔eB息erk閘ele困yN廳ati偶ona森lL識abo借rat關ory違,B丟erk梁ele蛋y,頸CA厲947作20,絕US異A.3Whit摸ehea恭dIn繭stit蓮ute,躺Cam晉brid插ge,三MA0留1242淚,

US芬A.The賣Stru經ctur訪alB替asis拔of撫Ribo遮some音Act爸ivit積yin織Pep衣tide董Bon磚dSy曾nthe典sisSci竹enc單e.太2炮000貫.仔28想9:9羊20-放930.Pou留lN竄iss兼en,1*Jef舞fre岡yH旋ans拜en,1*Nena普dBa樓n,1*Pet旬er殺B.州Moo扭re,1,2Thom廣asA態.St榨eitz1,2燥,31Dep酬art豈men尿to于fM鞋ole通cul型ar弊Bio墊phy媽sic孤sa配nd臉Bio華che秋mis阿try泡an輝d2Dep叫art困men極to頂fC中hem填ist確ry,臟Ya升le菜Uni煉ver評sit絞y,糊and3Howa載rdH勉ughe儲sMe想dica摔lIn顏stit多ute,惜New換Hav響en,點CT0撤6520變-811勁4,U金SA.*The比se卷aut劣hor軌sc的ont駝rib巾ute悟de形qua戚lly熔to怠th盞is茂wor改k.RNA組富學RNA組兇學研究全侄部非mR肅NA小R志NA的集析合人類基因注組序列特徹點：2萬2.5萬飲個基因，繳與蛋白質晃合成有關印的序列占中整個基因磁組的2%厭左右，其呆余98%見的基因組覽序列沒有平得到注釋結。RNA阿組學研待究范疇誦（小分棚子RN州A）包括：snRN另A、sn粥oRNA胳、scR礦NA、催化性神小RN始A（s編mal轟lc提ata藏lyt爪ic廊RNA脈）、小片段干妹涉RN士A（sm昂all林inte學rfer橋ing帶RNA，久siRN箭A）、微小R預NA（愁mic鴿roR愉NA，田miR遭NA）Non隸cod謠ing則RN丟As婆(ncRN呼As)in除euk巷ary毀ote桶sSmal勁lRN剩A(sRN河A)in面bac胖ter鑼iaSma質ll護nuc深lea個rR拉NAs僑(snR邊NAs)Smal譜lnu隊cleo蛇lar猛RNAs遮(sno襲RNA區s)Mic饒roR巾NA(miRN死A)Sma款ll斷tem煎por六al仁RNA捷s(stR征NAs)Sma宜ll眨int賣erf吸eri梢ng特RNA莖s(siRN斷As)RNA育in紗ter賢fer遲enc獸e(RNAi)Guid偽eRN糟As(gRN健As)tRN球A/m旬RNA槽:tmRN險A非編碼丑RNA恢的名稱芒與縮寫裁符號RNA逆研究的進嫂步

與R服NA技魄術的發展毒密切相關RNA研廣究相關技刊術RNA網研究相勢關技術RNA技挽術可以分阻為：RNA基礎研究遵相關的技挪術、RNA應用相柏關的技陪術、RNA生物信脈息學技稼術.RNA北基礎研物究相關陽技術包借括RN市A分離善純化和質鑒定技請術、R驢NA與場其他生涉物大分光子相互環作用技閉術、R貸NA高謝級結構受的研究幻玉技術和柴其他相筍關RN符A技術膨;RNA派應用相蠅關技術督則包括黨用于生藥產其他福產品的乖RNA陷技術和遠直接用去于藥物另開發的蒸RNA丹技術;RNA的酒生物信息鍬學技術則煩有各種數路據庫、非頸編碼RN窮A的預測脈、RNA晶二級結構漿預測和各基種設計軟泰件.第一節售RNA營基礎研究秩相關技術RNA刃基礎研章究相關準技術大致可分萍為四類：RNA分離純化和鑒定技術、RNA橡與其敗他生物軋大分子相互作涼用技術、RNA高級結構的研究技抱術其他相關RN拆A技術貨。RNA分懂離純化和乞鑒定技術RNA分轎離純化和懂鑒定技術菠是幾乎所耀有RNA驕基礎研究冬的基點。（188影9年暫，Al叼tma贈nn碼第一次僑分離純仔化出不英含蛋白懇質的核預酸制品餅。189密3年撕，Ko牙sse孩l提鈔出，酵誦母來源榴的核酸標含有核童糖，R伴NA才的研究坐正式開投始。）現在各未種材料荒的RN芳A提取便和純化繁均包括余三個步盾驟：破碎細兆胞釋放求其內含織物、非遭RNA砌物質屆的去除匆、RN著A的墨濃縮。Triz聲ol的技諸術是目前公應用最廣吊泛和最著界名的方法繪之一。對于稀級有樣本月還聯合最體外轉五錄發展信了總RNA盟擴增技術(cR抖NA微擴增)爸。RNA懷可利用掩體外轉雙錄體系汪合成利用體外轉錄眼體系（in廁vi持tro核tr絮ans魯cri卸pti刻on冬sys錘tem殺）合成他RNA留是分子膽生物學通常用技淡術。這種體棕外轉錄忘體系是谷現代發眾展起來士的體外絨轉錄（制in班vit厲ro樂tra托nsc游rip傍tio酸n）技擊術——伐在含有必RNA宵聚合酶野（轉錄債酶）、婚必要的伸蛋白質點因子、屆核苷三升磷酸等弄條件的厭體外無貌細胞體罩系中，鐵加入D悉NA模扔板，模幫仿體內荷轉錄、般生成R懂NA的芝過程。利用真核拐細胞核抽咐提物（n指ucle脹are絮xtra沖ct）建蓋立再造體幣系是當前信生物技術累商家提供馳體外轉錄荒商品試劑辯盒（ki鈔t）的主選要來源?？俁NA莫的分離純荒化總RNA棗的分離純徒化技術已冠經相當完憤善，目前獄和將來的般重要發展緒方向是R競NA的進亡一步分級輕分離，其氏中小RN岔A的分斜離是研究呈的熱點。目前主粥要有兩拋種：一是利用電泳根據分草子大小銷分離；二是利仍用不同星濃度的有機溶漂劑的沉臭降或吸附效梯率不同分據離。Tri折zol乖技術Triz玻ol是一者種新型總每RNA抽錢提試劑，其內含異硫壺氰酸胍等葛物質，能譜迅速破碎冬細胞，抑款制細胞釋熄放出的核晨酸酶。特點：1.劫Tri狼zol粗試劑含鋒有苯酚嚼，具有仁毒性和斤刺激性害，注意懲操作態2.魔RNa珠se污凱染的主老要來源博是操作剝過程中哥手和空野氣中的局浮沉，睛注意配捏帶手套叉，樣品進盡可能賴蓋嚴篇3.沖細胞裂冬解必需套充分且辣操作迅踏速。裂扶解不完祖全會降椒低最后云得率，蜘因為一恰部分R瓦NA會喬殘留在然未裂解孕的細胞底中。細睛胞裂解摧之后要啦看不見淺顆粒狀鏡物質（隊結締組吼織和骨折除外）萬。在清之洗和裂村解細胞至時最好生在低溫扎下操作理，防止疏在操作第過程中矮釋放的柿內源R巾Nas催e降解港了RN野A撞4芒.酵消母和一漲些細菌符由于細賞胞壁的敵特殊結松構，可看以加入社Tri攤zol臥試劑同蛾時加入扣無RN寒ase悶的玻璃抬珠并劇命烈振蕩距，使細胃胞裂解鞋充分5.榜2-8?！姹芄怅P保存一炊年準備工努作RNA酶死（RNa程se）是貪導致RN貪A降解最姿主要的物奴質。此酶螞非常穩定舅，在一些侮極端的條良件下只可枝暫時失活限，但限制硬因素去除膛后又迅速昂恢復活性枯。常規高特溫高壓滅紙菌方法和莫蛋白抑制駱劑不能使徐所有的R鐵Nase變完全失活云。廉1.它墻廣泛存在球于人的皮這膚上，因翠此制備R傭NA時必言須戴手套2.R州Nase灶的又一污眼染源是取污液器。根肯據取液器笑制造商的紙要求對取液器進銜行處理央。一般擔情況下杰采用以慌DEP淋C配制爐的乙醇歇擦洗取液器的黃內部和伙外部，談可基本貪達到要安求色3衡.塑料災制品、挎玻璃和脹金屬物駛品的處致理觀（添1）塑霞料制品盞：盡量尾使用一優次性無古菌塑料囑制品。距已標明球RNa致se-fre盾e的塑關料制品爬，如沒器有開封肌使用過姜，通常捎不必再仔處理處理的步段驟如下：在玻璃燒混杯中注入櫻去離子水啊，加入D目EPC使佩其終濃度筋為0.0恐5%~0堵.1%（幸DEPC再-H2O懼）。（D膠EPC二方乙基焦碳菌酸酯為活強性很強的拳劇毒物，滅須在通風昏櫥中小心賭使用）缸將躲待處理的宵塑料制品頑放入一個講可以高溫持滅菌的容姑器中，注佳入DEP白C-H2歲O，使塑謊料制品的餃所有部分開都浸泡到毫溶液中，釘在通風柜著中37℃狼或室溫下克處理過夜元將D鎮EPC-吐H2O小昏心倒入廢崇液瓶中，粒將裝有D駱EPC-灰H2O處棄理過的塑奸料制品的之容器以鋁尺箔封口，裂高溫高壓昏蒸汽滅菌年至少30表分鐘。督滅菌塑料喊制品烘烤斜干燥，置均潔凈處備肯用（2）仰玻璃和尤金屬物休品25胳0℃烘翠烤3小封時以上繁DE織PC(獵二乙基汽焦碳酸毒酯)翻DEP姥C是R快NA酶宮的化學關修飾劑箭,它和河RNA拖酶的活睛性基團餐組氨酸扔的咪唑閃環反應蹦而抑制獲酶活性DEPC感與氨水溶診液混合會介產生致癌壓物,因而經使用時需和小心瘦試驗狗所用試劑襖也可用D遇EPC處遮理,加入犧DEPC速至0.1愉%濃度,蜜然后劇烈甚振蕩10抓分鐘,再霞煮沸15妄分鐘或高甩壓滅菌以潑消除殘存析的DEP真C,否則欲DEPC甜也能和腺怖嘌呤作用徹而破壞m留RNA活押性施但DE相PC能與慎胺和巰基江反應,因責而含Tr泰is和D滿TT的試咽劑不能用走DEPC外處理實驗步驟1.取性50~誕100赴mg的滅組織,兩加入1漁mlT沉riz盈ol試刺劑，用捕勻漿器漢打勻(醋Tri弦zol衡先放于楚冰上)頌2.購將勻漿平室溫放虎置5m減in寨3.加詢入20反0μl耳氯仿,驅劇烈震盟蕩混勻物30s荒，冰上閉靜置3案min始4.園120述00r彩pm，斥4℃離擇心15比min唉5.倘將上清補液小心拋轉移到竄新的1券.5m載l離心烈管中（益取40蓋0μl膽），加姓入等量庸體積的個異丙醇松，上下膝顛倒幾猴次混勻柜，室溫企下放置申15m梨in。澡（此步嫌中注意甜：不要推吸取任熄何中間今層物質肯，寧缺位勿爛。孩）搏6念.12赤000鼠rpm塘，4℃拳離心1筆5mi銜n峰7故.小心孝移去上裂清液，劃防止R賞NA沉消淀丟失8.用7圾0%乙醇知（DEP疼C處理的舌水配制）緊洗滌1次塔，加嚴入700浴μl乙醇首，將吃RN唇A沉淀彈關起，漂洗射。（此時態RNA是商不溶解的拉）許9.擾8000歇rpm，像室溫離心污10mi零n敗10.膊盡可能徹刃底地吸走今上清，防涼止RNA倚沉淀丟失斗11.真候空離心干濟燥3~5味分鐘，或競放在室溫絹下使乙醇殖完全揮發塘掉緊12.秋沉淀用3側0μlD偉EPC-引H2O溶抗解。如發忍現沉淀難翁溶，68猾℃處理1扒0min13.辮RNA拋檢測(1)績測定樣珠品在2嬸60n挨m和2楚80n峰m的吸善光值按1OD支=40賀μg/碗mlR勁NA計縱算RN險A的產籌量什O倆D26油0/O避D28翅0在1飄.8-也2.0栽(2駁)進行逃甲醛變帶性瓊脂貞糖凝膠適電泳,冰確定R倒NA的兵完整性缸和污染蝕情況RNA鑒之定RNA濾鑒定技衫術，主鉗要是分辜析RN名A的量覆、大小膜、豐度輕、定位帖、剪切拿、修飾止和序列荒等信息純化的森RNA窯可通推過光譜分騙析和定量分析特定鬧RNA母大小最常奧用的技術烤是Nor衡ther耽n雜交泊技術，它帶是由Al絲式wine兵等在19盒77年建渴立的核酸定吩量（DNA稱或RN唱A的定錯量）A260=1豆.0累相當于50μg/m稈l雙鏈DNA緩(dsD估NA)40μg/冷ml單鏈DNA屆(ssD趴NAo代rRN玩A)20μg/傳ml寡核苷剃酸確定樣同品中核濾酸的純訪度純DNA苦:守A260/A280=1媽.8純RNA秧:書A260/A280=2癢.0核酸紫竭外吸收衡量特脈異mR星NA豐仗度方法經典的衡云量某一特增異mRN桑A豐度的露方法的有覺：Nor嗽the敗rn松雜交核糖核酸莖酶保護定量的反轉錄些PCR等為研究異縫質細胞群健中RNA鋤和DN墻A序列闖的定位，寺還發展了原位雜交旗術目前這方井面的技術汽發展方向紹是大規模兵化和高通格量，其中基因芯奪片技術有鴉著相當咳大的優踐勢RNA本加工糞修飾鑒叼定技術有關RN趕A加工任修飾的鑒忠定技術有仰多種其中利梳用核酸酶伶對RN眠A進行晨作圖，定位內含隨子和外顯匠子；通過核提取鵲物等進行體外剪切夏分析。最近發展期的基因芯片梢技術可以高通脅量地分析南RNA奔剪接。與RNA輕修飾和睡RNA自編輯研究忍相關的技仗術主要有妹：snoR熊NA指導攝的2‘-替O-核糖底甲基化修蒜飾鑒定技憂術假尿苷掏化修飾摔鑒定技袖術mRNA到的各種編剃輯鑒定技橫術等另外，利婚用引物延路伸法、S返1核酸酶好法等可以枝進行RN潮A末端星鑒定。近年來知發展的姓CAG巨E(c膠ap宇ana襲lys笛is城gen狡ee單xpr類ess如ion抓)，S類AGE獲(se隙ria厚la敞nal葛ysi舞so執fg銳ene沉ex墻pre旗ssi尼on)材等技術漂可以實識現RN參A末慎端大規痕模鑒定員。其基本扭原理是薪在RN更A5震‘端附加上帶鮮酶切位難點的接乏頭，酶議切后可屬產生帶臟有5’守端序介列的短莖片段，藥經過連每接和測兄序，即葛可獲得學大量5偽‘Ta脈g序正列信息揀。通過烏分析T疾aq臣的頻率削可同時彈估計基環因的表累達情況糾。小RN大A豐度爽測定隨著s毀iRN指A、m壓icr茫oRN誓A、s賓noR時NA等孩非編碼蓬RNA論研究肺的不斷協深入，聞小RN戲A的主分析和府鑒定技剪術也逐正步完善屋。目前有關惡小RNA坊豐度測定證主要是利偉用改進反應轉錄P梢CR默技術，常見漏有三種辯方案：一、在華兩端加役RNA俱接頭二、通每過在3座‘端史加po燥lyA覆尾模駕擬mR腸NA三、利岸用st讓em-認loo富p反糕轉錄引無物技術前兩者同憶樣可用于運小RNA葬文庫的汪構建，之舞后通過測必序，可以覺獲得小R丸NA的舅序列信息騰，在大規及模實驗的辦條件下，峽根據獲得扮的克隆頻咱數也能分眾析相應的巷表達水平頓。也有一小鉛部分小R濕NA序列路是在生物輕信息學預規測的結果描基礎上進滑一步驗證慮獲得的。目前，高卻通量小R錢NA分懼析鑒定技行術常用的鑰是改進的越非編碼痕RNA弦芯片技屬術；對于特甲定的小R事NA的分造析鑒定除師上述技術欣以外還有改良的電Nor半the論rn技集術等?？寺亮cRN讀A的方秋法計算機分收析法基因克浩隆法蛋白質趴-RN矮A分離兆法計算機是分析法大致過程：利用計春算機軟候件從已蝦知基因擁組序列鎮中尋找畢基因間礙區中的穿sno己RNA艦序列，草然后模底擬其高惕級結構處，設計免引物擴目增其序從列和克飼隆，或錦人工合稿成其序偷列，測凍定其功斤能。小RNA穗的克隆和經鑒定小鼠腦組織勻漿總RNA8%PAGE回收50-110nt(fractionI)和110-500nt(fractionII)Poly(A)聚合酶加C尾cDNApSPORT1PCR高密度陣列雜交除去高豐度、已知的小RNA未雜交的cDNA測序詳見：子htt采p:/沿/ex掃ppc外01.弓uni害-mu兩ens雞ter泄.de降/ex饞pat修h/s顫nmr壘nas館.ht窗m蛋白質-巴RNA復元合物分離枝法分離蛋稅白質-予RN解A復合識物，除間去蛋白過質，純馳化RN繼A分子燙，反轉凈錄成c舊DNA榨，克隆庫，測序員，結果采分析。所得RN們A的cD鉛NA克隆管必須進行轟Nort僑hern滅雜交，以銷確認其轉釣錄物大小剛是否相符頓。RNA姿與其他況大分子直相互作閑用研究勢技術RNA與苗蛋白相互啄作用在基躍因表達調斗控中發揮衡著重要作家用，相應粥的技術也樂與細胞技畝術和蛋白帝質技術交燙叉。通過光交聯進行RN土A的體外遠修飾并增捎加RNP羞的穩定性凳，利用凝膠阻滯和硝酸纖維舅素濾膜結懸合實驗技術分相析RN血A-死蛋白質筐作用常朱數，用免疫共沉單淀技術分防離特異堤的RN守P。RNA朱足跡、修飾干擾裹分析和RNP這中寡核苷斥酸靶向的飽RNas揉eH各切割保護實驗技術也常垃用于鑒定襯重要的蛋蒼白質結合頸位點。目前這懂方面研算究也有肢向大規盞模發展這的趨勢肉，主要唐有兩種幼方案：一是在唱細胞水礙平利用山光交聯艇技術后妙，通過水免疫共被沉淀或政者其他齡親和技水術，獲留取某個南或某類俘蛋白的鐮所有結萌合RN揮A基蜻序，進皆一步通臭過分離午純化和郵測序等死，獲得粘RNA圾與蛋白濃質的相鍬互作用慌信息。反過來鉆，利用新標記的突RNA墓或者已特知的R切NA結課合蛋白臟也可獲沫得相應嫁與RN立A相互沿作用的運蛋白或薪其他大困分子，其再通過好蛋白質創組技術延獲得相踏應信息環。如RNA超i和mi息croR午NA作用泄過程中許柴多新蛋白薦的發現就膨是通過這陣種技術完室成的，從件而逐步揭幸示了細胞所內RNA逮干擾的分還子機制。二是利伯用各種附文庫篩丸選技術外，如酵設母三雜晶交技術幸、噬菌賣體展示級技術、厭核糖體森展示技榮術、抑睛制細菌彈轉錄終紀止檢測殘技術、理Nor箱thw控est懲ern酒技術薄等篩選肯RNA際結合蛋做白?；蚍催^來敗通過構建渣天然或人仗工RNA里文庫篩選臭與蛋白質蹈特異結合架的RNA甩序列。RNA與引DNA或城RNA的堡相互作用獨也是基因斃調控的重盟要方面如si港RNA須或mi殖cro去RNA寒與靶m統RNA曠的結合測，導致網靶mR績NA拉的降解龍或翻譯顯抑制；浪或者與歪靶DN氣A結合砌指導D額NA的吊甲基化第等。從這也衍冷生出許多率相關的實罪驗技術，厘例如micr量oRNA仁的實驗豆性尋靶技紙術。RNA夾高級結構面研究技術RNA疲高級結構刊、RNA隆與其結合號蛋白的高誓級結構是窯RNA研筒究的重要州組成部分敘。RNA涂在體乓內是以贊RNP胃形式勞存在的美，因此奮研究R說NP的按結構更極具有意昆義。與之相關旦技術有各種顯炎微技術、X光晶賣體衍射技債術和磁共振遞技術等。（高分控辨率核焦糖體晶袖體結構供的解析輔、Ar桂gon口aut售e蛋啟白晶體鈴結構的明研究等冊都是這啊些技術逮發展的黨成果，俯并為R峽NAi釀機制鵲的闡明揚起到巨羽大幫助蔥。）其他R潮NA研疑究相關蜂技術在RNA螞的研究中暑不可避免幕的會遇到俊RNA降紋解問題，遲這就需要編利用RNA保見存技術，這是R口NA研究仁中最基礎大也是最重消要的技術交之一。各種RNA智工具酶如RN發A聚合叫酶、R寇NA酶裳、RN急A連顧接酶和守反轉錄禮酶的發獵現，使敢得進行胖RNA遍操作戴更加方伏便和容殃易，從圍而也促腰進RN旱A技狀術不斷查創新，牽應用范運圍更加始廣泛。獲得已知胞序列的R茅NA分子無論基虧礎或應撈用研究布中，都極有可能柿需要大見量獲得鄰已知序緣瑞列的R委NA分信子。RNA萌合成技術錢包括：體外轉錄油合成技術直接化學庫合成技術體內合成敏技術利用tR符NA骨架響在體內大似量表達出指研究者需齡要RNA踏分子第二節暖RNA胃應用相關歐技術RNA救應用相紡關技術雖然RN爐A的研算究蓬勃開救展，但是撕在相當長僻的時間里櫻RNA會還主要停鼻留在基礎咽研究階段鏈。直到20瞞世紀80脂年代末縮慧，核酶專泛利的出現濾使得R汁NA矩應用技蓬術的研垂究迅速按升溫。從新RN疫A應用技起術的建立翠到專利出椒現的時間細差也在不花斷縮短。這方面技藏術也可大階致分為兩博大類：用于生產包其他產品壟的RNA蟲技術直接用份于藥物畢開發的勾RNA聚技術皆。用于生杜產其他撞產品的尋RNA新技術主滅要是指談蛋白質貫合成方沫面，如蛋白質的言體外合成將RN精A的閘體外合德成技術濱與蛋白給質體外據合成系單統聯合厲在一起放可以制緩備許多扒生物工齒程技術訴不能生氣產的毒蛋白、人工合賴成氨基酸摻入蛋淘白質等大規模蛋法白質體外弄合成技術這必將是今己后RNA見應用技兇術發展的宋一個重要掩方向多聚核蛋總白體(p獎olys現ome)：mRN印A與多個磁核糖體的設聚合物——使蛋白貴質合成揉以高速怨度、高爹效率進初行目錄電鏡下目的多聚送核糖體瘦現象目錄rRNA烏與蛋白質預組成核糖矩體目錄設--蛋白質欄合成場繡所核糖體的尿組成目錄原核生物諷核糖體70襪SMt2.7×壺106真核生物李核糖體80SMt4.2×106直接用印于藥物開開發的衰RNA慎技術目前應輝用較廣爭泛的主伯要有：反義核兔酸(狹扭義的)梢技術、核酶技襲術、SELE弊X技術(sy抽ste割mat朵ic伏evo泉lut菌ion毫of落li咐gan堡ds舅by楚exp抱one快nti艙al素enr析ich直men織t)、RNA予干擾具、引誘物(埋deco資y)技術上述各牛種技術咸獲得的悲RNA農或D平NA口及其類免似物的歸作用都屢是抑制革基因表及達，因醉此，這儲些分子戴本身可撒作為各驗種疾病趁治療用即的藥物許多這方刻面的藥物糕已經獲準敢上市或處銹于臨床研調究階段反義核拴酸技術1978幻玉年，Z壯amec況nik吵等證明特地異互補的浮寡核苷酸謊在體外能辯有效地抑疊制Rou刑s肉瘤病毛毒(RS都V)增殖倡。1984聯年，I漠zant晝和We飼intr節aub云等首次提補出反義核嘩酸技術(梨anti戰sens困ete姿chno扯logy恩)的概念秀。反義技術罰：指根據炒堿基互蠶補原理崖，用人皮工或生綠物體合況成的特眼異互補滿的DN哨A或弓RNA借片段誦(或其怕化學修蘇飾產物宅)抑制或截封閉目另的基因僻表達的技術摧。廣義地講粒，反義寡封核苷酸技亂術、反義齡RNA毀技術、核拍酶技術、福RNAi繩技術等允都屬于反洪義技術范潛疇。目前，傳戲統的反義鄭核酸藥物筋已經發展爭到了第三茶代，主要啊包括肽核酸(pep伸tide廣nuc舉leic牛aci項ds，梳PNA)珍、鎖定核酸(loc齡ked喘nucl沉eic腎acid絨，LNA削)等多種黃化學修飾照的寡核苷灣酸。第一個攝反義核渣酸藥物洗(Vi熔tra港ven敢ekT中M)已間經進入乳商業市莊場，還砍有多種鍵反義核辯酸進入價III始期臨籠床試驗姿。核酶技任術幾乎在發濾現反義R段NA的截同時,悔人們發現駛了一類具有酶爺活性的插單鏈R尼NA拍分子，即核巾酶(r繁ibo參zym稼e)1982點年，C贏ech搖首先提出張Ribo次zyme潑的概念皇，并認為問核酶在生唐物體內普增通存在核酶發現康的意義：改變了理酶的化相學本質哪是蛋白隆質的傳薯統概念特，揭示情了RN升A在臥生物體按內的多售功能特撇性，R軟NA傍既是遺跳傳物質怨,還截具有多泳功能的走催化作奔用，是由生命科煎學發展妹過程又覺一里程綱碑83一些內含垃子RNA謝具有自我勿剪接和催敵化功能由RN你A分子揀催化自覽身內含子剪咐接的反應毅稱為自我剪熊接(s隔elf拼-sp菜lic杜ing固)自身剪接音內含子的析RNA具且有催化功倒能，是一廈種核酶(甚rib衛ozy灑me)四膜蟲處rRN巖A的剪聽接采用自價我剪接危方式核酶（r衛iboz延yme）四是具有催鈔化功能的疏RNA分逐子。核酶投又稱核酸賴類酶、酶墨RNA、范類酶RN危A。核酶的功乳能很多,誓有的能夠獄切割RN題A,有極的能夠切炒割DNA模,有些詳還具有R耽NA連垂接酶、磷樓酸酶等活亮性。核酶通過敢催化轉磷爺酸酯和磷撲酸二酯鍵岔水解反應花參與RN果A自身剪輪切、加工脊過程。與蛋白質晃酶相比，辭核酶的催琴化效率較呆低，是一浙種較為原甚始的催化銷酶。核酶技術風原理：核酶R濾NA分驅子通過澤堿基配樣對原則紅與靶m栗RNA項結合僑發揮酶繳活性，獄在特定隊的位點倆特異性惡滅活靶頌RNA垮分子報，同時魄兼具反巷義抑制溪效果。核酶可如以在體生外合成尾，也可確以經表追達載體羨導入后紀在細胞展內合成裁。脫氧核酶(deo隨xyri眾bozy欣me)印是近年來芳發現的一黨類具有催效化活性的皺單鏈DN員A分子。祥脫氧核酶盈兼具AS姨ON反梢義抑制作榴用和核酶碌的靶向性續剪切活性度等雙重優友勢，而且拜穩定性較堅好。核酶類型到目前為本止，人們經發現的核碧酶共有6卻種類型：I類內杠含子RNas陷eP錘頭狀腳核酶發夾狀酸核酶丁型肝炎燈核酶VS核遇酶通過對這陵6類核酶襲組成及結鬼構的研究符，人們利侄用錘頭狀舅、發夾狀攏、斧頭狀倉核酶的特勵點，人工膜合成所需嘴要的核酶額。錘頭狀武核酶的二倡級結構是鉆由核酶和摔底物復合敞物組成的疑三個莖環鎖結構。RNA底漆物通過二將個莖環結抬合到核酶涉上，切割響位點由一覆個非配對省堿基及與簡之相連的庸二個莖環老結構組成桂。切割發住生在非紡配對的漫3’側構，切割濟產物5膠’端是法羥基。聚3`端檢是一個枕2’3近’環磷朵酸二酯福，核酶丹催化水柜解底物仗需要被顫水解部古有一個抬特殊的盾三聯密壇碼，N海UX、聾(N{夸G、A薦．U；菜XA趣、U，嘩C)當炕三聯碼矮為GU顆C時，竟被水解棉的活性浩最高。核酶技令術的特羅點①序列叔特異性檔；②不編蛋神白質，無懲免疫原性矛；③可以重偷復利用，肉所以研究世進展迅速SEL丟EX技暢術SEL專EX技糟術適配分游子技術粘是一種孫最近發芹展起來就的體外軋篩選和瘡放大技挺術，通逢過該技敞術可得內到一段閥能與各尊種目標胖分子高傻親和、散高特異買結合的踐核酸序征列，該仆核酸序桿列稱之糠為適配崖分子(域apt材ame望r)。Apta滑mer一福詞來源于匆拉丁文A變ptus趴，意即適換合的意思難(fit稅)，而這淚種體外的跪篩選技術錦稱之為指數級遲富集配樹體系統縱進化技犧術即SEL沸EX(s工yste床mati嚷cev調olut么ion怨ofl塘igan鋪dsb鄙yex舒pone義ntia軋len離rich窗ment沉)。簡言之唐，Ap括tam三er就近是一段額核酸序眼列，它韻能與相扇應的配亦體高特展異性和再高親合服力地結榴合。從以原始文翻庫中篩她選配體福相應的西Apt止ame蒙r的技文術稱為榆SEL沃EX技滴術。Apta貪mer具炒有廣泛的矛實用性，區它能用于飾任何以分之子識別為凳基礎的診虛斷和治療貴。原理從大量的肺隨機序列煤的寡核苷葡酸庫中鑒里定出一種猛數量很少硬的具有獨竹特性質的光核酸序列嶺的方法是香由Tue敗rk和E看llin竊gton介等在19學90年建招立的，它截是一種通瀉過體外反復不選擇和放氣大從巨大互的核苷癥酸組合難庫中篩泰選特定制核苷酸烏序列的雞方法。SEL慕EX過漁程中，稻首先是投用組合太化學合績成DN覽A的方匹法合成秒隨機序汁列的核膛酸庫，碧庫中的愚每一個蜓成員是激一個線谷形的寡偽聚物，沃庫中分顛子多樣迷性的程綁度取決磨于隨機聯寡核苷朗酸的長衣度。理論上拼講，一悟個40出個堿基顫的隨機詳序列可恩有1.留2X柜10迅24種濾核苷酸媽排列順撿序(440=1.2專X1比024)厭。實際上舒1μmo中l的固相塵DNA合隆成的隨機壟組合核苷繳酸庫的序誘列多樣性隱僅限制于森1014跌—101蘿5種，能頁否找出與冶靶分子相掉互作用的第稀有序列嫂，很大程瀉度上取決景于組合庫紋的多樣性琴，在所有仰種類的組薪合隨機序服列庫中寡是核苷酸庫毯的多樣性局最為豐富六。篩選過程某中，首先用在一定的糧溫度下將歪寡核苷酸崖隨機序列野庫與靶分阿子共同孵跳育于特定拳的緩沖液魯中，組合搜庫中的極虹少數分子蠟將與靶分味子結合，幅然后用物撞理的方法焦將結合的呈分子與末劣結合的分坐子分離開匠來。標準賞的方法是預將蛋白靶既分子固定鑄于硝酸纖葵維素濾膜樹上，而其宏他小的靶捐分子則固幟定于固相青載體的表貫面，因此僅，未與靶舊分子結合柳的序列很凳容易被沖浙洗掉，而五與靶分子牛結合的序亂列將被分琴離出來并棍放大以獲蘿得一個序損列庫，再弱對這一序憑列庫進行繩下一輪的匯篩選和放綿大。SELE堵X技術原園理由于a球pta蒸mer第具有姐精確識岸別、易說體外合神成與修逃飾等特托性，S亂ELE翼X技般術在分錯析化學味、基因使調控、英蛋白質溉組研究謎、疾病奸治療與院新藥研汁發等方幟面得到苦廣泛的與應用。更重要蛙的是，脈apt跟ame巴r的畫靶分子血范圍很遭廣，與輩靶分子猛間的親福和力和鋤特異性沾更高，拐從SE早LEX軍技術遣建立至現今，S低ELE什X技弓術和a舅pta爸mer四的研欣究不斷煉受到新便的挑戰誓與更新還。SEL俯EX芹技術改晴良經過1標5年的舒發展，偷SEL查EX隨技術不膊斷得到爭改進與歇完善，灑實現了啦篩選流俊程的自贊動化、島篩選形堅式的多例樣化、應篩選結梁果的快掉速化，按apt烘ame莖r也古有了多背種應用葡形式。各種改堤良SE催LEX躁技術護：自動化S只ELEX消減SE冰LEX楚(sub帶trac貴tive守SEL陣EX)毛細管蒜電泳S解ELE像X(禽CE-士SEL船EX)加尾S趣ELE涂X(療tai榆lor等ed轟SEL鴿EX)無引物作基因組把SEL繞EX(科pri抗mer剃-fr洽ee榴gen掩omi蒙cS她ELE挪X)切換S蔽ELE震X(音tog毅gli謀ng眾SEL棒EX)表達盒胳SE宿LEX唉(ex涌pre敏ssi伙on總cas族set每te黑SEL攔EX)變構篩向選(甩all框ost翼eri欲cs色ele涂cti丘on)利用S喬ELE突X技淘術篩選醉獲得的仰針對V貴EGF廈的R灘NA配耽基(a蕉pta振mer喇)已經縣獲得美脂國FD夜A批準春上市，弄商品名酸為Ma妻cug端en，狼用于老您年性視路網膜黃惹斑營養缺不良(嗎AMD象)的治汁療。RNA妹干擾技術早在1場990炊年，圓人們就驢發現植乳物中存單在轉錄滴后基因羨沉默現時象。199憲5年罩，康乃德爾大學雪的Gu必o在利撿用反義由RNA御技術特鴿異性地贈抑制秀記麗新小超桿線蟲血(C.錘ele覽gan嗓s)中的糟par沈-1基嗓因的表趴達時，真意外發虧現對照論實驗中較給線蟲蹈注射正滋義RN勻A(s存ens裕eR剪NA)捷也能抑暢制pa色r-1調基因村的表達壁。直到19著98年樹，Fir院e和M淚ello葵才首次揭因示雙鏈R貝NA能夠雅特異抑制釘具有相同有序列的靶駕mRNA逮的表達戰，并將這僅一現象稱棒為RNA屈干涉(懸RNA立inte時rfer裕ence兼，RNA慌i)。在隨后詞的短短抹一年中抗，RN隆Ai章現象被浴廣泛地跪發現存諒在于大忍多數真怒核生物往中，R木NAi姓技術窩也被迅道速應用尼到生命腰研究的晚各個領布域。目前，R墊NAi灑技術作為警基因功能綢研究和疾看病基因治匠療的革命稼性工具，炸已經在醫泄藥開發、膜基因治療賀和功能基富因組研究闊等方面得凱到廣泛應恒用，并于壓2006上年獲得怪諾貝爾獎旁。RNA棵i技廟術的作送用基礎威是si晚RNA唯的基派因沉默胳作用。RNA干足擾一些小稈的雙鏈振RNA油可以高拘效、特峽異地阻共斷體內燈特定基克因表達速,促使嘉ｍRN偽A降解關,誘使讓細胞表足現出特畫定基因輔缺失的面表型,椒稱為R叨NA干態擾(R融NA游int裳erf媽ere市nce姿,R喚NAi耀,也譯盟作RN輸A干預剪或者干評涉)。RNA私干擾原笛理RNA驚i－一忙種新的榆遺傳學謙研究工鎖具RNAi滑是植物、條果蠅、線爪蟲和很可汁能包括哺手乳動物在萍內的許多遭生物抵抗病喂毒感染和限制轉腿座子運志動的一種儲自然存怕在的防輸御機制。RNA殿i可以授作為一至種簡單臣、有效瞇的代替基虛因敲除在哺乳動物細胞中用siRNA(21－23核苷酸長的小分子干擾ＲＮＡ片段(smallinterferingRNAs,siRNAs,又被稱為引導RNAs)。能高效阻斷某個特定基因的表達,這項技術在疾病的基因治療上也有光明的應用前景。特別可以用于阻斷某些突變基因的表達,或者由蛋白過量表達引起的疾病。共抑制砍現象的ＲＮＡｉ墓研究的早材期線索早基因沉魯默轉錄階段抓基因沉默(tr五ans這cri任pti尊

對于部分植物來說,轉基因引發的基因沉默可能是因為基因特異的甲基化而導致,這被稱為轉錄階段基因沉默.轉錄后發生的基因沉默(posttranscriptionalgenesilencing,orPTGS)：Ｈａｍｉｌｔｏｎ等,率先在發生ＰＴＧＳ的西紅柿中檢測出與被沉默基因同源的約25ｎｔ的短片段ＲＮＡ,而未發生ＰＴＧＳ的西紅柿則不能檢出25ｎｔ的ＲＮＡＨａｍｉｌｔｏｎＡＪｅｔａｌ.Ｓｃｉｅｎｃｅ,1999,286(5441):950—952

目前在筋體內或脊體外R飯NAi晶中應賣用的s役iRN痛A主性要有兩載種來源芒：體外就化學合慈成或轉所錄的s雨iRN漫A和利繁用DN斬A載體創在細胞索內轉錄揀產生。由化學合個成或體外妖轉錄的方督法得到~滲21nt元的si知RNA，教目前應用慎得最廣泛攻。尤其是螺經過修飾降后提高穩焰定性的s危iRNA伸仍可表現冬特異的基癥因沉默作圣用，為其寶在體內的域應用提供附了可能的湖前景，而幻玉且目前的桑研究表明宵，無論在賢細胞或動益物體內，餅應用此類拜siRN狂A均不艙影響體內籠miRN聚A的表腹達和功能唯，進一步槽說明si顛RNA咐應用的可幫靠性。也有根獲據靶基臟因mR反NA設階計的長幻玉dsR瘡NA經歷Dic眼er快剪切成挪一系列鼻~21客nt麥的si窄RNA辟(統稱把為es這iRN伐A)，仿能更有雕效、更趨方便地傭抑制基鋪因的表兄達，但喚是其缺憑點是可葬能存在烤非特異堤效應。隨著m現iRN淡A研究以的不斷貞深入，隊人們發丹現根據付miR禁NA設舉計的發模夾RN叛A，或液基于s飯iRN搭A的發吸夾RN菌A在么體內都西表現出蓋有效地鍵基因抑艘制作用口。基于D辰NA顆載體在纖體內表醋達si露RNA夫的技演術，其籮優勢是稿可調控批的表達柏，而且吸利用病幫毒載體仔可能更趟易在體述內獲得躍應用；收但是這極種系統扣不可避傍免的與昌miR菌NA機恨制相競棕爭，從廊而導致棄相當大神的非特懇異性和妹毒性。RNA孤i技躁術的問包題盡管R們NAi踩技術雞飛速發疊展，它攤的應用轎也開始服向高通津量的方煮向發展局，但是爽在機制聰研究和錢應用方廚面還存躺在著許辣多問題布。其一是柱si峰RN鑼A存械在一種承稱為“昨off阿-t